Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5737
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5737, 795 aa
1>>>pF1KB5737 795 - 795 aa - 795 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9305+/-0.000891; mu= 14.8605+/- 0.054
mean_var=134.9115+/-27.018, 0's: 0 Z-trim(111.1): 50 B-trim: 132 in 1/51
Lambda= 0.110420
statistics sampled from 12099 (12149) to 12099 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 5236 845.9 0
CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 2916 476.1 5.9e-134
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 1792 297.3 6.8e-80
CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 1015 173.4 1.1e-42
CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 1015 173.4 1.1e-42
CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 1015 173.5 1.2e-42
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 641 113.9 1.1e-24
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 634 112.5 1.4e-24
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 634 112.6 1.4e-24
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 627 111.4 3e-24
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 622 110.7 5.4e-24
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 620 110.6 1.2e-23
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 598 106.8 6.8e-23
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 598 106.8 7.8e-23
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 584 104.6 3.3e-22
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 584 104.6 3.5e-22
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 578 103.8 1.1e-21
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 578 103.8 1.1e-21
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 578 103.9 1.2e-21
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 571 102.5 1.5e-21
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 543 98.4 6.3e-20
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 526 95.5 3e-19
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 471 87.0 2.3e-16
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 466 86.2 4.2e-16
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 464 85.8 4.6e-16
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 464 85.9 4.7e-16
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 448 83.0 1.3e-15
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 446 82.7 1.7e-15
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 437 81.2 4.5e-15
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 422 78.8 2.2e-14
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 422 78.9 2.7e-14
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 422 78.9 2.8e-14
CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 412 77.4 9.7e-14
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 406 76.3 1.3e-13
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 403 75.9 2.4e-13
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 390 73.6 6.3e-13
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 381 72.4 2.6e-12
CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 381 72.5 3e-12
>>CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 (795 aa)
initn: 5236 init1: 5236 opt: 5236 Z-score: 4513.0 bits: 845.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5236; 100.0% identity (100.0% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAVLLLLLRALRRGPGPGPRPLWGPGPAWSPGFPARPGRGRPYMASRPPGDLAEAGGRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAVLLLLLRALRRGPGPGPRPLWGPGPAWSPGFPARPGRGRPYMASRPPGDLAEAGGRAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QSLQLRLLTPTFEGINGLLLKQHLVQNPVRLWQLLGGTFYFNTSRLKQKNKEKDKSKGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSLQLRLLTPTFEGINGLLLKQHLVQNPVRLWQLLGGTFYFNTSRLKQKNKEKDKSKGKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PEEDEEERRRRERDDQMYRERLRTLLVIAVVMSLLNALSTSGGSISWNDFVHEMLAKGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PEEDEEERRRRERDDQMYRERLRTLLVIAVVMSLLNALSTSGGSISWNDFVHEMLAKGEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEAKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEAKDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IPVSYKRTGFFGNALYSVGMTAVGLAILWYVFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTIVDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IPVSYKRTGFFGNALYSVGMTAVGLAILWYVFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTIVDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARARAPCIVYIDEIDAVGKKRSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARARAPCIVYIDEIDAVGKKRSTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MSGFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDGALMRPGRLDRHVFIDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSGFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDGALMRPGRLDRHVFIDLP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TLQERREIFEQHLKSLKLTQSSTFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TLQERREIFEQHLKSLKLTQSSTFYSQRLAELTPGFSGADIANICNEAALHAAREGHTSV
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550 560 570 580 590 600
pF1KB5 HTLNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQKVVAFHESGHALVGWMLEHTEAVMKVSITPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HTLNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQKVVAFHESGHALVGWMLEHTEAVMKVSITPRT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEALSFNEVTSGAQDDLRKVTRIAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEALSFNEVTSGAQDDLRKVTRIAYS
610 620 630 640 650 660
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pF1KB5 MVKQFGMAPGIGPISFPEAQEGLMGIGRRPFSQGLQQMMDHEARLLVAKAYRHTEKVLQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MVKQFGMAPGIGPISFPEAQEGLMGIGRRPFSQGLQQMMDHEARLLVAKAYRHTEKVLQD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 NLDKLQALANALLEKEVINYEDIEALIGPPPHGPKKMIAPQRWIDAQREKQDLGEEETEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NLDKLQALANALLEKEVINYEDIEALIGPPPHGPKKMIAPQRWIDAQREKQDLGEEETEE
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB5 TQQPPLGGEEPTWPK
:::::::::::::::
CCDS10 TQQPPLGGEEPTWPK
790
>>CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 (489 aa)
initn: 2916 init1: 2916 opt: 2916 Z-score: 2518.5 bits: 476.1 E(32554): 5.9e-134
Smith-Waterman score: 2916; 100.0% identity (100.0% similar) in 442 aa overlap (1-442:1-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAVLLLLLRALRRGPGPGPRPLWGPGPAWSPGFPARPGRGRPYMASRPPGDLAEAGGRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAVLLLLLRALRRGPGPGPRPLWGPGPAWSPGFPARPGRGRPYMASRPPGDLAEAGGRAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QSLQLRLLTPTFEGINGLLLKQHLVQNPVRLWQLLGGTFYFNTSRLKQKNKEKDKSKGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QSLQLRLLTPTFEGINGLLLKQHLVQNPVRLWQLLGGTFYFNTSRLKQKNKEKDKSKGKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PEEDEEERRRRERDDQMYRERLRTLLVIAVVMSLLNALSTSGGSISWNDFVHEMLAKGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PEEDEEERRRRERDDQMYRERLRTLLVIAVVMSLLNALSTSGGSISWNDFVHEMLAKGEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEAKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKFEEKLRAAEDELNIEAKDR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IPVSYKRTGFFGNALYSVGMTAVGLAILWYVFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTIVDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IPVSYKRTGFFGNALYSVGMTAVGLAILWYVFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTIVDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFVDYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAK
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 AVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARARAPCIVYIDEIDAVGKKRSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARARAPCIVYIDEIDAVGKKRSTT
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pF1KB5 MSGFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRADILDGALMRPGRLDRHVFIDLP
::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSGFSNTEEEQTLNQLLVEMDGASLDQLPSQGTMRKLRGKTPACSCLTEPTGSRRAMEGH
430 440 450 460 470 480
>>CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 (797 aa)
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Smith-Waterman score: 1792; 45.6% identity (74.5% similar) in 671 aa overlap (134-790:139-794)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 SRLKQKNKEKDKSKGKAPEEDEEERRRRERDDQMYRER-LRTLLVIAVVMSLLNALSTSG
::. .: : : : . :: : :. ::
CCDS11 GGGGGGGGKRGGKKDDSHWWSRFQKGDIPWDDKDFRMFFLWTALFWGGVMFYL-LLKRSG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 GSISWNDFVHEMLAKGEVQRVQVVPESDVVEVYLHPGAVVFGRPRLALMYRMQVANIDKF
:.:.:::...:.:: :.:..:: . :.: . :: . : . . ......: :
CCDS11 REITWKDFVNNYLSKGVVDRLEVVNKR-FVRVTFTPGKT----PVDGQYVWFNIGSVDTF
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 EEKLRAAEDELNIEAKDRIPVSYKRTGFFGNALYSVGMTAVGLAILWYVFRL--AGMTGR
:..:.. ..::.::...:.:: : . :. : :. :.. .:.: :..: ::. ::
CCDS11 ERNLETLQQELGIEGENRVPVVYIAESD-GSFLLSMLPTVLIIAFLLYTIRRGPAGI-GR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB5 EG-GFSAFNQLKMARFTIVDGKMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFVDYLKSPERFLQLGA
: :.... .. . .. .. :.:::::: .:::::. :::..::.:... .:::
CCDS11 TGRGMGGLFSVGETTAKVLKDEI--DVKFKDVAGCEEAKLEIMEFVNFLKNPKQYQDLGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 KVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGLGAARVRSLFKEARA
:.::::.: :::: ::::::::.: ::.:::....: ::.:.. :.: ::::.:: ::
CCDS11 KIPKGAILTGPPGTGKTLLAKATAGEANVPFITVSGSEFLEMFVGVGPARVRDLFALARK
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 RAPCIVYIDEIDAVGKKRSTTMSGFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMGTTDHVIVLASTNRAD
::::..::::::::.::. : ...:.:.:::::::::::..:: .:..::.::: :
CCDS11 NAPCILFIDEIDAVGRKRGRGNFG-GQSEQENTLNQLLVEMDGFNTTTNVVILAGTNRPD
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 ILDGALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKL--TQSSTFYSQRLAELTPGFS
::: ::.::::.::..:: : .. : ::. ::. ::: : . ...:: ::::::
CCDS11 ILDPALLRPGRFDRQIFIGPPDIKGRASIFKVHLRPLKLDSTLEKDKLARKLASLTPGFS
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 GADIANICNEAALHAAREGHTSVHTLNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQKVVAFHESG
:::.::.:::::: :::. :.. .:: :.:::..: ::...:. ::.:.::.::.:
CCDS11 GADVANVCNEAALIAARHLSDSINQKHFEQAIERVIGGLEKKTQVLQPEEKKTVAYHEAG
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 HALVGWMLEHTEAVMKVSITPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRASEA
::..::.:::.. ..:::: :: . .::.::.::..:.:.:::::..::::.::::.::
CCDS11 HAVAGWYLEHADPLLKVSIIPR-GKGLGYAQYLPKEQYLYTKEQLLDRMCMTLGGRVSEE
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 LSFNEVTSGAQDDLRKVTRIAYSMVKQFGMAPGIGPISFPEAQEGLMGIGRRPFSQGLQQ
. :...:.::::::::::. ::... :::: .: ::: ..: : . ..:.:.. .
CCDS11 IFFGRITTGAQDDLRKVTQSAYAQIVQFGMNEKVGQISFDLPRQGDM-VLEKPYSEATAR
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 MMDHEARLLVAKAYRHTEKVLQDNLDKLQALANALLEKEVINYEDIEALIGPPPHGPK--
..: :.:.:. ::..: .: .. .. .: ::::::.. .:. :.:: : . :
CCDS11 LIDDEVRILINDAYKRTVALLTEKKADVEKVALLLLEKEVLDKNDMVELLGPRPFAEKST
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790
pF1KB5 --KMIAPQRWIDAQREK----QDLGEEETEETQQPPLGGEEPTWPK
... .: . .: ..:. .: ..:: ::.
CCDS11 YEEFVEGTGSLDEDTSLPEGLKDWNKEREKEKEEPP--GEKVAN
760 770 780 790
>>CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 (683 aa)
initn: 913 init1: 470 opt: 1015 Z-score: 879.8 bits: 173.4 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 1076; 38.6% identity (73.5% similar) in 456 aa overlap (296-747:236-675)
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 AILWYVFRLAGMTGREGGFSAFNQLKMARFTIVDGKMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFV
. :: . :.:.:. : :..::: :..: :
CCDS58 ILFVLLLFGIYGLLKNPFLSVRFRTTTGLDSAVDPVQMKNVTFEHVKGVEEAKQELQEVV
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 DYLKSPERFLQLGAKVPKGALLLGPPGCGKTLLAKAVATEAQVPFLAMAGPEFVEVIGGL
..::.:..: ::.:.::: ::.:::: ::::::.::: ::.::: .: :: :.. :.
CCDS58 EFLKNPQKFTILGGKLPKGILLVGPPGTGKTLLARAVAGEADVPFYYASGSEFDEMFVGV
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 GAARVRSLFKEARARAPCIVYIDEIDAVGKKR-STTMSGFSNTEEEQTLNQLLVEMDGMG
::.:.:.::.::.: :::...:::.:.:: :: . : .: .::.::::.::::.
CCDS58 GASRIRNLFREAKANAPCVIFIDELDSVGGKRIESPMHPYS----RQTINQLLAEMDGFK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 TTDHVIVLASTNRADILDGALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTQSSTF
.. ::....:: . ::.::.::::.: .: . : .. : ::.. .:...:. ::
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CCDS58 EIQIVLEGKKLEVR
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CCDS71 EIQIVLEGKKLEVR
710
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CCDS71 NKNKTITAYHESGHAIIAYYTKDAMPINKATIMPR-GPTLGHVSLLPENDRWNETRAQLL
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CCDS71 EIQIVLEGKKLEVR
760 770
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CCDS56 MAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSG-GDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMAT
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CCDS56 NRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINL--RKIAELMPG
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CCDS56 ASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK
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pF1KB5 SGHALVGWMLEHTEAVMKVSITPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRAS
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CCDS11 RNDSYTLHKILPNKVDPLVSLMMVEKVPDSTYEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFE
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CCDS11 ALGIAQPKGVLLYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCTFIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFV
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CCDS11 MAREHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSG-GDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMAT
240 250 260 270 280 290
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pF1KB5 NRADILDGALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTQSSTFYSQRLAELTPG
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CCDS11 NRIDILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGINL--RKIAELMPG
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pF1KB5 FSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTLNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQKVVAFHE
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CCDS11 ASGAEVKGVCTEAGMYALRERRVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK
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pF1KB5 SGHALVGWMLEHTEAVMKVSITPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRAS
>>CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 (403 aa)
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pF1KB5 GMTGREGGFSAFNQLKMARFTIVDGKMGKGVSFKDVAGMHEAKLEVREFVDY-LKSPERF
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CCDS97 LDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIELPLTNPELF
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CCDS97 QRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGESARLIREMF
180 190 200 210 220 230
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CCDS97 NYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTS-ADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMIMA
240 250 260 270 280 290
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TNRADILDGALMRPGRLDRHVFIDLPTLQERREIFEQHLKSLKLTQSSTFYSQRLAELTP
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CCDS97 TNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIH--AGPITKHGEIDYEAIVKLSD
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pF1KB5 GFSGADIANICNEAALHAAREGHTSVHTLNFEYAVERVLAGTAKKSKILSKEEQKVVAFH
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CCDS97 GFNGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKV----ADSKKLESKLDYKPV
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pF1KB5 ESGHALVGWMLEHTEAVMKVSITPRTNAALGFAQMLPRDQHLFTKEQLFERMCMALGGRA
795 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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