Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5914
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5914, 530 aa
1>>>pF1KB5914 530 - 530 aa - 530 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3474+/-0.000907; mu= 13.7411+/- 0.055
mean_var=97.1809+/-19.640, 0's: 0 Z-trim(108.1): 128 B-trim: 46 in 1/49
Lambda= 0.130102
statistics sampled from 10017 (10147) to 10017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 1.710
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 530) 3612 688.6 4.9e-198
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 495) 3206 612.3 4.1e-175
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 481) 3202 611.6 6.7e-175
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 474) 3197 610.6 1.3e-174
CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 ( 439) 2226 428.4 8.7e-120
CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6 ( 595) 1013 200.8 3.9e-51
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11 ( 423) 787 158.3 1.7e-38
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs109|chr11 ( 422) 782 157.3 3.3e-38
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 470) 763 153.8 4.2e-37
CCDS87457.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6 ( 310) 676 137.3 2.5e-32
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs109|chr11 ( 933) 605 124.3 6.3e-28
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5 ( 742) 569 117.5 5.7e-26
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5 ( 777) 569 117.5 5.9e-26
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs109|chr5 ( 778) 567 117.1 7.6e-26
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX ( 388) 541 112.1 1.3e-24
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs109|chrX ( 920) 541 112.3 2.6e-24
CCDS86887.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2 ( 535) 500 104.5 3.4e-22
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs109|chr2 ( 598) 500 104.5 3.7e-22
CCDS59229.1 PGR gene_id:5241|Hs109|chr11 ( 339) 466 98.0 2e-20
CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9 ( 626) 459 96.8 8.1e-20
CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs109|chr9 ( 637) 459 96.8 8.2e-20
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs109|chr19 ( 404) 443 93.7 4.5e-19
CCDS58060.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 396) 414 88.2 1.9e-17
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 435) 395 84.7 2.5e-16
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs109|chr1 ( 458) 395 84.7 2.6e-16
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs109|chr14 ( 508) 394 84.5 3.2e-16
CCDS44261.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1 ( 340) 384 82.6 8.4e-16
CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1 ( 348) 383 82.4 9.8e-16
CCDS41429.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1 ( 357) 382 82.2 1.1e-15
CCDS41430.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1 ( 352) 377 81.3 2.2e-15
CCDS44260.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs109|chr1 ( 339) 374 80.7 3.1e-15
CCDS86200.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11 ( 342) 353 76.7 4.8e-14
CCDS44584.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11 ( 387) 353 76.8 5.3e-14
CCDS44585.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11 ( 402) 353 76.8 5.5e-14
CCDS7929.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11 ( 447) 353 76.8 6e-14
CCDS73285.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs109|chr11 ( 453) 353 76.8 6e-14
CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17 ( 462) 342 74.8 2.6e-13
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6 ( 533) 340 74.4 3.7e-13
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs109|chr6 ( 537) 340 74.4 3.8e-13
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs109|chr4 ( 984) 343 75.1 4.2e-13
CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs109|chr17 ( 457) 334 73.3 7.2e-13
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 ( 598) 334 73.3 9e-13
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 ( 611) 334 73.3 9.1e-13
CCDS54811.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs109|chr4 ( 867) 336 73.8 9.4e-13
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs109|chr12 ( 652) 334 73.3 9.6e-13
CCDS69165.1 NR2E1 gene_id:7101|Hs109|chr6 ( 422) 330 72.5 1.1e-12
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs109|chr1 ( 340) 328 72.1 1.2e-12
CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 382) 328 72.1 1.4e-12
CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 443) 328 72.1 1.5e-12
CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs109|chr12 ( 454) 328 72.1 1.6e-12
>>CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 (530 aa)
initn: 3612 init1: 3612 opt: 3612 Z-score: 3669.0 bits: 688.6 E(33420): 4.9e-198
Smith-Waterman score: 3612; 100.0% identity (100.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
490 500 510 520 530
>>CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 (495 aa)
initn: 3197 init1: 3197 opt: 3206 Z-score: 3257.6 bits: 612.3 E(33420): 4.1e-175
Smith-Waterman score: 3206; 96.7% identity (98.8% similar) in 489 aa overlap (1-486:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHA-SNKGMEHL--L
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:. . : .
CCDS32 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARAEKASQTLTSF
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
.:: ....:
CCDS32 GMKMETLLPEATMEQ
490
>>CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 (481 aa)
initn: 3197 init1: 3197 opt: 3202 Z-score: 3253.7 bits: 611.6 E(33420): 6.7e-175
Smith-Waterman score: 3202; 97.9% identity (99.2% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : ......:
CCDS55 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHAR-WGEKQFIHLK
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
CCDS55 LS
480
>>CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs109|chr14 (474 aa)
initn: 3197 init1: 3197 opt: 3197 Z-score: 3248.7 bits: 610.6 E(33420): 1.3e-174
Smith-Waterman score: 3197; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARSCVYK
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEHGSIYIPSSYVDSHHEYPAMTFYSPAVMNYSIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NVTNLEGGPGRQTTSPNVLWPTPGHLSPLVVHRQLSHLYAEPQKSPWCEARSLEHTLPVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADEQLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISRPSAPFTEASMMMSLTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDL
::::::::::::::::::
CCDS61 LADKELVHMISWAKKIPG------------------------------------------
310
370 380 390 400 410 420
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:::::::::::
CCDS61 -------------------------------------------------MYPLVTATQDA
320
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMK
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530
pF1KB5 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
390 400 410 420 430
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10 20 30 40
pF1KB5 MDIKNSPSSLNSPSSYNCSQSILPLEH--GSIYIPSSY--VDSHHEYPAM
: : .:::. : .:. :: : .. : :.
CCDS52 MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPAVYNYPEGAAY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB5 TFYSPAVMNYSIPSNVTNLEGGPGRQ------------------TTSPNVLWPTPGHLSP
: . :. : .. .. :.: ::: . . :: .: : .:::
CCDS52 EFNAAAAANAQVYGQ-TGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPLNSVSPSPLMLLHPPPQLSP
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 LVV-HRQLSHLYAEPQKSPWC--EARSLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGS---
.. : : : : . : . :: : : .. .:. . .: :: .. ::
CCDS52 FLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFYRP-NSDN-RRQGGRERLAS-TNDKGSMAM
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 --KRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKS
.....::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS52 ESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKS
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB5 CQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRRQRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPR
::::::::::::::.: : :..: : :.....:. :. .. :: . .. .:
CCDS52 CQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPL
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KB5 V-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVLISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELV
. .. : .:. .:.: .::.:::: .: :. :. ::.::::: ::.:::.:::
CCDS52 MIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-ILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELV
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 HMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEG
:::.:::..::::.:.: :::.::: :.:.::.::.:::..:::::.:::.:.:::..:
CCDS52 HMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQG
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSMYPLVTATQDADSSRKLA
:::::..:::::::::.:::: ..:: .:..:.:..:::::..: ....: . .
CCDS52 KCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKSIILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHI
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 H-LLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKGMEHLLNMKCKNVVP
: .:. .::.:. ..::.:.. ::: .:::.::..:::.:: :::::::: .::::::::
CCDS52 HRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQHQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVP
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530
pF1KB5 VYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSK-SKEGSQNPQSQ
.::::::::.:: :.. .: :. ...:. . :: . .:
CCDS52 LYDLLLEMLDAHRLHA-PTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPAT
540 550 560 570 580 590
CCDS52 V
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120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
.: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS41 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
:: .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .: : : ..:
CCDS41 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
. : :: .:: :: ..: :: :: .:: .. . :..:
CCDS41 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PRKTAAPVNA-----LVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
. . .: : :.:.: :::::.:::: ::: ::. .:.: :::::..:. ::.
CCDS41 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
.: :: ::::: .:: . :. :. :: . :.. :.:...::. .::. : ::.
CCDS41 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASN
. .::.. ..: . :. . : . ...: .. . : . ::. : .:....
CCDS41 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KGMEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
: . :. ..: .. ::.. :.::::.:
CCDS41 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
400 410 420
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120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
.: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS60 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
:: .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .: : : ..:
CCDS60 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
. : :: .:: :: . ..: :: :: .:: .. . :..:
CCDS60 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PR-KTAPVNA-----LVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
. . .: : :.:.: :::::.:::: ::: ::. .:.: :::::..:. ::.
CCDS60 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
.: :: ::::: .:: . :. :. :: . :.. :.:...::. .::. : ::.
CCDS60 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASN
. .::.. ..: . :. . : . ...: .. . : . ::. : .:....
CCDS60 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 KGMEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
: . :. ..: .. ::.. :.::::.:
CCDS60 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
400 410 420
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120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
.: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS58 VRKLYDDCSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKRLCLVCGDIASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
110 120 130 140 150 160
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pF1KB5 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSR--RERCGYRLVRRQRSA
::. .: :::::.: : : :::::::::. :: .:::.: : : : : : . .:. .:
CCDS58 QGNIEYSCPATNECEITKRRRKSCQACRFMKCLKVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRIDA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DEQLHCAGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFTEASM
... . . . : . :: . . ...: :: ::: .. . :..: .. .
CCDS58 ENSPYLNPQLVQ-----PAKKPLLWSDPADNKIVSHLLVAEPEKIYAMPDPTVPDSDIKA
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 MMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDHPGKL
. .: :::.::: .:.:::.:::: ::: ::. ::.: :::.:..:...::.. .:
CCDS58 LTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSTLSLADQMSLLQSAWMEILILGVVYRSLSFEDEL
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 IFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNS-SMYPL
..: : ..:.:..: . :.:.. . .: ..... .::...:.. .::. : :: ::.
CCDS58 VYADDYIMDEDQSK-LAGLLDLNNAILQLVKKYKSMKLEKEEFVTLKAIALANSDSMH--
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VTATQDADSSRKLAHLLN-AVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASNKG
.:... .:: .:. :. : ..: . ... : ...:: : .:..:.:.
CCDS58 ---IEDVEAVQKLQDVLHEALQDY------EAG-QHMEDPRRAGKMLMTLPLLRQTSTKA
400 410 420 430 440
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..:. :.: .. ::.. :.::::.:.:
CCDS58 VQHFYNIKLEGKVPMHKLFLEMLEAKV
450 460 470
>>CCDS87457.1 ESR1 gene_id:2099|Hs109|chr6 (310 aa)
initn: 1207 init1: 615 opt: 676 Z-score: 694.2 bits: 137.3 E(33420): 2.5e-32
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120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SLEHTLPVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKA
: .....::::.::::::::::::::::::
CCDS87 MAMESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVWSCEGCKA
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FFKRSIQGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERCGYRLVRR
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: : :..: : :....
CCDS87 FFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMMKGGIRKDRRGGRMLKH
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 QRSADE-----QLHCAGKAKRSG-GHAPRV-----RELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHV
.:. :. .. :: . .. .: . .. : .:. .:.: .::.:::: .
CCDS87 KRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLMIKRSKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPP-I
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 LISR--PSAPFTEASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEV
: :. :. ::.::::: ::.:::.::::::.:::..::::.:.: :::.::: :.:.
CCDS87 LYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLADRELVHMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEI
160 170 180 190 200 210
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pF1KB5 LMMGLMWRSIDHPGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYL
::.::.:::..:::::.:::.:.:::..::::::..:::::::::.:::: ..:: .:..
CCDS87 LMIGLVWRSMEHPGKLLFAPNLLLDRNQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFV
220 230 240 250 260 270
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:.:..:::::..
CCDS87 CLKSIILLNSGISHVEAKKRILNLHPKIFGNKWFPRV
280 290 300 310
530 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]