FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5746, 746 aa
1>>>pF1KB5746 746 - 746 aa - 746 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3834+/-0.000809; mu= 19.7080+/- 0.049
mean_var=62.8348+/-12.654, 0's: 0 Z-trim(106.2): 23 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.161798
statistics sampled from 8825 (8847) to 8825 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 3.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14328.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX ( 746) 4990 1173.7 0
CCDS48115.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX ( 816) 4990 1173.7 0
CCDS14137.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX ( 760) 4080 961.3 0
CCDS75208.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 791) 4042 952.4 0
CCDS34101.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 818) 4042 952.4 0
CCDS34100.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 866) 3954 931.9 0
CCDS59159.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX ( 666) 3670 865.5 0
CCDS58932.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 ( 791) 2602 616.3 5.9e-176
CCDS54692.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 869) 706 173.7 1.1e-42
CCDS3263.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 898) 706 173.7 1.1e-42
CCDS5881.1 CLCN1 gene_id:1180|Hs108|chr7 ( 988) 705 173.5 1.4e-42
CCDS54690.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 854) 704 173.2 1.5e-42
CCDS41269.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 686) 529 132.4 2.4e-30
CCDS167.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 687) 529 132.4 2.4e-30
CCDS168.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1 ( 687) 528 132.1 2.8e-30
CCDS57973.1 CLCNKA gene_id:1187|Hs108|chr1 ( 644) 524 131.2 5.1e-30
CCDS54691.1 CLCN2 gene_id:1181|Hs108|chr3 ( 881) 513 128.7 4e-29
CCDS45378.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 781) 478 120.5 1e-26
CCDS32361.1 CLCN7 gene_id:1186|Hs108|chr16 ( 805) 478 120.5 1.1e-26
CCDS57974.1 CLCNKB gene_id:1188|Hs108|chr1 ( 517) 313 81.9 2.8e-15
>>CCDS14328.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX (746 aa)
initn: 4990 init1: 4990 opt: 4990 Z-score: 6285.4 bits: 1173.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4990; 100.0% identity (100.0% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 SWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFNDCGLLDSSKLCDYENRFNTSKGGELPDRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFNDCGLLDSSKLCDYENRFNTSKGGELPDRPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 QEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 AAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEFAHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEFAHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 DSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIENARKKQDGVVSTSII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIENARKKQDGVVSTSII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 YFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLL
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 GIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
730 740
>>CCDS48115.1 CLCN5 gene_id:1184|Hs108|chrX (816 aa)
initn: 4990 init1: 4990 opt: 4990 Z-score: 6284.8 bits: 1173.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4990; 100.0% identity (100.0% similar) in 746 aa overlap (1-746:71-816)
10 20 30
pF1KB5 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SMRDDVPPLDREVGEDKSYNGGGIGSSNRIMDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDR
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 DRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGIC
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 TGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLF
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGK
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVS
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGG
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFN
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 DCGLLDSSKLCDYENRFNTSKGGELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DCGLLDSSKLCDYENRFNTSKGGELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKI
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 PSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PSGLFIPSMAVGAIAGRLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAAC
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 LGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFL
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 EAKEEFAHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EAKEEFAHKTLAMDVMKPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQR
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 LVGFVLRRDLIISIENARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LVGFVLRRDLIISIENARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTV
710 720 730 740 750 760
700 710 720 730 740
pF1KB5 TDLTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TDLTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
770 780 790 800 810
>>CCDS14137.1 CLCN4 gene_id:1183|Hs108|chrX (760 aa)
initn: 4081 init1: 2293 opt: 4080 Z-score: 5137.3 bits: 961.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4080; 78.2% identity (94.2% similar) in 747 aa overlap (1-746:14-760)
10 20 30 40
pF1KB5 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDRDRHREITNKSKESTWAL
::::.::.: ::::.::.::::.:::::: ::::.::.::::: : .
CCDS14 MVNAGAMSGSGNLMDFLDEPFPDVGTYEDFHTIDWLREKSRDTDRHRKITSKSKESIWEF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 IHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGICTGGFWFNHEHCCWNSEH
:.:. ::.:::..:::::::.:.:::.::... ::::::::.: ..::..::.:::.:..
CCDS14 IKSLLDAWSGWVVMLLIGLLAGTLAGVIDLAVDWMTDLKEGVCLSAFWYSHEQCCWTSNE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 VTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLFAFLAVSLVKVFAPYACG
.:::.::::: :..::.:... .::: :::.::.::.::::::::::::::.::::::::
CCDS14 TTFEDRDKCPLWQKWSELLVNQSEGASAYILNYLMYILWALLFAFLAVSLVRVFAPYACG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNILCH
::::::::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::::::::::::::::..
CCDS14 SGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLLIKTVTLVLVVSSGLSLGKEGPLVHVACCCGNFFSS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 CFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV
:.:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFSKYSKNEGKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVSYYFPLKTLWRSFFAALV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGGLWGALFIRTNIAWCRKR
::::::::::::::::::::::.::::.. :: ::::::.::::::.:::: ::::::.:
CCDS14 AAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYMAELFPFILLGVFGGLWGTLFIRCNIAWCRRR
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFNDCGLLDSSKLCDYENRF
:::.::::::.::.::::::::.:.:: :::.:::::::::::::: :.::.:::: :
CCDS14 KTTRLGKYPVLEVIVVTAITAIIAYPNPYTRQSTSELISELFNDCGALESSQLCDYINDP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 NTSKG-GELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAG
: .. ..::::::::::.:::::::.::.:::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMTRPVDDIPDRPAGVGVYTAMWQLALALIFKIVVTIFTFGMKIPSGLFIPSMAVGAIAG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 RLLGVGMEQLAYYHQEWTVFNSWCSQGADCITPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMF
:..:.:.:::::.:..: .: .:: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RMVGIGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 ELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPFLEAKEEFAHKTLAMDVM
::::::::::::::::.::::::::.:.::::.:::.:::::::..:.::.:.::: :::
CCDS14 ELTGGLEYIVPLMAAAVTSKWVADAFGKEGIYEAHIHLNGYPFLDVKDEFTHRTLATDVM
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 KPRRNDPLLTVLTQDSMTVEDVETIISETTYSGFPVVVSRESQRLVGFVLRRDLIISIEN
.:::..: :.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:.::.::. ::.::..:.:
CCDS14 RPRRGEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKN
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ARKKQDGVVSTSIIYFTEHSPPLPPYTPPTLKLRNILDLSPFTVTDLTPMEIVVDIFRKL
::..:.:.::.::.::::. : :: .: :::: ::.:::::::: :::: ::::::::
CCDS14 ARQRQEGIVSNSIMYFTEEPPELPANSPHPLKLRRILNLSPFTVTDHTPMETVVDIFRKL
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740
pF1KB5 GLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
::::::::..:::::::::::::.:.::::::::.::.::
CCDS14 GLRQCLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
730 740 750 760
>>CCDS75208.1 CLCN3 gene_id:1182|Hs108|chr4 (791 aa)
initn: 4045 init1: 2262 opt: 4042 Z-score: 5089.1 bits: 952.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4042; 76.7% identity (94.0% similar) in 747 aa overlap (1-746:45-791)
10 20 30
pF1KB5 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDR
.:.:.::::::::::::.:::::::: .::
CCDS75 GDSIPLRELHKRGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDFHTIDWVREKCKDR
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 DRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGIC
.:::.:..:.:::.: . .:. ::.::::.. : :: ::.:::::::.: ::::::::::
CCDS75 ERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGIC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 TGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLF
...:.:::.:::.:...:::::::::.:..:..:::. :: .::.::.::..::: :
CCDS75 LSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSF
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::
CCDS75 AFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGK
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVS
::::::::::::::. . : :: ::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREVLSAASAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVS
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YYFPLKTLWRSFFAALVAAFTLRSINPFGNSRLVLFYVEFHTPWHLFELVPFILLGIFGG
::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::.:::
CCDS75 YYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELFPFILLGVFGG
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LWGALFIRTNIAWCRKRKTTQLGKYPVIEVLVVTAITAILAFPNEYTRMSTSELISELFN
::::.:::.::::::.::.:..:::::.::..:.::::..:::: :::..:::::.:::.
CCDS75 LWGAFFIRANIAWCRRRKSTKFGKYPVLEVIIVAAITAVIAFPNPYTRLNTSELIKELFT
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440
pF1KB5 DCGLLDSSKLCDYENRFNTSKG-GELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMK
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570 580 590 600 610 620
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:.:::::.: ::: :::.:::::: :.:::::.:::.:.:..:.::.:.::::..:.:::
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630 640 650 660 670 680
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10 20 30
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CCDS34 RLVGFALRRDLTIAIESARKKQEGIVGSSRVCFAQHTPSLPAESPRPLKLRSILDMSPFT
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pF1KB5 VTDLTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGRLLGIITKKDVLKHIAQMANQDPDSILFN
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CCDS34 VTDHTPMEIVVDIFRKLGLRQCLVTHNGIVLGIITKKNILEHLEQLKQHVEPLAPPWHYN
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CCDS34 KKRYPPAYGPDGKPRPRFNNVQLNLTDEEREETEEEVYLLNSTTL
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::::::.::.::::::::.:.:: :::.:::::::::::::: :.::.:::: : : ..
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.:.:::::.:..: .: .:: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IGVEQLAYHHHDWIIFRNWCRPGADCVTPGLYAMVGAAACLGGVTRMTVSLVVIMFELTG
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::::::::::::.::::::::.:.::::.:::.:::::::..:.::.:.::: :::.:::
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..: :.::::::::::::::.:.:: :.::::::::.:.::.::. ::.::..:.:::..
CCDS59 GEPPLSVLTQDSMTVEDVETLIKETDYNGFPVVVSRDSERLIGFAQRRELILAIKNARQR
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CCDS59 CLVTRSGRLLGIITKKDVLRHMAQMANQDPESIMFN
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10 20 30
pF1KB5 MDFLEEPIPGVGTYDDFNTIDWVREKSRDR
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CCDS58 EDDNLLDGDTAVGTHYTMTNGGSINSSTHLLDLLDEPIPGVGTYDDFHTIDWVREKCKDR
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pF1KB5 DRHREITNKSKESTWALIHSVSDAFSGWLLMLLIGLLSGSLAGLIDISAHWMTDLKEGIC
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CCDS58 ERHRRINSKKKESAWEMTKSLYDAWSGWLVVTLTGLASGALAGLIDIAADWMTDLKEGIC
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pF1KB5 TGGFWFNHEHCCWNSEHVTFEERDKCPEWNSWSQLIISTDEGAFAYIVNYFMYVLWALLF
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CCDS58 LSALWYNHEQCCWGSNETTFEERDKCPQWKTWAELIIGQAEGPGSYIMNYIMYIFWALSF
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pF1KB5 AFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLVIKTITLVLAVSSGLSLGK
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CCDS58 AFLAVSLVKVFAPYACGSGIPEIKTILSGFIIRGYLGKWTLMIKTITLVLAVASGLSLGK
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pF1KB5 EGPLVHVACCCGNILCHCFNKYRKNEAKRREVLSAAAAAGVSVAFGAPIGGVLFSLEEVS
::::::::::::::. . : :: ::::.::: :
CCDS58 EGPLVHVACCCGNIFSYLFPKYSTNEAKKREV---------------------------S
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CCDS58 YYFPLKTLWRSFFAALVAAFVLRSINPFGNSRLVLFYVEYHTPWYLFELFPFILLGVFGG
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pF1KB5 DCGLLDSSKLCDYENRFNTSKG-GELPDRPAGVGVYSAMWQLALTLILKIVITIFTFGMK
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CCDS58 DCGPLESSSLCDYRNDMNASKIVDDIPDRPAGIGVYSAIWQLCLALIFKIIMTVFTFGIK
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CCDS58 VPSGLFIPSMAIGAIAGRIVGIAVEQLAYYHHDWFIFKEWCEVGADCITPGLYAMVGAAA
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pF1KB5 CLGGVTRMTVSLVVIMFELTGGLEYIVPLMAAAMTSKWVADALGREGIYDAHIRLNGYPF
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CCDS58 CLGGVTRMTVSLVVIVFELTGGLEYIVPLMAAVMTSKWVGDAFGREGIYEAHIRLNGYPF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]