FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5782, 769 aa 1>>>pF1KB5782 769 - 769 aa - 769 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4666+/-0.00135; mu= 16.6211+/- 0.081 mean_var=193.7878+/-36.457, 0's: 0 Z-trim(108.1): 129 B-trim: 26 in 2/47 Lambda= 0.092132 statistics sampled from 9846 (9976) to 9846 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16 Scan time: 3.610 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 5450 738.2 1.2e-212 CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2524 349.3 1.4e-95 CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 2018 282.0 2.5e-75 CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 2009 280.8 5.7e-75 CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 1925 269.7 1.3e-71 CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 1854 260.2 8.7e-69 CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 1803 253.5 1e-66 CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 1799 252.9 1.3e-66 CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1461 208.5 7.7e-53 CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1461 208.5 7.9e-53 CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1461 208.5 7.9e-53 CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 1436 204.6 4.4e-52 CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1419 202.4 2.3e-51 CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 494) 499 79.9 1.1e-14 CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 353) 465 75.1 2.1e-13 CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 445) 465 75.3 2.4e-13 CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 453 73.6 6.9e-13 >>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 (769 aa) initn: 5450 init1: 5450 opt: 5450 Z-score: 3931.4 bits: 738.2 E(32554): 1.2e-212 Smith-Waterman score: 5450; 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CCDS88 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGATQLAPQRVRVTLRPGEPQQ 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 FNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDK ..: : ::.:::.:::::::::::: :::. :..:: :: :.:.:.: :::::::::: CCDS88 LQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFVDK 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 TVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPE ::::::.: :.:::.:::.. ..:: ::.:.:::.::.... :. :::.: .:::::.:: CCDS88 TVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLDSPE 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 GGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDN-LY ::.::..:.: : :.::::::.:::::..:: :: :::::::.:. :.::.:::..: :: CCDS88 GGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDSNGLY 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 KRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVV .::.:::::::::.:. :. :::::::::: . .:..:...::::::::::::::::: CCDS88 SRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDSSNVV 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 HLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRN---QPRGDCDGVQINVPIT .:: .:::.::: : :.:..:: ....:.: : .: .:. . ::.:. :.:: .: CCDS88 QLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQC-EGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQTVT 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 pF1KB5 FQVKVTATECIQEQSFV-IRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSLCH-GKGFLECG : :.. ::.:. : .. .:::::.. . :.. :.: : : . . : :.: :.:: CCDS88 FWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCG 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 ICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNS-IICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGK .: : : .:. :::.. :: .::..:: :.. .::: : : ::.: : .. CCDS88 VCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCSGQSS--- 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 LIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRR :. :::: .:::..: .::: :: : :: :.:: . : ::.: ..:..:. CCDS88 ---GHLCECDDASCERHEGILCGGFGR--CQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPEG 560 570 580 590 600 610 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 VECSGRGRCRCNVCECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAAC :::.:::.:: :.: .:: ::..:::: .:: .. .:::: :. ::.. :::.:: CCDS88 GLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPLATNCSTAC 620 630 640 650 660 670 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 P--GLQLSNNPVKGRT-CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAI .. :. :. :::: .. . . : ..:. .. : ... .. . :: CCDS88 AHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDN-QLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEK--GADHTQAI 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 VGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMN : : :.::: .:. :.. .. ... : ::: :::::. . .:..: :::.::: ::..: CCDS88 VLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTIN 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 PKFAES :.: :. CCDS88 PRFQEADSPTL 790 >>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa) initn: 1251 init1: 374 opt: 2018 Z-score: 1465.9 bits: 282.0 E(32554): 2.5e-75 Smith-Waterman score: 2075; 40.3% identity (68.3% similar) in 791 aa overlap (5-763:6-782) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MLGLRP-PL----LALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGP :: :: ::: .: ..: . :: ::::..:. .: :.::. . : CCDS11 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 -GDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK---------QLSPQKVT :.: ::: . .:: .:: ..: :.: :.. ::. ..: :.:::... CCDS11 LGSP---RCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIA 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 LYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESG : ::: .. :.. :... ::.:.:::::::::: ::: ....:: : . ..: . CCDS11 LRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 RIGFGSFVDKTVLPFVN-THPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK :::::.:::: : :.. . :. :.::: . . : : :...::: ::.. ..:. :: : CCDS11 RIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRN-VTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN : .: : ::::::.::.::...: :.::::: ...::::.:: :.: ::.:..:. :: CCDS11 QSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA ::.::. :: :. :. .::::.: ...::...::. ::::: .:. :.. .:.:: .. CCDS11 DGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD :: :: :::::..:: .::.:. :.: :. ::. :...... : :. . . .: CCDS11 VGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK--SCM 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KB5 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQ--SFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSL- :..:. ..:.... . : ::. ::.:. .:: : . ::: .:.: :. :.. : CCDS11 GLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHR 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQG-RSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQ :. :.: .:::.::: :..:..:::. . : ::. : : ... .:: :.:.::: CCDS11 CNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE--CSPREGQPVCSQRGECLCGQ 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 CLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCE :.::.:: :: : :.::::: ..: ::.:..:.: :. : :: : : . : :.: CCDS11 CVCHSSDF-GK-ITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQ--CSCGDCLCDSDWTGYYCNCT 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 RTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFE :. :.. . :::::.:.:. : : . : :..:: ::. : :.:: ::. CCDS11 TRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFD 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 pF1KB5 KGPFG--KNCSAACPGLQLSNNPVK--GR---TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIY .: . ..:. : : . .: :. .: .. . : : . .:. . ..: CCDS11 RGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQY-YEDSSGKSILY 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 pF1KB5 VDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN : : :: ::.: ... .....:.:::. :.::: :: . : .:. .::.:. ...:. CCDS11 VVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWD 710 720 730 740 750 760 750 760 pF1KB5 N-DNPLFKSATTTVMNPKFAES . .:::.: ::.: : CCDS11 TANNPLYKEATSTFTNITYRGT 770 780 >>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 (798 aa) initn: 2051 init1: 885 opt: 2009 Z-score: 1459.4 bits: 280.8 E(32554): 5.7e-75 Smith-Waterman score: 2541; 45.6% identity (73.3% similar) in 801 aa overlap (2-766:1-795) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MLGLRPPLLALVGLLS-LGCVLSQ----ECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPG ..:.: . .::.: . ::..: .: : ...:: :::..::.: :: . .: : CCDS71 MNLQP--IFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK--------------QLSPQ : : ::: : .:: ::: .: . . ....: .. :..:: CCDS71 MPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 KVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEIT ...: :: :. .:.. :.::. ::::::::::::::: :::.:::.:: ::. . .:: CCDS71 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 ESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEV . ::::::::.:::.:...: : :::::: ..:..: ::....::.:::... :. : CCDS71 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPC-TSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 GKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTP ::: ::::::.::::.::.::::.: ::::::::::::.:: :::::::::::.:. : CCDS71 GKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLP 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 NDGRCHLEDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA :::.::::.:.: :. .::::...:..::.::::: ::::: .. .:..: ..::::: CCDS71 NDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD :: :: .::::..:: .:::.:::.:.:... : . . ..: :.:.:::. .. :. CCDS71 VGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCS 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KB5 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQS--FVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRS-L ...:. . :....:...: ...: : :: ::::. : : . :::.:.... .: CCDS71 NISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC :: :.: .::: :::. : .:..:::.:. .:..... :::.:.: :::. :.:::::: CCDS71 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQC 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER .:. : ... :..::::..::.: :: .::: :.: : :.:.:.. ::::.: CCDS71 VCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGG--NGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSL 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECHSG-YQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK : : :.::: :.:.::.: . .: :. : : . :... :..: :.: CCDS71 DTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNK 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 pF1KB5 GPFGKNCSAACPGLQLSN--------NPVKGRT---CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRY : .:. : ..... .::. :::.: . :: .: . .: .. CCDS71 GEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTY-SVNGNNEV 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 pF1KB5 LIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKS ...: :. :: .::.: ::.:.::::::::. ::.::: :. . : ::. .:::::... CCDS71 MVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNA 720 730 740 750 760 770 750 760 pF1KB5 QWNN-DNPLFKSATTTVMNPKFAES .:.. .::..:::.:::.:::. CCDS71 KWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK 780 790 >>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (788 aa) initn: 1418 init1: 579 opt: 1925 Z-score: 1399.1 bits: 269.7 E(32554): 1.3e-71 Smith-Waterman score: 2003; 39.3% identity (68.0% similar) in 763 aa overlap (25-763:23-771) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MLGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSI :. . .:..:. :: :.:: . ::: :. CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPSGVGE- 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB5 RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHN---GGQK------QLSPQKVTLYLRPGQ :::: .:: .:: . : .:.: .: ... : :: :..::.. : :::: CCDS22 RCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSF : ...: :... ::.::::::::: :: ::: ..:.::. : . ....: . :.::::: CCDS22 AQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLD :.: : :::.: :... ::: . : : :.:.:.: :::....:. : .: ::.:.: CCDS22 VEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANID 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 APEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVT-RLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLED .::::.::.::.:.: :.::::: . .::::..: ::. :.::..:. :::: :::.. CCDS22 TPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 -NLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDS : :. :. ..::..::: ::..::. :::::...:. ::. ...:: ..:: :..:: CCDS22 KNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDS 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDT--LKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINV .:...:: .::..: :.: :. .: :: :.... ..:.::. ..: . :. .... CCDS22 GNILQLIISAYEELRSEVELE--VLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKK--CSHMKVGD 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 PITFQVKVTATECIQE-QSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSR-DRSLCH-GKGF .:.: :. .: .. . ..:. .:. : . . : :.:.: :. . . . : :: :.: CCDS22 TASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGS 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 LECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDV ..::.: : :..: ::: . :.. ::.. . ::: ::: ::::.:: : CCDS22 FQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTD----SCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS-- 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 PGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLN : ::: ::.::...: :..: .::: : : ::.: :. :. : :.: .:..:.. CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGD--CDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVS 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 PRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNC : ::::: : :. : : . : . : :..:: : .::.. :: :: : ..: CCDS22 EDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREEC 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 SAACP--GLQLSNNPVKGR----TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVA : : .:.. .. .:. . . : ... : :. . .:. . ..: CCDS22 VDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLITF-LITTDNEGKTIIHSINEKDCPK 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KB5 GPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKS ::: :. :. .:.:::..:: ::: :. . : .: .:: :. :..:.. :::... CCDS22 PPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRG 710 720 730 740 750 760 760 pF1KB5 ATTTVMNPKFAES .:.: : CCDS22 STSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 770 780 >>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (746 aa) initn: 1430 init1: 579 opt: 1854 Z-score: 1348.4 bits: 260.2 E(32554): 8.7e-69 Smith-Waterman score: 1919; 39.4% identity (68.2% similar) in 738 aa overlap (50-763:6-729) 20 30 40 50 60 70 pF1KB5 VLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIM ::: :. :::: .:: .:: . : CCDS74 MITYKNFTHPSGVGE-RCDTPANLLAKGCQLNFIE 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 DPTSLAETQEDHN---GGQK------QLSPQKVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLY .:.: .: ... : :: :..::.. : :::: : ...: :... ::.::: CCDS74 NPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLY 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 YLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNP :::::: :: ::: ..:.::. : . ....: . :.::::::.: : :::.: :... :: CCDS74 YLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANP 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 CPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEI : . : : :.:.:.: :::....:. : .: ::.:.:.::::.::.::.:.: :.: CCDS74 CSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKI 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 pF1KB5 GWRNVT-RLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLED-NLYKRSNEFDYPSVGQLA :::: . .::::..: ::. :.::..:. :::: :::.. : :. :. ..::..::: CCDS74 GWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLI 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 HKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVF ::..::. :::::...:. ::. ...:: ..:: :..::.:...:: .::..: :.: CCDS74 DKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVE 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 LDHNALPDT--LKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINVPITFQVKVTATECIQE-QS :. .: :: :.... ..:.::. ..: . :. .... .:.: :. .: .. . CCDS74 LE--VLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKK--CSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRH 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 FVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSR-DRSLCH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCEC ..:. .:. : . . : :.:.: :. . . . : :: :.: ..::.: : :..: ::: CCDS74 IIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 QTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCER . :.. ::.. . ::: ::: ::::.:: : : ::: ::.::...: : CCDS74 GEDMLSTD----SCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS--PYGNIYGPYCQCDNFSCVR 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 YNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC ..: .::: : : ::.: :. :. : :.: .:..:.. : ::::: : :. : : CCDS74 HKGLLCGGNGD--CDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVC 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 -HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACP--GLQLSNNPVKGR . : . : :..:: : .::.. :: :: : ..: : : .:.. .. CCDS74 TNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSK 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 pF1KB5 ----TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIG .:. . . : ... . :. . .:. . ..: ::: :. :. .:.::: CCDS74 DGSVSCSLQGENECLITFLITT-DNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIG 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 pF1KB5 ILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMNPKFAES ..:: ::: :. . : .: .:: :. :..:.. :::....:.: : CCDS74 VVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVD 690 700 710 720 730 740 CCDS74 LSTDC >>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa) initn: 1363 init1: 332 opt: 1803 Z-score: 1311.4 bits: 253.5 E(32554): 1e-66 Smith-Waterman score: 1930; 39.1% identity (66.7% similar) in 786 aa overlap (7-760:7-780) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MLGLRPPLLA-LVGLLSLGCVLS--QECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDP :: : :.:: .: :. . ::. ...::.::. : :.::.: .: :.: CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDF---GSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 DSI--RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQK------QLSPQKVTL :: ::: : .:. ::... : .:.: : . .:. . :..::.... CCDS30 RSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAV 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 YLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGR ::::. ..:.. :... ::.::::::::: :: ::: :...:: : . . ..: . : CCDS30 NLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFR 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 IGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKE--KECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK .:::::::: . :: : : ::: . . .: : :.:::.: ::. ..:. :: : CCDS30 LGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWR-NVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN : .: : ::::::.::..:.:.: :.:::: .. .::::.::: :.: :::::... :. CCDS30 QRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPH 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA ::.::: : : : ::..::::.. :..:::::::. :::::. :...: .:: .. CCDS30 DGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD : :. ::.:...:: ::::.. :.: :. :. :.. . . :..::.. .: . :. CCDS30 VEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK--CE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KB5 GVQINVPITFQVKVTATECIQ---EQSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSL :..:. .:.:.. : : . :. :..: .:: : . : : .: : : . : CCDS30 GLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSA 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 -CHGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC :.:.: ::.:.:. ::.: :::: .:.... .. ::. ... .::: ::: :.:: CCDS30 RCNGSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQ-DGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQC 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER : :. :: ::: .::::...: : .: .:.: :. : ::.:.:: :. :. :.: CCDS30 SCFESEF-GK-IYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGE--CHCGECKCHAGYIGDNCNCST 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK : . :: ::.: :. :.: . : .:..:: ::. :. .:.::: ... CCDS30 DISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHS 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 pF1KB5 G-PFGKNCSAACPGLQLS--NNPVKGRT----CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYV : : ...: . : .. .. :: : . .. : . .: . . : . CCDS30 GKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVL 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 pF1KB5 DESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN- : :: :: .:. ..:..:.:.:. ::.::: :. . : ::. .:..:. ..... CCDS30 REP-ECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEM 710 720 730 740 750 760 750 760 pF1KB5 NDNPLFKSATTTVMNPKFAES .:::... .: CCDS30 ASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD 770 780 790 >>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (693 aa) initn: 1378 init1: 527 opt: 1799 Z-score: 1309.2 bits: 252.9 E(32554): 1.3e-66 Smith-Waterman score: 1799; 39.8% identity (69.2% similar) in 669 aa overlap (110-763:21-676) 80 90 100 110 120 130 pF1KB5 DPTSLAETQEDHNGGQKQLSPQKVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSM : : ...: :... ::.::::::::: :: CCDS74 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 LDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQ ::: ..:.::. : . ....: . :.::::::.: : :::.: :... ::: . : CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCL 60 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 PPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVT-RL : :.:.:.: :::....:. : .: ::.:.:.::::.::.::.:.: :.::::: . .: CCDS74 PTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHL 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 LVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLED-NLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQ :::..: ::. :.::..:. :::: :::.. : :. :. ..::..::: ::..::. CCDS74 LVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVL 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 PIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDT :::::...:. ::. ...:: ..:: :..::.:...:: .::..: :.: :. .: :: CCDS74 LIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELE--VLGDT 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 --LKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINVPITFQVKVTATECIQE-QSFVIRALGFT :.... ..:.::. ..: . :. .... .:.: :. .: .. . ..:. .:. CCDS74 EGLNLSFTAICNNGTLFQHQKK--CSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLG 290 300 310 320 330 340 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 DIVTVQVLPQCECRCRDQSR-DRSLCH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQE : . . : :.:.: :. . . . : :: :.: ..::.: : :..: ::: . :.. CCDS74 DALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTD- 350 360 370 380 390 400 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 LEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGP ::.. . ::: ::: ::::.:: : : ::: ::.::...: :..: .::: CCDS74 ---SCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS--PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGN 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 GRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPL : : ::.: :. :. : :.: .:..:.. : ::::: : :. : : . : . : CCDS74 GD--CDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPT 470 480 490 500 510 620 630 640 650 660 pF1KB5 CQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACP--GLQLSNNPVKGR----TCKER :..:: : .::.. :: :: : ..: : : .:.. .. .:. . CCDS74 CERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQ 520 530 540 550 560 570 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 DSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKA . : ... : :. . .:. . ..: ::: :. :. .:.:::..:: ::: CCDS74 GENECLITF-LITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKL 580 590 600 610 620 630 730 740 750 760 pF1KB5 LIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMNPKFAES :. . : .: .:: :. :..:.. :::....:.: : CCDS74 LVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 640 650 660 670 680 690 >>CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752 aa) initn: 753 init1: 431 opt: 1461 Z-score: 1062.1 bits: 208.5 E(32554): 7.7e-53 Smith-Waterman score: 1471; 34.4% identity (62.0% similar) in 805 aa overlap (1-756:1-781) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MLGLRP-P----LLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPG : : :: : ::: . .::. .:...: : :.:: ::.. :..: : CCDS58 MAGPRPSPWARLLLAALISVSLSGTLANRCKKAPVKSCTECVRVDKDCAYCTDEMFR--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQKQLSPQKVTLYLRPGQ : ::.:. .:: :: ..:. : ::: : . ..:.::: . . ::::. CCDS58 --DR-RCNTQAELLAAGCQRESIVVMESSFQITEETQIDTTLRRSQMSPQGLRVRLRPGE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSF :.. . :.::: :::.: :: ::: :.::.: .: :.:...: . ::::.: CCDS58 ERHFELEVFEPLESPVDLYILMDFSNSMSDDLDNLKKMGQNLARVLSQLTSDYTIGFGKF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLD :::. .: .. .:.::..: ::.. :::.:..:..::.. ..:.... . :::::: CCDS58 VDKVSVPQTDMRPEKLKEPWPNSD----PPFSFKNVISLTEDVDEFRNKLQGERISGNLD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 APEGGLDAMMQVAACPEEIGWR-NVTRLLVFATDDGFHFAGDGK--LGAILTPNDGRCHL :::::.::..:.:.: ..:::: . :.::::.:...::. .:: :..:.. :: :::: CCDS58 APEGGFDAILQTAVCTRDIGWRPDSTHLLVFSTESAFHYEADGANVLAGIMSRNDERCHL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 EDN-LYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSE . . : . ::::: :.. ::..:: ::::::. . :::: .: :..: :.: CCDS58 DTTGTYTQYRTQDYPSVPTLVRLLAKHNIIPIFAVTNYSYSYYEKLHTYFPVSSLGVLQE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 DSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNAL--PDTLK--VTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGV ::::.:.:...:.:.. : :: :: : :. :: : .. . . ::. CCDS58 DSSNIVELLEEAFNRIRSN--LDIRALDSPRGLRTEVTSKMFQKTRTGSFHIRRGEVGIY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 QINVPITFQVKVT-ATECIQEQSFVIRAL-GFTDIVTVQVLPQCE-CRCRDQSRDRSL-C :... .: : . . ..:. :. .:.: . ... :. : :. :.. :: : CCDS58 QVQLRALEHVDGTHVCQLPEDQKGNIHLKPSFSDGLKMDAGIICDVCTCELQKEVRSARC 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 HGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLC .: . :: : :. :. :..:.:.: . :. . : ..... ::: :.: ::.:.: CCDS58 SFNGDFVCGQCVCSEGWSGQTCNCSTGSLSDIQ---PCLREGEDKPCSGRGECQCGHCVC 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 HTSDVPGKLIY-GQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERT . :. : ::.:: :...: : .: .:. :: : :.: :.::. : .:.: . CCDS58 Y-----GEGRYEGQFCEYDNFQCPRTSGFLCN--DRGRCSMGQCVCEPGWTGPSCDCPLS 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 TEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECH--SGYQLPLCQECPGCPSP--CGKYISCAECLKF . :.. :.:::.:.:. :.:: : : .:. . : : ::..: . 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CCDS58 VLVHKKKDCPPG-SFWWLIPLLLLLLPLLALLLLLCWKYCACCKACLALLPCCNRGHMVG 700 710 720 730 740 750 740 750 760 pF1KB5 LREYRRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES ..: . . .:.: .. . :.:...: CCDS58 FKEDHYMLRENLMASDHLDTPMLRSGNLKGRDVVRWKVTNNMQRPGFATHAASINPTELV 760 770 780 790 800 810 >>CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805 aa) initn: 753 init1: 431 opt: 1461 Z-score: 1062.0 bits: 208.5 E(32554): 7.9e-53 Smith-Waterman score: 1471; 34.4% identity (62.0% similar) in 805 aa overlap (1-756:1-781) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MLGLRP-P----LLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPG : : :: : ::: . .::. .:...: : :.:: ::.. :..: : CCDS32 MAGPRPSPWARLLLAALISVSLSGTLANRCKKAPVKSCTECVRVDKDCAYCTDEMFR--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQKQLSPQKVTLYLRPGQ : ::.:. .:: :: ..:. : ::: : . ..:.::: . . ::::. CCDS32 --DR-RCNTQAELLAAGCQRESIVVMESSFQITEETQIDTTLRRSQMSPQGLRVRLRPGE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSF :.. . :.::: :::.: :: ::: :.::.: .: :.:...: . ::::.: CCDS32 ERHFELEVFEPLESPVDLYILMDFSNSMSDDLDNLKKMGQNLARVLSQLTSDYTIGFGKF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLD :::. .: .. .:.::..: ::.. :::.:..:..::.. ..:.... . :::::: CCDS32 VDKVSVPQTDMRPEKLKEPWPNSD----PPFSFKNVISLTEDVDEFRNKLQGERISGNLD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 APEGGLDAMMQVAACPEEIGWR-NVTRLLVFATDDGFHFAGDGK--LGAILTPNDGRCHL :::::.::..:.:.: ..:::: . :.::::.:...::. .:: :..:.. :: :::: CCDS32 APEGGFDAILQTAVCTRDIGWRPDSTHLLVFSTESAFHYEADGANVLAGIMSRNDERCHL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 EDN-LYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSE . . : . ::::: :.. ::..:: ::::::. . :::: .: :..: :.: CCDS32 DTTGTYTQYRTQDYPSVPTLVRLLAKHNIIPIFAVTNYSYSYYEKLHTYFPVSSLGVLQE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 DSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNAL--PDTLK--VTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGV ::::.:.:...:.:.. : :: :: : :. :: : .. . . ::. CCDS32 DSSNIVELLEEAFNRIRSN--LDIRALDSPRGLRTEVTSKMFQKTRTGSFHIRRGEVGIY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 QINVPITFQVKVT-ATECIQEQSFVIRAL-GFTDIVTVQVLPQCE-CRCRDQSRDRSL-C :... .: : . . ..:. :. .:.: . ... :. : :. :.. :: : CCDS32 QVQLRALEHVDGTHVCQLPEDQKGNIHLKPSFSDGLKMDAGIICDVCTCELQKEVRSARC 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 HGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLC .: . :: : :. :. :..:.:.: . :. . : ..... ::: :.: ::.:.: CCDS32 SFNGDFVCGQCVCSEGWSGQTCNCSTGSLSDIQ---PCLREGEDKPCSGRGECQCGHCVC 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 HTSDVPGKLIY-GQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERT . :. : ::.:: :...: : .: .:. :: : :.: :.::. : .:.: . CCDS32 Y-----GEGRYEGQFCEYDNFQCPRTSGFLCN--DRGRCSMGQCVCEPGWTGPSCDCPLS 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 TEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECH--SGYQLPLCQECPGCPSP--CGKYISCAECLKF . :.. :.:::.:.:. :.:: : : .:. . : : ::..: . 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