FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5747, 807 aa 1>>>pF1KB5747 807 - 807 aa - 807 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3452+/-0.00091; mu= 11.2252+/- 0.055 mean_var=118.2029+/-24.290, 0's: 0 Z-trim(109.5): 103 B-trim: 277 in 1/52 Lambda= 0.117967 statistics sampled from 10842 (10948) to 10842 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16 Scan time: 4.240 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 5367 924.9 0 CCDS76191.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 783) 4303 743.8 2.6e-214 CCDS864.2 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 752) 3306 574.1 3e-163 CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 1355 242.0 2.8e-63 CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2 ( 460) 954 173.7 6.2e-43 CCDS47619.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 661) 867 159.0 2.4e-38 CCDS47620.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 650) 804 148.2 4.1e-35 CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 690 128.9 4.6e-29 CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 690 129.0 5.2e-29 CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 666 124.9 8.9e-28 CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 657 123.2 1.3e-27 CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 657 123.2 1.3e-27 CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 646 121.3 4.9e-27 CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 649 122.0 7.1e-27 CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 649 122.0 7.2e-27 CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 647 121.7 9e-27 CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 647 121.7 9e-27 CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 642 120.8 1.6e-26 CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 642 120.8 1.6e-26 CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 623 117.5 9.1e-26 CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 623 117.5 9.2e-26 CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 625 117.9 1.2e-25 CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 625 117.9 1.2e-25 CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 621 117.2 1.3e-25 CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 614 115.8 1.4e-25 CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 614 115.8 1.5e-25 CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 621 117.2 1.5e-25 CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 614 116.0 3.7e-25 CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 614 116.0 3.8e-25 CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 610 115.5 1.1e-24 CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 604 114.3 1.4e-24 CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 603 114.3 2.4e-24 CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 399) 577 109.5 1.1e-23 CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 737) 581 110.3 1.2e-23 CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 782) 581 110.3 1.3e-23 CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 465) 577 109.5 1.3e-23 CCDS6776.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9 ( 913) 581 110.3 1.5e-23 CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 584 111.0 1.6e-23 CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 584 111.0 1.6e-23 CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 580 110.2 1.7e-23 CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 584 111.0 1.9e-23 CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 584 111.0 2e-23 CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 889) 578 109.8 2e-23 CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 950) 578 109.8 2.1e-23 CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 979) 578 109.8 2.2e-23 CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 571 108.5 2.5e-23 CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 569 108.4 1.1e-22 CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 569 108.4 1.1e-22 CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 415) 552 105.3 2.2e-22 CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 561 107.0 2.4e-22 >>CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 (807 aa) initn: 5367 init1: 5367 opt: 5367 Z-score: 4939.4 bits: 924.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5367; 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93.1% identity (93.1% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-752) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 SVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 SVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 DYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDK :::::::::: CCDS86 DYTWMLLKDG-------------------------------------------------- 250 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 HSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 -----SQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSE 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 ISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAFPIVGEPLQKHQSLDLGSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 ISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAFPIVGEPLQKHQSLDLGSL 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 LFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRTKSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 LFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRTKSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSC 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 FVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENPYFSSW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 FVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENPYFSSW 430 440 450 460 470 480 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 PPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSLLNQES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 PPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSLLNQES 490 500 510 520 530 540 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 AVLATAPRIDDEIPPPLPVRTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTS ::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 AVLATAPRIDDEIPPPLPVWTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTS 550 560 570 580 590 600 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 EPKKFDDSVILRPSKSVKLRSPKSELHQDRSSPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 EPKKFDDSVILRPSKSVKLRSPKSELHQDRSSPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIET 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 YSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRSKSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQSNNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 YSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRSKSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQSNNS 670 680 690 700 710 720 790 800 pF1KB5 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI ::::::::::::::::::::::::::: CCDS86 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI 730 740 750 >>CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 (780 aa) initn: 1634 init1: 1318 opt: 1355 Z-score: 1249.5 bits: 242.0 E(32554): 2.8e-63 Smith-Waterman score: 1514; 37.7% identity (62.2% similar) in 831 aa overlap (1-805:1-779) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKIT----KEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIK :.: :::.::....:. : ...:: .:..:.: ::::...: :::...:: .:.: CCDS55 MEQVEILRKFIQRVQAMKSPDHNGEDNFARDFMRLRRLSTKYRTEKIYPTATGEKEENVK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 KNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRM :::::::::.:.:::.:.: : ..::.::::::::::::::::.::::::..:..::::: CCDS55 KNRYKDILPFDHSRVKLTLKTPSQDSDYINANFIKGVYGPKAYVATQGPLANTVIDFWRM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 IWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKV ::::.:.:::::: :.:::.::::::: :: . :.::..::: :. ..::.:::: . CCDS55 IWEYNVVIIVMACREFEMGRKKCERYWPLYGEDPITFAPFKISCEDEQARTDYFIRTLLL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 KFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGV .:..:.: .::::: ::::::::::.: ::..: .: ::: ..:::::::::::::::. CCDS55 EFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSILDMISLMRKYQEHEDVPICIHCSAGCGRTGA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 ICAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDV :::::::: ::: : :::.:.::.::.:::::: : :::.::::::. :. .::..:.. CCDS55 ICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEMRTQRHSAVQTKEQYELVHRAIAQLFEKQLQ- 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 IRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDF . . : :... : . : : ...: :. :. . : ::. . :.. CCDS55 LYEIH-GAQKIADG-VNEINTENMVSSIEPE--KQDSPPPK---PPRTRSCLVEGD---- 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 RTSEISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAF----PIVGEPLQKH :::: .:.: . .: . . ::. :: . :.. ... CCDS55 ------AKEE-ILQPPEPHPVPPILTPSPPSAFPTVTTV-WQDNDRYHPKPVLHMVSSEQ 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QSLDLGSLLFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRT--KSTPFELIQQRETKEVDSKENFS .: ::. . :: .. :. .. : . .. :: :.. .: .. . . CCDS55 HSADLNR------NYSKSTELPGKNESTIEQIDKKLERNLSFE-IKKVPLQEGPKSFDGN 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KB5 YLESQPHDSCFVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSAL--GVYSY : .. : .. ... . ... .: .. ..:. . : :. . : CCDS55 TLLNRGH-----AIKIKSASPCIADKISKPQELSSDLNVGDTSQNSCVDCSVTQSNKVSV 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 IPLVENPYFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSL--FSYYNSHDSLSL : :. :. :: ... :: :: : : : : .. . .: :: : . CCDS55 TP-PEESQNSDTPPR--PDRLPLD--EK--GHVTWSFHGPENAIPIPDLSEGNSSD---I 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 NSPTNIS-SLLNQESAVLATAPRIDDEIPPPLPVRTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSA : : . :: . .. . : .: . :: ::: :: .. . . . .: ... CCDS55 NYQTRKTVSLTPSPTTQVETPDLVDHDNTSPL-FRTPLSFTNPLHSDDSDSDERNSDGAV 560 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 pF1KB5 VKVKIGTSLEWGGTSEPKKFDDSVILRP--SKSVKLRSPKSELHQ------DRS-SPPPP .. : . : ..: .:. : :. .. . :. : : . ::: CCDS55 TQNKTNISTA-SATVSAATSTESISTRKVLPMSIARHNIAGTTHSGAEKDVDVSEDSPPP 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 pF1KB5 LPERTLESFFLADEDCMQAQSIETYSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRS-KSLKIL ::::: ::: ::.: ..: .: .... :.: :. : ... : . CCDS55 LPERTPESFVLASEHNTPVRS--EWSE-----LQSQERSEQK-KSEGLITSENEKCDHPA 680 690 700 710 720 760 770 780 790 800 pF1KB5 RNMKKSICNSCPPNKPAESVQ-SNNSSSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI ... .: :::. . : :.: . ..::.:: .::::::.:: : CCDS55 GGIHYEMCIECPPTFSDKREQISENPTEATDIGFGNRCGKPKGPRDPPSEWT 730 740 750 760 770 780 >>CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2 (460 aa) initn: 999 init1: 916 opt: 954 Z-score: 884.2 bits: 173.7 E(32554): 6.2e-43 Smith-Waterman score: 954; 46.1% identity (74.7% similar) in 297 aa overlap (24-319:26-318) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKN .:.:: .. :. .::: . :... .:.:..:: CCDS21 MSRSLDSARSFLERLEARGGREGAVLAGEFSDIQACSAAWKADGVCSTVAGSRPENVRKN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIW ::::.:::: .:: :::. . :.:::.:::.:: : ::::::::: :::::::..: CCDS21 RYKDVLPYDQTRVILSLLQEEGHSDYINGNFIRGVDGSLAYIATQGPLPHTLLDFWRLVW 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 EYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKR-KSDYIIRTLKVK :..: .:.::: : : :.:.::::::. : :. : : .. :: . : ..::::: CCDS21 EFGVKVILMACREIENGRKRCERYWAQEQE-PLQTGLFCITLIKEKWLNEDIMLRTLKVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 FNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVI :..:.:..::..: .:::. :::: : .: .. ..: : . :.:.:::::::::::. CCDS21 FQKESRSVYQLQYMSWPDRGVPSSPDHMLAMVEEARRLQGSGPEPLCVHCSAGCGRTGVL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 CAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVI :..::. .:: .:: .::.:... .:: :::. :::.:::...:..: ..: ... CCDS21 CTVDYVRQLLLTQMIPPDFSLFDVVLKMRKQRPAAVQTEEQYRFLYHTVAQMF---CSTL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 RDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFR .. .. ..: : . .: CCDS21 QNASPHYQNIKENCAPLYDDALFLRTPQALLAIPRPPGGVLRSISVPGSPGHAMADTYAV 300 310 320 330 340 350 >>CCDS47619.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 (661 aa) initn: 1114 init1: 866 opt: 867 Z-score: 801.8 bits: 159.0 E(32554): 2.4e-38 Smith-Waterman score: 1026; 34.0% identity (57.9% similar) in 712 aa overlap (116-805:1-660) 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 NANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAE :::::.:.:::::: :.:::.::::::: CCDS47 MIWEYNVVIIVMACREFEMGRKKCERYWPL 10 20 30 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 PGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPI :: . :.::..::: :. ..::.:::: ..:..:.: .::::: ::::::::::.: : CCDS47 YGEDPITFAPFKISCEDEQARTDYFIRTLLLEFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSI 40 50 60 70 80 90 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 LELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREM :..: .: ::: ..:::::::::::::::.:::::::: ::: : :::.:.::.::.:: CCDS47 LDMISLMRKYQEHEDVPICIHCSAGCGRTGAICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEM 100 110 120 130 140 150 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 RTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYS :::: : :::.::::::. :. .::..:.. . . : :... : . : : ...: CCDS47 RTQRHSAVQTKEQYELVHRAIAQLFEKQLQ-LYEIH-GAQKIADG-VNEINTENMVSSIE 160 170 180 190 200 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 PNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNY :. :. . : ::. . :.. :::: .:.: . .: . CCDS47 PE--KQDSPPPK---PPRTRSCLVEGD----------AKEE-ILQPPEPHPVPPILTPSP 210 220 230 240 250 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 SFDKNADTTMKWQTKAF----PIVGEPLQKHQSLDLGSLLFEGCSNSKPVNAAGRYFNSK . ::. :: . :.. ....: ::. . :: .. :. .. CCDS47 PSAFPTVTTV-WQDNDRYHPKPVLHMVSSEQHSADLNR------NYSKSTELPGKNESTI 260 270 280 290 300 450 460 470 480 490 pF1KB5 VPITRT--KSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSCFVEMQAQKVMHVSSAELNY : . .. :: :.. .: .. . . : .. : .. ... . ... CCDS47 EQIDKKLERNLSFE-IKKVPLQEGPKSFDGNTLLNRGH-----AIKIKSASPCIADKISK 310 320 330 340 350 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 SLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSAL--GVYSYIPLVENPYFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQ .: .. ..:. . : :. . : : :. :. :: ... :: :: CCDS47 PQELSSDLNVGDTSQNSCVDCSVTQSNKVSVTP-PEESQNSDTPPR--PDRLPLD--EK- 360 370 380 390 400 410 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 DGTVFPSSLLPTSSTSL--FSYYNSHDSLSLNSPTNIS-SLLNQESAVLATAPRIDDEIP : : : : .. . .: :: : .: : . :: . .. . : .: . CCDS47 -GHVTWSFHGPENAIPIPDLSEGNSSD---INYQTRKTVSLTPSPTTQVETPDLVDHDNT 420 430 440 450 460 620 630 640 650 660 670 pF1KB5 PPLPVRTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTSEPKKFDDSVILRP- :: ::: :: .. . . . .: ..... : . : . .: . .:. : CCDS47 SPL-FRTPLSFTNPLHSDDSDSDERNSDGAVTQNKTNISTASATVSAATS-TESISTRKV 470 480 490 500 510 520 680 690 700 710 720 pF1KB5 -SKSVKLRSPKSELHQ------DRS-SPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIETYSTSY :. .. . :. : : . :::::::: ::: ::.: .: : CCDS47 LPMSIARHNIAGTTHSGAEKDVDVSEDSPPPLPERTPESFVLASEH-------NTPVRSE 530 540 550 560 570 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 PDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRS-KSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQ-SNNSSSF . .... :.: :. : ... : . ... .: :::. . : :.: . CCDS47 WSELQSQERSEQK-KSEGLITSENEKCDHPAGGIHYEMCIECPPTFSDKREQISENPTEA 580 590 600 610 620 630 790 800 pF1KB5 LNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI ..::.:: .::::::.:: : CCDS47 TDIGFGNRCGKPKGPRDPPSEWT 640 650 660 >>CCDS47620.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 (650 aa) initn: 1051 init1: 803 opt: 804 Z-score: 743.9 bits: 148.2 E(32554): 4.1e-35 Smith-Waterman score: 963; 33.2% identity (57.1% similar) in 701 aa overlap (127-805:1-649) 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 KAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPF ::: :.:::.::::::: :: . :.:: CCDS47 MACREFEMGRKKCERYWPLYGEDPITFAPF 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 SVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQ ..::: :. ..::.:::: ..:..:.: .::::: ::::::::::.: ::..: .: :: CCDS47 KISCEDEQARTDYFIRTLLLEFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSILDMISLMRKYQ 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 EDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQ : ..:::::::::::::::.:::::::: ::: : :::.:.::.::.:::::: : :::. CCDS47 EHEDVPICIHCSAGCGRTGAICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEMRTQRHSAVQTK 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 EQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAA ::::::. :. .::..:.. . . : :... : . : : ...: :. :. . CCDS47 EQYELVHRAIAQLFEKQLQ-LYEIH-GAQKIADG-VNEINTENMVSSIEPE--KQDSPPP 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 KMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMK : ::. . :.. :::: .:.: . .: . . ::. CCDS47 K---PPRTRSCLVEGD----------AKEE-ILQPPEPHPVPPILTPSPPSAFPTVTTV- 210 220 230 240 250 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 WQTKAF----PIVGEPLQKHQSLDLGSLLFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRT--KST :: . :.. ....: ::. . :: .. :. .. : . .. CCDS47 WQDNDRYHPKPVLHMVSSEQHSADLNR------NYSKSTELPGKNESTIEQIDKKLERNL 260 270 280 290 300 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 PFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSCFVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIR :: :.. .: .. . . : .. : .. ... . ... .: .. CCDS47 SFE-IKKVPLQEGPKSFDGNTLLNRGH-----AIKIKSASPCIADKISKPQELSSDLNVG 310 320 330 340 350 520 530 540 550 560 pF1KB5 NASNVKHHDSSAL--GVYSYIPLVENPYFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLP ..:. . : :. . : : :. :. :: ... :: :: : : : : CCDS47 DTSQNSCVDCSVTQSNKVSVTP-PEESQNSDTPP--RPDRLPLD--EK--GHVTWSFHGP 360 370 380 390 400 410 570 580 590 600 610 620 pF1KB5 TSSTSL--FSYYNSHDSLSLNSPTNIS-SLLNQESAVLATAPRIDDEIPPPLPVRTPESF .. . .: :: : .: : . :: . .. . : .: . :: ::: :: CCDS47 ENAIPIPDLSEGNSSD---INYQTRKTVSLTPSPTTQVETPDLVDHDNTSPL-FRTPLSF 420 430 440 450 460 630 640 650 660 670 680 pF1KB5 IVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTSEPKKFDDSVILRP--SKSVKLRSPK .. . . . .: ..... : . : ..: .:. : :. .. CCDS47 TNPLHSDDSDSDERNSDGAVTQNKTNISTA-SATVSAATSTESISTRKVLPMSIARHNIA 470 480 490 500 510 520 690 700 710 720 730 pF1KB5 SELHQ------DRS-SPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIETYSTSYPDTMENSTSSK . :. : : . :::::::: ::: ::.: .: : . .... :. CCDS47 GTTHSGAEKDVDVSEDSPPPLPERTPESFVLASEH-------NTPVRSEWSELQSQERSE 530 540 550 560 570 740 750 760 770 780 790 pF1KB5 QTLKTPGKSFTRS-KSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQ-SNNSSSFLNFGFANRFSK : :. : ... : . ... .: :::. . : :.: . ..::.:: .: CCDS47 QK-KSEGLITSENEKCDHPAGGIHYEMCIECPPTFSDKREQISENPTEATDIGFGNRCGK 580 590 600 610 620 630 800 pF1KB5 PKGPRNPPPTWNI :::::.:: : CCDS47 PKGPRDPPSEWT 640 650 >>CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145 aa) initn: 462 init1: 408 opt: 690 Z-score: 635.2 bits: 128.9 E(32554): 4.6e-29 Smith-Waterman score: 696; 30.1% identity (57.2% similar) in 561 aa overlap (1-526:467-1007) 10 20 pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEE--FANEF :. . : .: :. ..::. : : :: CCDS13 LYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEF 440 450 460 470 480 490 30 40 50 60 70 80 pF1KB5 LKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINAN .. : .:. : :.:: : .:::: :::::::.::::: :..: :.::::. CCDS13 QSIPRVFSKF------PIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINAS 500 510 520 530 540 550 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 FIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGE .: : :. :::.::: . :. :::::::: .. .:::. : ...:: .:: : CCDS13 YIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEE 560 570 580 590 600 610 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 MQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKV---KFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPI :: :. . .:: ::::. :.. : .. : . .... .:::: :: . . CCDS13 GTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLL 620 630 640 650 660 670 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 LELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPEN-FSVFSLIRE :.: : ... : :: .::::: ::::. .:: :: .:. :: .:.. . . CCDS13 LKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDA--ML--EGLEAENKVDVYGYVVK 680 690 700 710 720 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 MRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLEL--FKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQAD .: :: .::.. :: :...:..: : . . . : ... :. : . :.:. CCDS13 LRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAE 730 740 750 760 770 780 330 340 350 360 370 pF1KB5 SYSPNLPKSTT-KAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVL-----HPAKSST ::. . .. .. ::...: . ..:. . . ... :.:: . : . :. CCDS13 FQR--LPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESS 790 800 810 820 830 840 380 390 400 410 420 pF1KB5 SFDFLELNYSFDKNADTTMK-WQTKAFPIVGEPLQK----------HQSLDLGSLLFEGC . : . : ::. :. :. ... . ::.. .... . .: : CCDS13 DDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELK 850 860 870 880 890 900 430 440 450 460 470 pF1KB5 SNSKPVNAA----GR--YFNSKVPITRT-KSTPFEL--IQQRETKEVDSKENFSYLESQP ... . : :. : . .: . : ::. . : .. :..:. ::. ..: : CCDS13 HGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQY---QY 910 920 930 940 950 960 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 HDSCFVEMQAQKVMHVSSAEL-NYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENP . .. :. .: .. . .:: : .. . ::: :. : .. CCDS13 TNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLP-----QKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTG 970 980 990 1000 1010 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 YFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSL CCDS13 IFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVK 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306 aa) initn: 462 init1: 408 opt: 690 Z-score: 634.4 bits: 129.0 E(32554): 5.2e-29 Smith-Waterman score: 696; 30.1% identity (57.2% similar) in 561 aa overlap (1-526:628-1168) 10 20 pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEE--FANEF :. . : .: :. ..::. : : :: CCDS13 LYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEF 600 610 620 630 640 650 30 40 50 60 70 80 pF1KB5 LKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINAN .. : .:. : :.:: : .:::: :::::::.::::: :..: :.::::. CCDS13 QSIPRVFSKF------PIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINAS 660 670 680 690 700 710 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 FIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGE .: : :. :::.::: . :. :::::::: .. .:::. : ...:: .:: : CCDS13 YIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVDDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEE 720 730 740 750 760 770 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 MQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKV---KFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPI :: :. . .:: ::::. :.. : .. : . .... .:::: :: . . CCDS13 GTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLL 780 790 800 810 820 830 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 LELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPEN-FSVFSLIRE :.: : ... : :: .::::: ::::. .:: :: .:. :: .:.. . . CCDS13 LKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDA--ML--EGLEAENKVDVYGYVVK 840 850 860 870 880 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 MRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLEL--FKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQAD .: :: .::.. :: :...:..: : . . . : ... :. : . :.:. 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