Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5853
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5853, 322 aa
1>>>pF1KB5853 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2660+/-0.000931; mu= 16.2965+/- 0.056
mean_var=71.4476+/-15.123, 0's: 0 Z-trim(105.6): 51 B-trim: 5 in 2/47
Lambda= 0.151733
statistics sampled from 8474 (8520) to 8474 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS76422.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 ( 322) 2180 486.4 1.3e-137
CCDS73308.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 ( 552) 1885 422.0 5.4e-118
CCDS8043.1 SLC22A9 gene_id:114571|Hs108|chr11 ( 553) 1222 276.9 2.6e-74
CCDS31592.1 SLC22A25 gene_id:387601|Hs108|chr11 ( 547) 1217 275.8 5.6e-74
CCDS41661.1 SLC22A10 gene_id:387775|Hs108|chr11 ( 541) 1195 270.9 1.6e-72
CCDS8075.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 553) 929 212.7 5.3e-55
CCDS76425.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 ( 442) 926 212.0 7e-55
CCDS8074.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 ( 550) 926 212.1 8.4e-55
CCDS44632.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 506) 695 161.5 1.3e-39
CCDS44631.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 519) 695 161.5 1.3e-39
CCDS8041.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 550) 695 161.5 1.4e-39
CCDS31591.1 SLC22A6 gene_id:9356|Hs108|chr11 ( 563) 695 161.5 1.4e-39
CCDS60835.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 519) 664 154.7 1.5e-37
CCDS8042.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 542) 659 153.6 3.3e-37
CCDS60836.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 ( 445) 618 144.6 1.4e-34
CCDS53644.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 451) 576 135.4 8.3e-32
CCDS4892.1 SLC22A7 gene_id:10864|Hs108|chr6 ( 546) 512 121.4 1.6e-27
CCDS4893.2 SLC22A7 gene_id:10864|Hs108|chr6 ( 548) 498 118.4 1.3e-26
CCDS2676.1 SLC22A13 gene_id:9390|Hs108|chr3 ( 551) 462 110.5 3.2e-24
CCDS53643.1 SLC22A8 gene_id:9376|Hs108|chr11 ( 419) 429 103.2 3.8e-22
CCDS5084.1 SLC22A16 gene_id:85413|Hs108|chr6 ( 577) 429 103.3 4.9e-22
CCDS5275.1 SLC22A1 gene_id:6580|Hs108|chr6 ( 506) 416 100.4 3.2e-21
CCDS5274.1 SLC22A1 gene_id:6580|Hs108|chr6 ( 554) 416 100.4 3.4e-21
CCDS5276.1 SLC22A2 gene_id:6582|Hs108|chr6 ( 555) 391 95.0 1.5e-19
CCDS4153.1 SLC22A4 gene_id:6583|Hs108|chr5 ( 551) 389 94.5 2e-19
CCDS4154.1 SLC22A5 gene_id:6584|Hs108|chr5 ( 557) 389 94.5 2.1e-19
CCDS5277.1 SLC22A3 gene_id:6581|Hs108|chr6 ( 556) 384 93.4 4.4e-19
CCDS2677.1 SLC22A14 gene_id:9389|Hs108|chr3 ( 594) 351 86.2 6.9e-17
CCDS75389.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 ( 361) 273 69.0 6.4e-12
CCDS47363.1 SLC22A23 gene_id:63027|Hs108|chr6 ( 686) 275 69.6 7.9e-12
>>CCDS76422.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 2180 init1: 2180 opt: 2180 Z-score: 2584.3 bits: 486.4 E(32554): 1.3e-137
Smith-Waterman score: 2180; 99.4% identity (100.0% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDSVS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS76 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDTVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
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CCDS76 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFLSSWYEQSPHSLPVSEAMVDIERKIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS76 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFLSSWYEQSPHSLPVSEAMVDIERKILT
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB5 PGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
::::::::::::::::::::::
CCDS76 PGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
310 320
>>CCDS73308.1 SLC22A24 gene_id:283238|Hs108|chr11 (552 aa)
initn: 1909 init1: 1885 opt: 1885 Z-score: 2231.9 bits: 422.0 E(32554): 5.4e-118
Smith-Waterman score: 1885; 99.6% identity (100.0% similar) in 277 aa overlap (1-277:1-277)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDSVS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS73 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDTVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFLSSWYEQSPHSLPVSEAMVDIERKIVT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFLSSWKMVESARWLIINNQLDEGLKELR
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB5 PGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
CCDS73 RVAHINGKKNTEETLTTELVRSTMKKELDAVRIKTSIFSLFRAPKLRMRVFGLCFVRFAI
310 320 330 340 350 360
>>CCDS8043.1 SLC22A9 gene_id:114571|Hs108|chr11 (553 aa)
initn: 1200 init1: 1200 opt: 1222 Z-score: 1447.5 bits: 276.9 E(32554): 2.6e-74
Smith-Waterman score: 1222; 59.5% identity (83.0% similar) in 289 aa overlap (1-288:1-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDSVS
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CCDS80 MAFQDLLGHAGDLWRFQILQTVFLSIFAVATYLHFMLENFTAFIPGHRCWVHILDNDTVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
:::::.::.: :::::::::::.::.::.::.::::::::::::::::.. : :::::::
CCDS80 DNDTGALSQDALLRISIPLDSNMRPEKCRRFVHPQWQLLHLNGTFPNTSDADMEPCVDGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
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CCDS80 VYDRISFSSTIVTEWDLVCDSQSLTSVAKFVFMAGMMVGGILGGHLSDRFGRRFVLRWCY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
::.:: .::::.:::::.:: ::::.:...:... ::..: ::. : ..: : . .:
CCDS80 LQVAIVGTCAALAPTFLIYCSLRFLSGIAAMSLITNTIMLIAEWATHRFQAMGITLGMCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB5 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFL-SSWYEQSPHSLPVSEAMVDIERKIV
... : :.::::::.:::::::.::.: .:.:: ::: .: . : ..
CCDS80 SGIAFMTLAGLAFAIRDWHILQLVVSVPYFVIFLTSSWLLESARWLIINNKPEEGLKELR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KB5 TPGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
CCDS80 KAAHRSGMKNARDTLTLEILKSTMKKELEAAQKKKPSLCEMLHMPNICKRISLLSFTRFA
310 320 330 340 350 360
>>CCDS31592.1 SLC22A25 gene_id:387601|Hs108|chr11 (547 aa)
initn: 1238 init1: 1194 opt: 1217 Z-score: 1441.7 bits: 275.8 E(32554): 5.6e-74
Smith-Waterman score: 1217; 60.2% identity (83.4% similar) in 289 aa overlap (1-288:1-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDSVS
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CCDS31 MAFQDLLDQVGGLGRFQILQMVFLIMFNVIVYHQTQLENFAAFILDHRCWVHILDNDTIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
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CCDS31 DNDPGTLSQDALLRISIPFDSNLRPEKCRRFVHPQWKLIHLNGTFPNTSEPDTEPCVDGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
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CCDS31 VYDQSSFPSTIVTKWDLVCESQPLNSVAKFLFMAGMMVGGNLYGHLSDRFGRKFVLRWSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
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CCDS31 LQLAIVGTCAAFAPTILVYCSLRFLAGAATFSIIVNTVLLIVEWITHQFCAMALTLTLCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB5 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFL-SSWYEQSPHSLPVSEAMVDIERKIV
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CCDS31 ASIGHITLGSLAFVIRDQCILQLVMSAPCFVFFLFSRWLAESARWLIINNKPEEGLKELR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KB5 TPGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
CCDS31 KAAHRNGMKNAEDILTMEVLKSTMKQELEAAQKKHSLCELLRIPNICKRICFLSFVRFAS
310 320 330 340 350 360
>>CCDS41661.1 SLC22A10 gene_id:387775|Hs108|chr11 (541 aa)
initn: 1198 init1: 1167 opt: 1195 Z-score: 1415.7 bits: 270.9 E(32554): 1.6e-72
Smith-Waterman score: 1195; 56.2% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (1-303:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDSVS
:.:. ::.::::.::::. ..:. . .::.:.:.::::.: :.::::: .:::.. :
CCDS41 MAFEELLSQVGGLGRFQMLHLVFILPSLMLLIPHILLENFAAAIPGHRCWVHMLDNNTGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
:.:: ::.: ::::::::::::::.::.::.::::::::::::. .:.: :::::::::
CCDS41 GNETGILSEDALLRISIPLDSNLRPEKCRRFVHPQWQLLHLNGTIHSTSEADTEPCVDGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
:::.: : :::::.:::::. :::::.:: :...: :.::.: ::.::: ::..: . :.
CCDS41 VYDQSYFPSTIVTKWDLVCDYQSLKSVVQFLLLTGMLVGGIIGGHVSDRFGRRFILRWCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
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CCDS41 LQLAITDTCAAFAPTFPVYCVLRFLAGFSSMIIISNNSLPITEWIRPNSKALVVILSSGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB5 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFL-SSWYEQSPHSLPVSEAM---VDIER
:.::..:::::....::. :....:.:..:.:: : : .: . : ... . . :
CCDS41 LSIGQIILGGLAYVFRDWQTLHVVASVPFFVFFLLSRWLVESARWLIITNKLDEGLKALR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KB5 KIV-TPGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
:.. : ::
CCDS41 KVARTNGIKNAEETLNIEVVRSTMQEELDAAQTKTTVCDLFRNPSMRKRICILVFLRFAN
310 320 330 340 350 360
>>CCDS8075.1 SLC22A12 gene_id:116085|Hs108|chr11 (553 aa)
initn: 917 init1: 917 opt: 929 Z-score: 1100.9 bits: 212.7 E(32554): 5.3e-55
Smith-Waterman score: 929; 47.8% identity (75.5% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDSVS
:.:. ::: :::.::::. . .. . : . .::::.: .::::::.:::::....
CCDS80 MAFSELLDLVGGLGRFQVLQTMALMVSIMWLCTQSMLENFSAAVPSHRCWAPLLDNSTAQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
. :.:: . :: :::: : ::..:.:: .:::::: :.: . .: :::::::::
CCDS80 ASILGSLSPEALLAISIPPGPNQRPHQCRRFRQPQWQLLDPNATATSWSEADTEPCVDGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
::::: : ::::..:.:::.:..:: :.::...:: :.:. : ::: ::... .
CCDS80 VYDRSIFTSTIVAKWNLVCDSHALKPMAQSIYLAGILVGAAACGPASDRFGRRLVLTWSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LQLAISNTCAAFAPTFLVYCILRFLAGFSTMTILGNTFILSLEWTLPRSRSMTIMVLLCS
::.:. .: :::::.: :::..::: .:.. .. :: : .::: :.: ... . .
CCDS80 LQMAVMGTAAAFAPAFPVYCLFRFLLAFAVAGVMMNTGTLLMEWTAARARPLVMTLNSLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YSVGQMLLGGLAFAIQDWHILQLTVSTPIIVLFLSSWYEQSPHSLPVSEAMVDIERKIVT
.: :. : ...:....:: .:::.::.:... :: ::.
CCDS80 FSFGHGLTAAVAYGVRDWTLLQLVVSVPFFLCFLYSWWLAESARWLLTTGRLDWGLQELW
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB5 PGICSVSGLVLSHDVHSTYCVT
CCDS80 RVAAINGKGAVQDTLTPEVLLSAMREELSMGQPPASLGTLLRMPGLRFRTCISTLCWFAF
310 320 330 340 350 360
>>CCDS76425.1 SLC22A11 gene_id:55867|Hs108|chr11 (442 aa)
initn: 913 init1: 757 opt: 926 Z-score: 1098.7 bits: 212.0 E(32554): 7e-55
Smith-Waterman score: 926; 49.5% identity (74.6% similar) in 279 aa overlap (1-278:1-275)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGFDVLLDQVGGMGRFQICLIAFFCITNILLFPNIVLENFTAFTPSHRCWVPLLDNDS-V
:.:. ::.:.::.: :: . : . ... ...::::.: :.::::. .::: : :
CCDS76 MAFSKLLEQAGGVGLFQTLQVLTFILPCLMIPSQMLLENFSAAIPGHRCWTHMLDNGSAV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SDNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDG
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CCDS76 STN----MTPKALLTISIPPGPNQGPHQCRRFRQPQWQLLDPNATATSWSEADTEPCVDG
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70 80 90 100 110 120
pF1KB5 DNDTGTLSKDDLLRISIPLDSNLRPQKCQRFIHPQWQLLHLNGTFPNTNEPDTEPCVDGW
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60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VYDRSSFLSTIVTEWDLVCESQSLKSMVQSLFMAGSLLGGLIYGHLSDRVGRKIICKLCF
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170 180 190 200 210 220
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]