Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5798
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5798, 781 aa
1>>>pF1KB5798 781 - 781 aa - 781 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0506+/-0.00101; mu= 4.9211+/- 0.060
mean_var=226.8259+/-45.468, 0's: 0 Z-trim(112.1): 117 B-trim: 19 in 2/51
Lambda= 0.085158
statistics sampled from 12770 (12887) to 12770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16
Scan time: 4.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 5267 660.5 3e-189
CCDS55981.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 445) 1937 251.2 2.8e-66
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 1187 159.1 1.7e-38
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 720 101.7 3e-21
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 684 97.2 6.4e-20
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 680 96.8 9.6e-20
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 666 95.0 3e-19
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 640 91.8 2.8e-18
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 589 85.6 2.3e-16
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 567 82.7 9.9e-16
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 569 83.1 1.1e-15
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 567 82.8 1.2e-15
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 569 83.1 1.2e-15
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 567 82.9 1.5e-15
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 555 81.4 3.7e-15
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 556 81.6 4.1e-15
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 555 81.4 4.1e-15
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 552 81.1 5.4e-15
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 541 79.7 1.2e-14
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 532 78.6 2.7e-14
CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 526 77.9 4.7e-14
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 525 77.7 5e-14
CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 520 77.1 8.2e-14
CCDS13857.2 RFPL1 gene_id:5988|Hs108|chr22 ( 317) 508 75.5 1.5e-13
CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 263) 504 74.9 1.8e-13
CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 279) 504 75.0 1.9e-13
CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 504 75.0 2e-13
CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 504 75.0 2.3e-13
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 506 75.4 2.4e-13
CCDS13904.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 288) 499 74.4 3e-13
CCDS43011.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 317) 499 74.4 3.3e-13
CCDS46694.1 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 317) 493 73.6 5.4e-13
CCDS43009.2 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 378) 493 73.7 6.2e-13
CCDS47358.1 BTNL3 gene_id:10917|Hs108|chr5 ( 466) 485 72.8 1.4e-12
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 484 72.7 1.6e-12
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 484 72.7 1.7e-12
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 479 72.1 2.5e-12
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 467 70.6 7.1e-12
CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 463 70.1 9e-12
CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 354) 452 68.6 1.9e-11
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 454 69.0 2e-11
CCDS46201.1 RFPL4A gene_id:342931|Hs108|chr19 ( 287) 447 68.0 2.5e-11
CCDS54959.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 316) 444 67.6 3.5e-11
CCDS54958.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 375) 444 67.7 4e-11
CCDS54957.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 384) 444 67.7 4.1e-11
CCDS43413.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 500) 444 67.8 5e-11
CCDS59425.1 RFPL4AL1 gene_id:729974|Hs108|chr19 ( 287) 436 66.6 6.5e-11
>>CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 (781 aa)
initn: 5267 init1: 5267 opt: 5267 Z-score: 3511.1 bits: 660.5 E(32554): 3e-189
Smith-Waterman score: 5267; 100.0% identity (100.0% similar) in 781 aa overlap (1-781:1-781)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKTPSDHLLSTLEELVPYDFEKFKFKLQNTSVQKEHSRIPRSQIQRARPVKMATLLVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAKTPSDHLLSTLEELVPYDFEKFKFKLQNTSVQKEHSRIPRSQIQRARPVKMATLLVTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YGEEYAVQLTLQVLRAINQRLLAEELHRAAIQEYSTQENGTDDSAASSSLGENKPRSLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YGEEYAVQLTLQVLRAINQRLLAEELHRAAIQEYSTQENGTDDSAASSSLGENKPRSLKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PDHPEGNEGNGPRPYGGGAASLRCSQPEAGRGLSRKPLSKRREKASEGLDAQGKPRTRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PDHPEGNEGNGPRPYGGGAASLRCSQPEAGRGLSRKPLSKRREKASEGLDAQGKPRTRSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ALPGGRSPGPCRALEGGQAEVRLRRNASSAGRLQGLAGGAPGQKECRPFEVYLPSGKMRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALPGGRSPGPCRALEGGQAEVRLRRNASSAGRLQGLAGGAPGQKECRPFEVYLPSGKMRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RSLEVTISTGEKAPANPEILLTLEEKTAANLDSATEPRARPTPDGGASADLKEGPGNPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSLEVTISTGEKAPANPEILLTLEEKTAANLDSATEPRARPTPDGGASADLKEGPGNPEH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SVTGRPPDTAASPRCHAQEGDPVDGTCVRDSCSFPEAVSGHPQASGSRSPGCPRCQDSHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVTGRPPDTAASPRCHAQEGDPVDGTCVRDSCSFPEAVSGHPQASGSRSPGCPRCQDSHE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RKSPGSLSPQPLPQCKRHLKQVQLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RKSPGSLSPQPLPQCKRHLKQVQLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KKIQKQLEHLKKLRKSGEEQRSYGEEKAVSFLKQTEALKQRVQRKLEQVYYFLEQQEHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKIQKQLEHLKKLRKSGEEQRSYGEEKAVSFLKQTEALKQRVQRKLEQVYYFLEQQEHFF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VASLEDVGQMVGQIRKAYDTRVSQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VASLEDVGQMVGQIRKAYDTRVSQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 VPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIGAQAHAVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIGAQAHAVNV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ILDAETAYPNLIFSDDLKSVRLGNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ILDAETAYPNLIFSDDLKSVRLGNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DKTAWILGACKTSISRKGNMTLSPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DKTAWILGACKTSISRKGNMTLSPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 FVDYRVGSISFYNVTARSHIYTFASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FVDYRVGSISFYNVTARSHIYTFASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGP
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 D
:
CCDS10 D
>>CCDS55981.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 (445 aa)
initn: 1937 init1: 1937 opt: 1937 Z-score: 1303.4 bits: 251.2 E(32554): 2.8e-66
Smith-Waterman score: 2078; 64.0% identity (64.0% similar) in 586 aa overlap (1-586:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAKTPSDHLLSTLEELVPYDFEKFKFKLQNTSVQKEHSRIPRSQIQRARPVKMATLLVTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAKTPSDHLLSTLEELVPYDFEKFKFKLQNTSVQKEHSRIPRSQIQRARPVKMATLLVTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YGEEYAVQLTLQVLRAINQRLLAEELHRAAIQEYSTQENGTDDSAASSSLGENKPRSLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YGEEYAVQLTLQVLRAINQRLLAEELHRAAIQ----------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PDHPEGNEGNGPRPYGGGAASLRCSQPEAGRGLSRKPLSKRREKASEGLDAQGKPRTRSP
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190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ALPGGRSPGPCRALEGGQAEVRLRRNASSAGRLQGLAGGAPGQKECRPFEVYLPSGKMRP
CCDS55 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RSLEVTISTGEKAPANPEILLTLEEKTAANLDSATEPRARPTPDGGASADLKEGPGNPEH
CCDS55 ------------------------------------------------------------
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SVTGRPPDTAASPRCHAQEGDPVDGTCVRDSCSFPEAVSGHPQASGSRSPGCPRCQDSHE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ---GRPPDTAASPRCHAQEGDPVDGTCVRDSCSFPEAVSGHPQASGSRSPGCPRCQDSHE
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370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RKSPGSLSPQPLPQCKRHLKQVQLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKSPGSLSPQPLPQCKRHLKQVQLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHK
150 160 170 180 190 200
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KKIQKQLEHLKKLRKSGEEQRSYGEEKAVSFLKQTEALKQRVQRKLEQVYYFLEQQEHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKIQKQLEHLKKLRKSGEEQRSYGEEKAVSFLKQTEALKQRVQRKLEQVYYFLEQQEHFF
210 220 230 240 250 260
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VASLEDVGQMVGQIRKAYDTRVSQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VASLEDVGQMVGQIRKAYDTRVSQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKT
270 280 290 300 310 320
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 VPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIGAQAHAVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNDHSPQHGLGSWEER
330 340 350 360 370 380
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pF1KB5 ILDAETAYPNLIFSDDLKSVRLGNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVG
CCDS55 DYTQHSMQGPKQGVPCLSLLSGQCNLAPLNANAQDFFPYLIFLRSSGADWRSGTCC
390 400 410 420 430 440
>>CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 761 init1: 619 opt: 1187 Z-score: 804.6 bits: 159.1 E(32554): 1.7e-38
Smith-Waterman score: 1191; 38.6% identity (68.7% similar) in 485 aa overlap (313-777:17-494)
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 PDGGASADLKEGPGNPEHSVTGRPPDTAASPRCHAQEGDPVDGTCVRDSCSFPEAVSGHP
: : ..:. : .. : : ..
CCDS46 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICC---ACLARC
10 20 30 40
350 360 370 380
pF1KB5 QASGSRSPGCPRCQDS----HER------------KSPGSLSPQ-P---LPQCKRHLKQV
... . .::.:... : : :. . :. : . :..: . .
CCDS46 WGTAETNVSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPL
50 60 70 80 90 100
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 QLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHKKKIQKQLEHLKKLRKSGEEQRS
.: .::. . :::..:. :.::.:: : :.::.. :..::.::.:::... ...:.
CCDS46 KL-YCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRA
110 120 130 140 150 160
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 YGEEKAVSFLKQTEALKQRVQRKLEQVYYFLEQQEHFFVASLEDVGQMVGQIRKAYDTRV
::. . .:. :. .... ..::.:. :...:. ..: ::.. . . .. :.
CCDS46 QGEQARAELLSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQF
170 180 190 200 210 220
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 SQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKTVPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQ
: .:. :..::..:: :. : :::::::: : ::. . .:: : :: ....::... :
CCDS46 SCNISHLSSLIAQLEEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQ
230 240 250 260 270 280
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 KSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIGAQAHAVNVILDAETAYPNLIFSDDLKSVRL
: :. .: : :.: ..:.:: .. :: :: ..:.: :: .::::.::.::.:..::
CCDS46 KCLFLTESLKQFTEKMQSDME--KIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRY
290 300 310 320 330 340
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 GNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVGDKTAWILGACKTSISRKGNMTL
. . :::.:.::. ::::: :..::.:::::::::. : .:.:. :. :::..:
CCDS46 SYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTS
350 360 370 380 390 400
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 SPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDYRVGSISFYNVTARSHIYT
.:.::.:.: . .:: : . : : : .. : .:::::.:: .: .:::::: : : .:
CCDS46 APQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFT
410 420 430 440 450 460
750 760 770 780
pF1KB5 FASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGPD
:. .: ::..: :: . .:::..::: :::..:
CCDS46 FSHATFCGPVRPYFSL-SYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP
470 480 490 500 510
>>CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 (475 aa)
initn: 711 init1: 584 opt: 720 Z-score: 495.0 bits: 101.7 E(32554): 3e-21
Smith-Waterman score: 720; 53.8% identity (76.9% similar) in 199 aa overlap (578-773:215-412)
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TTPQEIKQKIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIG---AQAHAVNVILDA
::::... . : :. : : : ::
CCDS47 KLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAVTLDP
190 200 210 220 230 240
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ETAYPNLIFSDDLKSVRLGNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVGDKTA
.::.:.::.:.: . ::::.. . .::.::::: . .::: : .: .:::: :::::
CCDS47 DTAHPKLILSEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTK
250 260 270 280 290 300
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 WILGACKTSISRKGNMTLSPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDY
::::.:. :.::::..: :: ::.:.. . . :::.: . : : . .::::. ::::.::
CCDS47 WILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDY
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730 740 750 760 770 780
pF1KB5 RVGSISFYNVTARSHIYTFASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGPD
..: ::::::: .:::.::. .:::::.:.: : .:::::::::.::
CCDS47 EAGVISFYNVTNKSHIFTFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEESIV
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CCDS47 PRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
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350 360 370 380
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CCDS44 KGGGSVCPVCRQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHL-FC
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CCDS44 EKDGKALCWVCAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIK
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... : .:. :.:.. .. : :: ..:. . :: . .: .....:.
CCDS44 RADWKKTVETQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQ
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pF1KB5 LLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKTVPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQKSEFV
:. ::.::. . .: ::::.. .:.:. :.:.
CCDS44 ALQELISELDRRCHSSALELLQEVIIVLERS------ESWNL------------------
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CCDS44 -KDLDITSPELRSVCHVPGLKKML--RTCAVHITLDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQQ
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CCDS44 FWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPPCQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSEC
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CCDS44 AFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGSTDY
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CCDS34 LGLVKEINRCEKV-KTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHP
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CCDS34 NLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVG
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pF1KB5 ACKTSISRKGNMTLSPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDYRVGS
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CCDS34 VCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGT
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CCDS34 LSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
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CCDS34 TRWWEDLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEA
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CCDS34 LSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKS
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CCDS34 SEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHL
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CCDS34 GDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNF-----
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CCDS34 -SNF---PRQYFA--LRKILK-----QLIA------DVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKF
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pF1KB5 LSPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDYRVGSISFYNVTARSHIY
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CCDS34 PLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIY
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CCDS34 TFTD-TFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
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CCDS31 GLWEIPGESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDL--CE
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pF1KB5 RHLKQVQLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHKKKIQKQLEHLKKLRKS
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CCDS31 RHGEKLKM-FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEE
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CCDS31 AWKLE-VGERKRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQ----PPHRQLGAEVAAAL
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pF1KB5 KAYDTRVSQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKTVPVPEKWTTPQEIKQ
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CCDS31 ASLQREAAETMQKLELNHSEL-IQQSQVLWRMIAELKERSQR------PVRWML-QDIQ-
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pF1KB5 KIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIGAQAHAVNVILDAETAYPNLIFSD
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CCDS31 --EVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLREIL--KTYAADVRLDPDTAYSRLIVSE
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pF1KB5 DLKSVRLGNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVGDKTAWILGACKTSIS
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CCDS31 DRKRVHYGDTNQKLPDNPERFYRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVD
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CCDS31 RKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAGTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVT
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pF1KB5 -ARSHIYTFASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGPD
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CCDS31 DCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
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CCDS46 EDSRQKLPEKTERFDSWPCVLGRETFTSGRHYWEVEVGDRTDWAIGVCRENVMKKGFDPM
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CCDS46 FSNVTFSGPLRPFFC--LWSSGKK--PLTICPIA-DGPERVTVIANAQDLSKEIPLSPMG
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CCDS46 EDSAPRDADTLHSKLIPTQPSQGAP
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CCDS56 ILSGEKKVEQEEKEIAQQLQEELRWRRTFLHAADVVLDPDTAHPELFLSEDRRSVRRGPY
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CCDS56 RQRVPDNPERFDSQPCVLGWESFASGKHYWEVEVENVMVWTVGVCRHSVERKGEVLLIPQ
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pF1KB5 NGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDYRVGSISFYNVTARSHIYTFAS
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CCDS56 NGFWTLEMFG-NQYRALSSPERILPLKESLCRVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPR
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 CSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPV--GGQGPD
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CCDS56 SAFTVPVRPFFRLGSDD-----SPIFICPALTGASGVMVPEEGLKLHRVGTHQSL
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781 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:23:15 2016 done: Sat Nov 5 16:23:16 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]