Result of FASTA (omim) for
pF1KB5954
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5954, 548 aa
1>>>pF1KB5954 548 - 548 aa - 548 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0035+/-0.000402; mu= 15.7586+/- 0.025
mean_var=93.4927+/-19.221, 0's: 0 Z-trim(113.3): 20 B-trim: 639 in 1/52
Lambda= 0.132643
statistics sampled from 22545 (22560) to 22545 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 10.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004530 (OMIM: 108410) asparagine--tRNA ligase, ( 548) 3749 728.1 1.7e-209
XP_005266757 (OMIM: 108410) PREDICTED: asparagine- ( 547) 3732 724.9 1.6e-208
NP_001280241 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA ( 401) 523 110.7 9e-24
XP_016858978 (OMIM: 603084,615281) PREDICTED: aspa ( 468) 523 110.7 1e-23
NP_001340 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA li ( 501) 523 110.7 1.1e-23
NP_078954 (OMIM: 612803,616239) probable asparagin ( 477) 492 104.8 6.3e-22
NP_001230180 (OMIM: 612803,616239) probable aspara ( 250) 433 93.3 9.5e-19
XP_016873792 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 250) 433 93.3 9.5e-19
XP_011543555 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 468) 425 92.0 4.5e-18
XP_016873793 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 241) 273 62.7 1.5e-09
XP_016873791 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: prob ( 310) 250 58.4 3.9e-08
XP_006711490 (OMIM: 610956,611105) PREDICTED: aspa ( 594) 162 41.7 0.0077
NP_060592 (OMIM: 610956,611105) aspartate--tRNA li ( 645) 162 41.7 0.0082
>>NP_004530 (OMIM: 108410) asparagine--tRNA ligase, cyto (548 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3882.2 bits: 728.1 E(85289): 1.7e-209
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVLAELYVSDREGSDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWNVISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MVLAELYVSDREGSDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWNVISK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SQLKNIKKMWHREQMKSESREKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SQLKNIKKMWHREQMKSESREKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGYRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLADELCQCYNGVLLSTESSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EGYRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLADELCQCYNGVLLSTESSVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VYGMLNLTPKGKQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VYGMLNLTPKGKQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QLYLETCLPALGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPFLTFDDLLNRLEDLVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QLYLETCLPALGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPFLTFDDLLNRLEDLVCD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFKRMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFYEFGEDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFKRMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFYEFGEDIP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EAPERLMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EAPERLMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYP
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 RFVQRCTP
::::::::
NP_004 RFVQRCTP
>>XP_005266757 (OMIM: 108410) PREDICTED: asparagine--tRN (547 aa)
initn: 3727 init1: 3727 opt: 3732 Z-score: 3864.6 bits: 724.9 E(85289): 1.6e-208
Smith-Waterman score: 3732; 99.8% identity (99.8% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-547)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVLAELYVSDREGSDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWNVISK
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVL-ELYVSDREGSDATGDGTKEKPFKTGLKALMTVGKEPFPTIYVDSQKENERWNVISK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SQLKNIKKMWHREQMKSESREKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SQLKNIKKMWHREQMKSESREKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGAL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGYRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLADELCQCYNGVLLSTESSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGYRGQRVKVFGWVHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLADELCQCYNGVLLSTESSVA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VYGMLNLTPKGKQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VYGMLNLTPKGKQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQSS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QLYLETCLPALGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPFLTFDDLLNRLEDLVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLYLETCLPALGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPFLTFDDLLNRLEDLVCD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFKRMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFYEFGEDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFKRMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFYEFGEDIP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EAPERLMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EAPERLMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYP
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 RFVQRCTP
::::::::
XP_005 RFVQRCTP
540
>>NP_001280241 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA lig (401 aa)
initn: 439 init1: 182 opt: 523 Z-score: 547.8 bits: 110.7 E(85289): 9e-24
Smith-Waterman score: 523; 28.4% identity (62.4% similar) in 335 aa overlap (227-548:77-401)
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 GHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGENMSKILKARSMVTRCF
:..:.:: . .: . . ... .: . . :
NP_001 LAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRTSTSQAVFRLQSGICHLF
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 RDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQSSQLYLETCLPA-LGDVF
:. ....:. :. : .... ::::..: ..:: ..:.:.:: ::: . :. : . ::
NP_001 RETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQSPQLYKQMCICADFEKVF
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 CIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPF-LTFDDLLNRLEDLVCDVVDRILKSPAGSIV
:. .:::.: :.:::.:.. .. : : . ...... : . .. . :. . .
NP_001 SIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADTMVQIF-KGLQERFQTEI
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420
pF1KB5 HELNPNFQPPKRPFK------RMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFYEFGEDIPEAPERLMT
. .: .: : .::: :..: .:.. :.: :. : .:. :.:.
NP_001 QTVNKQF--PCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDE------DDLSTPNEKLLG
230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DTINEPI-----LLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIFDSE
..: .: ..:. .. :: . :.. . ..: :..: . ::..:..:: : .
NP_001 HLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFMRGE-EILSGAQRIHDPQ
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 EILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTWILNRYHIRDVCLYPRFV
. ..::: : :. ..:. ::.: :.:::: .:. ...:.. ..::
NP_001 LLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTMLFLGLHNVRQTSMFPRDP
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 QRCTP
.: ::
NP_001 KRLTP
400
>>XP_016858978 (OMIM: 603084,615281) PREDICTED: aspartat (468 aa)
initn: 439 init1: 182 opt: 523 Z-score: 546.8 bits: 110.7 E(85289): 1e-23
Smith-Waterman score: 529; 26.7% identity (58.1% similar) in 472 aa overlap (110-548:8-468)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 REKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGALEGYRGQRVK-VFGWVHRLR
:. :.. : ....: : . :: :
XP_016 MIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVRARVHTSR
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 RQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLA--DELCQCYN--GVLLSTESSVAVYGMLNLTPK--GK
.::. :::::. .: ..: :. . . .. .. :: : : :.. . . :.
XP_016 AKGKQC-FLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230
pF1KB5 QAPGGHELSCDFWELIGLAPAG---GADNLINEESD----------VDVQLNNRHMMIRG
. :: . .:.:: :. . :.. :..:.:: . .:
XP_016 CTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRT
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ENMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQS
. . ... .: . . ::. ....:. :. : .... ::::..: ..:: ..:.:.::
XP_016 STSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQS
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SQLYLETCLPA-LGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPF-LTFDDLLNRLEDL
::: . :. : . :: :. .:::.: :.:::.:.. .. : : . ...... :
XP_016 PQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADT
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VCDVVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFK------RMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGT
. .. . :. . .. .: .: : .::: :..: .:.. :.: :. :
XP_016 MVQIF-KGLQERFQTEIQTVNKQF--PCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDE-
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460
pF1KB5 FYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPI-----LLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLM
.:. :.:. ..: .: ..:. .. :: . :.. . ..: :..:
XP_016 -----DDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTW
. ::..:..:: : . . ..::: : :. ..:. ::.: :.::::
XP_016 RGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTML
390 400 410 420 430 440
530 540
pF1KB5 ILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP
.:. ...:.. ..:: .: ::
XP_016 FLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
450 460
>>NP_001340 (OMIM: 603084,615281) aspartate--tRNA ligase (501 aa)
initn: 439 init1: 182 opt: 523 Z-score: 546.4 bits: 110.7 E(85289): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 529; 26.7% identity (58.1% similar) in 472 aa overlap (110-548:41-501)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 REKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGALEGYRGQRVK-VFGWVHRLR
:. :.. : ....: : . :: :
NP_001 QEKPREIMDAAEDYAKERYGISSMIQSQEKPDRVLVRVRDLTIQKADEVVWVRARVHTSR
20 30 40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 RQGKNLMFLVLRDGTGYLQCVLA--DELCQCYN--GVLLSTESSVAVYGMLNLTPK--GK
.::. :::::. .: ..: :. . . .. .. :: : : :.. . . :.
NP_001 AKGKQC-FLVLRQQQFNVQALVAVGDHASKQMVKFAANINKESIVDVEGVVRKVNQKIGS
80 90 100 110 120
200 210 220 230
pF1KB5 QAPGGHELSCDFWELIGLAPAG---GADNLINEESD----------VDVQLNNRHMMIRG
. :: . .:.:: :. . :.. :..:.:: . .:
NP_001 CTQQDVELHVQKIYVISLAEPRLPLQLDDAVRPEAEGEEEGRATVNQDTRLDNRVIDLRT
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ENMSKILKARSMVTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLDYFGEEAFLTQS
. . ... .: . . ::. ....:. :. : .... ::::..: ..:: ..:.:.::
NP_001 STSQAVFRLQSGICHLFRETLINKGFVEIQTPKIISAASEGGANVFTVSYFKNNAYLAQS
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SQLYLETCLPA-LGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVEAECPF-LTFDDLLNRLEDL
::: . :. : . :: :. .:::.: :.:::.:.. .. : : . ...... :
NP_001 PQLYKQMCICADFEKVFSIGPVFRAEDSNTHRHLTEFVGLDIEMAFNYHYHEVMEEIADT
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VCDVVDRILKSPAGSIVHELNPNFQPPKRPFK------RMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGT
. .. . :. . .. .: .: : .::: :..: .:.. :.: :. :
NP_001 MVQIF-KGLQERFQTEIQTVNKQF--PCEPFKFLEPTLRLEYCEALAMLREAGVEMGDE-
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
pF1KB5 FYEFGEDIPEAPERLMTDTINEPI-----LLCRFPVEIKSFYMQRCPEDSRLTESVDVLM
.:. :.:. ..: .: ..:. .. :: . :.. . ..: :..:
NP_001 -----DDLSTPNEKLLGHLVKEKYDTDFYILDKYPLAVRPFYTMPDPRNPKQSNSYDMFM
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 PNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYTDQRKYGTCPHGGYGLGLERFLTW
. ::..:..:: : . . ..::: : :. ..:. ::.: :.::::
NP_001 RGE-EILSGAQRIHDPQLLTERALHHGIDLEKIKAYIDSFRFGAPPHAGGGIGLERVTML
430 440 450 460 470
530 540
pF1KB5 ILNRYHIRDVCLYPRFVQRCTP
.:. ...:.. ..:: .: ::
NP_001 FLGLHNVRQTSMFPRDPKRLTP
480 490 500
>>NP_078954 (OMIM: 612803,616239) probable asparagine--t (477 aa)
initn: 516 init1: 186 opt: 492 Z-score: 514.6 bits: 104.8 E(85289): 6.3e-22
Smith-Waterman score: 656; 31.8% identity (59.1% similar) in 472 aa overlap (104-546:21-475)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 QMKSESREKKEAEDSLRREKNLEEAKKITIKNDPSLPEPKCVKIGALEGYRGQRVKVFGW
:. :: .:: .. :.:.:. ::
NP_078 MLGVRCLLRSVRFCSSAPFPKHKPSAKLSVRDALGA-QNASGERIKIQGW
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 VHRLRRQGKNLMFLVLRDGTGY--LQCVLADELCQCYNGVLLSTESSVAVYGMLNLTPKG
.. .: : :...:: . ::.. :: :.:: . .. :. ::: : :.: .:.
NP_078 IRSVRSQ-KEVLFLHVNDGSSLESLQ-VVAD---SGLDSRELNFGSSVEVQGQLIKSPSK
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGENMSKILKARSM
.: ::. . ..:: : .:. .. . :. : . ...::. ::
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pF1KB5 VTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLD-----------YFGEEAFLTQSS
.: ... : : :. .. : ..... ::.. ::.:. .:. :::: :.
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::.::. :. .:: .. ..:::.:..::::::. .::: :. ...::.. .:.:
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.. .: : : :: .: : : : ..:..:. ::. ..
NP_078 ATTMMVLSKCPEDV---ELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNNFLIISYTEAVEILKQ---ASQ
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NP_078 NFTFTPEWGADLRTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLTLKPFYM-RDNEDGPQHTVAAVDL
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:.:.:::. ::..: . . : :. . : :: : :..:. ::::.:.:.::.:
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::. .:.:: .::: . :
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:: :. ...::.. .:.: .. .: : : :: .: : :
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Smith-Waterman score: 433; 34.4% identity (61.3% similar) in 253 aa overlap (310-546:4-248)
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pF1KB5 GGATLFKLDYFGEEAFLTQSSQLYLETCLPALGDVFCIAQSYRAEQSRTRRHLAEYTHVE
:. .:: .. ..:::.:..::::::. .:
XP_016 MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMIE
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pF1KB5 AECPFL-TFDDLLNRLEDLVCDVVDRIL-KSPAGSIVHELNPNFQPP----------KRP
:: :. ...::.. .:.: .. .: : : :: .: : :
XP_016 AEISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDV---ELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNN
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pF1KB5 FKRMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFY-EFGEDIPEAPER-LMTDTINEPILLCRFPVEIK
: ..:..:. ::. ... :: :.: :. :. :. : :... .:. .:
XP_016 FLIISYTEAVEILKQ---ASQNFTFTPEWGADLRTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLTLK
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pF1KB5 SFYMQRCPEDS--RLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYT
::: : ::. . . .::.:.:.:::. ::..: . . : :. . : ::
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: :..:. ::::.:.:.::.: ::. .:.:: .::: . :
XP_016 DLRRFGSVPHGGFGMGFERYLQCILGVDNIKDVIPFPRFPHSCLL
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>>XP_011543555 (OMIM: 612803,616239) PREDICTED: probable (468 aa)
initn: 466 init1: 168 opt: 425 Z-score: 445.4 bits: 92.0 E(85289): 4.5e-18
Smith-Waterman score: 613; 31.6% identity (58.3% similar) in 472 aa overlap (104-546:21-466)
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pF1KB5 KQAPGGHELSCDFWELIGLAPAGGADNLINEESDVDVQLNNRHMMIRGENMSKILKARSM
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XP_011 RQNV---ELKAEKIKVIGNCDAKDFPIKYKERHPLEYLRQYPHFRCRTNVLGSILRIRSE
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300
pF1KB5 VTRCFRDHFFDRGYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFKLD-----------YFGEEAFLTQSS
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XP_011 ATAAIHSFFKDSGFVHIHTPIITSNDSEGAGELFQLEPSGKLKVPEENFFNVPAFLTVSG
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350
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pF1KB5 DGTFY-EFGEDIPEAPER-LMTDTINEPILLCRFPVEIKSFYMQRCPEDS--RLTESVDV
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XP_011 NFTFTPEWGADLRTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLTLKPFYM-RDNEDGPQHTVAAVDL
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XP_016 MSGAFTQVFTFGPTFRAENSQSRRHLAEFYMIE
10 20 30
340 350 360 370 380
pF1KB5 AECPFL-TFDDLLNRLEDLVCDVVDRIL-KSPAGSIVHELNPNFQPP----------KRP
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XP_016 AEISFVDSLQDLMQVIEELFKATTMMVLSKCPEDV---ELCHKFIAPGQKDRLEHMLKNN
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 FKRMNYSDAIVWLKEHDVKKEDGTFY-EFGEDIPEAPER-LMTDTINEPILLCRFPVEIK
: ..:..:. ::. ... :: :.: :. :. :. : :... .:. .:
XP_016 FLIISYTEAVEILKQ---ASQNFTFTPEWGADLRTEHEKYLVKHCGNIPVFVINYPLTLK
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pF1KB5 SFYMQRCPEDS--RLTESVDVLMPNVGEIVGGSMRIFDSEEILAGYKREGIDPTPYYWYT
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XP_016 PFYM-RDNEDGPQHTVAAVDLLVPGVGELFGGGLR----EE------RYHFLEERLARYL
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]