FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5752, 747 aa 1>>>pF1KB5752 747 - 747 aa - 747 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 62035967 residues in 87258 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6606+/-0.000328; mu= 11.4763+/- 0.021 mean_var=197.2828+/-40.387, 0's: 0 Z-trim(121.7): 36 B-trim: 676 in 1/59 Lambda= 0.091312 statistics sampled from 39014 (39053) to 39014 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.448), width: 16 Scan time: 9.210 The best scores are: opt bits E(87258) NP_036370 (OMIM: 604479) NAD-dependent protein dea ( 747) 5071 680.9 5.1e-195 NP_001135970 (OMIM: 604479) NAD-dependent protein ( 452) 3070 417.1 8.1e-116 NP_001300978 (OMIM: 604479) NAD-dependent protein ( 444) 2931 398.8 2.6e-110 NP_036369 (OMIM: 604480) NAD-dependent protein dea ( 389) 722 107.7 9.5e-23 XP_011524956 (OMIM: 604480) PREDICTED: NAD-depende ( 352) 721 107.5 9.7e-23 NP_085096 (OMIM: 604480) NAD-dependent protein dea ( 352) 721 107.5 9.7e-23 XP_006723174 (OMIM: 604480) PREDICTED: NAD-depende ( 352) 721 107.5 9.7e-23 XP_011524957 (OMIM: 604480) PREDICTED: NAD-depende ( 319) 691 103.6 1.4e-21 NP_036371 (OMIM: 604481) NAD-dependent protein dea ( 399) 681 102.3 4.1e-21 XP_005252892 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 417) 681 102.4 4.2e-21 NP_001180215 (OMIM: 604480) NAD-dependent protein ( 234) 650 98.0 4.7e-20 NP_001017524 (OMIM: 604481) NAD-dependent protein ( 257) 642 97.0 1.1e-19 XP_016872919 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 257) 642 97.0 1.1e-19 XP_016872917 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 275) 642 97.0 1.1e-19 XP_011518258 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 275) 642 97.0 1.1e-19 XP_016872918 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 275) 642 97.0 1.1e-19 XP_011518259 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 275) 642 97.0 1.1e-19 XP_016872920 (OMIM: 604481) PREDICTED: NAD-depende ( 275) 642 97.0 1.1e-19 XP_016881989 (OMIM: 604480) PREDICTED: NAD-depende ( 266) 442 70.7 9.2e-12 NP_001180196 (OMIM: 604483) NAD-dependent protein ( 292) 337 56.9 1.4e-07 XP_016866114 (OMIM: 604483) PREDICTED: NAD-depende ( 246) 227 42.3 0.0029 XP_016866113 (OMIM: 604483) PREDICTED: NAD-depende ( 255) 227 42.3 0.003 XP_016866110 (OMIM: 604483) PREDICTED: NAD-depende ( 283) 227 42.4 0.0032 >>NP_036370 (OMIM: 604479) NAD-dependent protein deacety (747 aa) initn: 5071 init1: 5071 opt: 5071 Z-score: 3622.4 bits: 680.9 E(87258): 5.1e-195 Smith-Waterman score: 5071; 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NP_036 KKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLV 130 140 150 160 170 180 370 380 390 400 410 pF1KB5 QCHGSFATASCLI--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENL . ::.: :. :. :... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.: NP_036 EAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESL 190 200 210 220 230 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 PEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHF : .: :. : .::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . NP_036 PARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGM 240 250 260 270 280 290 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 DVELLGDCDVIINELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTP . : : : .. . .. :: . : ..: . : ...: : .. . 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XP_011 ELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCV 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 I--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDK :... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:: .: :. : XP_011 SASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDF 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 pF1KB5 DEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVII .::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . . : : : XP_011 LKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDS 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 NELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPER .. . .. :: . : ..: . : ...: : .. . . :.::.. 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NP_085 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRR 10 20 30 40 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 IIVLTGAGVSVSCGIPDFRS-RDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAK .: :.:::.:.: ::::::: :.: : . :: :.:.:.: ::.: :.::: .:: NP_085 VICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNL--EKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAK 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 EIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCL :.:::::.:..:: :. : .: ::: :::::::::..::... ... ::.: :. :. NP_085 ELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCV 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 I--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDK :... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:: .: :. : NP_085 SASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDF 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 pF1KB5 DEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVII .::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . . : : : NP_085 LKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDS 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 NELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPER .. . .. :: . : ..: . : ...: : .. . . :.::.. NP_085 KKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKK 280 290 300 310 320 330 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 TSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNV . :: NP_085 SPPPAKDEARTTEREKPQ 340 350 >>XP_006723174 (OMIM: 604480) PREDICTED: NAD-dependent p (352 aa) initn: 675 init1: 310 opt: 721 Z-score: 529.4 bits: 107.5 E(87258): 9.7e-23 Smith-Waterman score: 721; 37.4% identity (64.7% similar) in 334 aa overlap (228-547:12-338) 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 PRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILSEPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQ--ECKK :: .... : :.: ... .: .:.. XP_006 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRR 10 20 30 40 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 IIVLTGAGVSVSCGIPDFRS-RDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAK .: :.:::.:.: ::::::: :.: : . :: :.:.:.: ::.: :.::: .:: XP_006 VICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNL--EKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAK 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 EIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCL :.:::::.:..:: :. : .: ::: :::::::::..::... ... ::.: :. :. XP_006 ELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCV 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 I--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDK :... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:: .: :. : XP_006 SASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDF 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 pF1KB5 DEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVII .::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . . : : : XP_006 LKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDS 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 NELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPER .. . .. :: . : ..: . : ...: : .. . . :.::.. XP_006 KKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKK 280 290 300 310 320 330 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 TSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNV . :: XP_006 SPPPAKDEARTTEREKPQ 340 350 >>XP_011524957 (OMIM: 604480) PREDICTED: NAD-dependent p (319 aa) initn: 660 init1: 310 opt: 691 Z-score: 508.6 bits: 103.6 E(87258): 1.4e-21 Smith-Waterman score: 691; 38.6% identity (65.0% similar) in 306 aa overlap (254-547:7-305) 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 VINILSEPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQECKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRS-RDGIYAR ...: :.:::.:.: ::::::: :.: XP_011 MAEPDRRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDN 10 20 30 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 LAVDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRN : . :: :.:.:.: ::.: :.::: .:::.:::::.:..:: :. : .: ::: XP_011 L--EKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRC 40 50 60 70 80 90 350 360 370 380 390 pF1KB5 YTQNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCLI--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRC :::::::::..::... ... ::.: :. :. :... .. ::..:.:.: : XP_011 YTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDC 100 110 120 130 140 150 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 PADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHE . ..::.::::::.:: .: :. : .::::.:.:.::.:.: : . :. : XP_011 QS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLS 160 170 180 190 200 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 VPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEIT .:..:::.: : : . . : : : .. . .. :: . : ..: . 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XP_005 PLQRP---PRPEV-PRAFRRQ-------PRAAAPSFFFSSIKGGR-RSISFSVGASSVVG 70 80 90 100 110 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 EPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQE--CKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRSR-DGIYARLAVD . : : ...:...:.. :....:..:::.:. ::::::: .:.:. : . XP_005 SGGSSDKGK--LSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQ-Q 120 130 140 150 160 170 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 FPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQN . ::: :.:.:.. .: ..:.::: .:::.:::...:.. : :. : .: ::: :::: XP_005 Y-DLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQN 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 IDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPL :: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .:.:.. . ::::: : . 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