Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5864
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5864, 491 aa
1>>>pF1KB5864 491 - 491 aa - 491 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4245+/-0.000972; mu= 12.2655+/- 0.058
mean_var=97.4202+/-18.762, 0's: 0 Z-trim(107.3): 133 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.129942
statistics sampled from 9319 (9474) to 9319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 ( 491) 3359 640.4 1.3e-183
CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 ( 523) 1829 353.6 3e-97
CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 1776 343.6 2.4e-94
CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 ( 590) 1296 253.7 3.9e-67
CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 947 188.2 1.5e-47
CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 947 188.2 1.5e-47
CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 940 186.9 3.4e-47
CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 934 185.8 7.9e-47
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 922 183.5 3.5e-46
CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 838 167.8 2e-41
CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 838 167.8 2.2e-41
CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 838 167.8 2.3e-41
CCDS11922.1 SYT4 gene_id:6860|Hs108|chr18 ( 425) 734 148.3 1.6e-35
CCDS1122.1 SYT11 gene_id:23208|Hs108|chr1 ( 431) 711 144.0 3.1e-34
CCDS81952.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 413) 627 128.2 1.7e-29
CCDS76835.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 470) 627 128.3 1.8e-29
CCDS10575.1 SYT17 gene_id:51760|Hs108|chr16 ( 474) 627 128.3 1.9e-29
CCDS73103.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 421) 583 120.0 5.1e-27
CCDS7726.2 SYT8 gene_id:90019|Hs108|chr11 ( 401) 560 115.7 9.7e-26
CCDS8154.1 SYT12 gene_id:91683|Hs108|chr11 ( 421) 540 111.9 1.4e-24
CCDS73104.1 SYT15 gene_id:83849|Hs108|chr10 ( 390) 496 103.7 3.9e-22
CCDS31470.1 SYT13 gene_id:57586|Hs108|chr11 ( 426) 475 99.7 6.4e-21
CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 462 97.3 3.4e-20
CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 690) 318 70.4 7e-12
CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 694) 318 70.4 7e-12
CCDS59506.1 RASA4B gene_id:100271927|Hs108|chr7 ( 757) 304 67.8 4.6e-11
CCDS47674.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 ( 757) 304 67.8 4.6e-11
CCDS5725.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 ( 803) 304 67.8 4.9e-11
>>CCDS7778.1 SYT9 gene_id:143425|Hs108|chr11 (491 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359 Z-score: 3410.0 bits: 640.4 E(32554): 1.3e-183
Smith-Waterman score: 3359; 100.0% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (1-491:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLTLVVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLTLVVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSGSKDNNQEPLNYMDTETNEQENSEDFLDPPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSGSKDNNQEPLNYMDTETNEQENSEDFLDPPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRRQLNLSNPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRRQLNLSNPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FNIQQLQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLNFILKYDCDLEQLIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FNIQQLQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLNFILKYDCDLEQLIVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYNDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYNDLEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVDLGELMFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVDLGELMFSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 CYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNPVYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNPVYN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSYPRKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSYPRKP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB5 IAHWHSLVEKR
:::::::::::
CCDS77 IAHWHSLVEKR
490
>>CCDS8732.1 SYT10 gene_id:341359|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 2056 init1: 1549 opt: 1829 Z-score: 1859.5 bits: 353.6 E(32554): 3e-97
Smith-Waterman score: 1987; 59.2% identity (82.6% similar) in 495 aa overlap (6-489:10-500)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLT
..::..::....::: : .: ..:. .. :::. . :::::::.
CCDS87 MSFHKEDGVNSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFP--RDRGSQGGSSTDISVSLLA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LVVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSG----SKDNNQEPLNYMDTETNEQENS
.::. :::::. ::::: ::::: :. . . :. .. .. : . ..:: :...
CCDS87 VVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETE--EKKEI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EDFLDPPTPCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRR
.. : . . ..:::::::::: .::...:. . .:::::.::::::.::.:.::
CCDS87 KENEKPAVKAIEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTRHSSFRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB5 ----QLNLSNPDFNIQQ---LQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLN
:...:. ::.. ::. : :.:::::::::::.:.:.. .. . : :::::
CCDS87 HLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVKICGKLN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVF
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CCDS87 FTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 DEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEY
::.: ::: :..: :::::::::::::::::.::.:..:......:. :: .::::.
CCDS87 DETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHC
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKK
.:....::::.::::::::::::.:.:.:: ::::::::::.:::::::::::.::::::
CCDS87 ATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERL
:::.::.:::::::::::.::.::::.::. :::::::::::::::.::::..: .:: :
CCDS87 RKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDAEGL
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KB5 GRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEKR
:::::.:::.: ::::.::: :.:
CCDS87 GRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
480 490 500 510 520
>>CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 1583 init1: 1583 opt: 1776 Z-score: 1807.2 bits: 343.6 E(32554): 2.4e-94
Smith-Waterman score: 1776; 62.2% identity (84.1% similar) in 415 aa overlap (80-489:1-413)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 ISVSLLTLVVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSGSKDNNQEPLNYMDTETNEQ
.:::.. : :. : ::. ... . .
CCDS87 MPWRNKEASSPSSAN--PPLEALQSPSFRG
10 20
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ENSEDFLDPPT-PCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHN
. .. . :: : ....:::::::::: .: ...:. . .:.:::.:::.::.::.
CCDS87 NMADKLKDPSTLGFLEAAVKISHTSPDIPAEVQMSVKEHIMRHTRLQRQTTEPASSTRHT
30 40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 SIRR----QLNLSNPDFNIQQLQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKL
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CCDS87 SFKRHLPRQMHVSSVDYGNELPPAAEQPTSIGRIKPELYKQKSVDGEDAKSEATKSCGKI
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 NFILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPV
:: :.:: . : :::.: :: .:::::: :.:::::::::::::: : ::.::::::::.
CCDS87 NFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCGSSDPYVKIYLLPDRKCKLQTRVHRKTLNPT
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 FDEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIE
::: : :::::..: ::::.::.:::::::::.::.:..:.... .:. :: .::::.
CCDS87 FDENFHFPVPYEELADRKLHLSVFDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEASDLSRETSIWKDIQ
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 YVTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLK
:.:...:::::.::::::::::::::.:.:: :::::::::: :::::::::.:::::::
CCDS87 YATSESVDLGEIMFSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNLKAMDITGYSDPYVKVSLLCDGRRLK
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 KRKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAER
:.::. :.:::::::::::.::.::::.::. : :.::::::::::::::::.:: ::
CCDS87 KKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENMDQVSLLISVMDYDRVGHNEIIGVCRVGITAEG
330 340 350 360 370 380
470 480 490
pF1KB5 LGRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEKR
::::::.:::.::::::::::::::
CCDS87 LGRDHWNEMLAYPRKPIAHWHSLVEVKKSFKEGNPRL
390 400 410 420
>>CCDS12798.1 SYT3 gene_id:84258|Hs108|chr19 (590 aa)
initn: 1714 init1: 1124 opt: 1296 Z-score: 1318.7 bits: 253.7 E(32554): 3.9e-67
Smith-Waterman score: 1447; 48.3% identity (68.7% similar) in 524 aa overlap (47-491:48-571)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 AELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLTLVVTACGLALFGVSLFVSWK
: :::::::...:: ::..:.:::::::::
CCDS12 SDLCARVRDADTNDRCQEFNDRIRGYPRGPDADISVSLLSVIVTFCGIVLLGVSLFVSWK
20 30 40 50 60 70
80 90 100
pF1KB5 LCWVPWRERG---------------------LPSGSKDN-----NQEPL---NYMDTETN
:::::::..: : .:. . . .:: . ...
CCDS12 LCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHLAAGLGGHPLLGGPHHHAHAA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140
pF1KB5 EQENSEDFLDP------PTPCP-----DS-----------SMKISHTSPDIPLSTQTG--
.. ..:.: :: : :: ..: :.:::..: .:
CCDS12 HHPPFAELLEPGSLGGSDTPEPSYLDMDSYPEAAAAAVAAGVKPSQTSPELPSEGGAGSG
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB5 --IQENCAHGV---RVQRQVTEPTSSARHNSIRRQLN----LSNPDFNIQQLQK------
. . :. . ..::: . ..:. .. : :. :.:: . ..
CCDS12 LLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRYPALPRPLTQQTLTSQPDPSSEERPPALPLPL
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230
pF1KB5 ---QEQLTGIGRIKPELYK------QRSLDND-DGRRSNSKACGKLNFILKYDCDLEQLI
.:. ::.::::::. .:: . .:. ... ::...: :.: .::.
CCDS12 PGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTGAPCGRISFALRYLYGSDQLV
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYNDL
:.: .:..::::: .: :::::::::::::: : :::::::::::::.:.: : :: .:
CCDS12 VRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRKTLNPVFNETFQFSVPLAEL
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVDLGELMF
:::::::::::::::::::::::.:..:.::. : . ::.:: ....::::: :
CCDS12 AQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNLLELAEQPPDRPLWRDIVEGGSEKADLGELNF
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNPV
::::::::::::.::::: ::::::.:: ::::::.::. .:::::::::: :.:::::.
CCDS12 SLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLISEGRRLKKRKTSIKKNTLNPT
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 YNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVG-NEAERLGRDHWSEMLSYP
::::.:::: ::..... :::::.::: .::::.::::.:: . :. ::.::.:::. :
CCDS12 YNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRVGPDAADPHGREHWAEMLANP
500 510 520 530 540 550
480 490
pF1KB5 RKPIAHWHSLVEKR
:::. :::.:::..
CCDS12 RKPVEHWHQLVEEKTVTSFTKGSKGLSEKENSE
560 570 580 590
>>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa)
initn: 1040 init1: 523 opt: 947 Z-score: 967.4 bits: 188.2 E(32554): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 947; 51.7% identity (79.8% similar) in 267 aa overlap (222-487:141-405)
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 LTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLNFILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKD
:::.. : :: . .::.: : .:..::: :
CCDS76 GKTMKDQDDDAETGLTDGEEKEEPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALD
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 FSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFD
..::::::::..::::.: : .::::::::::::.: : : :::..: .. : ..:::::
CCDS76 MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFD
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 RFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVD-LGELMFSLCYLPTAGRLT
:::.::.::. : .. .:: . :.:.. . ... . ::.. ::: :.::::.::
CCDS76 RFSKHDIIGEFKVP--MNTVDFGHVTEEWRDLQSAEKEEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLT
240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 ITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPE
..:..:.::: ::. : ::::::. :: .:.::::.::. :.::::: :::.. :.:: :
CCDS76 VVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFE
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 NIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEK
.:..... ..:.:::..:.:. :: :: .. :::.::. ::.:::.::.:
CCDS76 QIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVE
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 R
CCDS76 EEVDAMLAVKK
410
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200 210 220 230 240 250
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:::.. : :: . .::.: : .:..::: :
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260 270 280 290 300 310
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..::::::::..::::.: : .::::::::::::.: : : :::..: .. : ..:::::
CCDS90 MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFKVPYSELGGKTLVMAVYDFD
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240 250 260 270 280 290
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CCDS90 VVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFE
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pF1KB5 NIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEK
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CCDS90 QIQKVQVVVTVLDYDKIGKNDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVE
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 R
CCDS90 EEVDAMLAVKK
420
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. : . . :. . . :.. :: . :. . ... ::. . : . :
CCDS12 ALATIVL---VSGLLI---FSCCFCLYRKSCRRRTGKKSQAQAQVH-LQEVKGLGQSYID
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...::. . . . :.. .: :.:.. : :: . ::.: : .:..: : :..:.
CCDS12 KVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGGS
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pF1KB5 SDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSR
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CCDS12 SDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSR
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 HDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVD-LGELMFSLCYLPTAGRLTITII
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CCDS12 NDAIGEVRVP--MSSVDLGRPVQAWRELQAAPREEQEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVL
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380 390 400 410 420 430
pF1KB5 KARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQ
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CCDS12 EAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQK
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pF1KB5 IHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEKR
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CCDS12 VQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVR
330 340 350 360 370 380
CCDS12 LLPAP
>>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa)
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pF1KB5 LTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLNFILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKD
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CCDS14 MKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLTVGVLQAAELPALD
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 FSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFD
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CCDS14 MGGTSDPYVKVFLLPDKKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFKVPYQELGGKTLVMAIYDFD
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 RFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVD-LGELMFSLCYLPTAGRLT
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CCDS14 RFSKHDIIGEVKVP--MNTVDLGQPIEEWRDLQGGEKEEPEKLGDICTSLRYVPTAGKLT
240 250 260 270 280
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pF1KB5 ITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPE
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CCDS14 VCILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFE
290 300 310 320 330 340
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CCDS14 QIQKVQVVVTVLDYDKLGKNEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPE
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pF1KB5 R
CCDS14 EEVDALLGKNK
410
>>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (382 aa)
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CCDS74 RKDSRTPPPCSRSPQPRGLHRPTRLPTPVASATAQVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHEL
50 60 70 80 90 100
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CCDS74 GRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGGSSDPYVRVYLLPDKRRRYETKVHRQTL
110 120 130 140 150 160
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CCDS74 NPHFGETFAFKVPYVELGGRVLVMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVP--MSSVDLGRPVQAWR
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pF1KB5 DIEYVTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGR
... . .. ::.. ::: :.::::.::. ...:.::: ::. : ::::::: :. :.
CCDS74 ELQAAPREEEKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHLLQGGK
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410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RLKKRKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNE
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CCDS74 KVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGKNEAIGRVAVGAA
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pF1KB5 AERLGRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEKR
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CCDS74 AGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLRPPDRVRLLPAP
350 360 370 380
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CCDS31 ESDRRTEPRSSVSDLVNSLTSEMLMLSPGSEEDEAHEGCSRENLGRIQFSVGYNFQESTL
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 IVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFP-VPYN
::: :: .::::::::::::.::::::::.: : .:::.::.::: ..:.::: ::.
CCDS31 TVKIMKAQELPAKDFSGTSDPFVKIYLLPDKKHKLETKVKRKNLNPHWNETFLFEGFPYE
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pF1KB5 DLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVDLGEL
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CCDS31 KVVQRILYLQVLDYDRFSRNDPIGEVSIP--LNKVDLTQMQTFWKDLKPCSDGSGSRGEL
220 230 240 250 260 270
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CCDS31 LLSLCYNPSANSIIVNIIKARNLKAMDIGGTSDPYVKVWLMYKDKRVEKKKTVTMKRNLN
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 PVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSY
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::.:.:.::.:
CCDS31 PRQPVAQWHQLKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]