Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5887
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5887, 497 aa
1>>>pF1KB5887 497 - 497 aa - 497 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0215+/-0.000988; mu= 15.1934+/- 0.059
mean_var=101.1504+/-21.877, 0's: 0 Z-trim(107.3): 63 B-trim: 356 in 1/51
Lambda= 0.127524
statistics sampled from 9454 (9514) to 9454 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 3.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs108|chrX ( 497) 3440 643.7 1.3e-184
CCDS12863.1 BIRC8 gene_id:112401|Hs108|chr19 ( 236) 1358 260.4 1.5e-69
CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 ( 618) 688 137.5 4.1e-32
CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 ( 569) 671 134.3 3.3e-31
CCDS4009.1 NAIP gene_id:4671|Hs108|chr5 (1403) 444 92.9 2.5e-18
CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs108|chr11 ( 604) 344 74.2 4.5e-13
CCDS13512.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 ( 280) 330 71.4 1.5e-12
CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 ( 298) 330 71.4 1.6e-12
>>CCDS14606.1 XIAP gene_id:331|Hs108|chrX (497 aa)
initn: 3440 init1: 3440 opt: 3440 Z-score: 3427.7 bits: 643.7 E(32554): 1.3e-184
Smith-Waterman score: 3440; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGEGDT
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CCDS14 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGEGDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYLENSATQSTNSGIQNGQYKVENY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYLENSATQSTNSGIQNGQYKVENY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPAMYSEEARLKSFQNWPDYAHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPAMYSEEARLKSFQNWPDYAHLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLGRNLNIRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLGRNLNIRSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSVNKEQLARAGFYALGEGDKVKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSVNKEQLARAGFYALGEGDKVKC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIHLTHSLEECLVRTTEKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIHLTHSLEECLVRTTEKTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEKIQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEKIQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIVFVPCGHLVTCKQCAEAVDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIVFVPCGHLVTCKQCAEAVDK
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB5 CPMCYTVITFKQKIFMS
:::::::::::::::::
CCDS14 CPMCYTVITFKQKIFMS
490
>>CCDS12863.1 BIRC8 gene_id:112401|Hs108|chr19 (236 aa)
initn: 1358 init1: 1358 opt: 1358 Z-score: 1362.0 bits: 260.4 E(32554): 1.5e-69
Smith-Waterman score: 1358; 80.1% identity (94.9% similar) in 236 aa overlap (262-497:1-236)
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GRNLNIRSESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSVNKEQLARAGFYA
:. ::::..:::::.:::::::::::::::
CCDS12 MTGYEARLITFGTWMYSVNKEQLARAGFYA
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIHLTHSLEEC
.:. :::.::::::::..:::.:::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::
CCDS12 IGQEDKVQCFHCGGGLANWKPKEDPWEQHAKWYPGCKYLLEEKGHEYINNIHLTRSLEGA
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LVRTTEKTPSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEKIQISGSNYKSLEVLV
::.::.::::::.::.:::: :::.::::::::.:::.::::::.:: ::::::.:::::
CCDS12 LVQTTKKTPSLTKRISDTIFPNPMLQEAIRMGFDFKDVKKIMEERIQTSGSNYKTLEVLV
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 ADLVNAQKDSMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIVFVPCGHLVTC
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CCDS12 ADLVSAQKDTTENELNQTSLQREISPEEPLRRLQEEKLCKICMDRHIAVVFIPCGHLVTC
160 170 180 190 200 210
480 490
pF1KB5 KQCAEAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
::::::::.:::: .:: :::..:::
CCDS12 KQCAEAVDRCPMCSAVIDFKQRVFMS
220 230
>>CCDS8316.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 (618 aa)
initn: 1048 init1: 507 opt: 688 Z-score: 690.1 bits: 137.5 E(32554): 4.1e-32
Smith-Waterman score: 992; 37.5% identity (64.8% similar) in 437 aa overlap (22-439:42-457)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAG
.: :. :..:...::.: ::: .:::::
CCDS83 GPSYQNIKSIMEDSTILSDWTNSNKQKMKYDFSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAG
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FLYTGEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYLENSATQSTNSGIQ
: ::: .: :.:: : .: :. ::: . .:... :.: ::... . .. : :.. .
CCDS83 FYYTGVNDKVKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPM
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KB5 NGQYKVENYLGSRDHFALDRPSETH-ADYLLRTGQVVDISDT-IYPRNPAMYSEEARLKS
... ... . .: .: : . . : . : :::.. : . :: .::::. .
CCDS83 RNSF-AHSLSPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLT
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FQNWPDYAHLTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFF
.. :: . :.: ::: ::.:: : ::.: :: :::::.:::: : : :::::::::: :
CCDS83 YHMWP-LTFLSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPF
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VLGRNLNIRSESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSV--NKEQLARA
. . ..: : : : :: . ::. :: : :: . :::: :
CCDS83 LENSLETLR-----------FSIS-----NLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASA
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GFYALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIH--LT
::: .:..: :::: : ::: :. ..::: .::::.: :..:...::::....:.
CCDS83 GFYYVGRNDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB5 HSLEECLVRTTEKT-------------PSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKI
: ::. :. :.. : :. . : .....:.:. :..:::. .:.
CCDS83 HLLEQ-LLSTSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQT
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 MEEKIQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKI
.. :: .: :::... .:. :.::. .. ..:. . . .:.....
CCDS83 VQSKILTTGENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQA--EEMASDDLSLIRKNRMALFQ
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB5 CMDRNIAIVFVPCGHLVTCKQCAEAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
CCDS83 QLTCVLPILDNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS58169.1 BIRC2 gene_id:329|Hs108|chr11 (569 aa)
initn: 1036 init1: 495 opt: 671 Z-score: 673.7 bits: 134.3 E(32554): 3.3e-31
Smith-Waterman score: 975; 37.5% identity (64.8% similar) in 429 aa overlap (30-439:1-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGEGDT
..:...::.: ::: .:::::: ::: .:
CCDS58 MSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGVNDK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYLENSATQSTNSGIQNGQYKVENY
:.:: : .: :. ::: . .:... :.: ::... . .. : :.. . ... ...
CCDS58 VKCFCCGLMLDNWKLGDSPIQKHKQLYPSCSFIQNLVSASLGSTSKNTSPMRNSF-AHSL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB5 LGSRDHFALDRPSETH-ADYLLRTGQVVDISDT-IYPRNPAMYSEEARLKSFQNWPDYAH
. .: .: : . . : . : :::.. : . :: .::::. ... :: .
CCDS58 SPTLEHSSLFSGSYSSLSPNPLNSRAVEDISSSRTNPYSYAMSTEEARFLTYHMWP-LTF
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLGRNLNIR
:.: ::: ::.:: : ::.: :: :::::.:::: : : :::::::::: :. . ..:
CCDS58 LSPSELARAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDDAMSEHRRHFPNCPFLENSLETLR
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSV--NKEQLARAGFYALGEGD
: : : :: . ::. :: : :: . :::: :::: .:..:
CCDS58 -----------FSIS-----NLSMQTHAARMRTFMYWPSSVPVQPEQLASAGFYYVGRND
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIH--LTHSLEECLVR
:::: : ::: :. ..::: .::::.: :..:...::::....:. : ::. :.
CCDS58 DVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVEHAKWFPRCEFLIRMKGQEFVDEIQGRYPHLLEQ-LLS
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400
pF1KB5 TTEKT-------------PSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEKIQISG
:.. : :. . : .....:.:. :..:::. .:. .. :: .:
CCDS58 TSDTTGEENADPPIIHFGPGESSSEDAVMMNTPVVKSALEMGFNRDLVKQTVQSKILTTG
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 SNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKICMDRNIAIV
:::... .:. :.::. .. ..:. . . .:.....
CCDS58 ENYKTVNDIVSALLNAEDEKREEEKEKQA--EEMASDDLSLIRKNRMALFQQLTCVLPIL
380 390 400 410 420 430
470 480 490
pF1KB5 FVPCGHLVTCKQCAEAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
CCDS58 DNLLKANVINKQEHDIIKQKTQIPLQARELIDTILVKGNAAANIFKNCLKEIDSTLYKNL
440 450 460 470 480 490
>>CCDS4009.1 NAIP gene_id:4671|Hs108|chr5 (1403 aa)
initn: 745 init1: 397 opt: 444 Z-score: 442.6 bits: 92.9 E(32554): 2.5e-18
Smith-Waterman score: 517; 29.7% identity (54.7% similar) in 408 aa overlap (26-410:60-422)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYT
: .:::::... : . .: ::: .:
CCDS40 DAVQLAKELEEEEQKERAKMQKGYNSQMRSEAKRLKTFVTYEPYSSWIPQEMAAAGFYFT
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GEGDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFYLENSATQSTNSGIQNGQY
: . ..:: : . . :.. :.: :: :.... ..: . .
CCDS40 GVKSGIQCFCCSLILFGAGLTRLPIEDHKRFHPDC----GFLLNKDV-----GNIAKYDI
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KVENYLGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPAMYSEEARLKSFQNWPD
.:.: : :: :: :.. . ::::: ::.:::
CCDS40 RVKN-LKSR----------------LRGGKM------------RYQEEEARLASFRNWPF
150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YAH-LTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLGRN
:.. ..: :. ::. .:: : :::: ::: : ::: : :.:: . ::.: :. ...
CCDS40 YVQGISPCVLSEAGFVFTGKQDTVQCFSCGGCLGNWEEGDDPWKEHAKWFPKCEFLRSKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KB5 LN------IRSESDAVS-SDRNFPNS---TNLPR-----NPSMADYEA-RIFTFGTWIY-
. :.: . :. . ..: :: .:: : :. :: :. .: :
CCDS40 SSEEITQYIQSYKGFVDITGEHFVNSWVQRELPMASAYCNDSIFAYEELRLDSFKDWPRE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 -SVNKEQLARAGFYALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQ
.:. ::.::.. : : :.:: ::: : :. ..:: ..:.. .:.: .: ..:..
CCDS40 SAVGVAALAKAGLFYTGIKDIVQCFSCGGCLEKWQEGDDPLDDHTRCFPNCPFLQNMKSS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 -EYINNIHLTHSLEECLVRTTEKTPSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFS--FKDIKKIM
: ... : : : :.:.. ..:.: .:.: : . .: . :.. :..
CCDS40 AEVTPDLQSRGELCELLETTSESN------LEDSIAVGPIVPE-MAQGEAQWFQEAKNLN
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 EE-KIQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKI
:. . ...... . .:
CCDS40 EQLRAAYTSASFRHMSLLDISSDLATDHLLGCDLSIASKHISKPVQEPLVLPEVFGNLNS
410 420 430 440 450 460
>>CCDS8315.1 BIRC3 gene_id:330|Hs108|chr11 (604 aa)
initn: 1195 init1: 302 opt: 344 Z-score: 348.2 bits: 74.2 E(32554): 4.5e-13
Smith-Waterman score: 985; 37.8% identity (64.0% similar) in 439 aa overlap (26-443:29-449)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTFNSFEGSKTCVPADINKEEEFVEEFNRLKTFANFPSGSPVSASTLARAGFLYTGE
:. :..:...::.: ::: .:::::: :::
CCDS83 MNIVENSIFLSNLMKSANTFELKYDLSCELYRMSTYSTFPAGVPVSERSLARAGFYYTGV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GDTVRCFSCHAAVDRWQYGDSAVGRHRKVSPNCRFINGFY----LENSATQSTNSGIQNG
.: :.:: : .: :. ::: . .:.:. :.:::.... :: .. . :.. :.
CCDS83 NDKVKCFCCGLMLDNWKRGDSPTEKHKKLYPSCRFVQSLNSVNNLEATSQPTFPSSVTNS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QYKVENYLGSRDHFALDRPSETHADYLLRTGQVVDISDTIYPR-NPAMYSEEARLKSFQN
... . .: . . :..: :.: . . :: .:.::: .::.
CCDS83 THSLLPGTENSGYFRGSYSNSPSNPVNSRANQ--DFSALMRSSYHCAMNNENARLLTFQT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 WPDYAHLTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFCCGGKLKNWEPCDRAWSEHRRHFPNCFFVLG
:: . :.: .::.::.:: : ::.: :: :::::.:::: : : ::: ::::.: :.
CCDS83 WP-LTFLSPTDLAKAGFYYIGPGDRVACFACGGKLSNWEPKDNAMSEHLRHFPKCPFI--
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RNLNIRSESDAVSSDRNFPNSTNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSV--NKEQLARAGFY
:.. ...: . .:: :: . ::. :: .: :: : :::: ::::
CCDS83 -------ENQLQDTSRY--TVSNL----SMQTHAARFKTFFNWPSSVLVNPEQLASAGFY
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB5 ALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLEQKGQEYINNIHLT--HSL
.:..: :::: : ::: :. ..::: :::::.: :.::.. ::::.: ... . : :
CCDS83 YVGNSDDVKCFCCDGGLRCWESGDDPWVQHAKWFPRCEYLIRIKGQEFIRQVQASYPHLL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB5 EECLVRT-------TEKT-----PSLTRRIDDTIFQNPMVQEAIRMGFSFKDIKKIMEEK
:. : . .:.. :. . : ....:... :..:::: . .:. ...:
CCDS83 EQLLSTSDSPGDENAESSIIHFEPGEDHSEDAIMMNTPVINAAVEMGFSRSLVKQTVQRK
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 IQISGSNYKSLEVLVADLVNAQKDSMQDESSQTSLQKEISTEEQLRRLQEEKLCKICMDR
: .: ::. .. :: ::.::. . ..: ... .:: . .:.
CCDS83 ILATGENYRLVNDLVLDLLNAEDEIREEERERATEEKESNDLLLIRKNRMALFQHLTCVI
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490
pF1KB5 NIAIVFVPCGHLVTCKQCAEAVDKCPMCYTVITFKQKIFMS
CCDS83 PILDSLLTAGIINEQEHDVIKQKTQTSLQARELIDTILVKGNIAATVFRNSLQEAEAVLY
470 480 490 500 510 520
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>>CCDS13513.1 BIRC7 gene_id:79444|Hs108|chr20 (298 aa)
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CCDS13 AAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQSWKRGDDPWTEHAKWFPSCQFLLRSKGRDFVHSVQE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]