FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5935, 508 aa 1>>>pF1KB5935 508 - 508 aa - 508 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6704+/-0.000869; mu= 7.0818+/- 0.052 mean_var=113.7119+/-22.680, 0's: 0 Z-trim(109.8): 20 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.120274 statistics sampled from 11100 (11116) to 11100 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.341), width: 16 Scan time: 3.150 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41809.1 FRS2 gene_id:10818|Hs108|chr12 ( 508) 3417 603.8 1.5e-172 CCDS4860.1 FRS3 gene_id:10817|Hs108|chr6 ( 492) 880 163.5 4.8e-40 >>CCDS41809.1 FRS2 gene_id:10818|Hs108|chr12 (508 aa) initn: 3417 init1: 3417 opt: 3417 Z-score: 3211.3 bits: 603.8 E(32554): 1.5e-172 Smith-Waterman score: 3417; 100.0% identity (100.0% similar) in 508 aa overlap (1-508:1-508) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVVER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVVER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 NNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 NNHQTELEVPRTPRTPTTPGFAAQNLPNGYPRYPSFGDASSHPSSRHPSVGSARLPSVGE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 ESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 ESTHPLLVAEEQVHTYVNTTGVQEERKNRTSVHVPLEARVSNAESSTPKEEPSSIEDRDP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 QILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 QILLEPEGVKFVLGPTPVQKQLMEKEKLEQLGRDQVSGSGANNTEWDTGYDSDERRDAPS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 VNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 VNKLVYENINGLSIPSASGVRRGRLTSTSTSDTQNINNSAQRRTALLNYENLPSLPPVWE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 ARKLSRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 ARKLSRDEDDNLGPKTPSLNGYHNNLDPMHNYVNTENVTVPASAHKIEYSRRRDCTPTVF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 NFDIRRPSLEHRQLNYIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 NFDIRRPSLEHRQLNYIQVDLEGGSDSDNPQTPKTPTTPLPQTPTRRTELYAVIDIERTA 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB5 AMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM :::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 AMSNLQKALPRDDGTSRKTRHNSTDLPM 490 500 >>CCDS4860.1 FRS3 gene_id:10817|Hs108|chr6 (492 aa) initn: 1402 init1: 663 opt: 880 Z-score: 832.4 bits: 163.5 E(32554): 4.8e-40 Smith-Waterman score: 1524; 48.6% identity (73.4% similar) in 523 aa overlap (1-508:1-492) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MGSCCSCPDKDTVPDNHRNKFKVINVDDDGNELGSGIMELTDTELILYTRKRDSVKWHYL ::::::: ..:.::::: .:::: ::::.: :::::.::::..::.:. ..:..:.: :: CCDS48 MGSCCSCLNRDSVPDNHPTKFKVTNVDDEGVELGSGVMELTQSELVLHLHRREAVRWPYL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 CLRRYGYDSNLFSFESGRRCQTGQGIFAFKCARAEELFNMLQEIMQNNSINVVEEPVV-E :::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::.::..:: :::::.::::. 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