FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5791, 830 aa 1>>>pF1KB5791 830 - 830 aa - 830 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3108+/-0.00145; mu= 17.7150+/- 0.087 mean_var=220.5515+/-40.733, 0's: 0 Z-trim(107.5): 156 B-trim: 4 in 1/48 Lambda= 0.086361 statistics sampled from 9470 (9634) to 9470 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16 Scan time: 4.140 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 ( 830) 6027 765.4 0 CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 1875 247.9 3.9e-65 CCDS53427.1 SELL gene_id:6402|Hs108|chr1 ( 385) 1229 167.1 5.1e-41 CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 841 119.4 3.1e-26 CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 760 109.4 3.5e-23 CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 661 97.8 3.5e-19 CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 661 97.8 3.5e-19 CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 661 97.8 3.6e-19 CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 540 81.5 4.4e-15 CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1 (1231) 541 82.2 6.2e-15 CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 ( 597) 535 80.9 7e-15 CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 523 80.6 5.2e-14 CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 518 80.0 8e-14 CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039) 513 79.0 9.1e-14 CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2489) 510 78.8 1.3e-13 CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 459 71.1 3.7e-12 CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 442 70.5 5.6e-11 CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 442 70.5 5.8e-11 >>CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1 (830 aa) initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027 Z-score: 4077.3 bits: 765.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6027; 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CCDS12 QQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN ::::....::::::::: . : ::::.: ::: ::::::.: . ::: .:::.:::.: CCDS12 EPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINN 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS :::.: ::: : .:: . .: :: :.: . :::::::::.::.::. : :: .. CCDS12 YTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSME 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG ..:..:: :. : : ...: . : : . :... .: ...:.:.::::: :.: CCDS12 TMQCMSSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMG 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KB5 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVH-PLTAFAYGSSCKFECQPGYR . .:::.:: : :.:::: :. .. :..:.. : : : :.. :::.: :. :. CCDS12 AQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFM 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 VRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSPSLR-AFQYDTNCSFRCAE ..: ...: .:.:. .:.:::..: : .: .: :.: :: .:.: ..: : : . CCDS12 LQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQ 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 GFMLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSH-PFGAFRYQSVCSFT ::.:.:. ..: :.: :.:.:..:. . : .. : :.: :.: : :.: :.:. CCDS12 GFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 CNEGLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQ :.::. : :.. :.: . :.:. : ::.. :. : : . .:.: : . ..:. CCDS12 CEEGFELHGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS---GEPVFGTVCK 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 FICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGST : : ::..:.: : .:.:. : ::: CCDS12 FACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLW 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 CHFSCNNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRH CCDS12 LRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL 580 590 600 610 >>CCDS53427.1 SELL gene_id:6402|Hs108|chr1 (385 aa) initn: 1668 init1: 1225 opt: 1229 Z-score: 849.8 bits: 167.1 E(32554): 5.1e-41 Smith-Waterman score: 1229; 51.3% identity (74.5% similar) in 310 aa overlap (11-320:21-330) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKA : :: ...: .: .. : .. .. . :::::: : CCDS53 MGCRRTREGPSKAMIFPWKCQSTQRDLWNIFKLWGWTMLCCDFLAHHGTDCWTYHYSEKP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 YSWNISRKYCQNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKAL ..:. .:..:.. :::::::::: ::.::.:.::. ::::::::: . ::::::.:.: CCDS53 MNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 TNEAENWADNEPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSK :.:::::.:.:::::.:.::::::::: . :::::. : : : ::::::::: ::: CCDS53 TEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 QGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHC .:::.: :.::::.: :.:::.:..: .: :: :. :.:.::::::::.:::.: : CCDS53 HGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSC 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 TDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSF ..: ...: . : : :.. : : . :: ::. :. : :.: : .:. :.:.: CCDS53 SEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTF 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 SCEEGFALVGPEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSC : :: :.: . . : .::.:. :.:.:. CCDS53 ICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYNPLFIPVAVMVTAFSG 310 320 330 340 350 360 >>CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033 aa) initn: 364 init1: 161 opt: 841 Z-score: 584.4 bits: 119.4 E(32554): 3.1e-26 Smith-Waterman score: 863; 28.8% identity (51.0% similar) in 626 aa overlap (179-762:126-715) 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 HCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPG-FYGPE----CEYVR--ECG :: . : . ..:: : : :: CCDS14 VPGGYKIRGSTPYRHGDSVTFACKTNFSMNGNKSVWCQANNMWGPTRLPTCVSVFPLECP 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 ELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQCLAAQ : . : . :. .:... . . .. : .:: . : . ..::.:: :. :: : :. CCDS14 ALPMI-HNGHHTSENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCLSSGKWSAVPPTCEEAR 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 pF1KB5 CPPL-KIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASG---VWTAPAP : : ..:. :.. . .. . .: :.::. : :: .:. .: .:: : CCDS14 CKSLGRFPN-GKV---KEPPILRVGVTANFFCDEGYRLQGPPSSRCVIAGQGVAWTK-MP 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 VCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQP------GYRVRGLDMLRC-ID ::. . : : . . :. .::: . :.: .. . : . ::: .: CCDS14 VCEEIFCPS-PPPILNGRHIGNSLANVSYGSIVTYTCDPDPEEGVNFILIGESTLRCTVD 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KB5 S---GHWSAPLPTCE----AISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLR : : ::.: : :: :..: : . ..: : . . : . :. . : : :: :. CCDS14 SQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQC-PHPQILRGRMVSGQKDR-YTYNDTVIFACMFGFTLK 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 GADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNEGLL :. .::. : : ::::. .:: : ... . : : . ...:: : . CCDS14 GSKQIRCNAQGTWEPSAPVCEK-ECQAPPNILNGQKEDRHMV-RFDPGTSIKYSCNPGYV 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 pF1KB5 LVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTP-----LLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQF ::: .:: . : :. :.:.. : : .::. :.: .:: CCDS14 LVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEATGRQLLTKPQH---QFVRPDVNSS------- 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 ICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTC : :::.::: .: . : .:. : :: . .:. :. . .: :.: CCDS14 -CGEGYKLSGSVYQECQGTIPWFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTGSSLE-DFPYGTTV 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 pF1KB5 HFSCNNG------FKLEGPNNVECTTS----GRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTP ..:: : :.: : ....::.. : ::. : :: : .::: . CCDS14 TYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCK----LSLLAVQCSHVHIA 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 GQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELH . . .. : . .: : : : .:::: :.: . :. .. : :.:. :. : CCDS14 NGYKISGKEAP--YFYNDTVTFKCYSGFTLKGSSQIRCKADNTWDPEIPVCEKETCQ--H 610 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 VNKPIAMNCSNLWGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQ--ENGHWSTTVPTCQAGPL : . . ..: .. : . . : .: :.: : :: ::: : .: :. CCDS14 VRQSL----QELPAG-SRVELVNTSCQDGYQLTGHAYQMCQDAENGIWFKKIPLCKVIHC 670 680 690 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KB5 TIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAF CCDS14 HPPPVIVNGKHTGMMAENFLYGNEVSYECDQGFYLLGEKKLQCRSDSKGHGSWSGPSPQC 720 730 740 750 760 770 >>CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092 aa) initn: 433 init1: 161 opt: 760 Z-score: 529.6 bits: 109.4 E(32554): 3.5e-23 Smith-Waterman score: 872; 28.3% identity (50.9% similar) in 637 aa overlap (179-772:126-728) 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 HCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPG-FYGPE----CEYVR--ECG :: . : . ..:: : : :: CCDS31 VPGGYKIRGSTPYRHGDSVTFACKTNFSMNGNKSVWCQANNMWGPTRLPTCVSVFPLECP 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 ELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQCLAAQ : . : . :. .:... . . .. : .:: . : . ..::.:: :. :: : :. CCDS31 ALPMI-HNGHHTSENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCLSSGKWSAVPPTCEEAR 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 pF1KB5 CPPL-KIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASG---VWTAPAP : : ..:. :.. . .. . .: :.::. : :: .:. .: .:: : CCDS31 CKSLGRFPN-GKV---KEPPILRVGVTANFFCDEGYRLQGPPSSRCVIAGQGVAWTK-MP 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 VCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQP------GYRVRGLDMLRC-ID ::. . : : . . :. .::: . :.: .. . : . ::: .: CCDS31 VCEEIFCPS-PPPILNGRHIGNSLANVSYGSIVTYTCDPDPEEGVNFILIGESTLRCTVD 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KB5 S---GHWSAPLPTCE----AISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLR : : ::.: : :: :..: : . ..: : . . : . :. . : : :: :. CCDS31 SQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQC-PHPQILRGRMVSGQKDR-YTYNDTVIFACMFGFTLK 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 GADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNEGLL :. .::. : : ::::. .:: : ... . : : . ...:: : . CCDS31 GSKQIRCNAQGTWEPSAPVCEK-ECQAPPNILNGQKEDRHMV-RFDPGTSIKYSCNPGYV 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 pF1KB5 LVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTP-----LLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQF ::: .:: . : :. :.:.. : : .::. :.: .:: CCDS31 LVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEATGRQLLTKPQH---QFVRPDVNSS------- 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 ICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTC : :::.::: .: . : .:. : :: . .:. :. . .: :.: CCDS31 -CGEGYKLSGSVYQECQGTIPWFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTGSSLE-DFPYGTTV 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 pF1KB5 HFSCNNG------FKLEGPNNVECTTS----GRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTP ..:: : :.: : ....::.. : ::. : :: : .::: . CCDS31 TYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCK----LSLLAVQCSHVHIA 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 GQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELH . . .. : . .: : : : .:::: :.: . :. .. : :.:. :. CCDS31 NGYKISGKEAP--YFYNDTVTFKCYSGFTLKGSSQIRCKADNTWDPEIPVCEK-GCQ--- 610 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 VNKPIAMNCSNLWGN---FSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGP . : . . :: : : .. : : :: :. . :. .:.:: ..: :. CCDS31 -SPPGLHHGRHTGGNTVFFVSGMTVDYTCDPGYLLVGNKSIHCMPSGNWSPSAPRCEETC 670 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 820 pF1KB5 LTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAA ....: CCDS31 QHVRQSLQELPAGSRVELVNTSCQDGYQLTGHAYQMCQDAENGIWFKKIPLCKVIHCHPP 730 740 750 760 770 780 >>CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538 aa) initn: 576 init1: 257 opt: 661 Z-score: 457.9 bits: 97.8 E(32554): 3.5e-19 Smith-Waterman score: 998; 26.6% identity (52.9% similar) in 665 aa overlap (117-763:2445-3061) 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 SSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADNEPNNKRNNE-DCVEIYIKSPSAPGKW :. .. :::.. . . .: ..: .: CCDS63 NIQSPVLISLSGDYSSAFNITSNGHEVFLQWSADHGNNKKGFRIRYIAFYCSTPESP--- 2420 2430 2440 2450 2460 2470 150 160 170 180 190 pF1KB5 NDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYG--------PECEYV : ... : .:.. .. .:. . : . :: : :. . CCDS63 --PHGYIISQTGGQLNSVVRWACDRG---FRLVGKSSAVCRKSSYGYHAWDAPVPACQAI 2480 2490 2500 2510 2520 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 RECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGP--SKLECLASGIWTN--K :: . : : . .. ... .. :.:::.... . : ..: :.: : CCDS63 S-CGIPKAPT----NGGILTTDYLVGTRVTYFCNDGYRLSSKELTTAVCQSDGTWSNHNK 2530 2540 2550 2560 2570 2580 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 PPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASGVWT :.:.. .: : : :: ... . :. :.:. :: ::: : .: .::.:. CCDS63 TPRCVVISCGELPTPPNGNKIGTQTS----YGSTAIFTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWS 2590 2600 2610 2620 2630 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 APAPVCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRVRGLDMLRCIDSGH : : .: : .: . ..: .. ..:.::.:. : .. : .. . CCDS63 ESETRCLAGHCGIPELIVNGQVIG----ENYGYRDTVVYQCNPGFRLIGSSVRICQQDHN 2640 2650 2660 2670 2680 2690 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 WSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLRGADIVRCDNL ::. ::.: .:: ::..: : .:... .: : :....: ..:. CCDS63 WSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRT----SGNGFNFNDVVTFSCNIGYLMQGPTKAQCQAN 2700 2710 2720 2730 2740 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 GQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNEGLLLVGASVLQCL ::. : :.:....:.: .: ... . . : : : .: . :: : .: :.::: : CCDS63 RQWSHPPPMCKVVNCSDPGIPANSKRESKIEHGNFTYGTVVFYDCNPGYFLFGSSVLICQ 2750 2760 2770 2780 2790 2800 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 ATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQFICDEGYSLSGPERLD .:.:.. ::: : : : :.... . .. :: .. : :: : CCDS63 PNGQWDKPLPECIMIDCGHPGVPPNAVLSGEK----YTFGSTVHYSCTGKRSLLGQSSRT 2810 2820 2830 2840 2850 2860 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 CTRSGRWTDSPPMC--EAI-KCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHFSCNNGFKLEG : .:.:. : : : .: : . .: .:: . :. : . :: ...:..:. :.: CCDS63 CQLNGHWSGSQPHCSGDATGTCGDPGTPGHGSRQESN----FRTKSTVRYACDTGYILHG 2870 2880 2890 2900 2910 2920 620 630 640 650 660 670 pF1KB5 PNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYF .. : ..: :.. : ::. ::: : ..: .. . :: :... . CCDS63 SEERTCLANGSWTGRQPECKA--------VQCGNPGTTANGKVF--RIDGTT-FSSSVIY 2930 2940 2950 2960 2970 680 690 700 710 720 730 pF1KB5 GCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSIC .: :. : : :. .: .: :... : : ..:.. : : .. :. CCDS63 SCMEGYILSGPSVRQCTANGTWSGTLPNCTIISCGD----PGIPANGLRYGDDYVVGQNV 2980 2990 3000 3010 3020 740 750 760 770 780 pF1KB5 SFHCLEGQL--LNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMG :. : : :::: .: :: :: ..:::.: CCDS63 SYMCQPGYTMELNGSRIRTCTINGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSI 3030 3040 3050 3060 3070 3080 790 800 810 820 830 pF1KB5 GTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP CCDS63 SYICSPGYELSFPAVLTCVGNGTWSGEVPQCLPKFCGDPGIPAQGKREGKSFIYQSEVSF 3090 3100 3110 3120 3130 3140 >>CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667 aa) initn: 576 init1: 257 opt: 661 Z-score: 457.8 bits: 97.8 E(32554): 3.5e-19 Smith-Waterman score: 999; 28.9% identity (53.8% similar) in 584 aa overlap (192-763:2647-3190) 170 180 190 200 210 pF1KB5 SCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVRECGE-----LELPQHVLMNCSHP :.: : : :: . ..: :: CCDS63 FCNDGYRLSSKELTTAVCQSDGTWSNHNKTPRC-VVVTCPSINSFILEHGRWRIVNGSH- 2620 2630 2640 2650 2660 2670 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 LGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWT--NKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMT . .... : : ::. ::...::: .: :. :. : : .: : : :: CCDS63 ---YEYKTKVVFSCDPGYHGLGPASIECLPNGTWSWRNERPYCQIISCGELPTPPNGNKI 2680 2690 2700 2710 2720 2730 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 CLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGT ... . :. :.:. :: ::: : .: .::.:. : : .: : .: CCDS63 GTQTS----YGSTAIFTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSESETRCLAGHCGIPELIVNGQ 2740 2750 2760 2770 2780 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 MDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRVRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVH . ..: .. ..:.::.:. : .. : .. .::. ::.: .:: ::.. 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CCDS63 CGDPGTPGHGSRQESN----FRTKSTVRYACDTGYILHGSEERTCLANGSWTGRQPECKA 3020 3030 3040 3050 3060 3070 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 IASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQ ::: : ..: .. . :: :... ..: :. : : :. .: .: CCDS63 --------VQCGNPGTTANGKVF--RIDGTT-FSSSVIYSCMEGYILSGPSVRQCTANGT 3080 3090 3100 3110 3120 700 710 720 730 740 pF1KB5 WTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSICSFHCLEGQL--LNGSAQTACQ :... : : ..:. . : : .. :. :. : : :::: .: CCDS63 WSGTLPNCTIISCG----DPGIPANGLRYGDDYVVGQNVSYMCQPGYTMELNGSRIRTCT 3130 3140 3150 3160 3170 750 760 770 780 790 800 pF1KB5 ENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPL :: :: ..:::.: CCDS63 INGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSPGYELSFPAVLTCVGN 3180 3190 3200 3210 3220 3230 >>CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707 aa) initn: 572 init1: 257 opt: 661 Z-score: 457.7 bits: 97.8 E(32554): 3.6e-19 Smith-Waterman score: 999; 28.9% identity (53.8% similar) in 584 aa overlap (192-763:2687-3230) 170 180 190 200 210 pF1KB5 SCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVRECGE-----LELPQHVLMNCSHP :.: : : :: . ..: :: CCDS63 FCNDGYRLSSKELTTAVCQSDGTWSNHNKTPRC-VVVTCPSINSFILEHGRWRIVNGSH- 2660 2670 2680 2690 2700 2710 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 LGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWT--NKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMT . .... : : ::. ::...::: .: :. :. : : .: : : :: CCDS63 ---YEYKTKVVFSCDPGYHGLGPASIECLPNGTWSWRNERPYCQIISCGELPTPPNGNKI 2720 2730 2740 2750 2760 2770 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 CLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGT ... . :. :.:. :: ::: : .: .::.:. : : .: : .: CCDS63 GTQTS----YGSTAIFTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSESETRCLAGHCGIPELIVNGQ 2780 2790 2800 2810 2820 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 MDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRVRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVH . ..: .. ..:.::.:. : .. : .. .::. ::.: .:: ::.. 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CCDS63 CGDPGTPGHGSRQESN----FRTKSTVRYACDTGYILHGSEERTCLANGSWTGRQPECKA 3060 3070 3080 3090 3100 3110 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 IASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQ ::: : ..: .. . :: :... ..: :. : : :. .: .: CCDS63 --------VQCGNPGTTANGKVF--RIDGTT-FSSSVIYSCMEGYILSGPSVRQCTANGT 3120 3130 3140 3150 3160 700 710 720 730 740 pF1KB5 WTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSICSFHCLEGQL--LNGSAQTACQ :... : : ..:. . : : .. :. :. : : :::: .: CCDS63 WSGTLPNCTIISCG----DPGIPANGLRYGDDYVVGQNVSYMCQPGYTMELNGSRIRTCT 3170 3180 3190 3200 3210 750 760 770 780 790 800 pF1KB5 ENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPL :: :: ..:::.: CCDS63 INGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSPGYELSFPAVLTCVGN 3220 3230 3240 3250 3260 3270 >>CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 (569 aa) initn: 243 init1: 138 opt: 540 Z-score: 384.2 bits: 81.5 E(32554): 4.4e-15 Smith-Waterman score: 686; 27.0% identity (51.7% similar) in 540 aa overlap (190-699:31-541) 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 TASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGN .. .:. : : . : .. . :.:. 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CCDS13 QCRSPYEMFGDEEVMCL-NGNW-TEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 830 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 9 12:18:14 2016 done: Wed Nov 9 12:18:15 2016 Total Scan time: 4.140 Total Display time: 0.240 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]