Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5748
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5748, 746 aa
1>>>pF1KB5748 746 - 746 aa - 746 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5425+/-0.00101; mu= 18.3725+/- 0.061
mean_var=62.9338+/-12.724, 0's: 0 Z-trim(103.3): 28 B-trim: 6 in 1/48
Lambda= 0.161671
statistics sampled from 7344 (7356) to 7344 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 3.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6324.1 EXT1 gene_id:2131|Hs108|chr8 ( 746) 5119 1203.2 0
CCDS271.1 EXTL1 gene_id:2134|Hs108|chr1 ( 676) 1386 332.5 1.3e-90
CCDS53619.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 728) 996 241.5 3.5e-63
CCDS7908.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 718) 735 180.7 7.2e-45
CCDS53618.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 ( 751) 735 180.7 7.5e-45
CCDS6070.1 EXTL3 gene_id:2137|Hs108|chr8 ( 919) 711 175.1 4.4e-43
CCDS775.1 EXTL2 gene_id:2135|Hs108|chr1 ( 330) 375 96.6 6.8e-20
>>CCDS6324.1 EXT1 gene_id:2131|Hs108|chr8 (746 aa)
initn: 5119 init1: 5119 opt: 5119 Z-score: 6444.9 bits: 1203.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5119; 100.0% identity (100.0% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQAKKRYFILLSAGSCLALLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPD
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CCDS63 MQAKKRYFILLSAGSCLALLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ALRPFVPWDQLENEDSSVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYP
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CCDS63 ALRPFVPWDQLENEDSSVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QQKGEKIAESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QQKGEKIAESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LHLWNNGRNHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LHLWNNGRNHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HPRTGGERGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HPRTGGERGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GKDWQKHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GKDWQKHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVML
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SNGWELPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SNGWELPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KIVLTTLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KIVLTTLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TAVIHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TAVIHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 VSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 QMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
730 740
>>CCDS271.1 EXTL1 gene_id:2134|Hs108|chr1 (676 aa)
initn: 1876 init1: 612 opt: 1386 Z-score: 1740.0 bits: 332.5 E(32554): 1.3e-90
Smith-Waterman score: 1916; 45.6% identity (69.5% similar) in 702 aa overlap (49-745:40-675)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPDA--LRPFVPWDQLENEDS
:. .. :::. :: :. : .: ::.
CCDS27 LWLALSASWLLLVLLGGFSLLRLALPPRPRPGASQGWPRWLDAELLQSFSQPGELP-EDA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 SVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYPQQKGEKIAESYQNILA
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CCDS27 ---VSPPQ-------APHGGSCNWESCFDTSKCRGDGLKVFVYPAV-GT-ISETHRRILA
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 AIEGSRFYTSDPSQACLFVL-SLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQSLHL-WNNGRNHLIFN
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CCDS27 SIEGSRFYTFSPAGACLLLLLSLDAQT-------------GECSSMPLQWNRGRNHLVLR
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTGGERGFLKFN
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CCDS27 LHPAPCPRT-----FQLGQAMVAEASPTVDSFRPGFDVALPFLPEAHPLRGGAPGQLRQH
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 TIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKHGKDWQKHKDSRCDR
. : . . . :.. . .: ..: : :.::..
CCDS27 SPQPGVALLAL-----------EEERGGWRTADTGS-----SACP----W----DGRCEQ
220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 DNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWELPFSEVINW
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CCDS27 DPGPGQT-QRQETLPNATFCLISGHRPEAASRFLQALQAGCIPVLLSPRWELPFSEVIDW
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 NQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLTTLEIIQDRI
..::...:::: ::. .... . ..:::::::::::.::::::::.. ::::.:::::
CCDS27 TKAAIVADERLPLQVLAALQEMSPARVLALRQQTQFLWDAYFSSVEKVIHTTLEVIQDRI
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 FKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKFTAVIHAVTPLVSQS
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CCDS27 FGTSAHPSLLWNSPPGALLALSTFSTSPQDFPFYYLQQGSRPEGRFSALIWVGPP----G
380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 QPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIEGESKVMSSRFLPYD
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CCDS27 QPPLKLIQAVAGSQHCAQILVLWSNERPLPS--RWPETAVPLTVIDGHRKV-SDRFYPYS
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 NIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTN
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CCDS27 TIRTDAILSLDARSSLSTSEVDFAFLVWQSFPERMVGFLTSSHFWDEAHGGWGYTAERTN
490 500 510 520 530 540
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 DYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQ
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CCDS27 EFSMVLTTAAFYHRYYHTLFTHSLPKALRTLADEAPTCVDVLMNFIVAAVTKLPPIKVPY
550 560 570 580 590 600
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 KKQYKETM-MGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQV
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CCDS27 GKQRQEAAPLAPGGPGPRPKPP---APAPDCINQIAAAFGHMPLLSSRLRLDPVLFKDPV
610 620 630 640 650 660
740
pF1KB5 SILRKKYRDIERL
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CCDS27 SVQRKKYRSLEKP
670
>>CCDS53619.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (728 aa)
initn: 1133 init1: 566 opt: 996 Z-score: 1247.9 bits: 241.5 E(32554): 3.5e-63
Smith-Waterman score: 1327; 34.2% identity (62.7% similar) in 726 aa overlap (53-746:44-728)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 FGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPDALRPFVPWDQLENEDSSVHISP
.:::. ... :. : :.. :
CCDS53 LIPRMKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPH---SIESSNDWNV---EKRSIRDVP
20 30 40 50 60
90 100 110 120
pF1KB5 RQKRDANSSI-YKGK-KCRMESCFDFTLC---KKNGFKVYVYPQQK---------GEKIA
. :.: : .: .:::..::: : :: .:::.: .: .. :.
CCDS53 VVRLPADSPIPERGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQSLHLWNNGR
. :...: :: : .::.: ..::::: :.:.:... : ... . . .: :. :
CCDS53 REYNELLMAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNTLR---IKETAQAMAQLSRWDRGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTG-GE
:::.::. : :::. . .:.:: ...:: ..: ..:::::..: .. :
CCDS53 NHLLFNMLPGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSIPVYSPLSAEVDLPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNAL--YHVHNGEDVVLLTTCKHGKDWQ
.: : :.:.:. . .:. . :. : .:..::.:..: : . ..
CCDS53 KG-------PGPRQYFLLSSQ----VGLHPEYREDLEALQVKHGESVLVLDKCTNLSEGV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWE
.:: . .. .:: ..:..::::.: :: :::. . ..:::.::::......
CCDS53 LSVRKRCHK----HQVFDYPQVLQEATFCVVLRGARLGQAVLSDVLQAGCVPVVIADSYI
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KB5 LPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFL-------WEAYFSS
::::::..:..:.:. :. . .. : ..:: : .: ...: :. : : .
CCDS53 LPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQL-FMEPARRENWSAANHQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VEKIVLTTLE----IIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGL
..... . ::.:::. . . . :: :. ...: . : . : :
CCDS53 MNSLIWPREQWDSQIINDRIYPYAAISYEEWNDPPA-----VKWGSVSN--PLF---LPL
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KPPSK--FTAVIHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNC-DKPLPAKHRWPA
::.. :::.. . .. . ...... ..: ....:.:: .: : ::
CCDS53 IPPQSQGFTAIVLT----YDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVWNNQNKNPPEDSLWPK
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 TAVPVVVIEGESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTV-LSTTEVDFAFTVWQSFPERIV
::. :.. . .:.::.:::.: :.:::..:.: . :.. :..:.. ::. ::.:.:
CCDS53 IRVPLKVVRTAENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDELQFGYEVWREFPDRLV
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLA
:::.: :.::. ..: : :.:::. ::::::::.::::..:::.. .:...:: ::
CCDS53 GYPGRLHLWDHEMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYTYKMPGDIKNWVDAHM
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 NCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFAS
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CCDS53 NCEDIAMNFLVANVTGKAVIKVTPRKKFKCPECTAIDGLS--LDQTHMVERSECINKFAS
640 650 660 670 680 690
720 730 740
pF1KB5 WFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
:: ::: . : ::::.::. :.. .: :
CCDS53 VFGTMPLKVVEHRADPVLYKDDFPEKLKSFPNIGSL
700 710 720
>>CCDS7908.1 EXT2 gene_id:2132|Hs108|chr11 (718 aa)
initn: 1311 init1: 424 opt: 735 Z-score: 919.0 bits: 180.7 E(32554): 7.2e-45
Smith-Waterman score: 1433; 35.7% identity (64.9% similar) in 715 aa overlap (53-746:44-718)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 FGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPDALRPFVPWDQLENEDSSVHISP
.:::. ... :. : :.. :
CCDS79 LIPRMKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPH---SIESSNDWNV---EKRSIRDVP
20 30 40 50 60
90 100 110 120
pF1KB5 RQKRDANSSI-YKGK-KCRMESCFDFTLC---KKNGFKVYVYPQQK---------GEKIA
. :.: : .: .:::..::: : :: .:::.: .: .. :.
CCDS79 VVRLPADSPIPERGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQSLHLWNNGR
. :...: :: : .::.: ..::::: :.:.:... : ... . . .: :. :
CCDS79 REYNELLMAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNTLR---IKETAQAMAQLSRWDRGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTG-GE
:::.::. : :::. . .:.:: ...:: ..: ..:::::..: .. :
CCDS79 NHLLFNMLPGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSIPVYSPLSAEVDLPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNAL--YHVHNGEDVVLLTTCKHGKDWQ
.: : :.:.:. . .:. . :. : .:..::.:..: : . ..
CCDS79 KG-------PGPRQYFLLSSQ----VGLHPEYREDLEALQVKHGESVLVLDKCTNLSEGV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWE
.:: . .. .:: ..:..::::.: :: :::. . ..:::.::::......
CCDS79 LSVRKRCHK----HQVFDYPQVLQEATFCVVLRGARLGQAVLSDVLQAGCVPVVIADSYI
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLT
::::::..:..:.:. :. . .. : ..:: : .: ...:....:::::.:.. :.:.
CCDS79 LPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQARWFWEAYFQSIKAIALA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSK--FTAV
::.::.:::. . . . :: :. ...: . : . : : ::.. :::.
CCDS79 TLQIINDRIYPYAAISYEEWNDPPA-----VKWGSVSN--PLF---LPLIPPQSQGFTAI
410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 IHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNC-DKPLPAKHRWPATAVPVVVIEGE
. . .. . ...... ..: ....:.:: .: : :: ::. :..
CCDS79 VLT----YDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVWNNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTV-LSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWDN
. .:.::.:::.: :.:::..:.: . :.. :..:.. ::. ::.:.::::.: :.::.
CCDS79 ENKLSNRFFPYDEIETEAVLAIDDDIIMLTSDELQFGYEVWREFPDRLVGYPGRLHLWDH
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFLV
..: : :.:::. ::::::::.::::..:::.. .:...:: :: ::::: :::::
CCDS79 EMNKWKYESEWTNEVSMVLTGAAFYHKYFNYLYTYKMPGDIKNWVDAHMNCEDIAMNFLV
580 590 600 610 620 630
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CCDS53 HRADPVLYKDDFPEKLKSFPNIGSL
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