FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5948, 544 aa 1>>>pF1KB5948 544 - 544 aa - 544 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3041+/-0.00106; mu= 0.8089+/- 0.064 mean_var=269.4143+/-58.827, 0's: 0 Z-trim(113.3): 673 B-trim: 515 in 1/50 Lambda= 0.078138 statistics sampled from 13164 (13951) to 13164 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.429), width: 16 Scan time: 3.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 3569 415.9 6.3e-116 CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 2957 346.9 3.8e-95 CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 2955 346.7 4.4e-95 CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 2947 345.8 8.2e-95 CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 2889 339.2 7.5e-93 CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 2754 324.0 2.9e-88 CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 1873 224.7 2.2e-58 CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 1085 135.8 1.1e-31 CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 1082 135.5 1.7e-31 CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 1064 133.6 7.8e-31 CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 1007 127.1 6.4e-29 CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 815 105.4 1.7e-22 CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 811 104.9 2.3e-22 CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 805 104.2 3.2e-22 CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 806 104.3 3.3e-22 CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 798 103.4 5.7e-22 CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 798 103.4 5.8e-22 CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 791 102.6 9.8e-22 CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 734 96.4 1.3e-19 CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 734 96.4 1.4e-19 CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 733 96.5 1.9e-19 CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 733 96.5 2e-19 CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 636) 724 95.2 2.5e-19 CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 718 94.7 4.9e-19 CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 718 94.7 5e-19 CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 685 90.9 6.4e-18 CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 686 91.1 6.5e-18 CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 685 91.0 7.2e-18 CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 676 89.9 1.3e-17 CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 671 89.3 1.9e-17 CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 671 89.3 1.9e-17 CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 652 86.8 4.3e-17 CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 653 87.4 9.1e-17 CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 653 87.4 9.5e-17 CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 653 87.5 1e-16 CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 636 85.1 1.5e-16 CCDS63199.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 332) 607 81.8 1.4e-15 CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 600 81.5 6.6e-15 CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 600 81.5 6.6e-15 CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 600 81.5 6.7e-15 CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 600 81.5 6.7e-15 CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 600 81.5 6.8e-15 CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 600 81.5 6.8e-15 CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 600 81.5 6.9e-15 CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 600 81.5 6.9e-15 CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 596 81.1 1.1e-14 CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 580 79.3 3.2e-14 CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 580 79.3 3.2e-14 CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 580 79.3 3.2e-14 CCDS66573.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 412) 568 77.5 3.5e-14 >>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (544 aa) initn: 3569 init1: 3569 opt: 3569 Z-score: 2194.8 bits: 415.9 E(32554): 6.3e-116 Smith-Waterman score: 3569; 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97.3% identity (97.3% similar) in 559 aa overlap (1-544:1-559) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSNNRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGGGDKTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSNNRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGGGDKTN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 KKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT---------------GIPEQWARLLQTS :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: CCDS48 KKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTPDLYGSQMCPGKLPEGIPEQWARLLQTS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 NITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 NITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 LAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 LAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 ENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 ENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTA 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 LDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 LDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYL 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 AGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 AGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTD 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 FGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 FGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNE 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 NPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS48 NPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPL 490 500 510 520 530 540 530 540 pF1KB5 SSLTPLIIAAKEAIKNSSR ::::::::::::::::::: CCDS48 SSLTPLIIAAKEAIKNSSR 550 >>CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 (545 aa) initn: 2752 init1: 1933 opt: 2889 Z-score: 1780.5 bits: 339.2 E(32554): 7.5e-93 Smith-Waterman score: 2889; 80.6% identity (91.7% similar) in 552 aa overlap (2-542:3-544) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSN-----NRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARL-RSIFP ..::: ..::::::.: .:. ..:...:::.::::: ::::.:: :. :::.: CCDS82 MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GGGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQWARLLQTSNITKLEQK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::: CCDS82 --GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 KNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEE ::::::::::.::.::.: :.::::::: ::::. : ... ..:..:: : .:::::. CCDS82 KNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFT--DKSAEDYNSSNALNVKAVSETPAVPPVSED 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 EDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEV-TPPSAENANSST ::.. .:. ::::::::::::::.:::::.: . :..:...: : : . . :..: CCDS82 EDDD----DDDATPPPVIAPRPEHTKSVYTRSVIEPL--PVTPTRDVATSPISPTENNTT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 ----LYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDI : :::..:.:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. CCDS82 PPDALTRNTEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 ATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGF :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 SLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGF 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 CAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: CCDS82 CAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 RALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSL ::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::..:::::::::: :::.::::::: CCDS82 RALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSL 480 490 500 510 520 530 530 540 pF1KB5 TPLIIAAKEAIKNSSR :::: ::::: ::. CCDS82 TPLIAAAKEATKNNH 540 >>CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 (553 aa) initn: 2620 init1: 1801 opt: 2754 Z-score: 1698.2 bits: 324.0 E(32554): 2.9e-88 Smith-Waterman score: 2754; 80.6% identity (91.8% similar) in 525 aa overlap (2-515:3-517) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSN-----NRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARL-RSIFP ..::: ..::::::.: .:. ..:...:::.::::: ::::.:: :. :::.: CCDS44 MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GGGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQWARLLQTSNITKLEQK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::: CCDS44 --GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 KNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEE ::::::::::.::.::.: :.::::::: ::::. : ... ..:..:: : .:::::. CCDS44 KNPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFT--DKSAEDYNSSNALNVKAVSETPAVPPVSED 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 EDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEV-TPPSAENANSST ::.. .:. ::::::::::::::.:::::.: . :..:...: : : . . :..: CCDS44 EDDD----DDDATPPPVIAPRPEHTKSVYTRSVIEPL--PVTPTRDVATSPISPTENNTT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 ----LYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDI : :::..:.:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. CCDS44 PPDALTRNTEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGF :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 SLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGF 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 CAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: CCDS44 CAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 RALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSL ::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::..::::::::: CCDS44 RALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQVRKLRFQVFSNFS 480 490 500 510 520 530 530 540 pF1KB5 TPLIIAAKEAIKNSSR CCDS44 MIAASIPEDCQAPLQPHSTDCCS 540 550 >>CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 (524 aa) initn: 2539 init1: 1828 opt: 1873 Z-score: 1161.7 bits: 224.7 E(32554): 2.2e-58 Smith-Waterman score: 2631; 75.5% identity (88.7% similar) in 547 aa overlap (1-542:1-523) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSN-----NRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGG :::. . :.::::::.::.:. ..: . ::: :::: .::::. . .. ::: .: CCDS33 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIF-SG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKN .: .::::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS33 TEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 PQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEED :::::::::::::. ::. :::.::: .:. :. .. :. . ..: : . :.:::: CCDS33 PQAVLDVLKFYDSN-TVK-QKYLSFTPPEKD--GFPSGTPALNAKGTEAPAV--VTEEED 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 EEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYR ..:: ::::::::.::::::::::.. . .: : ...: ..: .: CCDS33 DDEET------APPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP-VGDSHV-----DGAAKSL--- 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 NTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVA :.:.::.:::::::.::::.:::.:::::::::.:::::::::::.:: :.: ::::: CCDS33 --DKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVA 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 IKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVT :::.:::.::::::::::::::.: :::::::.::::::::::.:::::::::::::::: CCDS33 IKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVT 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 ETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPE ::::::.:::::::::::::.:::.::::::::::::.::::.::::::::::::::::: CCDS33 ETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPE 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 QSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 QSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIA 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 TNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAA :::::::::::.:: .:::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS33 TNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAA 460 470 480 490 500 510 540 pF1KB5 KEAIKNSSR :::.:.. CCDS33 KEAMKSNR 520 >>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (438 aa) initn: 1274 init1: 1072 opt: 1085 Z-score: 682.7 bits: 135.8 E(32554): 1.1e-31 Smith-Waterman score: 1225; 42.7% identity (68.8% similar) in 471 aa overlap (63-532:4-432) 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 KPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGGGDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT :.:.: ::: ::.::: .:.::: .:: CCDS33 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFT 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 GIPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIA :.:.:: :.. :. . :. ..: . . . . . . . . . :: : CCDS33 GLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGL-- 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 AHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIA : :.:....:.:: . .. : : :..: :.. . . : CCDS33 AIPQSSSSSSRPPT---------------RARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPA 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 SPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRF .::::. ::. .. ::. .... :.. :. .:. :::.. : CCDS33 APAVPG----PPGPRSP-----------QREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNF 130 140 150 160 170 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 EKIGQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDS :::.:..: : : ..:. ::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .: CCDS33 IKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNS 180 190 200 210 220 230 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 YLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSD ::::::::::::.: ::.:::.::.: :.: :::::: ::::. ::.. ::::::::: CCDS33 YLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSD 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 NILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIM .::: :: :::.:::::::.. : .:...::::::::::...: :::.::::::::: CCDS33 SILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIM 300 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 AIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAK .::::.:::::.:: ::.:. .: : :.:.: ...: .. ::.: : : .:..: CCDS33 VIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAA 360 370 380 390 400 410 520 530 540 pF1KB5 ELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR :::.:::: : : .:..::. CCDS33 ELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 420 430 >>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (591 aa) initn: 1267 init1: 1072 opt: 1082 Z-score: 679.1 bits: 135.5 E(32554): 1.7e-31 Smith-Waterman score: 1090; 38.5% identity (63.8% similar) in 527 aa overlap (9-532:103-585) 10 20 30 pF1KB5 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSNNRDSSALNHSSKPLPMA ..:: :: : ..: ... : CCDS12 GSKGAKDGALTLLLDEFENMSVTRSNSLRRDSPP-PPARARQENGMPEEPATTARGGPGK 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 PEEKNKKARLRSIFPGGGDKTNKKKEKERPEISLP-SDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQ ... : :.::. :: ::. : : . ..: .: : : CCDS12 AGSRGRFAGHSEAGGGSGDRRRAGPEK-RPKSSREGSGGPQESSRDKRPLSGPDVGTP-Q 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 WARLLQTSNITKLEQ-KKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPS : : . .... . . :.: : . :. . .. . .. . :: : : :. CCDS12 PAGLASGAKLAAGRPFNTYPRADTD----HPSRGAQGEPHDVA--PNGPSAGGL--AIPQ 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 STKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPP-VIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAV :....:.:: . .. : : :..: :.. . . :.::: CCDS12 SSSSSSRPPT---------------RARGAPSPGVLGP---HASEPQLAPPACTPAAPAV 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 PNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIG :. ::. .. ::. .... :.. :. .:. :::.. : ::: CCDS12 PG----PPGPRSP-----------QREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIG 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 QGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVG .:..: : : ..:. ::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .::::: CCDS12 EGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVG 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 DELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILL ::::::::.: ::.:::.::.: :.: :::::: ::::. ::.. :::::::::.::: CCDS12 DELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILL 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 GMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEM :: :::.:::::::.. : .:...::::::::::...: :::.:::::::::.::: CCDS12 THDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEM 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 VEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQ :.:::::.:: ::.:. .: : :.:.: ...: .. ::.: : : .:..: :::. CCDS12 VDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLK 510 520 530 540 550 560 520 530 540 pF1KB5 HPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR :::: : : .:..::. CCDS12 HPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR 570 580 590 >>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 (719 aa) initn: 1212 init1: 1036 opt: 1064 Z-score: 667.1 bits: 133.6 E(32554): 7.8e-31 Smith-Waterman score: 1064; 46.2% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (193-532:374-713) 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 EPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTP : : ..: . ..: .. . .. CCDS13 LSGSDTYPRGPAKLPQSQSKSGYSSSSHQYPSGYHKATLYHHPSLQSSSQYISTASYLSS 350 360 370 380 390 400 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 PSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTV : ... ... ... :... :.. :. .:: :::.. . : :::.:..: : CCDS13 LSLSSSTYPPPSWGSSSDQQPSRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIV 410 420 430 440 450 460 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 YTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVM : . ::..::.:.:.:..: ..::..::...::. .. :.:.. .:::::::::::: CCDS13 CIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVM 470 480 490 500 510 520 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 EYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVK :.: ::.:::.::.: :.: :::.:: :.::..::.. :::::::::.::: :: .: CCDS13 EFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIK 530 540 550 560 570 580 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 LTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPY :.:::::::.. : ::...:::::::::::..: :: .:::::::::.:::..::::: CCDS13 LSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPY 590 600 610 620 630 640 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 LNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLA .:: ::.:. : . :.... ...:.:.: ::. : . ..:..:.::: ::::::: CCDS13 FNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLA 650 660 670 680 690 700 530 540 pF1KB5 KPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR : : ..::. CCDS13 GPPSCIVPLMRQYRHH 710 544 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 03:56:45 2016 done: Tue Nov 8 03:56:45 2016 Total Scan time: 3.480 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]