Result of FASTA (ccds) for pF1KB5747
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5747, 807 aa
  1>>>pF1KB5747 807 - 807 aa - 807 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3452+/-0.00091; mu= 11.2252+/- 0.055
 mean_var=118.2029+/-24.290, 0's: 0 Z-trim(109.5): 103  B-trim: 277 in 1/52
 Lambda= 0.117967
 statistics sampled from 10842 (10948) to 10842 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.336), width:  16
 Scan time:  4.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1          ( 807) 5367 924.9       0
CCDS76191.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1        ( 783) 4303 743.8 2.6e-214
CCDS864.2 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1          ( 752) 3306 574.1  3e-163
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7          ( 780) 1355 242.0 2.8e-63
CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2         ( 460)  954 173.7 6.2e-43
CCDS47619.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7         ( 661)  867 159.0 2.4e-38
CCDS47620.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7         ( 650)  804 148.2 4.1e-35
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1145)  690 128.9 4.6e-29
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1306)  690 129.0 5.2e-29
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11          (1337)  666 124.9 8.9e-28
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 595)  657 123.2 1.3e-27
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 597)  657 123.2 1.3e-27
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 624)  646 121.3 4.9e-27
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1441)  649 122.0 7.1e-27
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1460)  649 122.0 7.2e-27
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1439)  647 121.7   9e-27
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6           (1440)  647 121.7   9e-27
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1452)  642 120.8 1.6e-26
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1465)  642 120.8 1.6e-26
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 793)  623 117.5 9.1e-26
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 802)  623 117.5 9.2e-26
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1446)  625 117.9 1.2e-25
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1462)  625 117.9 1.2e-25
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19         ( 937)  621 117.2 1.3e-25
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12         ( 377)  614 115.8 1.4e-25
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12         ( 405)  614 115.8 1.5e-25
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19         (1115)  621 117.2 1.5e-25
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12          (1188)  614 116.0 3.7e-25
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12          (1216)  614 116.0 3.8e-25
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (2315)  610 115.5 1.1e-24
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (1448)  604 114.3 1.4e-24
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12       (2299)  603 114.3 2.4e-24
CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1           ( 399)  577 109.5 1.1e-23
CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9          ( 737)  581 110.3 1.2e-23
CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9          ( 782)  581 110.3 1.3e-23
CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1           ( 465)  577 109.5 1.3e-23
CCDS6776.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9           ( 913)  581 110.3 1.5e-23
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1501)  584 111.0 1.6e-23
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1505)  584 111.0 1.6e-23
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2           ( 926)  580 110.2 1.7e-23
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910)  584 111.0 1.9e-23
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1948)  584 111.0   2e-23
CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2          ( 889)  578 109.8   2e-23
CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2          ( 950)  578 109.8 2.1e-23
CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2           ( 979)  578 109.8 2.2e-23
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20         ( 435)  571 108.5 2.5e-23
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1898)  569 108.4 1.1e-22
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1907)  569 108.4 1.1e-22
CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18         ( 415)  552 105.3 2.2e-22
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1496)  561 107.0 2.4e-22


>>CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1               (807 aa)
 initn: 5367 init1: 5367 opt: 5367  Z-score: 4939.4  bits: 924.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5367; 99.9% identity (99.9% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-807)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 DYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 DYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 HSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAFPIVGEPLQKHQSLDLGSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAFPIVGEPLQKHQSLDLGSL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 LFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRTKSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRTKSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSC
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 FVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENPYFSSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENPYFSSW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 PPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSLLNQES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSLLNQES
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 AVLATAPRIDDEIPPPLPVRTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTS
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 AVLATAPRIDDEIPPPLPVWTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 EPKKFDDSVILRPSKSVKLRSPKSELHQDRSSPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EPKKFDDSVILRPSKSVKLRSPKSELHQDRSSPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIET
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 YSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRSKSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQSNNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRSKSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQSNNS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       
pF1KB5 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
              790       800       

>>CCDS76191.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1             (783 aa)
 initn: 4303 init1: 4303 opt: 4303  Z-score: 3961.0  bits: 743.8 E(32554): 2.6e-214
Smith-Waterman score: 5126; 96.9% identity (96.9% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-783)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNS
       ::::::::::::::::                        ::::::::::::::::::::
CCDS76 SVLIIVMACMEYEMGK------------------------EAEKRKSDYIIRTLKVKFNS
              130                               140       150      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI
        160       170       180       190       200       210      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 DYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAFPIVGEPLQKHQSLDLGSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRTKSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS76 PPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSLLNQES
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CCDS76 YSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRSKSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQSNNS
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       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
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>>CCDS864.2 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1               (752 aa)
 initn: 5003 init1: 3306 opt: 3306  Z-score: 3044.2  bits: 574.1 E(32554): 3e-163
Smith-Waterman score: 4897; 93.1% identity (93.1% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-752)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAI
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       ::::::::::                                                  
CCDS86 DYTWMLLKDG--------------------------------------------------
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            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAFPIVGEPLQKHQSLDLGSL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRTKSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSC
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CCDS86 FVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENPYFSSW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSLLNQES
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       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 AVLATAPRIDDEIPPPLPVWTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EPKKFDDSVILRPSKSVKLRSPKSELHQDRSSPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIET
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRSKSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQSNNS
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pF1KB5 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 SSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
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>>CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7               (780 aa)
 initn: 1634 init1: 1318 opt: 1355  Z-score: 1249.5  bits: 242.0 E(32554): 2.8e-63
Smith-Waterman score: 1514; 37.7% identity (62.2% similar) in 831 aa overlap (1-805:1-779)

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pF1KB5 MDQREILQKFLDEAQSKKIT----KEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIK
       :.: :::.::....:. :      ...:: .:..:.: ::::...: :::...:: .:.:
CCDS55 MEQVEILRKFIQRVQAMKSPDHNGEDNFARDFMRLRRLSTKYRTEKIYPTATGEKEENVK
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB5 KNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRM
       :::::::::.:.:::.:.: : ..::.::::::::::::::::.::::::..:..:::::
CCDS55 KNRYKDILPFDHSRVKLTLKTPSQDSDYINANFIKGVYGPKAYVATQGPLANTVIDFWRM
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pF1KB5 IWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKV
       ::::.:.:::::: :.:::.:::::::   ::  . :.::..::: :. ..::.:::: .
CCDS55 IWEYNVVIIVMACREFEMGRKKCERYWPLYGEDPITFAPFKISCEDEQARTDYFIRTLLL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB5 KFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGV
       .:..:.: .::::: ::::::::::.: ::..:  .: ::: ..:::::::::::::::.
CCDS55 EFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSILDMISLMRKYQEHEDVPICIHCSAGCGRTGA
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pF1KB5 ICAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDV
       :::::::: ::: : :::.:.::.::.:::::: : :::.::::::. :. .::..:.. 
CCDS55 ICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEMRTQRHSAVQTKEQYELVHRAIAQLFEKQLQ-
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pF1KB5 IRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDF
       . . : :... :   . : :   ...:  :.  :. .   :     ::.  . :..    
CCDS55 LYEIH-GAQKIADG-VNEINTENMVSSIEPE--KQDSPPPK---PPRTRSCLVEGD----
     300        310        320         330          340            

        360       370       380       390       400           410  
pF1KB5 RTSEISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMKWQTKAF----PIVGEPLQKH
             :::: .:.: .      .:  .      . ::. :: .      :..    ...
CCDS55 ------AKEE-ILQPPEPHPVPPILTPSPPSAFPTVTTV-WQDNDRYHPKPVLHMVSSEQ
            350        360       370       380        390       400

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pF1KB5 QSLDLGSLLFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRT--KSTPFELIQQRETKEVDSKENFS
       .: ::.       . :: ..  :.  ..   : .   ..  :: :..   .:  .. . .
CCDS55 HSADLNR------NYSKSTELPGKNESTIEQIDKKLERNLSFE-IKKVPLQEGPKSFDGN
                    410       420       430        440       450   

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pF1KB5 YLESQPHDSCFVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSAL--GVYSY
        : .. :      .. ...    . ...     .:  .. ..:. .  : :.   .  : 
CCDS55 TLLNRGH-----AIKIKSASPCIADKISKPQELSSDLNVGDTSQNSCVDCSVTQSNKVSV
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pF1KB5 IPLVENPYFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSL--FSYYNSHDSLSL
        :  :.   :. ::    ... ::  ::  : :  :   : ..  .  .:  :: :   .
CCDS55 TP-PEESQNSDTPPR--PDRLPLD--EK--GHVTWSFHGPENAIPIPDLSEGNSSD---I
      510        520           530         540       550           

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pF1KB5 NSPTNIS-SLLNQESAVLATAPRIDDEIPPPLPVRTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSA
       :  :  . ::  . .. . :   .: .   ::  ::: ::    .. . . .  .: ...
CCDS55 NYQTRKTVSLTPSPTTQVETPDLVDHDNTSPL-FRTPLSFTNPLHSDDSDSDERNSDGAV
      560       570       580       590        600       610       

         650       660       670         680             690       
pF1KB5 VKVKIGTSLEWGGTSEPKKFDDSVILRP--SKSVKLRSPKSELHQ------DRS-SPPPP
       .. : . :   ..:       .:.  :     :.  ..  .  :.      : : . :::
CCDS55 TQNKTNISTA-SATVSAATSTESISTRKVLPMSIARHNIAGTTHSGAEKDVDVSEDSPPP
       620        630       640       650       660       670      

        700       710       720       730       740        750     
pF1KB5 LPERTLESFFLADEDCMQAQSIETYSTSYPDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRS-KSLKIL
       ::::: ::: ::.:    ..:   .:      ....  :.:  :. :   ... :  .  
CCDS55 LPERTPESFVLASEHNTPVRS--EWSE-----LQSQERSEQK-KSEGLITSENEKCDHPA
        680       690         700            710        720        

         760       770        780       790       800       
pF1KB5 RNMKKSICNSCPPNKPAESVQ-SNNSSSFLNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
        ...  .:  :::.   .  : :.: .   ..::.:: .::::::.::  :  
CCDS55 GGIHYEMCIECPPTFSDKREQISENPTEATDIGFGNRCGKPKGPRDPPSEWT 
      730       740       750       760       770       780 

>>CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2              (460 aa)
 initn: 999 init1: 916 opt: 954  Z-score: 884.2  bits: 173.7 E(32554): 6.2e-43
Smith-Waterman score: 954; 46.1% identity (74.7% similar) in 297 aa overlap (24-319:26-318)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB5   MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKN
                                .:.::  ..  :. .::: .  :... .:.:..::
CCDS21 MSRSLDSARSFLERLEARGGREGAVLAGEFSDIQACSAAWKADGVCSTVAGSRPENVRKN
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB5 RYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIW
       ::::.:::: .:: :::.  .  :.:::.:::.:: :  :::::::::  :::::::..:
CCDS21 RYKDVLPYDQTRVILSLLQEEGHSDYINGNFIRGVDGSLAYIATQGPLPHTLLDFWRLVW
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160        170       
pF1KB5 EYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSCEAEKR-KSDYIIRTLKVK
       :..: .:.::: : : :.:.::::::.  :  :. : : ..   ::  . : ..::::: 
CCDS21 EFGVKVILMACREIENGRKRCERYWAQEQE-PLQTGLFCITLIKEKWLNEDIMLRTLKVT
              130       140       150        160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB5 FNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVI
       :..:.:..::..: .:::. :::: : .: .. ..:  : .   :.:.:::::::::::.
CCDS21 FQKESRSVYQLQYMSWPDRGVPSSPDHMLAMVEEARRLQGSGPEPLCVHCSAGCGRTGVL
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB5 CAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVI
       :..::. .::   .:: .::.:... .:: :::. :::.:::...:..: ..:    ...
CCDS21 CTVDYVRQLLLTQMIPPDFSLFDVVLKMRKQRPAAVQTEEQYRFLYHTVAQMF---CSTL
     240       250       260       270       280       290         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 RDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFR
       ..     ..  ..: :  . .:                                      
CCDS21 QNASPHYQNIKENCAPLYDDALFLRTPQALLAIPRPPGGVLRSISVPGSPGHAMADTYAV
        300       310       320       330       340       350      

>>CCDS47619.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7              (661 aa)
 initn: 1114 init1: 866 opt: 867  Z-score: 801.8  bits: 159.0 E(32554): 2.4e-38
Smith-Waterman score: 1026; 34.0% identity (57.9% similar) in 712 aa overlap (116-805:1-660)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB5 NANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAE
                                     :::::.:.:::::: :.:::.:::::::  
CCDS47                               MIWEYNVVIIVMACREFEMGRKKCERYWPL
                                             10        20        30

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB5 PGEMQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPI
        ::  . :.::..::: :. ..::.:::: ..:..:.: .::::: ::::::::::.: :
CCDS47 YGEDPITFAPFKISCEDEQARTDYFIRTLLLEFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSI
               40        50        60        70        80        90

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB5 LELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREM
       :..:  .: ::: ..:::::::::::::::.:::::::: ::: : :::.:.::.::.::
CCDS47 LDMISLMRKYQEHEDVPICIHCSAGCGRTGAICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEM
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB5 RTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYS
       :::: : :::.::::::. :. .::..:.. . . : :... :   . : :   ...:  
CCDS47 RTQRHSAVQTKEQYELVHRAIAQLFEKQLQ-LYEIH-GAQKIADG-VNEINTENMVSSIE
              160       170       180         190        200       

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB5 PNLPKSTTKAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNY
       :.  :. .   :     ::.  . :..          :::: .:.: .      .:  . 
CCDS47 PE--KQDSPPPK---PPRTRSCLVEGD----------AKEE-ILQPPEPHPVPPILTPSP
         210          220                 230        240       250 

         390       400           410       420       430       440 
pF1KB5 SFDKNADTTMKWQTKAF----PIVGEPLQKHQSLDLGSLLFEGCSNSKPVNAAGRYFNSK
            . ::. :: .      :..    ....: ::.       . :: ..  :.  .. 
CCDS47 PSAFPTVTTV-WQDNDRYHPKPVLHMVSSEQHSADLNR------NYSKSTELPGKNESTI
             260        270       280             290       300    

               450       460       470       480       490         
pF1KB5 VPITRT--KSTPFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSCFVEMQAQKVMHVSSAELNY
         : .   ..  :: :..   .:  .. . . : .. :      .. ...    . ... 
CCDS47 EQIDKKLERNLSFE-IKKVPLQEGPKSFDGNTLLNRGH-----AIKIKSASPCIADKISK
          310        320       330       340            350        

     500       510       520         530       540       550       
pF1KB5 SLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSAL--GVYSYIPLVENPYFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQ
           .:  .. ..:. .  : :.   .  :  :  :.   :. ::    ... ::  :: 
CCDS47 PQELSSDLNVGDTSQNSCVDCSVTQSNKVSVTP-PEESQNSDTPPR--PDRLPLD--EK-
      360       370       380       390        400         410     

       560       570         580       590        600       610    
pF1KB5 DGTVFPSSLLPTSSTSL--FSYYNSHDSLSLNSPTNIS-SLLNQESAVLATAPRIDDEIP
        : :  :   : ..  .  .:  :: :   .:  :  . ::  . .. . :   .: .  
CCDS47 -GHVTWSFHGPENAIPIPDLSEGNSSD---INYQTRKTVSLTPSPTTQVETPDLVDHDNT
             420       430          440       450       460        

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB5 PPLPVRTPESFIVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTSEPKKFDDSVILRP-
        ::  ::: ::    .. . . .  .: ..... : . :   . .:   .  .:.  :  
CCDS47 SPL-FRTPLSFTNPLHSDDSDSDERNSDGAVTQNKTNISTASATVSAATS-TESISTRKV
      470        480       490       500       510        520      

            680             690        700       710       720     
pF1KB5 -SKSVKLRSPKSELHQ------DRS-SPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIETYSTSY
          :.  ..  .  :.      : : . :::::::: ::: ::.:        .:   : 
CCDS47 LPMSIARHNIAGTTHSGAEKDVDVSEDSPPPLPERTPESFVLASEH-------NTPVRSE
        530       540       550       560       570                

         730       740        750       760       770        780   
pF1KB5 PDTMENSTSSKQTLKTPGKSFTRS-KSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQ-SNNSSSF
        . ....  :.:  :. :   ... :  .   ...  .:  :::.   .  : :.: .  
CCDS47 WSELQSQERSEQK-KSEGLITSENEKCDHPAGGIHYEMCIECPPTFSDKREQISENPTEA
     580       590        600       610       620       630        

           790       800       
pF1KB5 LNFGFANRFSKPKGPRNPPPTWNI
        ..::.:: .::::::.::  :  
CCDS47 TDIGFGNRCGKPKGPRDPPSEWT 
      640       650       660  

>>CCDS47620.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7              (650 aa)
 initn: 1051 init1: 803 opt: 804  Z-score: 743.9  bits: 148.2 E(32554): 4.1e-35
Smith-Waterman score: 963; 33.2% identity (57.1% similar) in 701 aa overlap (127-805:1-649)

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB5 KAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPF
                                     ::: :.:::.:::::::   ::  . :.::
CCDS47                               MACREFEMGRKKCERYWPLYGEDPITFAPF
                                             10        20        30

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB5 SVSCEAEKRKSDYIIRTLKVKFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPILELIWDVRCYQ
       ..::: :. ..::.:::: ..:..:.: .::::: ::::::::::.: ::..:  .: ::
CCDS47 KISCEDEQARTDYFIRTLLLEFQNESRRLYQFHYVNWPDHDVPSSFDSILDMISLMRKYQ
               40        50        60        70        80        90

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB5 EDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQ
       : ..:::::::::::::::.:::::::: ::: : :::.:.::.::.:::::: : :::.
CCDS47 EHEDVPICIHCSAGCGRTGAICAIDYTWNLLKAGKIPEEFNVFNLIQEMRTQRHSAVQTK
              100       110       120       130       140       150

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB5 EQYELVYNAVLELFKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQADSYSPNLPKSTTKAA
       ::::::. :. .::..:.. . . : :... :   . : :   ...:  :.  :. .   
CCDS47 EQYELVHRAIAQLFEKQLQ-LYEIH-GAQKIADG-VNEINTENMVSSIEPE--KQDSPPP
              160        170        180        190         200     

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB5 KMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVLHPAKSSTSFDFLELNYSFDKNADTTMK
       :     ::.  . :..          :::: .:.: .      .:  .      . ::. 
CCDS47 K---PPRTRSCLVEGD----------AKEE-ILQPPEPHPVPPILTPSPPSAFPTVTTV-
            210                 220        230       240       250 

        400           410       420       430       440         450
pF1KB5 WQTKAF----PIVGEPLQKHQSLDLGSLLFEGCSNSKPVNAAGRYFNSKVPITRT--KST
       :: .      :..    ....: ::.       . :: ..  :.  ..   : .   .. 
CCDS47 WQDNDRYHPKPVLHMVSSEQHSADLNR------NYSKSTELPGKNESTIEQIDKKLERNL
              260       270             280       290       300    

              460       470       480       490       500       510
pF1KB5 PFELIQQRETKEVDSKENFSYLESQPHDSCFVEMQAQKVMHVSSAELNYSLPYDSKHQIR
        :: :..   .:  .. . . : .. :      .. ...    . ...     .:  .. 
CCDS47 SFE-IKKVPLQEGPKSFDGNTLLNRGH-----AIKIKSASPCIADKISKPQELSSDLNVG
           310       320       330            340       350        

              520         530       540       550       560        
pF1KB5 NASNVKHHDSSAL--GVYSYIPLVENPYFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLP
       ..:. .  : :.   .  :  :  :.   :. ::    ... ::  ::  : :  :   :
CCDS47 DTSQNSCVDCSVTQSNKVSVTP-PEESQNSDTPP--RPDRLPLD--EK--GHVTWSFHGP
      360       370       380        390           400         410 

      570         580       590        600       610       620     
pF1KB5 TSSTSL--FSYYNSHDSLSLNSPTNIS-SLLNQESAVLATAPRIDDEIPPPLPVRTPESF
        ..  .  .:  :: :   .:  :  . ::  . .. . :   .: .   ::  ::: ::
CCDS47 ENAIPIPDLSEGNSSD---INYQTRKTVSLTPSPTTQVETPDLVDHDNTSPL-FRTPLSF
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pF1KB5 IVVEEAGEFSPNVPKSLSSAVKVKIGTSLEWGGTSEPKKFDDSVILRP--SKSVKLRSPK
           .. . . .  .: ..... : . :   ..:       .:.  :     :.  ..  
CCDS47 TNPLHSDDSDSDERNSDGAVTQNKTNISTA-SATVSAATSTESISTRKVLPMSIARHNIA
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pF1KB5 SELHQ------DRS-SPPPPLPERTLESFFLADEDCMQAQSIETYSTSYPDTMENSTSSK
       .  :.      : : . :::::::: ::: ::.:        .:   :  . ....  :.
CCDS47 GTTHSGAEKDVDVSEDSPPPLPERTPESFVLASEH-------NTPVRSEWSELQSQERSE
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pF1KB5 QTLKTPGKSFTRS-KSLKILRNMKKSICNSCPPNKPAESVQ-SNNSSSFLNFGFANRFSK
       :  :. :   ... :  .   ...  .:  :::.   .  : :.: .   ..::.:: .:
CCDS47 QK-KSEGLITSENEKCDHPAGGIHYEMCIECPPTFSDKREQISENPTEATDIGFGNRCGK
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       :::::.::  :  
CCDS47 PKGPRDPPSEWT 
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CCDS13 LYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEF
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pF1KB5 LKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINAN
        .. :  .:.      :   :.:: : .:::: :::::::.::::: :..:  :.::::.
CCDS13 QSIPRVFSKF------PIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINAS
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       .: :   :. :::.::: . :. :::::::: .. .:::.    : ...:: .::    :
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CCDS13 GTRAFGDVVVKINQHKRCPDYIIQKLNIVNKKEKATGREVTHIQFTSWPDHGVPEDPHLL
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       :.:   :  ...  : :: .::::: ::::.  .::   ::  .:.  ::  .:.. . .
CCDS13 LKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDA--ML--EGLEAENKVDVYGYVVK
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       .: ::  .::.. :: :...:..:   : .    . . :   ... :.  : .   :.:.
CCDS13 LRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAE
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pF1KB5 SYSPNLPKSTT-KAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVL-----HPAKSST
            ::.  . .. .. ::...: . ..:. . .  ...  :.:: .     : .  :.
CCDS13 FQR--LPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESS
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       . :    . :   ::.  :. :. ...  .  ::..          .... .  .: :  
CCDS13 DDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELK
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pF1KB5 SNSKPVNAA----GR--YFNSKVPITRT-KSTPFEL--IQQRETKEVDSKENFSYLESQP
        ... . :     :.  : . .: .  : ::. . :  .. :..:. ::.  ..:   : 
CCDS13 HGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQY---QY
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pF1KB5 HDSCFVEMQAQKVMHVSSAEL-NYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENP
        .    .. :.    .:  .. . .::     :  .. . ::: :. : ..         
CCDS13 TNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLP-----QKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTG
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pF1KB5 YFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSL
                                                                   
CCDS13 IFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVK
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>>CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1                (1306 aa)
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pF1KB5                               MDQREILQKFLDEAQSKKITKEE--FANEF
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CCDS13 LYKIYDLHKKRSCNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEF
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pF1KB5 LKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINAN
        .. :  .:.      :   :.:: : .:::: :::::::.::::: :..:  :.::::.
CCDS13 QSIPRVFSKF------PIKEARKPFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINAS
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pF1KB5 FIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGE
       .: :   :. :::.::: . :. :::::::: .. .:::.    : ...:: .::    :
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pF1KB5 MQLEFGPFSVSCEAEKRKSDYIIRTLKV---KFNSETRTIYQFHYKNWPDHDVPSSIDPI
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pF1KB5 LELIWDVRCYQEDDSVPICIHCSAGCGRTGVICAIDYTWMLLKDGIIPEN-FSVFSLIRE
       :.:   :  ...  : :: .::::: ::::.  .::   ::  .:.  ::  .:.. . .
CCDS13 LKLRRRVNAFSNFFSGPIVVHCSAGVGRTGTYIGIDA--ML--EGLEAENKVDVYGYVVK
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pF1KB5 MRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLEL--FKRQMDVIRDKHSGTESQAKHCIPEKNHTLQAD
       .: ::  .::.. :: :...:..:   : .    . . :   ... :.  : .   :.:.
CCDS13 LRRQRCLMVQVEAQYILIHQALVEYNQFGETEVNLSELHPYLHNMKKRDPPSEPSPLEAE
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pF1KB5 SYSPNLPKSTT-KAAKMMNQQRTKMEIKESSSFDFRTSEISAKEELVL-----HPAKSST
            ::.  . .. .. ::...: . ..:. . .  ...  :.:: .     : .  :.
CCDS13 FQR--LPSYRSWRTQHIGNQEENKSKNRNSNVIPYDYNRVPLKHELEMSKESEHDSDESS
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pF1KB5 SFDFLELNYSFDKNADTTMK-WQTKAFPIVGEPLQK----------HQSLDLGSLLFEGC
       . :    . :   ::.  :. :. ...  .  ::..          .... .  .: :  
CCDS13 DDDSDSEEPSKYINASFIMSYWKPEVMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELK
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pF1KB5 SNSKPVNAA----GR--YFNSKVPITRT-KSTPFEL--IQQRETKEVDSKENFSYLESQP
        ... . :     :.  : . .: .  : ::. . :  .. :..:. ::.  ..:   : 
CCDS13 HGDQEICAQYWGEGKQTYGDIEVDLKDTDKSSTYTLRVFELRHSKRKDSRTVYQY---QY
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pF1KB5 HDSCFVEMQAQKVMHVSSAEL-NYSLPYDSKHQIRNASNVKHHDSSALGVYSYIPLVENP
        .    .. :.    .:  .. . .::     :  .. . ::: :. : ..         
CCDS13 TNWSVEQLPAEPKELISMIQVVKQKLP-----QKNSSEGNKHHKSTPLLIHCRDGSQQTG
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pF1KB5 YFSSWPPSGTSSKMSLDLPEKQDGTVFPSSLLPTSSTSLFSYYNSHDSLSLNSPTNISSL
                                                                   
CCDS13 IFCALLNLLESAETEEVVDIFQVVKALRKARPGMVSTFEQYQFLYDVIASTYPAQNGQVK
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>>CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11               (1337 aa)
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                               10        20        30              
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CCDS79 IVTVGGFIFWRKKRKDAKNNEVSFSQIKPKKSKLIRVENFEAYFKKQQADSNCGFAEEYE
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pF1KB5 ADK----TYPTTVAEKPKNIKKNRYKDILPYDYSRVELSLITSDEDSSYINANFIKGVYG
         :    . :  .::  .:  ::::...:::: :::.::. : . :. :::::.. : ..
CCDS79 DLKLVGISQPKYAAELAENRGKNRYNNVLPYDISRVKLSVQTHSTDD-YINANYMPGYHS
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pF1KB5 PKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGP
        : .::::::: .:: :::::.:: .:  :.:     :.:. :::.::  :...  ..: 
CCDS79 KKDFIATQGPLPNTLKDFWRMVWEKNVYAIIMLTKCVEQGRTKCEEYW--PSKQAQDYGD
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