FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5935, 508 aa 1>>>pF1KB5935 508 - 508 aa - 508 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9746+/-0.000367; mu= 5.3512+/- 0.023 mean_var=125.9923+/-25.968, 0's: 0 Z-trim(117.5): 46 B-trim: 902 in 2/53 Lambda= 0.114262 statistics sampled from 29419 (29467) to 29419 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16 Scan time: 10.920 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016874208 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001265286 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001036020 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001265280 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001265284 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001265283 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001265285 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_006645 (OMIM: 607743) fibroblast growth factor ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 NP_001265282 (OMIM: 607743) fibroblast growth fact ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 XP_016874206 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 XP_016874207 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast ( 508) 3417 574.5 2.4e-163 XP_011512557 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast ( 492) 880 156.3 1.9e-37 XP_011512556 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast ( 492) 880 156.3 1.9e-37 NP_006644 (OMIM: 607744) fibroblast growth factor ( 492) 880 156.3 1.9e-37 XP_016865682 (OMIM: 607744) PREDICTED: fibroblast ( 455) 673 122.2 3.2e-27 NP_001184189 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 342) 191 42.7 0.0021 NP_001305795 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 342) 191 42.7 0.0021 NP_001305796 (OMIM: 602919) docking protein 1 isof ( 470) 191 42.7 0.0028 NP_001372 (OMIM: 602919) docking protein 1 isoform ( 481) 191 42.7 0.0028 NP_001304729 (OMIM: 604997) docking protein 2 isof ( 258) 186 41.8 0.0028 NP_958728 (OMIM: 604997) docking protein 2 isoform ( 258) 186 41.8 0.0028 XP_005273737 (OMIM: 604997) PREDICTED: docking pro ( 318) 186 41.9 0.0034 NP_003965 (OMIM: 604997) docking protein 2 isoform ( 412) 186 41.9 0.0043 XP_016881100 (OMIM: 611402) PREDICTED: docking pro ( 223) 175 40.0 0.0087 XP_016881099 (OMIM: 611402) PREDICTED: docking pro ( 223) 175 40.0 0.0087 >>XP_016874208 (OMIM: 607743) PREDICTED: fibroblast grow (508 aa) initn: 3417 init1: 3417 opt: 3417 Z-score: 3053.5 bits: 574.5 E(85289): 2.4e-163 Smith-Waterman score: 3417; 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