Result of FASTA (omim) for
pF1KB5787
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5787, 829 aa
1>>>pF1KB5787 829 - 829 aa - 829 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8383+/-0.00036; mu= 18.2021+/- 0.023
mean_var=87.7068+/-17.643, 0's: 0 Z-trim(114.1): 411 B-trim: 48 in 1/59
Lambda= 0.136949
statistics sampled from 23365 (23788) to 23365 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 13.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 ( 829) 5560 1109.2 0
NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 774) 5184 1034.9 0
XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTE ( 808) 5106 1019.5 0
NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 784) 5098 1017.9 0
NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19209 ( 882) 3045 612.4 2.9e-174
XP_011521790 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 2556 515.6 2.7e-145
XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 637) 2556 515.6 2.7e-145
NP_001304114 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 366) 1519 310.6 8.2e-84
XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 ( 821) 1495 306.1 4.2e-82
XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 ( 848) 1495 306.1 4.3e-82
NP_001295105 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 2 [ ( 875) 1495 306.1 4.4e-82
NP_001783 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 1 prep ( 906) 1495 306.1 4.5e-82
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842) 1469 301.0 1.5e-80
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879) 1469 301.0 1.6e-80
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916) 1469 301.0 1.6e-80
NP_004924 (OMIM: 114019,612580) cadherin-15 prepro ( 814) 1249 257.5 1.8e-67
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839) 1234 254.5 1.4e-66
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896) 1234 254.5 1.5e-66
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713) 1210 249.7 3.3e-65
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2 ( 760) 1210 249.8 3.5e-65
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612) 1208 249.3 3.9e-65
NP_004940 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 847) 1201 248.0 1.3e-64
NP_077740 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 901) 1201 248.0 1.4e-64
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840) 1176 243.1 4e-63
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894) 1176 243.1 4.2e-63
XP_005258263 (OMIM: 125645,610476) PREDICTED: desm ( 758) 1133 234.5 1.3e-60
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3 ( 674) 1124 232.7 4.2e-60
NP_001304113 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 821) 1050 218.2 1.2e-55
NP_001304115 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19 ( 227) 1041 216.0 1.5e-55
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4 ( 459) 1001 208.3 6.3e-53
NP_001934 (OMIM: 125671,610193,612877) desmoglein- (1118) 901 188.8 1.1e-46
NP_817123 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 isofo (1040) 887 186.0 7.3e-46
NP_001127925 (OMIM: 607892,607903) desmoglein-4 is (1059) 887 186.0 7.4e-46
NP_001933 (OMIM: 125670,148700,615508) desmoglein- (1049) 814 171.6 1.6e-41
XP_016864430 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574) 784 165.5 6.1e-40
XP_016864429 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574) 784 165.5 6.1e-40
NP_001161139 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 2 ( 574) 784 165.5 6.1e-40
XP_016864428 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 574) 784 165.5 6.1e-40
XP_016864427 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 784 165.5 6.1e-40
XP_011512232 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 784 165.5 6.1e-40
XP_016864424 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 784 165.5 6.1e-40
XP_016864425 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 784 165.5 6.1e-40
XP_016864426 (OMIM: 603019) PREDICTED: cadherin-18 ( 575) 784 165.5 6.1e-40
NP_001278886 (OMIM: 603019) cadherin-18 isoform 3 ( 575) 784 165.5 6.1e-40
NP_001295321 (OMIM: 600023) cadherin-11 isoform 2 ( 693) 784 165.6 7.1e-40
XP_011524152 (OMIM: 169615) PREDICTED: desmoglein- ( 998) 779 164.7 1.9e-39
NP_001935 (OMIM: 169615) desmoglein-3 preproprotei ( 999) 779 164.7 1.9e-39
NP_001257957 (OMIM: 603016) cadherin-19 isoform 2 ( 490) 657 140.4 1.9e-32
XP_011524234 (OMIM: 603016) PREDICTED: cadherin-19 ( 445) 627 134.4 1.1e-30
XP_011512223 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6 ( 790) 582 125.7 8.1e-28
>>NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 isof (829 aa)
initn: 5560 init1: 5560 opt: 5560 Z-score: 5935.5 bits: 1109.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5560; 100.0% identity (100.0% similar) in 829 aa overlap (1-829:1-829)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB5 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
790 800 810 820
>>NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3 i (774 aa)
initn: 5184 init1: 5184 opt: 5184 Z-score: 5534.4 bits: 1034.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5184; 100.0% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (56-829:1-774)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 PCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPGQEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERR
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGCPGQEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERR
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 SLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSI
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 TGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIV
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 TDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDP
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 HDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNA
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 PMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPES
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 NQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSK
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 VVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDRED
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 EQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVL
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 NITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGDTVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGDTVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHG
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 NKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKE
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 PLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYR
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 PRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQD
700 710 720 730 740 750
810 820
pF1KB5 YDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
::::::::::::::::::::::::
NP_001 YDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
760 770
>>XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTED: c (808 aa)
initn: 5171 init1: 5100 opt: 5106 Z-score: 5450.9 bits: 1019.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5106; 97.8% identity (98.3% similar) in 782 aa overlap (1-782:1-778)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
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370 380 390 400 410 420
pF1KB5 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
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pF1KB5 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
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pF1KB5 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
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pF1KB5 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : . ::.. :.
XP_011 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEVLLLCRS----PPWQEALAT
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pF1KB5 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
:
XP_011 GYSLDPAWPVPPFPPTTPGKTKTQPFHKYMST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFPSKRILRRHKRDWVVAPISVPENG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTAT
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NP_001 DEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQA
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pF1KB5 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSP
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pF1KB5 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDKENQKISYRILR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLID
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NP_001 VNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVL
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pF1KB5 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHR
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pF1KB5 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIEGRGERGSQRGNGGLQLARGR
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pF1KB5 DYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
NP_001 TRRS
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pF1KB5 MGLPRGPLASLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKV-FMG
:: : :::. : :. . . : :..::.: :
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10 20 30 40 50
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pF1KB5 CPG-QEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNP------------------------
: : :. : :: :. : : . .. .: :. .::
NP_004 CTGRQRTAYFSLDTR-FKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNT
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 --------------------LKIFP-SKRILRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQL
: :: :. :::.:::::. ::: ::: :::::. : :.
NP_004 VGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQI
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140 150 160 170 180 190
pF1KB5 KSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSEN
:::::.. :.:::::: :::.:: ::: .:.::::: ...:::::.:: : ::.:::: :
NP_004 KSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSN
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200 210 220 230 240 250
pF1KB5 GASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNG
: .:::::.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.:::::::.::::: :: . :::.
NP_004 GNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNA
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260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDREKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTT
..::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...:::::. : :::..::.:..:.: .::
NP_004 AIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTT
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320 330 340 350 360 370
pF1KB5 AVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGG
:.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. . : ::: ::::.:::.:.: :..
NP_004 ATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-
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380 390 400 410 420 430
pF1KB5 DDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHV
::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.: ::: .:: ..: :::::..: :
NP_004 DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDV
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440 450 460 470 480 490
pF1KB5 EDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDP
::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..:: .:::.::: :: :.:: ..:
NP_004 LDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINP
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pF1KB5 DSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEP
:.: ... . ::::: . :.:. : ....: ::::: .:::::::: : ::::..:.:::
NP_004 DTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEP
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560 570 580 590 600
pF1KB5 RQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDSDIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKF
: : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .. :: . :. ....:. :
NP_004 RTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESIILKPKMA
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610 620 630 640 650 660
pF1KB5 LKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVETC--PGPWKGGFILP----VLGAV
:. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .: : ..:. .: .::..
NP_004 LEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAGLQIPAILGILGGI
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670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLE
::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:: ::::::::::.:..::::::.
NP_004 LALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLD
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730 740 750 760 770 780
pF1KB5 ARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIENLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYE
:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: ::::::.:::::::::.:::::::
NP_004 ARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYE
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790 800 810 820
pF1KB5 GSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLADMYGGGEDD
::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_004 GSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD
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pF1KB5 LNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGV
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pF1KB5 LPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDR
:::::::.::::: :: . :::...::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...::::
XP_011 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
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pF1KB5 EKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQR
:. : :::..::.:..:.: .:::.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. .
XP_011 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
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pF1KB5 LTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYV
: ::: ::::.:::.:.: :.. ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.:
XP_011 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHV
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pF1KB5 EVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPD
::: .:: ..: :::::..: : ::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..::
XP_011 AVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPD
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pF1KB5 K-ENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPP
.:::.::: :: :.:: ..::.: ... . ::::: . :.:. : ....: :::::
XP_011 TFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPV
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pF1KB5 TTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDS
.:::::::: : ::::..:.:::: : .:...: ::.:: : :: :.:::: :.:: .
XP_011 ATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTIFFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGA
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pF1KB5 DIYWTAEVNEEG-DTVVLSLKKFLKQDTYDVHLSLSDHGNKEQLTVIRATVCDCHGHVET
. :: . :. ....:. : :. : ..:.: :. ::.:.:.....::::.: . .
XP_011 SANWTIQYNDPTQESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGV
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pF1KB5 C--PGPWKGGFILP----VLGAVLALLFLLLVLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFY
: : ..:. .: .::..::::.:.:.:::..:.. .::::: :::::::::.:
XP_011 CRKAQPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYY
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pF1KB5 YGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLRNDVAPTIIPTPMYRPRPANPDEIGNFIIE
: ::::::::::.:..::::::.:::::. :::::::.. .: : ::::::::::::: :
XP_011 YDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVT-RNDVAPTLMSVPRYLPRPANPDEIGNFIDE
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pF1KB5 NLKAANTDPTAPPYDTLLVFDYEGSGSDAASLSSLTSSASDQDQDYDYLNEWGSRFKKLA
:::::.:::::::::.:::::::::::.:::::::.:: ::.:::::::::::.::::::
XP_011 NLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNSSESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLA
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pF1KB5 DMYGGGEDD
:::::::::
XP_011 DMYGGGEDD
630
>>XP_011521791 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,192090 (637 aa)
initn: 1826 init1: 1118 opt: 2556 Z-score: 2729.5 bits: 515.6 E(85289): 2.7e-145
Smith-Waterman score: 2556; 59.2% identity (82.8% similar) in 639 aa overlap (199-829:1-637)
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGSVLEGV
:.: : ::::::.::.:::..:.:::.::.
XP_011 MEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGA
10 20 30
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pF1KB5 LPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVISSGLDR
:::::::.::::: :: . :::...::.: ::.:. : ::::.:.::.:::...::::
XP_011 LPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDR
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 EKVPEYTLTIQATDMDGDGSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQR
:. : :::..::.:..:.: .:::.::. . :.::: :.:.: :...:::: .. .
XP_011 ESFPTYTLVVQAADLQGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITT
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 LTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYV
: ::: ::::.:::.:.: :.. ::: .:..::.: .:.::: : ::::::::.:. :.:
XP_011 LKVTDADAPNTPAWEAVYTILN-DDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHV
160 170 180 190 200
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pF1KB5 EVTNEAPFVLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPD
::: .:: ..: :::::..: : ::::::.:::: : :::.: . .:. . :::..::
XP_011 AVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPD
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 K-ENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPP
.:::.::: :: :.:: ..::.: ... . ::::: . :.:. : ....: :::::
XP_011 TFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPV
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XP_011 DMYGGGEDD
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pF1KB5 RHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKE
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XP_016 RQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPI
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pF1KB5 TGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGS
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XP_016 SGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGT
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pF1KB5 AVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEA
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460 470 480 490 500 510
pF1KB5 PVCVYTAEDPDKENQK-ISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEV
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pF1KB5 MVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNIT--DKDLSP
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829 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 15:33:02 2016 done: Sat Nov 5 15:33:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]