FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5734, 735 aa
1>>>pF1KB5734 735 - 735 aa - 735 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0354+/-0.00107; mu= 17.0806+/- 0.065
mean_var=99.9769+/-20.014, 0's: 0 Z-trim(106.0): 89 B-trim: 4 in 1/49
Lambda= 0.128270
statistics sampled from 8620 (8708) to 8620 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8896.1 DGKA gene_id:1606|Hs108|chr12 ( 735) 5047 945.2 0
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CCDS43182.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 766) 1466 282.5 1.6e-75
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CCDS83227.1 DGKI gene_id:9162|Hs108|chr7 ( 734) 787 156.9 1e-37
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CCDS44579.2 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 933) 767 153.3 1.6e-36
CCDS55757.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 934) 767 153.3 1.6e-36
CCDS7918.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 945) 767 153.3 1.6e-36
CCDS41640.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 (1117) 767 153.3 1.9e-36
CCDS3342.1 DGKQ gene_id:1609|Hs108|chr4 ( 942) 548 112.7 2.6e-24
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CCDS55899.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1084) 497 103.3 2e-21
CCDS55898.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1100) 497 103.3 2e-21
CCDS9382.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1164) 497 103.4 2.1e-21
CCDS9381.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1220) 497 103.4 2.2e-21
CCDS46546.1 DGKD gene_id:8527|Hs108|chr2 (1170) 466 97.6 1.1e-19
CCDS2504.1 DGKD gene_id:8527|Hs108|chr2 (1214) 466 97.6 1.2e-19
>>CCDS8896.1 DGKA gene_id:1606|Hs108|chr12 (735 aa)
initn: 5047 init1: 5047 opt: 5047 Z-score: 5050.9 bits: 945.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5047; 100.0% identity (100.0% similar) in 735 aa overlap (1-735:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKERGLISPSDFAQLQKYMEYSTKKVSDVLKLFEDGEMAKYVQGDAIGYEGFQQFLKIY
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CCDS88 MAKERGLISPSDFAQLQKYMEYSTKKVSDVLKLFEDGEMAKYVQGDAIGYEGFQQFLKIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LEVDNVPRHLSLALFQSFETGHCLNETNVTKDVVCLNDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LYDTDRNGILDSSEVDKIILQMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGSVSQAEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDTDRNGILDSSEVDKIILQMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGSVSQAEW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDDGQHMWRPKRFPRPVYCNLCESSIGLGKQGLSCNLCKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VRAGATTVPLLVLLGLEMTLKDDGQHMWRPKRFPRPVYCNLCESSIGLGKQGLSCNLCKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TVHDQCAMKALPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCESGRCDRCQKKIRIYHSLTGLHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TVHDQCAMKALPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCESGRCDRCQKKIRIYHSLTGLHC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VWCHLEIHDDCLQAVGHECDCGLLRDHILPPSSIYPSVLASGPDRKNSKTSQKTMDDLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VWCHLEIHDDCLQAVGHECDCGLLRDHILPPSSIYPSVLASGPDRKNSKTSQKTMDDLNL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 STSEALRIDPVPNTHPLLVFVNPKSGGKQGQRVLWKFQYILNPRQVFNLLKDGPEIGLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 STSEALRIDPVPNTHPLLVFVNPKSGGKQGQRVLWKFQYILNPRQVFNLLKDGPEIGLRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 FKDVPDSRILVCGGDGTVGWILETIDKANLPVLPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 FKDVPDSRILVCGGDGTVGWILETIDKANLPVLPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NLAKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFQIINNYFSIGVDASIAHRFHIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NLAKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFQIINNYFSIGVDASIAHRFHIM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 REKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNLSLEGIAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 REKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNLSLEGIAVL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NIPSMHGGSNLWGDTRRPHGDIYGINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NIPSMHGGSNLWGDTRRPHGDIYGINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GAIEMGQIYTKLKNAGRRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQMPML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GAIEMGQIYTKLKNAGRRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQMPML
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 MGPPPRSTNFFGFLS
:::::::::::::::
CCDS88 MGPPPRSTNFFGFLS
730
>>CCDS3274.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 (791 aa)
initn: 2694 init1: 1223 opt: 2422 Z-score: 2425.2 bits: 459.5 E(32554): 9.2e-129
Smith-Waterman score: 2607; 58.6% identity (81.3% similar) in 643 aa overlap (93-733:158-783)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VDNVPRHLSLALFQSFETGHCLNETNVTKDVVCLNDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLY
:: :.:: ::.:::: :::.::::: :.::
CCDS32 MAEKQAPAEDQVAATPLEPPVPRSSSSESPVVYLKDVVCYLSLLETGRPQDKLEFMFRLY
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130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DTDRNGILDSSEVDKIILQMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGSVSQAEWVR
:.:.::.::..:.: :. ::...:.::.:: .::::::.::.. .::: .: :: :::.
CCDS32 DSDENGLLDQAEMDCIVNQMLHIAQYLEWDPTELRPILKEMLQGMDYDRDGFVSLQEWVH
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 AGATTVPLLVLLGLEMT-LKDDGQHMWRPKRFPRPVYCNLCESSI-GLGKQGLSCNLCKY
.: ::.:::::::.. . : ::.: : :.: .:.:::.:. . :. :::: :. :::
CCDS32 GGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTMKHFKKPTYCNFCHIMLMGVRKQGLCCTYCKY
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TVHDQCAMKALPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCESGRCDRCQKKIRIYHSLTGLHC
:::..:. . .: :.::.:.... :..:.::.:. : .::::.:.:. :.:.:. ::
CCDS32 TVHERCVSRNIPGCVKTYSKAKRSGEVMQHAWVEGNS-SVKCDRCHKSIKCYQSVTARHC
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VWCHLEIHDDCLQAVGHECDCGLLRDHILPPSSIYPSVLASGPDRKNSKTSQKTMDDLNL
:::.. .: : .. :: : :::::: :.:: : . ..... .: : .: .
CCDS32 VWCRMTFHRKC--ELSTLCDGGELRDHILLPTSICPITRDRPGEKSDGCVSAK--GELVM
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 STSEALRIDPVPNTHPLLVFVNPKSGGKQGQRVLWKFQYILNPRQVFNLLKDGPEIGLRL
. .: :.:.::::::.:::::::.::.:.: ::.:.:::.::::: . :: :: .
CCDS32 Q----YKIIPTPGTHPLLVLVNPKSGGRQGERILRKFHYLLNPKQVFNLDNGGPTPGLNF
430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 FKDVPDSRILVCGGDGTVGWILETIDKANLPVLPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGQ
:.:.:: :.:.:::::::::::. :::::. ::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FRDTPDFRVLACGGDGTVGWILDCIDKANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGG
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NLAKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFQIINNYFSIGVDASIAHRFHIM
.:.:::::.:.: .: .::: .::::.. :..: ::..:.:::::::::::::::::.:
CCDS32 SLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLEVIPREEVENGDQVPYSIMNNYFSIGVDASIAHRFHVM
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 REKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNLSLEGIAVL
:::.:::::::::::::::::.:::.. .:::::.. . .: : .::::. :::::.:
CCDS32 REKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGTSETFAATCKKLHDHIELECDGVGVDLSNIFLEGIAIL
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NIPSMHGGSNLWGDTRRPHGDIYGINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDKRLEVVGLE
:::::.::.::::.... .. : . : .::: :: :: ::::. :::::::
CCDS32 NIPSMYGGTNLWGENKKNRAVIR-------ESRKGVTDPKELKFCVQDLSDQLLEVVGLE
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GAIEMGQIYTKLKNAGRRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQMPML
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CCDS32 GAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCASVTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPCCTIKITHKNQAPMM
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730
pF1KB5 MGPPPRSTNFFGFLS
:::: .:. ::..
CCDS32 MGPPQKSS-FFSLRRKSRSKD
780 790
>>CCDS43181.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 (752 aa)
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Smith-Waterman score: 2452; 50.2% identity (69.7% similar) in 801 aa overlap (1-733:1-744)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAKERGL-ISPSDFAQLQKYMEYSTKKVSDVLKLF-EDGEMAKYVQGDAIGYEGFQQFLK
:..:: . ..: .: ::::: :::.::..:.: : : : . .: . :.:. :. :..
CCDS43 MGEERWVSLTPEEFDQLQKYSEYSSKKIKDALTEFNEGGSLKQYDPHEPISYDVFKLFMR
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 IYLEVDNVPRHLSLALFQSF------ETG-----------------HCLNETNVTK-DVV
::::: .:. :: :: .: ::. . : :.:: : .
CCDS43 AYLEVD-LPQPLSTHLFLAFSQKPRHETSDHPTEGASNSEANSADTNIQNADNATKADEA
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100 110
pF1KB5 C----------------------------------------LNDVSCYFSLLEGGRPEDK
: :.:: ::.:::: :::.::
CCDS43 CAPDTESNMAEKQAPAEDQVAATPLEPPVPRSSSSESPVVYLKDVVCYLSLLETGRPQDK
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pF1KB5 LEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIILQMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGS
::: :.:::.:.::.::..:.: :. ::...:.::.:: .::::::.::.. .::: .:
CCDS43 LEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDCIVNQMLHIAQYLEWDPTELRPILKEMLQGMDYDRDGF
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VSQAEWVRAGATTVPLLVLLGLEMT-LKDDGQHMWRPKRFPRPVYCNLCESSI-GLGKQG
:: :::..: ::.:::::::.. . : ::.: : :.: .:.:::.:. . :. :::
CCDS43 VSLQEWVHGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTMKHFKKPTYCNFCHIMLMGVRKQG
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LSCNLCKYTVHDQCAMKALPCEVSTYAKSRKDIGVQSHVWVRGGCESGRCDRCQKKIRIY
: :. ::::::..:. . .: :.::.:... ::
CCDS43 LCCTYCKYTVHERCVSRNIPGCVKTYSKAKR---------------SG------------
300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 HSLTGLHCVWCHLEIHDDCLQAVGHECDCGLLRDHILPPSSIYPSVLASGPDRKNSKTSQ
:.: : .. :: : :::::: :.:: : . ..... .:
CCDS43 -------------EFHRKC--ELSTLCDGGELRDHILLPTSICPITRDRPGEKSDGCVSA
340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KTMDDLNLSTSEALRIDPVPNTHPLLVFVNPKSGGKQGQRVLWKFQYILNPRQVFNLLKD
: .: .. .: :.:.::::::.:::::::.::.:.: ::.:.:::.::::: .
CCDS43 K--GELVMQ----YKIIPTPGTHPLLVLVNPKSGGRQGERILRKFHYLLNPKQVFNLDNG
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GPEIGLRLFKDVPDSRILVCGGDGTVGWILETIDKANLPVLPPVAVLPLGTGNDLARCLR
:: :: .:.:.:: :.:.:::::::::::. :::::. :::::::::::::::::::
CCDS43 GPTPGLNFFRDTPDFRVLACGGDGTVGWILDCIDKANFAKHPPVAVLPLGTGNDLARCLR
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 WGGGYEGQNLAKILKDLEMSKVVHMDRWSVEVIPQQTEEKSDPVPFQIINNYFSIGVDAS
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CCDS43 WGGGYEGGSLTKILKDIEQSPLVMLDRWHLEVIPREEVENGDQVPYSIMNNYFSIGVDAS
500 510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 IAHRFHIMREKYPEKFNSRMKNKLWYFEFATSESIFSTCKKLEESLTVEICGKPLDLSNL
::::::.::::.:::::::::::::::::.:::.. .:::::.. . .: : .::::.
CCDS43 IAHRFHVMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGTSETFAATCKKLHDHIELECDGVGVDLSNI
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 SLEGIAVLNIPSMHGGSNLWGDTRRPHGDIYGINQALGATAKVITDPDILKTCVPDLSDK
:::::.::::::.::.::::.... .. : . : .::: :: :: ::::.
CCDS43 FLEGIAILNIPSMYGGTNLWGENKKNRAVIR-------ESRKGVTDPKELKFCVQDLSDQ
620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 RLEVVGLEGAIEMGQIYTKLKNAGRRLAKCSEITFHTTKTLPMQIDGEPWMQTPCTIKIT
:::::::::.::::::: ::.::::::.:. .:..:.: ::::.::::::: ::::::
CCDS43 LLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCASVTIRTNKLLPMQVDGEPWMQPCCTIKIT
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720 730
pF1KB5 HKNQMPMLMGPPPRSTNFFGFLS
:::: ::.:::: .:. ::..
CCDS43 HKNQAPMMMGPPQKSS-FFSLRRKSRSKD
730 740 750
>>CCDS47547.1 DGKB gene_id:1607|Hs108|chr7 (804 aa)
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Smith-Waterman score: 2893; 56.2% identity (76.8% similar) in 767 aa overlap (29-730:31-791)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAKERGLISPSDFAQLQKYMEYSTKKVSDVLKLFE-DGEMAKY-------VQGDAIGY
:::. :. .: .::: . ...: .
CCDS47 MTNQEKWAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KB5 EGFQQFLKIYLEVDNVPRHLSLALFQSFET------------------GHCLNETNVTK-
:::. :.: .::.. .: .. ::.:: . : .:. .:
CCDS47 EGFKLFMKTFLEAE-LPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAITPP
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB5 -----------DVVCLNDVSCYFSLLEGGRPEDKLEFTFKLYDTDRNGILDSSEVDKIIL
.:. :.:. ::.:::: ::::::::: :.::::: ::.:::::...::
CCDS47 RTTSPANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIIS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 QMMRVAEYLDWDVSELRPILQEMMKEIDYDGSGSVSQAEWVRAGATTVPLLVLLGLEMTL
:::.:::::.:::.:: :::.:::.::::: .:.:: ::...: ::.::::::::: ..
CCDS47 QMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNV
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB5 KDDGQHMWRPKRFPRPVYCNLCESS-IGLGKQGLSCNLCKYTVHDQCAMKALPCEVSTYA
::::::.:: :.: .:.::::: . ::.::::: :..::::::..:. .: : ..::.
CCDS47 KDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYV
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
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CCDS11 FCDCCGLRVDEGCLRKADKRFQCKEIMLKNDTKVLDAMPHHWIRGNVPLCSYCMVCKQQC
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CCDS11 GCQPKLCDYRCIWCQKTVHDECMKNSLKNEKCDFGEFKNLIIPPSYL-TSI---NQMRKD
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CCDS11 KKTDYEVL---------ASKLG--KQWTPLIILANSRSGTNMGEGLLGEFRILLNPVQVF
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CCDS11 DVTKTPPIKALQLCTLLPYYSARVLVCGGDGTVGWVLDAVDDMKIKGQEKYIPQVAVLPL
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CCDS11 GTGNDLSNTLGWGTGYAGEIPVAQVLRNVMEADGIKLDRWKVQVTNKGYYNLRKPKEFTM
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CCDS11 -NNYFSVGPDALMALNFHAHREKAPSLFSSRILNKAVYLFYGTKDCLVQECKDLNKKVEL
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CCDS11 ELDGERVALP--SLEGIIVLNIGYWGGGCRLW--------------EGMGDETYPLARHD
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CCDS11 ----------DGLLEVVGVYGSFHCAQIQVKLANP-FRIGQAHTVRLILKCSMMPMQVDG
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CCDS11 EPWAQGPCTVTITHKTHAMMLYFSGEQTDDDISSTSDQEDIKATE
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CCDS55 APPPPTPGAPCSESERQIRSTVDWSESATYGEHIW----FETNVSGDFCYVGEQYCVARM
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CCDS55 LQKSVSRRKCAACKIVVHTPC-IEQLE-KINFRCKPSFRESGSRN---VREG--------
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CCDS55 FQQKFT-FHSKEIVAISCSWCKQAYHSKVSCFMLQQIEEPCSLGVHAAVVIPPTWILRAR
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CCDS55 RPQNTLKASKKKKRASFKRKSSKKGPEEGRWRPFIIRPTPSPLMKPLLVFVNPKSGGNQG
230 240 250 260 270 280
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CCDS55 AKIIQSFLWYLNPRQVFDLSQGGPKEALEMYRKVHNLRILACGGDGTVGWILSTLDQLRL
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CCDS55 KPPPPVAILPLGTGNDLARTLNWGGGYTDEPVSKILSHVEEGNVVQLDRWDLHAEPNPEA
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CCDS55 GPEDRDEGATDRLPLDVFNNYFSLGFDAHVTLEFHESREANPEKFNSRFRNKMFYAGTAF
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CCDS55 SDFLMGSSKDLAKHIRV-VCDG-MDLTPKIQDLKPQCVVFLNIPRYCAGTMPWGHPGEHH
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