FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5736, 736 aa 1>>>pF1KB5736 736 - 736 aa - 736 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4018+/-0.0011; mu= -3.7374+/- 0.067 mean_var=465.1494+/-94.524, 0's: 0 Z-trim(116.5): 13 B-trim: 192 in 1/53 Lambda= 0.059467 statistics sampled from 17102 (17112) to 17102 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16 Scan time: 4.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11091.1 DVL2 gene_id:1856|Hs108|chr17 ( 736) 5032 446.4 7.4e-125 CCDS3253.1 DVL3 gene_id:1857|Hs108|chr3 ( 716) 3228 291.6 2.8e-78 CCDS81252.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 ( 695) 2539 232.5 1.7e-60 CCDS22.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 ( 670) 1682 158.9 2.3e-38 >>CCDS11091.1 DVL2 gene_id:1856|Hs108|chr17 (736 aa) initn: 5032 init1: 5032 opt: 5032 Z-score: 2355.0 bits: 446.4 E(32554): 7.4e-125 Smith-Waterman score: 5032; 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60.5% identity (78.5% similar) in 744 aa overlap (11-736:1-695) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAGSSTGGGGVGETKVIYHLDEEETPYLVKIPVPAERITLGDFKSVLQ-RPAGA-KYFFK ..:::.:::.::::::::::.:: ::.::.:::.::. ::. : :.::: CCDS81 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 SMDQDFGVVKEEISDDNARLPCFNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLP ::::::::::::: ::::.::::::::::::: ... . . . . ...: :: CCDS81 SMDQDFGVVKEEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPL---- 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 PLPPERTSGIGDSRPPSFHPNVSSSHENLEPETETESVVSLRRERPRRRDSSEHGAGGHR :::.::::::::::::::.::..... :: :::.:: :::: :::. : . : CCDS81 ----ERTGGIGDSRPPSFHPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAA----R 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 TGGPSRLERHL-AGY--ESSSTLMTSELESTSLGDSDEEDTMSRFSSSTEQSSASRLLKR :.: : .:. .: .:.:: ..:::::.:. ::::. . ::.:::::::..:::... CCDS81 TNGHPRGDRRRDVGLPPDSASTALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRK 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 H-RRRRKQRPPRLERTSSFSSVTDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGI : ::::::: . .:.:::::.:::::::::.:::::::...:::::::::::.:::::: CCDS81 HKRRRRKQRLRQADRASSFSSITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGI 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 YIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKC ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:: . ::: :::::: CCDS81 YIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKC 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 WDPSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGS--SSMSTITSGSSLPDGC :::.:..:::.:: .:..:::::::.::.:::::..: : : :: : ::.::: .. 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CCDS81 SSGTSDQDTLAPLPHPAAPWPLGQGYPYQYPGPPPCFP--PAYQD-PGFSYGSGSTGSQQ 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 SEGSRSSGSTRSDGGAGRTGRPEERAPESKSGSGSESE---PSSRGGSLRRGGEASGTSD ::::.:::::::. : :: .:: . .::::::. ::. :.: :. :. : CCDS81 SEGSKSSGSTRSSRRA--PGREKERRAAGAGGSGSESDHTAPSGVGSSWRER-PAGQLSR 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 GGPPPSRGSTGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGAP :. : :..:. . ::: ::: : . ..:. :: :.: CCDS81 GSSPRSQASATA-------PGL----PPPH---PTTKAYTVVGGPP-----------GGP 630 640 650 660 710 720 730 pF1KB5 PVRDLGSVPPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM :::.:..::::::.:::::. ::::: :::::.: CCDS81 PVRELAAVPPELTGSRQSFQKAMGNPCEFFVDIM 670 680 690 >>CCDS22.1 DVL1 gene_id:1855|Hs108|chr1 (670 aa) initn: 1782 init1: 1135 opt: 1682 Z-score: 802.2 bits: 158.9 E(32554): 2.3e-38 Smith-Waterman score: 2644; 59.9% identity (77.7% similar) in 736 aa overlap (11-736:1-670) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MAGSSTGGGGVGETKVIYHLDEEETPYLVKIPVPAERITLGDFKSVLQ-RPAGA-KYFFK ..:::.:::.::::::::::.:: ::.::.:::.::. ::. : :.::: CCDS22 MAETKIIYHMDEEETPYLVKLPVAPERVTLADFKNVLSNRPVHAYKFFFK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 SMDQDFGVVKEEISDDNARLPCFNGRVVSWLVSSDNPQPEMAPPVHEPRAELAPPAPPLP ::::::::::::: ::::.::::::::::::: ... . . . . ...: :: CCDS22 SMDQDFGVVKEEIFDDNAKLPCFNGRVVSWLVLAEGAHSDAGSQGTDSHTDLPPPL---- 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 PLPPERTSGIGDSRPPSFHPNVSSSHENLEPETETESVVSLRRERPRRRDSSEHGAGGHR :::.::::::::::::::.::..... :: :::.:: :::: :::. : . : CCDS22 ----ERTGGIGDSRPPSFHPNVASSRDGMDNETGTESMVSHRRERARRRNREEAA----R 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 TGGPSRLERHL-AGY--ESSSTLMTSELESTSLGDSDEEDTMSRFSSSTEQSSASRLLKR :.: : .:. .: .:.:: ..:::::.:. ::::. . ::.:::::::..:::... CCDS22 TNGHPRGDRRRDVGLPPDSASTALSSELESSSFVDSDEDGSTSRLSSSTEQSTSSRLIRK 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 H-RRRRKQRPPRLERTSSFSSVTDSTMSLNIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGI : ::::::: . .:.:::::.:::::::::.:::::::...:::::::::::.:::::: CCDS22 HKRRRRKQRLRQADRASSFSSITDSTMSLNIVTVTLNMERHHFLGISIVGQSNDRGDGGI 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 YIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDMNFENMSNDDAVRVLRDIVHKPGPIVLTVAKC ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:: . ::: :::::: CCDS22 YIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVAKC 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 WDPSPQAYFTLPRNEPIQPIDPAAWVSHSAALTGTFPAYPGSSSMSTITSGSSLPDGCEG :::.:..:::.:: .:..:::::::.::.:::::..: : : CCDS22 WDPTPRSYFTVPRADPVRPIDPAAWLSHTAALTGALPRYE-----------------LEE 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 RGLSVHTDMASVTKAMAAPESGLEVRDRMWLKITIPNAFLGSDVVDWLYHHVEGFPERRE :.:..::..:...: :.::::.:::::::::: :: .:.::::::: ::::: :::: CCDS22 APLTVKSDMSAVVRVMQLPDSGLEIRDRMWLKITIANAVIGADVVDWLYTHVEGFKERRE 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 ARKYASGLLKAGLIRHTVNKITFSEQCYYVFGDLSGGCESYLVNLSLNDNDGSSGASDQD ::::::.::: :..:::::::::::::::::::: : : :..:.::. ::::.:::: CCDS22 ARKYASSLLKHGFLRHTVNKITFSEQCYYVFGDL---C-SNLATLNLNS--GSSGTSDQD 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 TLAPLPG-ATPWPLLPTFSYQYPAPHPYSPQPPPYHELSSYTYGGGSASSQHSEGSRSSG :::::: :.:::: . ::::.: : : : :.. ...::.::..::.::::.::: CCDS22 TLAPLPHPAAPWPLGQGYPYQYPGPPPCFP--PAYQD-PGFSYGSGSTGSQQSEGSKSSG 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 STRSDGGAGRTGRPEERAPESKSGSGSESE---PSSRGGSLRRGGEASGTSDGGPPPSRG ::::. : :: .:: . .::::::. ::. :.: :. :. : :. : :.. CCDS22 STRSSRRA--PGREKERRAAGAGGSGSESDHTAPSGVGSSWRER-PAGQLSRGSSPRSQA 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 STGGAPNLRAHPGLHPYGPPPGMALPYNPMMVVMMPPPPPPVPPAVQPPGAPPVRDLGSV :. . ::: ::: : . ..:. :: :.::::.:..: CCDS22 SATA-------PGL----PPPH---PTTKAYTVVGGPP-----------GGPPVRELAAV 610 620 630 640 720 730 pF1KB5 PPELTASRQSFHMAMGNPSEFFVDVM :::::.:::::. ::::: :::::.: CCDS22 PPELTGSRQSFQKAMGNPCEFFVDIM 650 660 670 736 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 15:21:00 2016 done: Sat Nov 5 15:21:01 2016 Total Scan time: 4.590 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]