Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5907
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5907, 504 aa
1>>>pF1KB5907 504 - 504 aa - 504 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9248+/-0.00115; mu= 0.9761+/- 0.068
mean_var=191.5449+/-38.670, 0's: 0 Z-trim(108.3): 33 B-trim: 11 in 1/51
Lambda= 0.092670
statistics sampled from 10083 (10113) to 10083 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 3.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1297.1 MYOC gene_id:4653|Hs108|chr1 ( 504) 3319 456.7 2.8e-128
CCDS65183.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 458) 757 114.1 3.4e-25
CCDS6986.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 467) 757 114.1 3.4e-25
CCDS65184.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 ( 485) 757 114.1 3.5e-25
CCDS12221.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 ( 454) 748 112.9 7.7e-25
CCDS77230.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 ( 376) 735 111.1 2.2e-24
CCDS30781.1 OLFM3 gene_id:118427|Hs108|chr1 ( 458) 676 103.3 6.1e-22
CCDS72832.1 OLFM3 gene_id:118427|Hs108|chr1 ( 478) 676 103.3 6.4e-22
CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 616 95.5 3.6e-19
CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 616 95.5 4.2e-19
CCDS65129.1 OLFML2A gene_id:169611|Hs108|chr9 ( 438) 605 93.8 4.3e-19
CCDS6857.2 OLFML2A gene_id:169611|Hs108|chr9 ( 652) 605 93.9 5.9e-19
CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 583 91.1 7.1e-18
CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 583 91.1 7.4e-18
CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 583 91.1 8.6e-18
CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 583 91.1 8.6e-18
CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 572 89.7 2.5e-17
CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 572 89.7 2.5e-17
CCDS1236.1 OLFML2B gene_id:25903|Hs108|chr1 ( 750) 551 86.7 9.9e-17
CCDS72966.1 OLFML2B gene_id:25903|Hs108|chr1 ( 751) 551 86.7 9.9e-17
CCDS9440.1 OLFM4 gene_id:10562|Hs108|chr13 ( 510) 503 80.2 6.2e-15
CCDS7779.1 OLFML1 gene_id:283298|Hs108|chr11 ( 402) 423 69.4 8.4e-12
>>CCDS1297.1 MYOC gene_id:4653|Hs108|chr1 (504 aa)
initn: 3319 init1: 3319 opt: 3319 Z-score: 2416.4 bits: 456.7 E(32554): 2.8e-128
Smith-Waterman score: 3319; 100.0% identity (100.0% similar) in 504 aa overlap (1-504:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRFFCARCCSFGPEMPAVQLLLLACLVWDVGARTAQLRKANDQSGRCQYTFSVASPNESS
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CCDS12 MRFFCARCCSFGPEMPAVQLLLLACLVWDVGARTAQLRKANDQSGRCQYTFSVASPNESS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CPEQSQAMSVIHNLQRDSSTQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLDQAARPQETQEGLQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CPEQSQAMSVIHNLQRDSSTQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLDQAARPQETQEGLQRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LGTLRRERDQLETQTRELETAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGTLRRERDQLETQTRELETAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RRGQCPQTRDTARAVPPGSREVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGYLRSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRGQCPQTRDTARAVPPGSREVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGYLRSGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GDTGCGELVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GDTGCGELVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 YDLISQFMQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YDLISQFMQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PGAGYHGQFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGAGYHGQFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IRKQSVANAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IRKQSVANAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYN
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB5 PLEKKLFAWDNLNMVTYDIKLSKM
::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PLEKKLFAWDNLNMVTYDIKLSKM
490 500
>>CCDS65183.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 (458 aa)
initn: 751 init1: 464 opt: 757 Z-score: 565.9 bits: 114.1 E(32554): 3.4e-25
Smith-Waterman score: 760; 32.7% identity (65.6% similar) in 407 aa overlap (110-501:53-449)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLDQAARPQETQEGLQRELGTLRRERDQLETQTRELE
::.:. . . . ::. ........ .:
CCDS65 RVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTMCSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIE
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARLRRGQCPQTRDTARAVPPGS
. :: . .:. ..... . .. . :: .:..:: .. . : : . :
CCDS65 VLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHKQHLARQFKAIKAKM-DELRPLIPVL
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240
pF1KB5 REVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGY---------------LRSGEGDTG
.: .. .: :.: ..:: : :.: ..: ::. .
CCDS65 EEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNE--LQEEIGAYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLA
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CGELVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFEYDLI
::.:. ...:.:..:. . ..: :: :: : .. .: .: .. : : :: .
CCDS65 CGKLTGISDPVTVKTSGS---RFGSWMTDP--LAPEGDNRVWYMDGYHNN-RFVREYKSM
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SQFMQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEIPGAG
.::. : ::.: .:: :::.::.::. .:. .::..:.:::. . . ::
CCDS65 VDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKTETILKTRSLDYAG
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YHGQFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETNIRKQ
:.... :.:::..:::: :::.:::..:.:.. : ::.:.:.: .:. :::.:. :.
CCDS65 YNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDPVSLQTLQTWNTSYPKR
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SVANAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYNPLEK
:...:::::::::....: :. . :..::.:... . . :::.:.:.. ::.:::: ..
CCDS65 SAGEAFIICGTLYVTNGY-SGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYSHISMLDYNPKDR
380 390 400 410 420 430
490 500
pF1KB5 KLFAWDNLNMVTYDIKLSKM
:.::.: ... :.. :
CCDS65 ALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
440 450
>>CCDS6986.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 (467 aa)
initn: 777 init1: 464 opt: 757 Z-score: 565.7 bits: 114.1 E(32554): 3.4e-25
Smith-Waterman score: 760; 32.7% identity (65.6% similar) in 407 aa overlap (110-501:62-458)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLDQAARPQETQEGLQRELGTLRRERDQLETQTRELE
::.:. . . . ::. ........ .:
CCDS69 QVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTMCSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIE
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARLRRGQCPQTRDTARAVPPGS
. :: . .:. ..... . .. . :: .:..:: .. . : : . :
CCDS69 VLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHKQHLARQFKAIKAKM-DELRPLIPVL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KB5 REVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGY---------------LRSGEGDTG
.: .. .: :.: ..:: : :.: ..: ::. .
CCDS69 EEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNE--LQEEIGAYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLA
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CGELVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFEYDLI
::.:. ...:.:..:. . ..: :: :: : .. .: .: .. : : :: .
CCDS69 CGKLTGISDPVTVKTSGS---RFGSWMTDP--LAPEGDNRVWYMDGYHNN-RFVREYKSM
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SQFMQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEIPGAG
.::. : ::.: .:: :::.::.::. .:. .::..:.:::. . . ::
CCDS69 VDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKTETILKTRSLDYAG
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YHGQFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETNIRKQ
:.... :.:::..:::: :::.:::..:.:.. : ::.:.:.: .:. :::.:. :.
CCDS69 YNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDPVSLQTLQTWNTSYPKR
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SVANAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYNPLEK
:...:::::::::....: :. . :..::.:... . . :::.:.:.. ::.:::: ..
CCDS69 SAGEAFIICGTLYVTNGY-SGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYSHISMLDYNPKDR
390 400 410 420 430 440
490 500
pF1KB5 KLFAWDNLNMVTYDIKLSKM
:.::.: ... :.. :
CCDS69 ALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
450 460
>>CCDS65184.1 OLFM1 gene_id:10439|Hs108|chr9 (485 aa)
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Smith-Waterman score: 760; 32.7% identity (65.6% similar) in 407 aa overlap (110-501:80-476)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 TQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLDQAARPQETQEGLQRELGTLRRERDQLETQTRELE
::.:. . . . ::. ........ .:
CCDS65 GVLPTNPEESWQVYSSAQDSEGRCICTVVAPQQTMCSRDARTKQLRQLLEKVQNMSQSIE
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEVARLRRGQCPQTRDTARAVPPGS
. :: . .:. ..... . .. . :: .:..:: .. . : : . :
CCDS65 VLDRRTQRDLQYVEKMENQMKGLESKFKQVEESHKQHLARQFKAIKAKM-DELRPLIPVL
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KB5 REVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGY---------------LRSGEGDTG
.: .. .: :.: ..:: : :.: ..: ::. .
CCDS65 EEYKADAKLVLQFKEEVQNLTSVLNE--LQEEIGAYDYDELQSRVSNLEERLRACMQKLA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CGELVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQVFEYDLI
::.:. ...:.:..:. . ..: :: :: : .. .: .: .. : : :: .
CCDS65 CGKLTGISDPVTVKTSGS---RFGSWMTDP--LAPEGDNRVWYMDGYHNN-RFVREYKSM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SQFMQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAEKEIPGAG
.::. : ::.: .:: :::.::.::. .:. .::..:.:::. . . ::
CCDS65 VDFMNTDNFTSHRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKTETILKTRSLDYAG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 YHGQFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTWETNIRKQ
:.... :.:::..:::: :::.:::..:.:.. : ::.:.:.: .:. :::.:. :.
CCDS65 YNNMYHYAWGGHSDIDLMVDESGLWAVYATNQNAGNIVVSRLDPVSLQTLQTWNTSYPKR
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SVANAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMIDYNPLEK
:...:::::::::....: :. . :..::.:... . . :::.:.:.. ::.:::: ..
CCDS65 SAGEAFIICGTLYVTNGY-SGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYSHISMLDYNPKDR
410 420 430 440 450
490 500
pF1KB5 KLFAWDNLNMVTYDIKLSKM
:.::.: ... :.. :
CCDS65 ALYAWNNGHQILYNVTLFHVIRSDEL
460 470 480
>>CCDS12221.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 (454 aa)
initn: 681 init1: 455 opt: 748 Z-score: 559.4 bits: 112.9 E(32554): 7.7e-25
Smith-Waterman score: 764; 31.3% identity (62.7% similar) in 485 aa overlap (20-501:10-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRFFCARCCSFGPEMPAVQLLLLACLVWDVGARTAQLRKANDQSGRCQYTFSVASPNESS
:::: : .. ..: : . : :: . : ..
CCDS12 MWPLTVPPPLLLLLC-----SGLAGQTLFQNPEEGWQLYTSAQAPDGKCI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB5 CPEQSQAMSVIHNLQRDSSTQRLDLEATKARLSSLESLLHQLTLD-QAARPQETQEGLQR
: :.:. :. ..: .: .. .:.: : . : : .: .:: :.:
CCDS12 CTAVIPAQSTCSRDGRSRELRQL-MEKVQNVSQSMEVLELRTYRDLQYVRGMET---LMR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ELGTLRRERD-QLETQT-RELETAYSNLLRDKSVLEEEKKRLRQENENLARRLESSSQEV
: . : : .: ... .::. ...:: .::::. : .... .
CCDS12 SLDARLRAADGSLSAKSFQELKDRMTELLPLSSVLEQYK---------------ADTRTI
110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ARLRRGQCPQTRDTARAVPPGSREVSTWNLDTLAFQELKSELTEVPASRILKESPSGYLR
.:::. ..:. . :: . .. . ....:.... . : :.
CCDS12 VRLRE----EVRNLS-----GSLAAIQEEMGAYGYEDLQQRVMALEAR----------LH
150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SGEGDTGCGELVWVGEPLTLRTAETITGKYGVWMRDPKPTYPYTQETTWRIDTVGTDVRQ
. :::.:. :..:.:.:. . ...: :: : : .. .: .: :.
CCDS12 ACAQKLGCGKLTGVSNPITVRA---MGSRFGSWMTDTMA--PSADSRVWYMDGYYKG-RR
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VFEYDLISQFMQGYPSKVHILPRPLESTGAVVYSGSLYFQGAESRTVIRYELNTETVKAE
:.:. ...:..: :.::.: .:: :::.:::... .: .:..:.. ...: ..
CCDS12 VLEFRTLGDFIKGQNFIQHLLPQPWAGTGHVVYNGSLFYNKYQSNVVVKYHFRSRSVLVQ
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KEIPGAGYHGQFPYSWGGYTDIDLAVDEAGLWVIYSTDEAKGAIVLSKLNPENLELEQTW
. .:::::.. :::::::..:.:. :::.:::..:.:.. : ::.:.:.:..::. ..:
CCDS12 RSLPGAGYNNTFPYSWGGFSDMDFMVDESGLWAVYTTNQNAGNIVVSRLDPHTLEVMRSW
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 ETNIRKQSVANAFIICGTLYTVSSYTSADATVNFAYDTGTGISKTLTIPFKNRYKYSSMI
.:. :.:...::.:::.::...:. : : : ::: :.:. . .::.:.:.. ::.
CCDS12 DTGYPKRSAGEAFMICGVLYVTNSHL-AGAKVYFAYFTNTSSYEYTDVPFHNQYSHISML
370 380 390 400 410 420
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pF1KB5 DYNPLEKKLFAWDNLNMVTYDIKLSKM
:::: :. :..:.: ..: :.. :
CCDS12 DYNPRERALYTWNNGHQVLYNVTLFHVISTSGDP
430 440 450
>>CCDS77230.1 OLFM2 gene_id:93145|Hs108|chr19 (376 aa)
initn: 681 init1: 455 opt: 735 Z-score: 551.2 bits: 111.1 E(32554): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 739; 32.7% identity (66.6% similar) in 392 aa overlap (120-501:2-366)
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CCDS54 GTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]