Result of FASTA (omim) for
pF1KB5892
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5892, 524 aa
1>>>pF1KB5892 524 - 524 aa - 524 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3366+/-0.000453; mu= 13.6956+/- 0.028
mean_var=110.0369+/-23.316, 0's: 0 Z-trim(113.0): 415 B-trim: 965 in 1/49
Lambda= 0.122266
statistics sampled from 21662 (22159) to 21662 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 8.990
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524) 3406 612.2 1.2e-174
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524) 3406 612.2 1.2e-174
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465) 2786 502.8 9e-142
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331) 2129 386.8 5.3e-107
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1630) 2107 383.5 2.7e-105
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog (1655) 2107 383.5 2.7e-105
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255) 1269 235.6 6.9e-61
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438) 1269 235.6 7.7e-61
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472) 1269 235.6 7.8e-61
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490) 1269 235.6 7.9e-61
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495) 1269 235.6 7.9e-61
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537) 1269 235.6 8.1e-61
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857377 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1541) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857376 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1547) 1269 235.6 8.1e-61
XP_016857375 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 1269 235.6 8.3e-61
XP_016857374 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594) 1269 235.6 8.3e-61
XP_016865126 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1298) 1258 233.6 2.7e-60
NP_001240630 (OMIM: 606944) erbin isoform 9 [Homo (1367) 1258 233.6 2.8e-60
XP_016865125 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1415) 1258 233.7 2.9e-60
XP_005248612 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1456) 1258 233.7 3e-60
XP_006714723 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1246) 1255 233.1 3.8e-60
NP_001006600 (OMIM: 606944) erbin isoform 7 [Homo (1302) 1255 233.1 3.9e-60
NP_001240627 (OMIM: 606944) erbin isoform 4 [Homo (1346) 1255 233.1 4e-60
NP_061165 (OMIM: 606944) erbin isoform 2 [Homo sap (1371) 1255 233.1 4.1e-60
NP_001240626 (OMIM: 606944) erbin isoform 1 [Homo (1412) 1255 233.1 4.2e-60
NP_001240628 (OMIM: 606944) erbin isoform 8 [Homo (1419) 1255 233.1 4.2e-60
XP_005248611 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 1255 233.1 4.3e-60
XP_016865124 (OMIM: 606944) PREDICTED: protein LAP (1460) 1255 233.1 4.3e-60
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536) 615 119.9 1.9e-26
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 521 103.4 2e-21
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 521 103.4 2e-21
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 521 103.4 2e-21
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582) 521 103.4 2e-21
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582) 521 103.4 2e-21
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582) 521 103.4 2e-21
XP_011542154 (OMIM: 605352) PREDICTED: malignant f (1003) 478 96.0 5.8e-19
NP_004216 (OMIM: 605352) malignant fibrous histioc (1052) 478 96.0 6.1e-19
NP_001243193 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1258) 438 89.0 9.2e-17
XP_005256615 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1268) 438 89.0 9.3e-17
NP_002009 (OMIM: 600362) protein flightless-1 homo (1269) 438 89.0 9.3e-17
XP_005256613 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1295) 438 89.0 9.5e-17
XP_005256612 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1296) 438 89.0 9.5e-17
NP_001243194 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1214) 429 87.4 2.7e-16
XP_011539446 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803) 406 83.2 3.3e-15
XP_016856372 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803) 406 83.2 3.3e-15
XP_005270760 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803) 406 83.2 3.3e-15
XP_005270758 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803) 406 83.2 3.3e-15
XP_011539445 (OMIM: 612888) PREDICTED: volume-regu ( 803) 406 83.2 3.3e-15
>>XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re (524 aa)
initn: 3406 init1: 3406 opt: 3406 Z-score: 3256.6 bits: 612.2 E(85289): 1.2e-174
Smith-Waterman score: 3406; 99.8% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
490 500 510 520
>>NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-containin (524 aa)
initn: 3406 init1: 3406 opt: 3406 Z-score: 3256.6 bits: 612.2 E(85289): 1.2e-174
Smith-Waterman score: 3406; 99.8% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
490 500 510 520
>>XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re (465 aa)
initn: 2784 init1: 2784 opt: 2786 Z-score: 2666.3 bits: 502.8 E(85289): 9e-142
Smith-Waterman score: 2786; 97.1% identity (98.7% similar) in 447 aa overlap (78-524:24-465)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 LRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKAL
..::..: . .:::::::::::::::
XP_011 MSHLYSTSGHKVFMGGEEKGELHLGNFYELCQ-----QEIPEIPESISFCKAL
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 QVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLP
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDV
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDV
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 SENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGE
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 CESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRL
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 TRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTG
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 EKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDEKDE
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 EDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
410 420 430 440 450 460
>>XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-rich re (331 aa)
initn: 2129 init1: 2129 opt: 2129 Z-score: 2042.0 bits: 386.8 E(85289): 5.3e-107
Smith-Waterman score: 2129; 99.7% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEQ
310 320 330
>>NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog isof (1630 aa)
initn: 2902 init1: 1992 opt: 2107 Z-score: 2011.4 bits: 383.5 E(85289): 2.7e-105
Smith-Waterman score: 2144; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-499:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
:..:::::::::::::.::::::: ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
NP_056 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
NP_056 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
:..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..:::::::: :: ::. : .::.::
NP_056 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
::.:.. ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
NP_056 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.::::
NP_056 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
:..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
NP_056 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
:::::::::: ::..:: :.::::::..::.::.: :::. : ::::.::: :::: :
NP_056 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
: :. . :.: .:.:.. .:::.:.:.: :: :: : : :
NP_056 --PPSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB5 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
:::::::.::: ::...:. :..
NP_056 QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
480 490 500 510 520 530
>>NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog isof (1655 aa)
initn: 2902 init1: 1992 opt: 2107 Z-score: 2011.3 bits: 383.5 E(85289): 2.7e-105
Smith-Waterman score: 2144; 64.5% identity (85.3% similar) in 504 aa overlap (1-499:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVK
:..:::::::::::::.::::::: ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
NP_874 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
NP_874 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELD
:..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..:::::::: :: ::. : .::.::
NP_874 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
::.:.. ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
NP_874 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQ
::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.::::
NP_874 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
:..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
NP_874 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HVLDVAGNRLLHLPLSLTALKLKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLP
:::::::::: ::..:: :.::::::..::.::.: :::. : ::::.::: :::: :
NP_874 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB5 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
: :. . :.: .:.:.. .:::.:.:.: :: :: : : :
NP_874 --PPSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB5 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
:::::::.::: ::...:. :..
NP_874 QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
480 490 500 510 520 530
>>XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re (1255 aa)
initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269 Z-score: 1214.1 bits: 235.6 E(85289): 6.9e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:72-529)
10 20 30
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRY
:: : : : : :::: ::.:.. .
XP_016 RAALRKRPEEELQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEI
:.:::: :::::..:::.:.:. ::::.. ::... :: ::....: :::.:.: .
XP_016 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGV
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 PEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA
:.::.:. :: : . . : ::...::..: .: ::: : .:: :. :: :.: : .:
XP_016 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ
:::::: : :: :. .: .::.:::::::. .::: . . .:..::.:.: :. ::
XP_016 ILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPG
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVD
::.:: :. ::.:.::.: . .::: .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::
XP_016 SIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVD
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 QNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC
.:.::.::...:. : :. . :.: .::..:: :..: .: .:.: : ::.:::.:
XP_016 DNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSC
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 CSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQ
..::. .:.:.: .: :..: .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::.
XP_016 KNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSK
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 PLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVN
:. .::.. : ...:: ..:: .: .:.. .. .. . :.:. .
XP_016 ALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQ
470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEV
:... ::.:....:
XP_016 RMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQ
520 530 540 550 560 570
>>XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re (1438 aa)
initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269 Z-score: 1213.3 bits: 235.6 E(85289): 7.7e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:20-477)
10 20 30 40
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEELLLDA
:: : : : : :::: ::.:.. . :.:::: :::
XP_016 MQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNFERTLEELYLDA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 NQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCK
::..:::.:.:. ::::.. ::... :: ::....: :::.:.: . :.::.:. ::
XP_016 NQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCCK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLASLELRENLLTY
: . . : ::...::..: .: ::: : .:: :. :: :.: : .: :::::: :
XP_016 CLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLRILELRENHLKT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCL
:: :. .: .::.:::::::. .::: . . .:..::.:.: :. :: ::.:: :. :
XP_016 LPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVYL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVDQNRLTQLPEAV
:.:.::.: . .::: .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::.:.::.::...
XP_016 DMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVDDNQLTMLPNTI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDN
:. : :. . :.: .::..:: :..: .: .:.: : ::.:::.: ..::. .:.:
XP_016 GNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSCKNVTVMSLRSN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 RLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQPLLTFQTDTDY
.: .: :..: .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::. :. .::..
XP_016 KLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSKALIPLQTEAHP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 TTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVEDE
: ...:: ..:: .: .:.. .. .. . :.:. .:... ::.
XP_016 ETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQRMTVAFEFEDK
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 KDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
:....:
XP_016 KEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQDMPVPQNDPQL
480 490 500 510 520 530
>>XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re (1472 aa)
initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269 Z-score: 1213.1 bits: 235.6 E(85289): 7.8e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:54-511)
10 20 30
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRY
:: : : : : :::: ::.:.. .
XP_016 RAALRKRPEEELQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEI
:.:::: :::::..:::.:.:. ::::.. ::... :: ::....: :::.:.: .
XP_016 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 PEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA
:.::.:. :: : . . : ::...::..: .: ::: : .:: :. :: :.: : .:
XP_016 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ
:::::: : :: :. .: .::.:::::::. .::: . . .:..::.:.: :. ::
XP_016 ILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPG
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVD
::.:: :. ::.:.::.: . .::: .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::
XP_016 SIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVD
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 QNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC
.:.::.::...:. : :. . :.: .::..:: :..: .: .:.: : ::.:::.:
XP_016 DNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSC
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 CSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQ
..::. .:.:.: .: :..: .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::.
XP_016 KNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSK
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 PLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVN
:. .::.. : ...:: ..:: .: .:.. .. .. . :.:. .
XP_016 ALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQ
450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEV
:... ::.:....:
XP_016 RMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQ
500 510 520 530 540 550
>>XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-rich re (1490 aa)
initn: 1122 init1: 1122 opt: 1269 Z-score: 1213.1 bits: 235.6 E(85289): 7.9e-61
Smith-Waterman score: 1269; 44.3% identity (73.0% similar) in 467 aa overlap (9-470:72-529)
10 20 30
pF1KB5 MFHCIPLWRCNRHVESI----DKRHCSLVYVPEEIYRY
:: : : : : :::: ::.:.. .
XP_016 RAALRKRPEEELQCLEMTTKRKIIGRLVPCRCFRGEEEIISVLDYSHCSLQQVPKEVFNF
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ARSLEELLLDANQLRELPEQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEI
:.:::: :::::..:::.:.:. ::::.. ::... :: ::....: :::.:.: .
XP_016 ERTLEELYLDANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGV
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 PEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYNLA
:.::.:. :: : . . : ::...::..: .: ::: : .:: :. :: :.: : .:
XP_016 QEFPENIKCCKCLTIIEASVNPISKLPDGFTQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLVKLR
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SLELRENLLTYLPDSLTQLRRLEELDLGNNEIYNLPESVGALLHLKDLWLDGNQLSELPQ
:::::: : :: :. .: .::.:::::::. .::: . . .:..::.:.: :. ::
XP_016 ILELRENHLKTLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPG
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSILKVD
::.:: :. ::.:.::.: . .::: .: ::..:.:.:. .::.:: ::::. ::::
XP_016 SIGKLKMLVYLDMSKNRIETVDMDISGCEALEDLLLSSNMLQQLPDSIGLLKKLTTLKVD
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 QNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGC
.:.::.::...:. : :. . :.: .::..:: :..: .: .:.: : ::.:::.:
XP_016 DNQLTMLPNTIGNLSLLEEFDCSCNELESLPSTIGYLHSLRTLAVDENFLPELPREIGSC
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 CSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATELHVLDVAGNRLLHLPLSLTALK-LKALWLSDNQSQ
..::. .:.:.: .: :..: .:.::... ::: .::.:.: :: : :::::::::.
XP_016 KNVTVMSLRSNKLEFLPEEIGQMQKLRVLNLSDNRLKNLPFSFTKLKELAALWLSDNQSK
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 PLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVN
:. .::.. : ...:: ..:: .: .:.. .. .. . :.:. .
XP_016 ALIPLQTEAHPETKQRVLTNYMFPQ---QPRGDEDF------QSDSDSFNPTLWEEQRQQ
470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 RVSAIRFVEDEKDEEDNETRTLLRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEV
:... ::.:....:
XP_016 RMTVAFEFEDKKEDDENAGKVKDLSCQAPWERGQRGITLQPARLSGDCCTPWARCDQQIQ
520 530 540 550 560 570
524 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 10:36:37 2016 done: Sat Nov 5 10:36:39 2016
Total Scan time: 8.990 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]