Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5912
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5912, 529 aa
1>>>pF1KB5912 529 - 529 aa - 529 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1283+/-0.00116; mu= 14.0533+/- 0.070
mean_var=76.6230+/-15.450, 0's: 0 Z-trim(102.9): 43 B-trim: 221 in 1/49
Lambda= 0.146519
statistics sampled from 7133 (7166) to 7133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32713.1 KPNA2 gene_id:3838|Hs108|chr17 ( 529) 3417 732.3 3.3e-211
CCDS47651.1 KPNA7 gene_id:402569|Hs108|chr7 ( 516) 1806 391.8 1e-108
CCDS3191.1 KPNA4 gene_id:3840|Hs108|chr3 ( 521) 1725 374.6 1.5e-103
CCDS9421.1 KPNA3 gene_id:3839|Hs108|chr13 ( 521) 1685 366.2 5.2e-101
CCDS5111.1 KPNA5 gene_id:3841|Hs108|chr6 ( 539) 1546 336.8 3.8e-92
CCDS352.1 KPNA6 gene_id:23633|Hs108|chr1 ( 536) 1521 331.5 1.5e-90
CCDS3013.1 KPNA1 gene_id:3836|Hs108|chr3 ( 538) 1474 321.6 1.4e-87
>>CCDS32713.1 KPNA2 gene_id:3838|Hs108|chr17 (529 aa)
initn: 3417 init1: 3417 opt: 3417 Z-score: 3905.4 bits: 732.3 E(32554): 3.3e-211
Smith-Waterman score: 3417; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
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CCDS32 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TSPLQENRNNQGTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGL
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CCDS32 TSPLQENRNNQGTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISE
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CCDS32 IPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNK
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CCDS32 QAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVK
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CCDS32 NPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMS
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CCDS32 LLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCG
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CCDS32 NITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHE
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CCDS32 IIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 NESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPETTSEGYTFQVQDGAPGTFNF
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CCDS32 NESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPETTSEGYTFQVQDGAPGTFNF
490 500 510 520
>>CCDS47651.1 KPNA7 gene_id:402569|Hs108|chr7 (516 aa)
initn: 1938 init1: 1141 opt: 1806 Z-score: 2065.2 bits: 391.8 E(32554): 1e-108
Smith-Waterman score: 1806; 55.1% identity (83.0% similar) in 512 aa overlap (8-517:5-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
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CCDS47 MPTLDAPEERRRKFKYRGKDVSLRRQQRMAVSLELRKAKKDEQTLKRRNITSFCPDT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 TSPLQENRNNQGT-VNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAG
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CCDS47 PS----EKTAKGVAVSLTLGEIIKGVNSSDPVLCFQATQTARKMLSQEKNPPLKLVIEAG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LIPKFVSFLGRTDCSP-IQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHI
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CCDS47 LIPRMVEFL-KSSLYPCLQFEAAWALTNIASGTSEQTRAVVEGGAIQPLIELLSSSNVAV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SEQAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCR
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CCDS47 CEQAVWALGNIAGDGPEFRDNVITSNAIPHLLALIS-P---TLPITFLRNITWTLSNLCR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 NKNPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQL
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CCDS47 NKNPYPCDTAVKQILPALLHLLQHQDSEVLSDACWALSYLTDGSNKRIGQVVNTGVLPRL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VKLLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWT
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CCDS47 VVLMTSSELNVLTPSLRTVGNIVTGTDEQTQMAIDAGMLNVLPQLLQHNKPSIQKEAAWA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 MSNITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVH
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CCDS47 LSNVAAGPCHHIQQLLAYDVLPPLVALLKNGEFKVQKEAVWMVANFATGATMDQLIQLVH
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQN
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CCDS47 SGVLEPLVNLLTAPDVKIVLIILDVISCILQAAEKRSEKENLCLLIEELGGIDRIEALQL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KB5 HENESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPETTSEGYTFQVQDGAPGTFNF
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CCDS47 HENRQIGQSALNIIEKHFGEEEDESQTLLSQVIDQDYEFIDYECLAKK
470 480 490 500 510
>>CCDS3191.1 KPNA4 gene_id:3840|Hs108|chr3 (521 aa)
initn: 1702 init1: 885 opt: 1725 Z-score: 1972.6 bits: 374.6 E(32554): 1.5e-103
Smith-Waterman score: 1726; 51.1% identity (78.8% similar) in 524 aa overlap (1-523:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
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CCDS31 MADNEKLDNQ--RLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNV---PHED
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TSPLQENRNNQGTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGL
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CCDS31 ICEDSDIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISE
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CCDS31 LPILVHCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNK
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CCDS31 QAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFIS-P---SIPITFLRNVTWVMVNLCRHK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVK
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CCDS31 DPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVPHLVP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMS
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CCDS31 LLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCG
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CCDS31 NITAGNQQQVQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYLIQQN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHE
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CCDS31 VIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAE--DEAETIGNLIEECGGLEKIEQLQNHE
420 430 440 450 460
490 500 510 520
pF1KB5 NESVYKASLSLIEKYFSVEE-EEDQNVVPETTSEGYTFQVQDGAPGTFNF
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CCDS31 NEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAI-QGGTFGFNSSANVPTEGFQF
470 480 490 500 510 520
>>CCDS9421.1 KPNA3 gene_id:3839|Hs108|chr13 (521 aa)
initn: 1942 init1: 853 opt: 1685 Z-score: 1926.9 bits: 366.2 E(32554): 5.2e-101
Smith-Waterman score: 1685; 49.8% identity (77.7% similar) in 528 aa overlap (5-529:3-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
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CCDS94 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TSPLQENRNNQGTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGL
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CCDS94 DSDVDADFKAQ---NVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISE
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CCDS94 LPILVKCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNK
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CCDS94 QAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFIS-P---SIPITFLRNVTWVIVNLCRNK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVK
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CCDS94 DPPPPMETVQEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMS
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CCDS94 LLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCG
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CCDS94 NITAGNQQQVQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHE
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CCDS94 VIPPFCNLLSVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAG--DEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHE
420 430 440 450 460
490 500 510 520
pF1KB5 NESVYKASLSLIEKYFSVEE-EEDQNVVPETTSEG-YTFQ-VQDGAPGTFNF
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CCDS94 NEDIYKLAFEIIDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
470 480 490 500 510 520
>>CCDS5111.1 KPNA5 gene_id:3841|Hs108|chr6 (539 aa)
initn: 1539 init1: 810 opt: 1546 Z-score: 1767.9 bits: 336.8 E(32554): 3.8e-92
Smith-Waterman score: 1546; 48.3% identity (75.0% similar) in 528 aa overlap (13-524:13-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
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CCDS51 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRNDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 T---SPLQENRNNQGTV-----NWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPI
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CCDS51 SMLESPIQDP-DISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPI
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 DNII-RAGLIPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLL
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CCDS51 DQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ASPHAHISEQAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTW
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CCDS51 NSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTT----RNAVW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TLSNLCRNKNPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVK
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CCDS51 ALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVID
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TGVVPQLVKLLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNI
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CCDS51 SGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 QKEATWTMSNITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVE
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CCDS51 RKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB5 QIVYLVHCGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSI-----MIEE
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CCDS51 QIRYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 CGGLDKIEALQNHENESVYKASLSLIEKYFSVEEEEDQNVVPET--TSEGYTFQVQDGAP
:::::: ::.:::. .:. ...:::.::.:::. : ..::.. ... . :: :. ::
CCDS51 AYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEED-DPSIVPQVDENQQQFIFQQQE-AP
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GTFNF
CCDS51 MDGFQL
>>CCDS352.1 KPNA6 gene_id:23633|Hs108|chr1 (536 aa)
initn: 1731 init1: 813 opt: 1521 Z-score: 1739.4 bits: 331.5 E(32554): 1.5e-90
Smith-Waterman score: 1521; 47.0% identity (73.9% similar) in 536 aa overlap (1-524:1-530)
10 20 30 40 50 60
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