FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5748, 746 aa
1>>>pF1KB5748 746 - 746 aa - 746 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3494+/-0.000436; mu= 19.4890+/- 0.027
mean_var=66.8374+/-13.640, 0's: 0 Z-trim(110.6): 34 B-trim: 909 in 1/49
Lambda= 0.156879
statistics sampled from 18954 (18984) to 18954 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 10.860
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000118 (OMIM: 133700,215300,608177) exostosin-1 ( 746) 5119 1168.2 0
NP_004446 (OMIM: 601738) exostosin-like 1 [Homo sa ( 676) 1386 323.3 2e-87
XP_005245836 (OMIM: 601738) PREDICTED: exostosin-l ( 640) 1281 299.6 2.7e-80
NP_001171554 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosi ( 728) 996 235.1 7.9e-61
XP_016856139 (OMIM: 601738) PREDICTED: exostosin-l ( 491) 823 195.8 3.5e-49
NP_997005 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosin-2 ( 718) 735 176.0 4.7e-43
XP_011518253 (OMIM: 133701,608210,616682) PREDICTE ( 731) 735 176.0 4.8e-43
NP_000392 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosin-2 ( 751) 735 176.0 4.9e-43
XP_011518252 (OMIM: 133701,608210,616682) PREDICTE ( 764) 735 176.0 5e-43
NP_001431 (OMIM: 605744) exostosin-like 3 [Homo sa ( 919) 711 170.6 2.5e-41
XP_011542742 (OMIM: 605744) PREDICTED: exostosin-l ( 919) 711 170.6 2.5e-41
NP_001430 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isoform ( 330) 375 94.4 8.3e-19
NP_001028197 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 330) 375 94.4 8.3e-19
XP_005270678 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 330) 375 94.4 8.3e-19
XP_011539297 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 338) 375 94.4 8.5e-19
XP_011539296 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 338) 375 94.4 8.5e-19
NP_001248370 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 338) 375 94.4 8.5e-19
NP_001248369 (OMIM: 602411) exostosin-like 2 isofo ( 329) 358 90.5 1.2e-17
XP_016856140 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 329) 358 90.5 1.2e-17
XP_011539298 (OMIM: 602411) PREDICTED: exostosin-l ( 337) 358 90.5 1.2e-17
>>NP_000118 (OMIM: 133700,215300,608177) exostosin-1 [Ho (746 aa)
initn: 5119 init1: 5119 opt: 5119 Z-score: 6256.1 bits: 1168.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5119; 100.0% identity (100.0% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQAKKRYFILLSAGSCLALLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MQAKKRYFILLSAGSCLALLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ALRPFVPWDQLENEDSSVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ALRPFVPWDQLENEDSSVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QQKGEKIAESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QQKGEKIAESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LHLWNNGRNHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LHLWNNGRNHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HPRTGGERGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HPRTGGERGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GKDWQKHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GKDWQKHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVML
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SNGWELPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SNGWELPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KIVLTTLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KIVLTTLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TAVIHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAVIHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GESKVMSSRFLPYDNIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NSKERWGYTSKWTNDYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 VSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSAVTKLPPIKVTQKKQYKETMMGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHS
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 QMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QMRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
730 740
>>NP_004446 (OMIM: 601738) exostosin-like 1 [Homo sapien (676 aa)
initn: 1876 init1: 612 opt: 1386 Z-score: 1690.6 bits: 323.3 E(85289): 2e-87
Smith-Waterman score: 1916; 45.6% identity (69.5% similar) in 702 aa overlap (49-745:40-675)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPDA--LRPFVPWDQLENEDS
:. .. :::. :: :. : .: ::.
NP_004 LWLALSASWLLLVLLGGFSLLRLALPPRPRPGASQGWPRWLDAELLQSFSQPGELP-EDA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 SVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYPQQKGEKIAESYQNILA
.:: : .: .: ::::: . :. .:.::.::: : :.:... :::
NP_004 ---VSPPQ-------APHGGSCNWESCFDTSKCRGDGLKVFVYPAV-GT-ISETHRRILA
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 AIEGSRFYTSDPSQACLFVL-SLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQSLHL-WNNGRNHLIFN
.:::::::: .:. :::..: :::. .. .:. : :: :::::..
NP_004 SIEGSRFYTFSPAGACLLLLLSLDAQT-------------GECSSMPLQWNRGRNHLVLR
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTGGERGFLKFN
:. . : :..::::.:.:: ....:::.:::..:.. . :: :: : :. .
NP_004 LHPAPCPRT-----FQLGQAMVAEASPTVDSFRPGFDVALPFLPEAHPLRGGAPGQLRQH
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 TIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKHGKDWQKHKDSRCDR
. : . . . :.. . .: ..: : :.::..
NP_004 SPQPGVALLAL-----------EEERGGWRTADTGS-----SACP----W----DGRCEQ
220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 DNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWELPFSEVINW
: . . .: : ::::::. : .. :::.::::.:.::.:: :::::::::.:
NP_004 DPGPGQT-QRQETLPNATFCLISGHRPEAASRFLQALQAGCIPVLLSPRWELPFSEVIDW
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 NQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLTTLEIIQDRI
..::...:::: ::. .... . ..:::::::::::.::::::::.. ::::.:::::
NP_004 TKAAIVADERLPLQVLAALQEMSPARVLALRQQTQFLWDAYFSSVEKVIHTTLEVIQDRI
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 FKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKFTAVIHAVTPLVSQS
: .. ::.::. ::.:..: .:. :::.:: . : .: ..:.:.: . : .
NP_004 FGTSAHPSLLWNSPPGALLALSTFSTSPQDFPFYYLQQGSRPEGRFSALIWVGPP----G
380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 QPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIEGESKVMSSRFLPYD
:: :::. :.: ::.::::.:::. ..:::. ::: ::::..::.:. :: :.:: ::.
NP_004 QPPLKLIQAVAGSQHCAQILVLWSNERPLPS--RWPETAVPLTVIDGHRKV-SDRFYPYS
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 NIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTN
.: :::.:::: . :::.:::::: ::::::::.::. . :::::... ::::.. ::
NP_004 TIRTDAILSLDARSSLSTSEVDFAFLVWQSFPERMVGFLTSSHFWDEAHGGWGYTAERTN
490 500 510 520 530 540
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 DYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQ
..::::: ::.::.::: :..: :: .:....:. .: :.::::.:.::::::::::
NP_004 EFSMVLTTAAFYHRYYHTLFTHSLPKALRTLADEAPTCVDVLMNFIVAAVTKLPPIKVPY
550 560 570 580 590 600
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 KKQYKETM-MGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQV
:: .:. .. . . : : : .:.: .:. ::.:::. :..::::::::: :
NP_004 GKQRQEAAPLAPGGPGPRPKPP---APAPDCINQIAAAFGHMPLLSSRLRLDPVLFKDPV
610 620 630 640 650 660
740
pF1KB5 SILRKKYRDIERL
:. :::::..:.
NP_004 SVQRKKYRSLEKP
670
>>XP_005245836 (OMIM: 601738) PREDICTED: exostosin-like (640 aa)
initn: 1570 init1: 569 opt: 1281 Z-score: 1562.5 bits: 299.6 E(85289): 2.7e-80
Smith-Waterman score: 1653; 42.2% identity (64.8% similar) in 702 aa overlap (49-745:40-639)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LLFYFGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPDA--LRPFVPWDQLENEDS
:. .. :::. :: :. : .: ::.
XP_005 LWLALSASWLLLVLLGGFSLLRLALPPRPRPGASQGWPRWLDAELLQSFSQPGELP-EDA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 SVHISPRQKRDANSSIYKGKKCRMESCFDFTLCKKNGFKVYVYPQQKGEKIAESYQNILA
.:: : .: .: ::::: . :. .:.::.::: : :.:... :::
XP_005 ---VSPPQ-------APHGGSCNWESCFDTSKCRGDGLKVFVYPAV-GT-ISETHRRILA
70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 AIEGSRFYTSDPSQACLFVL-SLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQSLHL-WNNGRNHLIFN
.:::::::: .:. :::..: :::. .. .:. : :: :::::..
XP_005 SIEGSRFYTFSPAGACLLLLLSLDAQT-------------GECSSMPLQWNRGRNHLVLR
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTGGERGFLKFN
:. . : :..::::.:.:: ....:::.:::..:.. . :: :: : :. .
XP_005 LHPAPCPRT-----FQLGQAMVAEASPTVDSFRPGFDVALPFLPEAHPLRGGAPGQLRQH
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 TIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNALYHVHNGEDVVLLTTCKHGKDWQKHKDSRCDR
. : . . . :.. . .: ..: : :.::..
XP_005 SPQPGVALLAL-----------EEERGGWRTADTGS-----SACP----W----DGRCEQ
220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 DNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWELPFSEVINW
: . . .: : ::::::. : .. :::.:::
XP_005 DPGPGQT-QRQETLPNATFCLISGHRPEAASRFLQALQ----------------------
260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 NQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLTTLEIIQDRI
. .... . ..:::::::::::.::::::::.. ::::.:::::
XP_005 --------------VLAALQEMSPARVLALRQQTQFLWDAYFSSVEKVIHTTLEVIQDRI
300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 FKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSKFTAVIHAVTPLVSQS
: .. ::.::. ::.:..: .:. :::.:: . : .: ..:.:.: . : .
XP_005 FGTSAHPSLLWNSPPGALLALSTFSTSPQDFPFYYLQQGSRPEGRFSALIWVGPP----G
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 QPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNCDKPLPAKHRWPATAVPVVVIEGESKVMSSRFLPYD
:: :::. :.: ::.::::.:::. ..:::. ::: ::::..::.:. :: :.:: ::.
XP_005 QPPLKLIQAVAGSQHCAQILVLWSNERPLPS--RWPETAVPLTVIDGHRKV-SDRFYPYS
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 NIITDAVLSLDEDTVLSTTEVDFAFTVWQSFPERIVGYPARSHFWDNSKERWGYTSKWTN
.: :::.:::: . :::.:::::: ::::::::.::. . :::::... ::::.. ::
XP_005 TIRTDAILSLDARSSLSTSEVDFAFLVWQSFPERMVGFLTSSHFWDEAHGGWGYTAERTN
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 DYSMVLTGAAIYHKYYHYLYSHYLPASLKNMVDQLANCEDILMNFLVSAVTKLPPIKVTQ
..::::: ::.::.::: :..: :: .:....:. .: :.::::.:.::::::::::
XP_005 EFSMVLTTAAFYHRYYHTLFTHSLPKALRTLADEAPTCVDVLMNFIVAAVTKLPPIKVPY
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 KKQYKETM-MGQTSRASRWADPDHFAQRQSCMNTFASWFGYMPLIHSQMRLDPVLFKDQV
:: .:. .. . . : : : .:.: .:. ::.:::. :..::::::::: :
XP_005 GKQRQEAAPLAPGGPGPRPKPP---APAPDCINQIAAAFGHMPLLSSRLRLDPVLFKDPV
580 590 600 610 620
740
pF1KB5 SILRKKYRDIERL
:. :::::..:.
XP_005 SVQRKKYRSLEKP
630 640
>>NP_001171554 (OMIM: 133701,608210,616682) exostosin-2 (728 aa)
initn: 1133 init1: 566 opt: 996 Z-score: 1213.0 bits: 235.1 E(85289): 7.9e-61
Smith-Waterman score: 1327; 34.2% identity (62.7% similar) in 726 aa overlap (53-746:44-728)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 FGGLQFRASRSHSRREEHSGRNGLHHPSPDHFWPRFPDALRPFVPWDQLENEDSSVHISP
.:::. ... :. : :.. :
NP_001 LIPRMKTKHRIYYITLFSIVLLGLIATGMFQFWPH---SIESSNDWNV---EKRSIRDVP
20 30 40 50 60
90 100 110 120
pF1KB5 RQKRDANSSI-YKGK-KCRMESCFDFTLC---KKNGFKVYVYPQQK---------GEKIA
. :.: : .: .:::..::: : :: .:::.: .: .. :.
NP_001 VVRLPADSPIPERGDLSCRMHTCFDVYRCGFNPKNKIKVYIYALKKYVDDFGVSVSNTIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ESYQNILAAIEGSRFYTSDPSQACLFVLSLDTLDRDQLSPQYVHNLRSKVQSLHLWNNGR
. :...: :: : .::.: ..::::: :.:.:... : ... . . .: :. :
NP_001 REYNELLMAISDSDYYTDDINRACLFVPSIDVLNQNTLR---IKETAQAMAQLSRWDRGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTG-GE
:::.::. : :::. . .:.:: ...:: ..: ..:::::..: .. :
NP_001 NHLLFNMLPGGPPDYNTALDVPRDRALLAGGGFSTWTYRQGYDVSIPVYSPLSAEVDLPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RGFLKFNTIPPLRKYMLVFKGKRYLTGIGSDTRNAL--YHVHNGEDVVLLTTCKHGKDWQ
.: : :.:.:. . .:. . :. : .:..::.:..: : . ..
NP_001 KG-------PGPRQYFLLSSQ----VGLHPEYREDLEALQVKHGESVLVLDKCTNLSEGV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KHKDSRCDRDNTEYEKYDYREMLHNATFCLVPRGRRLGSFRFLEALQAACVPVMLSNGWE
.:: . .. .:: ..:..::::.: :: :::. . ..:::.::::......
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XP_011 HRADPVLYKDDFPEKLKSFPNIGSL
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pF1KB5 NHLIFNLYSGTWPDYTEDVGFDIGQAMLAKASISTENFRPNFDVSIPLFSKDHPRTG-GE
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NP_000 LSVRKRCHK----HQVFDYPQVLQEATFCVVLRGARLGQAVLSDVLQAGCVPVVIADSYI
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pF1KB5 LPFSEVINWNQAAVIGDERLLLQIPSTIRSIHQDKILALRQQTQFLWEAYFSSVEKIVLT
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NP_000 LPFSEVLDWKRASVVVPEEKMSDVYSILQSIPQRQIEEMQRQARWFWEAYFQSIKAIALA
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pF1KB5 TLEIIQDRIFKHISRNSLIWNKHPGGLFVLPQYSSYLGDFPYYYANLGLKPPSK--FTAV
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NP_000 TLQIINDRIYPYAAISYEEWNDPPA-----VKWGSVSN--PLF---LPLIPPQSQGFTAI
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pF1KB5 IHAVTPLVSQSQPVLKLLVAAAKSQYCAQIIVLWNC-DKPLPAKHRWPATAVPVVVIEGE
. . .. . ...... ..: ....:.:: .: : :: ::. :..
NP_000 VLT----YDRVESLFRVITEVSKVPSLSKLLVVWNNQNKNPPEDSLWPKIRVPLKVVRTA
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pF1KB5 MRLDPVLFKDQVSILRKKYRDIERL
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XP_011 HRADPVLYKDDFPEKLKSFPNIGSL
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>>NP_001431 (OMIM: 605744) exostosin-like 3 [Homo sapien (919 aa)
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