Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5799
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5799, 834 aa
1>>>pF1KB5799 834 - 834 aa - 834 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9470+/-0.000899; mu= 19.1976+/- 0.055
mean_var=95.5168+/-18.850, 0's: 0 Z-trim(108.3): 14 B-trim: 109 in 1/51
Lambda= 0.131230
statistics sampled from 10135 (10145) to 10135 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 4.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4720.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 ( 834) 5468 1045.9 0
CCDS34410.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 ( 835) 5456 1043.7 0
CCDS34409.2 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 ( 822) 3687 708.8 9.8e-204
CCDS34195.1 MSH3 gene_id:4437|Hs108|chr5 (1137) 588 122.1 5.3e-27
CCDS58709.1 MSH2 gene_id:4436|Hs108|chr2 ( 868) 554 115.6 3.7e-25
CCDS1834.1 MSH2 gene_id:4436|Hs108|chr2 ( 934) 554 115.6 3.9e-25
CCDS670.1 MSH4 gene_id:4438|Hs108|chr1 ( 936) 502 105.8 3.6e-22
CCDS62907.1 MSH6 gene_id:2956|Hs108|chr2 (1058) 393 85.2 6.5e-16
CCDS62906.1 MSH6 gene_id:2956|Hs108|chr2 (1230) 393 85.2 7.3e-16
CCDS1836.1 MSH6 gene_id:2956|Hs108|chr2 (1360) 393 85.3 7.9e-16
>>CCDS4720.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 (834 aa)
initn: 5468 init1: 5468 opt: 5468 Z-score: 5593.4 bits: 1045.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5468; 100.0% identity (100.0% similar) in 834 aa overlap (1-834:1-834)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHLVNIDQDTYSVLQIFKSESHPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHLVNIDQDTYSVLQIFKSESHPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSALGLRDACRSLPQSIQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSALGLRDACRSLPQSIQLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNIDPEIDEKKRRLMGLPSFLTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNIDPEIDEKKRRLMGLPSFLTEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEINGLDFMFLSEEKLHYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEINGLDFMFLSEEKLHYRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALASAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALASAAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 DYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 YLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQVAKAVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQVAKAVN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 NATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTCPHIFVATNFLSLVQLQLLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTCPHIFVATNFLSLVQLQLLPQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 GPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKLVARGKEVSDLIRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKLVARGKEVSDLIRS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB5 GKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMSQEVLPAATSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMSQEVLPAATSIL
790 800 810 820 830
>>CCDS34410.1 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 (835 aa)
initn: 4297 init1: 4297 opt: 5456 Z-score: 5581.1 bits: 1043.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5456; 99.9% identity (99.9% similar) in 835 aa overlap (1-834:1-835)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLTV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHLVNIDQDTYSVLQIFKSESHPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHLVNIDQDTYSVLQIFKSESHPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSALGLRDACRSLPQSIQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSALGLRDACRSLPQSIQLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNIDPEIDEKKRRLMGLPSFLTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNIDPEIDEKKRRLMGLPSFLTEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEINGLDFMFLSEEKLHYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEINGLDFMFLSEEKLHYRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALASAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALASAAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 DYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB5 YLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQ-VAKAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS34 YLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQQVAKAV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 NNATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTCPHIFVATNFLSLVQLQLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NNATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTCPHIFVATNFLSLVQLQLLP
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 QGPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKLVARGKEVSDLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QGPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKLVARGKEVSDLIR
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 SGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMSQEVLPAATSIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMSQEVLPAATSIL
790 800 810 820 830
>>CCDS34409.2 MSH5 gene_id:4439|Hs108|chr6 (822 aa)
initn: 3691 init1: 3107 opt: 3687 Z-score: 3771.1 bits: 708.8 E(32554): 9.8e-204
Smith-Waterman score: 5148; 94.4% identity (94.4% similar) in 852 aa overlap (1-834:1-822)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSVVTSAKQDENMTRFLGKLASQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB5 EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLT-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLTP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB5 ----------------VRALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHLVNID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGDLRFTPIPLLIPSQVRALGGLLKFLGRRRIGVELEDYNVSVPILGFKKFMLTHLVNID
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 QDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNIDPEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNIDPEI
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 DEKKRRLMGLPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DEKKRRLMGLPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDALLGDLHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVL
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 DLASRLDVLLALASAARDYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DLASRLDVLLALASAARDYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGD
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 KGRVKVITGPNSSGKSIYLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KGRVKVITGPNSSGKSIYLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISL
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 GLSTFMIDLNQ-VAKAVNNATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTCPH
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLSTFMIDLNQQVAKAVNNATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTCPH
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 IFVATNFLSLVQLQLLPQGPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFVATNFLSLVQLQLLPQGPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQV------------------
730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 LPDKLVARGKEVSDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ------------SDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQTLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFM
770 780 790 800 810
830
pF1KB5 SQEVLPAATSIL
::::::::::::
CCDS34 SQEVLPAATSIL
820
>>CCDS34195.1 MSH3 gene_id:4437|Hs108|chr5 (1137 aa)
initn: 485 init1: 416 opt: 588 Z-score: 598.3 bits: 122.1 E(32554): 5.3e-27
Smith-Waterman score: 649; 27.8% identity (59.9% similar) in 616 aa overlap (241-818:547-1135)
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 FKKFMLTHLVNIDQDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLL
. . . .: ::. .:.. . ..:.. :
CCDS34 KMLSKPENFKQLSSKMEFMTINGTTLRNLEILQNQTDMKTKGSLLWVLDHTKTSFGRRKL
520 530 540 550 560 570
280 290 300 310 320
pF1KB5 RLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNLDMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRM-KLSHTK
. : :.: : :...:::... : .. ... .. .:....: : . . .. : :
CCDS34 KKWVTQPLLKLREINARLDAVSEVLHSES----SVFGQIENHLRKLPDIERGLCSIYHKK
580 590 600 610 620 630
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 VSDWQ--VLYKTVYSA----LGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVD
: . .. ::.: .. : : :: .:.: . :. . : . . :...
CCDS34 CSTQEFFLIVKTLYHLKSEFQAIIPAVNSHIQS-DLLRTVILEIPELLSPVEHYL-KILN
640 650 660 670 680 690
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 FEGSLAENRFTVLPNID--PEIDEKKRRLMGLPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVIYIP
... . .. .. ... : : ..: ...:. . :. : .:... . . . :. :.
CCDS34 EQAAKVGDKTELFKDLSDFPLIKKRKDEIQGV---IDEI-RMHLQEIRKILKNPSAQYVT
700 710 720 730 740
450 460 470 480 490
pF1KB5 LIG--FLLSIPR-----LPS-MVEASDFE-INGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDALLGD
. : :.. : .:. :.... . .. . :. :. : . : . .
CCDS34 VSGQEFMIEIKNSAVSCIPTDWVKVGSTKAVSRFHSPFIVENYRHLNQLREQLV------
750 760 770 780 790 800
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 LHCEIRDQETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALASAARDYGYSRPRYSPQ
: : . . : .. . . : .: : ::. .: ...::..:.. : :: . .
CCDS34 LDCSAEWLDFLEKFSEHYHSLCKA-----VHHLAT-VDCIFSLAKVAKQGDYCRPTVQEE
810 820 830 840 850
560 570 580 590 600
pF1KB5 VLGVRIQNGRHPLMELC---ARTFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSIYLKQVGLIT
. :.:::::.... .:::.:. . :. :: .::::: .::: :.:::.:::
CCDS34 R-KIVIKNGRHPVIDVLLGEQDQYVPNNTDLSEDSERVMIITGPNMGGKSSYIKQVALIT
860 870 880 890 900 910
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 FMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQVAKAVNNATAQSLVL
.:: .::.:::::: :: ::.::::. . ..: : :::: .:...:. . .::.::::.
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CCDS62 YIP-LDSDTVSTTRSGAIFTKAYQRMVLDAVTLNNLEIFLNGTNGSTEG-TLLERVDTCH
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CCDS62 NVGSPLK----SQNHPDSRAIMYEETTYSKKKIIDFLSALEGFKVMCKIIGIMEEVADGF
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CCDS62 K--SKILKQVISLQTKNPEGRFPDLTVELNRWDTAFDHEKARKTGLITPKAGFDSDYDQA
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CCDS62 LADIRENEQSLLEYLEKQRNRI-GCRTIVYWGIGRNRYQLEIPE--------NFTTRNLP
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CCDS62 EEYELKSTKKGCKRYWTKTIEKKLANLINAEERRDVSLKDCMRRLFYNFDKNYKDWQSAV
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CCDS62 ECIAVLDVLLCLANYSRGGDGPMCRPVILLPEDTPPFL--ELKGSRHPCITKTFFGDDFI
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CCDS62 PNDILIGCEEEEQENGKAYCVLVTGPNMGGKSTLMRQAGLLAVMAQMGCYVPAEVCRLTP
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CCDS62 IDRVFTRLGASDRIMSGESTFFVELSETASILMHATAHSLVLVDELGRGTATFDGTAIAN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]