FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5811, 474 aa
1>>>pF1KB5811 474 - 474 aa - 474 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2014+/-0.000889; mu= 14.2492+/- 0.053
mean_var=101.1490+/-19.411, 0's: 0 Z-trim(109.0): 99 B-trim: 6 in 1/49
Lambda= 0.127524
statistics sampled from 10508 (10613) to 10508 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 3190 597.5 1e-170
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CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 771 152.4 8.7e-37
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 768 151.8 1.3e-36
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 755 149.4 6.7e-36
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CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 727 144.3 2.3e-34
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 727 144.3 2.5e-34
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 708 140.8 2.5e-33
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 701 139.5 6.1e-33
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 646 129.4 7.3e-30
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 629 126.4 8.3e-29
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 627 125.9 9.3e-29
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 625 125.6 1.3e-28
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 619 124.4 2.3e-28
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 589 118.9 1.1e-26
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 496 101.8 1.5e-21
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 477 98.3 1.7e-20
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 466 96.3 6.5e-20
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 ( 426) 419 87.6 2.7e-17
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 390) 406 85.2 1.3e-16
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 392 82.7 8.4e-16
>>CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 (474 aa)
initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190 Z-score: 3178.4 bits: 597.5 E(32554): 1e-170
Smith-Waterman score: 3190; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSP
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
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250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB5 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
430 440 450 460 470
>>CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 (470 aa)
initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158 Z-score: 3146.6 bits: 591.6 E(32554): 6e-169
Smith-Waterman score: 3158; 100.0% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (6-474:2-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAYIQLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MLEPLNEGFLSRISGLLLCRWTCRHCCQKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDGRRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSP
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130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSND
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB5 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
420 430 440 450 460 470
>>CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 (413 aa)
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Smith-Waterman score: 2730; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (62-474:1-413)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 QKCYESSCCQSSEDEVEILGPFPAQTPPWLMASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MASRSSDKDGDSVHTASEVPLTPRTNSPDG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 RRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSPLIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RRSSSDTSKSTYSLTRRISSLESRRPSSPLIDIKPIEFGVLSAKKEPIQPSVLRRTYNPD
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 DYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQYDLLHNHLTVRVIEARDL
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 PPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKPVFEERYTFEIPFLEAQR
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280 290 300 310 320 330
pF1KB5 RTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIPSSQNEVELGELLLSLNY
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVKTKKTSFLRGTIDPFYNES
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 FSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 FSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSGPSETNHWRRMLNTHRTAV
340 350 360 370 380 390
460 470
pF1KB5 EQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
:::::::::::::::::::::::
CCDS81 EQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
400 410
>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa)
initn: 708 init1: 333 opt: 771 Z-score: 773.9 bits: 152.4 E(32554): 8.7e-37
Smith-Waterman score: 771; 40.7% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (165-464:116-412)
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 KKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTD----EEILSKYQLGMLHF
:...: .::: :: . .:: :..
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pF1KB5 STQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRK
: .::. .:.: : .:.: .:: .. :. :.::::. ::::.:.. .: :.::
CCDS76 SLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPA-LDMGGT------SDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRK
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pF1KB5 TQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWK
: .:::.:..::..:. : .::...: :::.::.: .::. .::. ::. . . :.
CCDS76 TLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWR
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pF1KB5 ALIPSSQNEVE-LGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGL
: . ..: : ::.. .:: :.:.::.:.: ...::.: . ::. :::.:::.:...
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260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQ
: .: :::.. ..:..:.:::::::.:: :.......: ::. .. ..:: ::.. .:
CCDS76 KRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGY
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430 440 450 460 470
pF1KB5 YSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
:.: .: :: :: . : . :::.:. . : :
CCDS76 NSTG-AELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK
380 390 400 410
>>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (422 aa)
initn: 708 init1: 333 opt: 768 Z-score: 770.9 bits: 151.8 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 768; 40.2% identity (73.1% similar) in 301 aa overlap (165-464:123-415)
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 KKEPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDSLTDEEILSKYQLGMLHFSTQY
:... .:. :: . .:: :..: .:
CCDS90 GKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKDQALKDDDAETGLTDGEEKEEPKEEEKLGKLQYSLDY
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200 210 220 230 240 250
pF1KB5 DLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRKTQKP
:. .:.: : .:.: .:: .. :. :.::::. ::::.:.. .: :.::: .:
CCDS90 DFQNNQLLVGIIQAAELPA-LDMGGT------SDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNP
160 170 180 190 200
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pF1KB5 VFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWKALIP
::.:..::..:. : .::...: :::.::.: .::. .::. ::. . . :. :
CCDS90 VFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWRDLQS
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 SSQNEVE-LGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGLKLVK
. ..: : ::.. .:: :.:.::.:.: ...::.: . ::. :::.:::.:... : .:
CCDS90 AEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLK
270 280 290 300 310 320
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pF1KB5 TKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQYSSG
:::.. ..:..:.:::::::.:: :.......: ::. .. ..:: ::.. .: :.:
CCDS90 KKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTG
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440 450 460 470
pF1KB5 PSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
.: :: :: . : . :::.:. . : :
CCDS90 -AELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK
390 400 410 420
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
initn: 708 init1: 315 opt: 755 Z-score: 758.0 bits: 149.4 E(32554): 6.7e-36
Smith-Waterman score: 755; 40.3% identity (72.1% similar) in 305 aa overlap (167-464:116-412)
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 EPIQPSVLRRTYNPDDYFRKFEPHLYSLDSNSDDVDS-LTD-----EEILSKYQLGMLHF
..::... ::. :: .:: :.:
CCDS14 KCCCKKKKNKKEKGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQF
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 STQYDLLHNHLTVRVIEARDLPPPISHDGSRQDMAHSNPYVKICLLPDQKNSKQTGVKRK
: .::. :.::: :..: .:: .. :. :.::::. ::::.:.. .: :.::
CCDS14 SLDYDFQANQLTVGVLQAAELPA-LDMGGT------SDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRK
150 160 170 180 190
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pF1KB5 TQKPVFEERYTFEIPFLEAQRRTLLLTVVDFDKFSRHCVIGKVSVPLCEVDLVKGGHWWK
: .:.:.: .::..:. : .::.... :::.::.: .::.:.::. ::: . . :.
CCDS14 TLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNTVDLGQPIEEWR
200 210 220 230 240 250
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pF1KB5 ALIPSSQNEVE-LGELLLSLNYLPSAGRLNVDVIRAKQLLQTDVSQGSDPFVKIQLVHGL
: . ..: : ::.. :: :.:.::.:.: ...::.: . ::. :::.:::.:...
CCDS14 DLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNG
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 KLVKTKKTSFLRGTIDPFYNESFSFKVPQEELENASLVFTVFGHNMKSSNDFIGRIVIGQ
: .: :::. . :..:..::::::..: :.......: ::. .. ..:. ::.: .:.
CCDS14 KRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGS
320 330 340 350 360 370
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pF1KB5 YSSGPSETNHWRRMLNTHRTAVEQWHSLRSRAECDRVSPASLEVT
..: .: :: :: . : . :::::. . : :
CCDS14 NATG-TELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK
380 390 400 410
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CCDS58 WHQLKA
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CCDS73 RPRQPVAQWHQLKA
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CCDS74 VELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMSSVDLGRPVQAWRELQAAPREEEKLGDIC
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CCDS74 FSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]