Result of FASTA (ccds) for pF1KB5797
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5797, 834 aa
  1>>>pF1KB5797 834 - 834 aa - 834 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9658+/-0.00102; mu= 4.8222+/- 0.061
 mean_var=228.4188+/-47.564, 0's: 0 Z-trim(110.8): 45  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.084861
 statistics sampled from 11859 (11889) to 11859 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time:  3.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4520.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6           ( 834) 5656 706.2  6e-203
CCDS47373.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6          ( 834) 5634 703.5 3.9e-202
CCDS75400.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6          ( 685) 4605 577.4 2.8e-164
CCDS54038.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 888) 1093 147.6 9.2e-35
CCDS34340.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6          ( 174) 1062 143.2 3.7e-34
CCDS54037.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 868)  989 134.8 6.1e-31
CCDS10915.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 870)  989 134.8 6.2e-31
CCDS54041.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 870)  989 134.8 6.2e-31
CCDS54042.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 888)  989 134.8 6.3e-31
CCDS54043.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 888)  989 134.8 6.3e-31
CCDS54040.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 916)  989 134.8 6.4e-31
CCDS54039.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16         ( 722)  936 128.3 4.8e-29
CCDS33492.1 CASS4 gene_id:57091|Hs108|chr20        ( 786)  515 76.8 1.7e-13


>>CCDS4520.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6                (834 aa)
 initn: 5656 init1: 5656 opt: 5656  Z-score: 3757.1  bits: 706.2 E(32554): 6e-203
Smith-Waterman score: 5656; 100.0% identity (100.0% similar) in 834 aa overlap (1-834:1-834)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KLLIGPMQETASSHEQPASGLMQQTFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KLLIGPMQETASSHEQPASGLMQQTFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PTGHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PTGHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PSHTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSHTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YDFPPPMRQAGRPDLRPEGVYDIPPTCTKPAGKDLHVKYNCDIPGAAEPVARRHQSLSPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YDFPPPMRQAGRPDLRPEGVYDIPPTCTKPAGKDLHVKYNCDIPGAAEPVARRHQSLSPN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 HPPPQLGQSVGSQNDAYDVPRGVQFLEPPAETSEKANPQERDGVYDVPLHNPPDAKGSRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HPPPQLGQSVGSQNDAYDVPRGVQFLEPPAETSEKANPQERDGVYDVPLHNPPDAKGSRD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 EMGVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EMGVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 LHNKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LHNKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 DAKQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPGDHKAQAHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DAKQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPGDHKAQAHN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 KALPPGLSKEQAPDCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KALPPGLSKEQAPDCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 LEHHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSLPTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEHHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSLPTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 SLLNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLLNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830    
pF1KB5 NQLCEQLKTIVMATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NQLCEQLKTIVMATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
              790       800       810       820       830    

>>CCDS47373.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6               (834 aa)
 initn: 5632 init1: 5632 opt: 5634  Z-score: 3742.5  bits: 703.5 E(32554): 3.9e-202
Smith-Waterman score: 5634; 99.6% identity (99.8% similar) in 834 aa overlap (1-834:1-834)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
       :  .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MWTRNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KLLIGPMQETASSHEQPASGLMQQTFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLLIGPMQETASSHEQPASGLMQQTFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PTGHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTGHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PSHTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSHTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YDFPPPMRQAGRPDLRPEGVYDIPPTCTKPAGKDLHVKYNCDIPGAAEPVARRHQSLSPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YDFPPPMRQAGRPDLRPEGVYDIPPTCTKPAGKDLHVKYNCDIPGAAEPVARRHQSLSPN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 HPPPQLGQSVGSQNDAYDVPRGVQFLEPPAETSEKANPQERDGVYDVPLHNPPDAKGSRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HPPPQLGQSVGSQNDAYDVPRGVQFLEPPAETSEKANPQERDGVYDVPLHNPPDAKGSRD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 EMGVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EMGVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 LHNKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHNKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 DAKQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPGDHKAQAHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DAKQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPGDHKAQAHN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 KALPPGLSKEQAPDCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KALPPGLSKEQAPDCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 LEHHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSLPTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEHHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSLPTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 SLLNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLLNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830    
pF1KB5 NQLCEQLKTIVMATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NQLCEQLKTIVMATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
              790       800       810       820       830    

>>CCDS75400.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6               (685 aa)
 initn: 4605 init1: 4605 opt: 4605  Z-score: 3062.9  bits: 577.4 E(32554): 2.8e-164
Smith-Waterman score: 4605; 100.0% identity (100.0% similar) in 682 aa overlap (153-834:4-685)

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB5 GHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIPPS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75                            MKYKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIPPS
                                          10        20        30   

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB5 HTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKDYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKDYD
            40        50        60        70        80        90   

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB5 FPPPMRQAGRPDLRPEGVYDIPPTCTKPAGKDLHVKYNCDIPGAAEPVARRHQSLSPNHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FPPPMRQAGRPDLRPEGVYDIPPTCTKPAGKDLHVKYNCDIPGAAEPVARRHQSLSPNHP
           100       110       120       130       140       150   

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB5 PPQLGQSVGSQNDAYDVPRGVQFLEPPAETSEKANPQERDGVYDVPLHNPPDAKGSRDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PPQLGQSVGSQNDAYDVPRGVQFLEPPAETSEKANPQERDGVYDVPLHNPPDAKGSRDLV
           160       170       180       190       200       210   

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB5 DGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQALEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DGINRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQALEM
           220       230       240       250       260       270   

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB5 GVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELILH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GVSSLMALVTTDWRCYGYMERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELILH
           280       290       300       310       320       330   

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB5 NKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPDDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPDDA
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pF1KB5 KQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPGDHKAQAHNKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPGDHKAQAHNKA
           400       410       420       430       440       450   

            610       620       630       640       650       660  
pF1KB5 LPPGLSKEQAPDCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPPGLSKEQAPDCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQLE
           460       470       480       490       500       510   

            670       680       690       700       710       720  
pF1KB5 HHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSLPTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFISL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSLPTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFISL
           520       530       540       550       560       570   

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pF1KB5 LNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSSNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSSNQ
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pF1KB5 LCEQLKTIVMATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LCEQLKTIVMATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
           640       650       660       670       680     

>>CCDS54038.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16              (888 aa)
 initn: 1622 init1: 504 opt: 1093  Z-score: 737.6  bits: 147.6 E(32554): 9.2e-35
Smith-Waterman score: 1725; 39.2% identity (61.5% similar) in 916 aa overlap (23-832:23-886)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
                             .::::::.::.::.: ::.::::::::::::::::::.
CCDS54 MNHLNVLAKALYDNVAESPDELSFRKGDIMTVLEQDTQGLDGWWLCSLHGRQGIVPGNRL
               10        20        30        40        50        60

                       70        80                                
pF1KB5 KLLIG--------PMQETASSHEQPASGL-------------MQQTF-------------
       :.:.:        :     ..  ::  ::             . .:.             
CCDS54 KILVGMYDKKPAGPGPGPPATPAQPQPGLHAPAPPASQYTPMLPNTYQPQPDSVYLVPTP
               70        80        90       100       110       120

           90                              100       110           
pF1KB5 --GQQKLYQVPNPQA-----------------------APRDTIYQVPPSYQN--QGIYQ
         .:: :::::.:.                        .:   .:::::.  .  : :::
CCDS54 SKAQQGLYQVPGPSPQFQSPPAKQTSTFSKQTPHHPFPSPATDLYQVPPGPGGPAQDIYQ
              130       140       150       160       170       180

     120       130        140       150       160       170        
pF1KB5 VPTGHGTQEQEVYQVPPSVQ-RSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYD
       :: . : . ...::::::.. ::  ::. :    ::..:.:.:.:::::  .. ..: ::
CCDS54 VPPSAG-MGHDIYQVPPSMDTRSWEGTKPP---AKVVVPTRVGQGYVYE-AAQPEQDEYD
               190       200          210       220        230     

      180           190             200        210       220       
pF1KB5 IPPSHTT----QGVYDIPPSSAKGP------VFSVPVGEIK-PQGVYDIPPTKGVYAIPP
       ::  :      : .::.::  .  :      :...:   .: :.:  :  :   :: .::
CCDS54 IP-RHLLAPGPQDIYDVPPVRGLLPSQYGQEVYDTPPMAVKGPNG-RD--PLLEVYDVPP
          240       250       260       270        280         290 

       230       240       250       260           270       280   
pF1KB5 SACRDEAGLREKDYDFPPPMRQAGRPDLRPEGV--YDIPPTCTK--PAGKDLHVKYNCDI
       :.   : ::  ...      .  .:  ::  ::  ::.::. .:  : :  :. . . :.
CCDS54 SV---EKGLPPSNHHAVSKCQGNARARLRLWGVWVYDVPPSVSKDVPDGPLLR-EETYDV
                300       310       320       330       340        

              290            300       310        320       330    
pF1KB5 PGA---AEPV--ARRHQSLS---PNHPPPQLGQSVGSQN-DAYDVPRGVQFLEPPAETSE
       : :   :.:   ::    :.   :. :: .   .:     : :::: :   :. :.  . 
CCDS54 PPAFAKAKPFDPARTPLVLAAPPPDSPPAEDVYDVPPPAPDLYDVPPG---LRRPGPGTL
       350       360       370       380       390          400    

          340               350        360       370       380     
pF1KB5 KANPQER--------DGVYDVPLHN-PPDAKGSRDLVDGINRLSFSSTGSTRSNMSTSST
          :.::         :: :  ..  :: :.  :.     .::: ::::::::..:.:: 
CCDS54 YDVPRERVLPPEVADGGVVDSGVYAVPPPAE--REAPAEGKRLSASSTGSTRSSQSASSL
          410       420       430         440       450       460  

         390       400       410       420       430            440
pF1KB5 SSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQALEMGVSSLMALV-----TTDWRCYGY
               :.:...    :. ..:.: : ::::..   :. :. :.     : .::  . 
CCDS54 EV------AGPGREP---LELEVAVEALARLQQGVSATVAHLLDLAGSAGATGSWRSPSE
                  470          480       490       500       510   

               450       460       470       480       490         
pF1KB5 -MERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELILHNKMKRELQRVEDSHQIL
        .:  ......::  :.  ..: :.:...::.:::   .  :: :..:.::..:: :: :
CCDS54 PQEPLVQDLQAAVAAVQSAVHELLEFARSAVGNAAHTSDRALHAKLSRQLQKMEDVHQTL
           520       530       540       550       560       570   

     500       510       520       530       540       550         
pF1KB5 SQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVPDDAKQLTTTINTNAEALFRP
          .. :.           .      .::::.:  ...::.:::::.. .. ::  ::: 
CCDS54 VAHGQALDAGR--------GGSGATLEDLDRLVACSRAVPEDAKQLASFLHGNASLLFRR
           580               590       600       610       620     

     560       570       580       590         600         610     
pF1KB5 GPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPG--DHKAQAHNKALP--PGLSKEQAPDC
         ..     :::.         ::.    :::.  :. .. ... ::  : ......:: 
CCDS54 TKAT---APGPEG---------GGT----LHPNPTDKTSSIQSRPLPSPPKFTSQDSPD-
            630                    640       650       660         

         620       630       640       650       660       670     
pF1KB5 SSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQLEHHQLSQFQLLEQE
       .. ..:: .::.::::::::::::::. ::::::: .: .:.: ::: .::.::. ::::
CCDS54 GQYENSEGGWMEDYDYVHLQGKEEFEKTQKELLEKGSITRQGKSQLELQQLKQFERLEQE
      670       680       690       700       710       720        

         680       690        700       710       720       730    
pF1KB5 ITKPVENDISKWKPSQSL-PTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFISLLNAIDALFSCVS
       ...:...:...: :.: : :  ..:.. .::::: :: .:::... .: ::.::.:. :.
CCDS54 VSRPIDHDLANWTPAQPLAPGRTGGLGPSDRQLLLFYLEQCEANLTTLTNAVDAFFTAVA
      730       740       750       760       770       780        

          740       750       760       770       780       790    
pF1KB5 SAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSSNQLCEQLKTIVMAT
       . :::.:::::::::::::::::::::::.::. : :.:..: . :: ::. :. :: .:
CCDS54 TNQPPKIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLSRQAKAADVRSQVTHYSNLLCDLLRGIVATT
      790       800       810       820       830       840        

          800       810       820       830    
pF1KB5 KMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
       : :::.::: .: :.::..: .:....: :.: : ..:  
CCDS54 KAAALQYPSPSAAQDMVERVKELGHSTQQFRRVLGQLAAA
      850       860       870       880        

>>CCDS34340.1 NEDD9 gene_id:4739|Hs108|chr6               (174 aa)
 initn: 1062 init1: 1062 opt: 1062  Z-score: 726.7  bits: 143.2 E(32554): 3.7e-34
Smith-Waterman score: 1062; 100.0% identity (100.0% similar) in 154 aa overlap (1-154:1-154)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KLLIGPMQETASSHEQPASGLMQQTFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLLIGPMQETASSHEQPASGLMQQTFGQQKLYQVPNPQAAPRDTIYQVPPSYQNQGIYQV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PTGHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVITPVRTGHGYVYEYPSRYQKDVYDIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::                          
CCDS34 PTGHGTQEQEVYQVPPSVQRSIGGTSGPHVGKKVFQRDGQVSYFLVRASKQTSL      
              130       140       150       160       170          

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PSHTTQGVYDIPPSSAKGPVFSVPVGEIKPQGVYDIPPTKGVYAIPPSACRDEAGLREKD

>>CCDS54037.1 BCAR1 gene_id:9564|Hs108|chr16              (868 aa)
 initn: 1617 init1: 504 opt: 989  Z-score: 668.9  bits: 134.8 E(32554): 6.1e-31
Smith-Waterman score: 1808; 39.7% identity (61.1% similar) in 936 aa overlap (5-832:3-866)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKYKNLMARALYDNVPECAEELAFRKGDILTVIEQNTGGLEGWWLCSLHGRQGIVPGNRV
           :..:.:::::: :  .::.::::::.::.::.: ::.::::::::::::::::::.
CCDS54   MENVLAKALYDNVAESPDELSFRKGDIMTVLEQDTQGLDGWWLCSLHGRQGIVPGNRL
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       :.:.:        :     ..  ::  ::             . .:.             
CCDS54 KILVGMYDKKPAGPGPGPPATPAQPQPGLHAPAPPASQYTPMLPNTYQPQPDSVYLVPTP
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         .:: :::::.:.                        .:   .:::::.  .  : :::
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       : .. ..:: .::.::::::::::::::. ::::::: .: .:.: ::: .::.::. ::
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       ::...:...:...: :.: : :  ..:.. .::::: :: .:::... .: ::.::.:. 
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       .:: :::.::: .: :.::..: .:....: :.: : ..:  
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       :.:.:        :     ..  ::  ::             . .:.             
CCDS54 KILVGMYDKKPAGPGPGPPATPAQPQPGLHAPAPPASQYTPMLPNTYQPQPDSVYLVPTP
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         .:: :::::.:.                        .:   .:::::.  .  : :::
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       :: . : . ...::::::.. ::  ::. :    ::..:.:.:.:::::  .  :     
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                .:.::.::      :.  : ::: :: ..:::    :. :     :::.::
CCDS54 PRHLLAPGPQDIYDVPPVRGLLPSQYGQEVYDTPPMAVKGPNGRDPLLE-----VYDVPP
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       .  ::        :: .:::. .:      :::. :: :: . .:   :  :   :   :
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       :  . :: .:..     :.:    : :    .. :.   :  :         :::::  .
CCDS54 PPDSPPA-EDVY-----DVP----PPAPDLYDVPPGLRRPGPGT-------LYDVPR--E
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        . ::    : :.    : ::: ::   ::  . .   ..: .::: ::::::::..:.:
CCDS54 RVLPP----EVADGGVVDSGVYAVP---PPAEREAP--AEG-KRLSASSTGSTRSSQSAS
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       :         :.:...    :. ..:.: : ::::..   :. :. :.     : .::  
CCDS54 SLE------VAGPGREP---LELEVAVEALARLQQGVSATVAHLLDLAGSAGATGSWRSP
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pF1KB5 GY-MERHINEIRTAVDKVELFLKEYLHFVKGAVANAACLPELILHNKMKRELQRVEDSHQ
       .  .:  ......::  :.  ..: :.:...::.:::   .  :: :..:.::..:: ::
CCDS54 SEPQEPLVQDLQAAVAAVQSAVHELLEFARSAVGNAAHTSDRALHAKLSRQLQKMEDVHQ
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        :   .. :.           .      .::::.:  ...::.:::::.. .. ::  ::
CCDS54 TLVAHGQALDAGR--------GGSGATLEDLDRLVACSRAVPEDAKQLASFLHGNASLLF
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pF1KB5 RPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPG--DHKAQAHNKALP--PGLSKEQAP
       :   ..     :::.         ::.    :::.  :. .. ... ::  : ......:
CCDS54 RRTKAT---APGPEG---------GGT----LHPNPTDKTSSIQSRPLPSPPKFTSQDSP
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pF1KB5 DCSSSDGSERSWMDDYDYVHLQGKEEFERQQKELLEKENIMKQNKMQLEHHQLSQFQLLE
       : .. ..:: .::.::::::::::::::. ::::::: .: .:.: ::: .::.::. ::
CCDS54 D-GQYENSEGGWMEDYDYVHLQGKEEFEKTQKELLEKGSITRQGKSQLELQQLKQFERLE
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pF1KB5 QEITKPVENDISKWKPSQSL-PTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQCETHFISLLNAIDALFSC
       ::...:...:...: :.: : :  ..:.. .::::: :: .:::... .: ::.::.:. 
CCDS54 QEVSRPIDHDLANWTPAQPLAPGRTGGLGPSDRQLLLFYLEQCEANLTTLTNAVDAFFTA
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pF1KB5 VSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRNKVMNSSNQLCEQLKTIVM
       :.. :::.:::::::::::::::::::::::.::. : :.:..: . :: ::. :. :: 
CCDS54 VATNQPPKIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLSRQAKAADVRSQVTHYSNLLCDLLRGIVA
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pF1KB5 ATKMAALHYPSTTALQEMVHQVTDLSRNAQLFKRSLLEMATF
       .:: :::.::: .: :.::..: .:....: :.: : ..:  
CCDS54 TTKAAALQYPSPSAAQDMVERVKELGHSTQQFRRVLGQLAAA
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CCDS54 MLTHRPQEAEQRGRTPGPSFEWNVLAKALYDNVAESPDELSFRKGDIMTVLEQDTQGLDG
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       :.:::::  .  :              .:.::.::      :.  : ::: :: ..::: 
CCDS54 GQGYVYEAAQPEQDEYDIPRHLLAPGPQDIYDVPPVRGLLPSQYGQEVYDTPPMAVKGPN
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          :. :     :::.::.  ::        :: .:::. .:      :::. :: :: .
CCDS54 GRDPLLE-----VYDVPPSVEKGLPPSNHHAVYDVPPSVSKDVPDGPLLREETYDVPPAF
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CCDS54 AKAKPFDPARTPLVLAAPPPDSPPA-EDVY-----DVP----PPAPDLYDVPPGLRRPGP
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CCDS54 GT-------LYDVPR--ERVLPP----EVADGGVVDSGVYAVP---PPAEREAP--AEG-
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pF1KB5 NRLSFSSTGSTRSNMSTSSTSSKESSLSASPAQDKRLFLDPDTAIERLQRLQQALEMGVS
       .::: ::::::::..:.::         :.:...    :. ..:.: : ::::..   :.
CCDS54 KRLSASSTGSTRSSQSASSLE------VAGPGREP---LELEVAVEALARLQQGVSATVA
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CCDS54 HLLDLAGSAGATGSWRSPSEPQEPLVQDLQAAVAAVQSAVHELLEFARSAVGNAAHTSDR
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pF1KB5 ILHNKMKRELQRVEDSHQILSQTSHDLNECSWSLNILAINKPQNKCDDLDRFVMVAKTVP
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CCDS54 ALHAKLSRQLQKMEDVHQTLVAHGQALDAGR--------GGSGATLEDLDRLVACSRAVP
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pF1KB5 DDAKQLTTTINTNAEALFRPGPGSLHLKNGPESIMNSTEYPHGGSQGQLLHPG--DHKAQ
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CCDS54 EDAKQLASFLHGNASLLFRRTKAT---APGPEG---------GGT----LHPNPTDKTSS
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        ... ::  : ......:: .. ..:: .::.::::::::::::::. ::::::: .: .
CCDS54 IQSRPLPSPPKFTSQDSPD-GQYENSEGGWMEDYDYVHLQGKEEFEKTQKELLEKGSITR
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pF1KB5 QNKMQLEHHQLSQFQLLEQEITKPVENDISKWKPSQSL-PTTNSGVSAQDRQLLCFYYDQ
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CCDS54 QGKSQLELQQLKQFERLEQEVSRPIDHDLANWTPAQPLAPGRTGGLGPSDRQLLLFYLEQ
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pF1KB5 CETHFISLLNAIDALFSCVSSAQPPRIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLTRQVTAQDIRN
       ::... .: ::.::.:. :.. :::.:::::::::::::::::::::::.::. : :.:.
CCDS54 CEANLTTLTNAVDAFFTAVATNQPPKIFVAHSKFVILSAHKLVFIGDTLSRQAKAADVRS
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       .: . :: ::. :. :: .:: :::.::: .: :.::..: .:....: :.: : ..:  
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