FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5777, 822 aa 1>>>pF1KB5777 822 - 822 aa - 822 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1465+/-0.000455; mu= 7.9952+/- 0.028 mean_var=153.2129+/-31.792, 0's: 0 Z-trim(114.8): 109 B-trim: 973 in 1/60 Lambda= 0.103616 statistics sampled from 24681 (24793) to 24681 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16 Scan time: 13.700 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamm ( 822) 5296 804.3 0 NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit g ( 825) 5280 801.9 0 NP_003908 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit gamm ( 785) 2839 437.0 1.6e-121 XP_005268229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 2839 437.0 1.6e-121 XP_005268230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 2839 437.0 1.6e-121 XP_005268234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 2245 348.2 7.2e-95 XP_005268235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 2245 348.2 7.2e-95 XP_005268236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 2245 348.2 7.2e-95 XP_016877234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 494) 2174 337.5 8.9e-92 XP_016877233 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 495) 2165 336.1 2.3e-91 XP_005268237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 640) 1997 311.1 1e-83 NP_001269404 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 713) 1997 311.1 1.1e-83 XP_016877231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 1997 311.1 1.1e-83 XP_005268231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 1997 311.1 1.1e-83 XP_005268232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 1997 311.1 1.1e-83 XP_016877230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 795) 1997 311.1 1.2e-83 XP_016877229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 804) 1997 311.1 1.2e-83 XP_006720364 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83 XP_005268224 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83 XP_005268226 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83 XP_005268227 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83 XP_005268225 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83 XP_005268239 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 575) 1886 294.5 9.2e-79 XP_011535585 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 807) 1668 262.0 7.9e-69 XP_016877232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 552) 1323 210.3 1.9e-53 XP_016877237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43 XP_011535588 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43 NP_001269403 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 404) 1083 174.3 9.3e-43 XP_016877235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43 XP_016877236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43 NP_031373 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 comple (1137) 757 125.8 1e-27 NP_001239056 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 com (1062) 704 117.9 2.4e-25 XP_005254321 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 704 117.9 2.4e-25 XP_006720510 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 704 117.9 2.4e-25 NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 955) 559 96.2 7.3e-19 XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 972) 559 96.2 7.4e-19 NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 977) 548 94.6 2.3e-18 XP_011524858 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 994) 548 94.6 2.4e-18 XP_011518231 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 864) 524 91.0 2.5e-17 NP_036437 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alph ( 939) 524 91.0 2.7e-17 NP_001229766 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit a ( 940) 524 91.0 2.7e-17 XP_011518232 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 666) 468 82.5 6.7e-15 NP_003929 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex subun (1153) 434 77.6 3.6e-13 XP_006722995 (OMIM: 607246,617050) PREDICTED: AP-3 (1203) 434 77.6 3.7e-13 NP_001248755 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex su (1215) 434 77.6 3.8e-13 XP_016877531 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE ( 843) 390 70.9 2.6e-11 XP_016884254 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 389) 294 56.4 2.9e-07 XP_005261579 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 389) 294 56.4 2.9e-07 XP_016884253 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 479) 294 56.4 3.4e-07 XP_016884252 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 502) 294 56.5 3.6e-07 >>NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma-1 (822 aa) initn: 5296 init1: 5296 opt: 5296 Z-score: 4287.6 bits: 804.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5296; 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