FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5957, 513 aa 1>>>pF1KB5957 513 - 513 aa - 513 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8495+/-0.00106; mu= 12.1450+/- 0.063 mean_var=156.0615+/-32.115, 0's: 0 Z-trim(109.9): 165 B-trim: 471 in 1/50 Lambda= 0.102666 statistics sampled from 11000 (11184) to 11000 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16 Scan time: 2.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 3570 541.0 1.2e-153 CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 1187 188.2 2.8e-47 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 842 136.9 4.8e-32 CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 788 129.0 1.3e-29 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 746 122.7 9.2e-28 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 735 121.1 2.8e-27 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 697 115.5 1.4e-25 CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 695 115.2 1.8e-25 CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 688 114.1 3.5e-25 CCDS43414.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 329) 683 113.2 4.5e-25 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 685 113.7 5.1e-25 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 680 112.9 8.1e-25 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 680 113.0 8.5e-25 CCDS4463.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 303) 676 112.2 8.8e-25 CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 675 112.0 1e-24 CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 677 112.5 1.1e-24 CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 677 112.5 1.2e-24 CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 675 112.1 1.2e-24 CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 675 112.2 1.4e-24 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 672 111.6 1.4e-24 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 674 112.1 1.5e-24 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 672 111.8 1.8e-24 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 672 111.8 1.9e-24 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 647 108.1 2.4e-23 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 646 107.9 2.7e-23 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 640 107.0 5.1e-23 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 637 106.5 5.8e-23 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 633 106.0 1e-22 CCDS4678.1 TRIM26 gene_id:7726|Hs108|chr6 ( 539) 627 105.1 2e-22 CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 601 101.3 3.1e-21 CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 599 101.0 3.6e-21 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 598 100.8 3.7e-21 CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 592 99.9 6.6e-21 CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 592 99.9 7.1e-21 CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 ( 465) 577 97.7 3.1e-20 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 574 97.2 3.9e-20 CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 573 97.1 5.1e-20 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 561 95.1 1.2e-19 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 561 95.2 1.3e-19 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 556 94.6 2.7e-19 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 554 94.5 5e-19 CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 544 92.8 9.8e-19 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 542 92.5 1.1e-18 CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 544 92.9 1.1e-18 CCDS46201.1 RFPL4A gene_id:342931|Hs108|chr19 ( 287) 530 90.5 2.7e-18 CCDS55981.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 445) 527 90.2 5.1e-18 CCDS59425.1 RFPL4AL1 gene_id:729974|Hs108|chr19 ( 287) 519 88.9 8.5e-18 CCDS13904.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 288) 517 88.6 1e-17 CCDS43011.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 317) 517 88.6 1.1e-17 CCDS46694.1 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 317) 513 88.0 1.7e-17 >>CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 (513 aa) initn: 3570 init1: 3570 opt: 3570 Z-score: 2872.1 bits: 541.0 E(32554): 1.2e-153 Smith-Waterman score: 3570; 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38.6% identity (68.7% similar) in 485 aa overlap (17-494:313-777) 10 20 30 40 pF1KB5 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICC---ACLARC : : ..:. : .. : : .. CCDS10 PDGGASADLKEGPGNPEHSVTGRPPDTAASPRCHAQEGDPVDGTCVRDSCSFPEAVSGHP 290 300 310 320 330 340 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 WGTAETNVSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPL ... . .::.:... : : :. . :. : . :..: . . CCDS10 QASGSRSPGCPRCQDS----HER------------KSPGSLSPQ-P---LPQCKRHLKQV 350 360 370 380 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 KL-YCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRA .: .::. . :::..:. :.::.:: : :.::.. :..::.::.:::... ...:. CCDS10 QLLFCEDHDEPICLICSLSQEHQGHRVRPIEEVALEHKKKIQKQLEHLKKLRKSGEEQRS 390 400 410 420 430 440 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 QGEQARAELLSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQF ::. . .:. :. .... ..::.:. :...:. ..: ::.. . . .. :. CCDS10 YGEEKAVSFLKQTEALKQRVQRKLEQVYYFLEQQEHFFVASLEDVGQMVGQIRKAYDTRV 450 460 470 480 490 500 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 SCNISHLSSLIAQLEEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQ : .:. :..::..:: :. : :::::::: : ::. . .:: : :: ....::... : CCDS10 SQDIALLDALIGELEAKECQSEWELLQDIGDILHRAKTVPVPEKWTTPQEIKQKIQLLHQ 510 520 530 540 550 560 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 KCLFLTESLKQFTEKMQSDME--KIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRY : :. .: : :.: ..:.:: .. :: :: ..:.: :: .::::.::.::.:..:: CCDS10 KSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIGAQAHAVNVILDAETAYPNLIFSDDLKSVRL 570 580 590 600 610 620 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTS . . :::.:.::. ::::: :..::.:::::::::. : .:.:. :. :::..: CCDS10 GNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVGDKTAWILGACKTSISRKGNMTL 630 640 650 660 670 680 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 APQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFT .:.::.:.: . .:: : . : : : .. : .:::::.:: .: .:::::: : : .: CCDS10 SPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDYRVGSISFYNVTARSHIYT 690 700 710 720 730 740 470 480 490 500 510 pF1KB5 FSHATFCGPVRPYFSL-SYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP :. .: ::..: :: . .:::..::: :::..: CCDS10 FASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGPD 750 760 770 780 >>CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 (474 aa) initn: 714 init1: 321 opt: 842 Z-score: 688.8 bits: 136.9 E(32554): 4.8e-32 Smith-Waterman score: 887; 32.9% identity (59.9% similar) in 514 aa overlap (7-493:3-471) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCWGTAETNVSCPQCRETF :: .:.: :::.::.:: .:. ..::::.: .:: : :. . ::.::. CCDS56 MEAEDIQEELTCPICLDYFQDPVSIECGHNFCRGCLHRNWAPGGGPFPCPECRHPS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 PQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDR .::: :: .:. . : : : :: .: .: :::.:.::.:: :.:.:: . CCDS56 APAALRPNWALARLTEKT-QRRRLGPVPPG----LCGRHWEPLRLFCEDDQRPVCLVCRE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB5 SREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQI----QNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQ :.::. :.. :..:: :...:.. .: . ..:.: :. . .. : . .. : CCDS56 SQEHQTHAMAPIDEAFESYREKLLKSQRNLVAKMKKVMHLQDVEVKNATQWKDKIKS--- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 MEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQL .: .: :: .:.. : :.: .: ::.. . ...: ... .:. :..:: .. CCDS56 -QRMRISTEFSKLHNFLVEEEDLFLQRLNKEEEETKKKLNENTLKLNQTIASLKKLILEV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 EEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTE ::.: :: ::::. ..:.:.: .:. .. ::. CCDS56 GEKSQAPTLELLQNPKEVLTRSE-------------IQD-----------VNYSLEAVKV 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KB5 KMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLP-------- : .. ..:. . ..: :.: :::.:.:..:.. : :. . .. : CCDS56 KTVCQIPLMKEM--LKRFQVAVNLAEDTAHPKLVFSQEGRYVKNTASASSWPVFSSAWNY 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 pF1KB5 ----DNP------ERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGV :: :::. .:::::. : .:.:::::: :. . ..:::...: :. CCDS56 FAGWRNPQKTAFVERFQHLPCVLGKNVFTSGKHYWEVESRDSLEVAVGVCREDVM---GI 330 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 TS----APQNGFWAVSLWYGKEYWALTS-PMTALPLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVT :. .:. :.::. : . :: : . : : . :.:::..:: .:.::::... CCDS56 TDRSKMSPDVGIWAI-YWSAAGYWPLIGFPGTPTQQEPALHRVGVYLDRGTGNVSFYSAV 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 ERCHTFTFSHATFCGPVRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP . : ::: .. . .::.: :: : :.: :.. CCDS56 DGVHLHTFSCSSV-SRLRPFFWLS-----PLASLVIPPVTDRK 440 450 460 470 >>CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 (511 aa) initn: 1151 init1: 488 opt: 788 Z-score: 645.2 bits: 129.0 E(32554): 1.3e-29 Smith-Waterman score: 1149; 40.3% identity (65.3% similar) in 501 aa overlap (5-480:18-504) 10 20 30 40 pF1KB5 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCW--- ..: :: :.:: .::. : ::. ..:::..: ::..::: CCDS44 MAAVGPRTGPGTGAEALALAAELQGEATCSICLELFREPVSVECGHSFCRACIGRCWERP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KB5 -----GTAETN----VSCPQCRETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGV :.: . :::::: ..::::.:: :. :.. : :.. :: : CCDS44 GAGSVGAATRAPPFPLPCPQCREPARPSQLRPNRQLAAVATLLR--RFSLPAAAPGEHGS 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 pF1KB5 -----------CEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQ : .: ::.::::..: :::::::.:::: :.::::.:::. :: .. CCDS44 QAAAARAAAARCGQHGEPFKLYCQDDGRAICVVCDRAREHREHAVLPLDEAVQEAKELLE 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 NQLDHLKR-VKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQMEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLAR ..: ::. ..: . : .. .... :::. :.::. ::. : : :.: :::.: CCDS44 SRLRVLKKELEDCEVFRSTEKKESK-ELLKQMAAEQEKVGAEFQALRAFLVEQEGRLLGR 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 LEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQLEEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRI ::::. . .. : ..:.. .:..::.: .:..: :.: ..::.. .:::: . CCDS44 LEELSREVAQKQNENLAQLGVEITQLSKLSSQIQETAQKPDLDFLQEFKSTLSRCSNVPG 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 PEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTEKMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPD :.: . ....:. . : . : ::.: : .....:: .. :..::::: CCDS44 PKPTTVSSEMKNKVWNVSLKTFVLKGMLKKFKEDLRGELEKEEK--------VELTLDPD 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 TAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKW :: : :::: .:. :: . ::::..: ::. ::.: : .:::.::::::.: : CCDS44 TANPRLILSLDLKGVRLGERAQDLPNHPCRFDTNTRVLASCGFSSGRHHWEVEVGSKDGW 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 TIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTP-LQRVGIFLDY ..:: ..:: ::: . .:..: ::..: : .:::.::: . :: :.:: . :: CCDS44 AFGVARESVRRKGLTPFTPEEGVWALQL-NGGQYWAVTSPERS-PLSCGHLSRVRVALDL 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KB5 DAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPVRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHV ..: :::: : . : .:: ...: : : ::. .: CCDS44 EVGAVSFYAVEDMRHLYTF-RVNFQERVFPLFSVCSTGTYLRIWP 470 480 490 500 510 510 pF1KB5 GNHGHSMETSP >>CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 (481 aa) initn: 896 init1: 416 opt: 746 Z-score: 611.9 bits: 122.7 E(32554): 9.2e-28 Smith-Waterman score: 963; 34.7% identity (64.1% similar) in 487 aa overlap (1-476:1-470) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLAR-CWGTA---ETNVSCPQC :::.. . : .:..::.: . ::. .:::::.: :::.: : . : . .:: : CCDS34 MASAASVTSLADEVNCPICQGTLREPVTIDCGHNFCRACLTRYCEIPGPDLEESPTCPLC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICV .: : .::: .::::.. ...:. : : : ::..: : . ..::.:.: .:: CCDS34 KEPFRPGSFRPNWQLANVVENIERLQLVSTLGLG-EEDVCQEHGEKIYFFCEDDEMQLCV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQ :: .. :: :.. ::.:. ..:::.. : :.. .. .. ... .. ::. .. CCDS34 VCREAGEHATHTMRFLEDAAAPYREQIHKCLKCLRKEREEIQEIQSRENKRMQVLLTQVS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 MEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQL .:.... :: .: . :.:.. :::.:: : : . . . .: ..:.:: .: CCDS34 TKRQQVISEFAHLRKFLEEQQSILLAQLESQDGDILRQRDEFDLLVAGEICRFSALIEEL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 EEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTE :::...:.:::: :: .:: : : . .: . :.: ..:. : :. : : . .:.: : CCDS34 EEKNERPARELLTDIRSTLIRCETRKCRKPVAVSPELGQRIRDFPQQALPLQREMKMFLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 KMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNL :. ... . ..:::.:..:.:.::.. .....:: :. ::::.::. CCDS34 KLCFELD---------YEPAHISLDPQTSHPKLLLSEDHQRAQFSYKWQNSPDNPQRFDR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 FPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKW---TIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWY :::. . .::: : : . : :. :.:: ..: ::: . :..: ::: : CCDS34 ATCVLAHTGITGGRHTWVVSI-DLAHGGSCTVGVVSEDVQRKGELRLRPEEGVWAVRL-- 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB5 GKEYWALTSPMTALPLRTPLQ----RVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGP :...: . ..: : :. .: . :::..: :.: :.. : .::. :.: CCDS34 ---AWGFVSALGSFPTRLTLKEQPRQVRVSLDYEVGWVTFTNAVTREPIYTFT-ASFTRK 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 VRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP : :.:.: CCDS34 VIPFFGLWGRGSSFSLSS 470 480 >>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa) initn: 1261 init1: 401 opt: 735 Z-score: 603.3 bits: 121.1 E(32554): 2.8e-27 Smith-Waterman score: 1238; 40.6% identity (67.8% similar) in 500 aa overlap (1-497:1-462) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACLARCWGTAETNVSCPQCRETF ::. ... ::.:.:: .::.::..:.: :::::.: :. :::: : .::.::: CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 PQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICVVCDR :::..:::: ::........:. : .: . ::: ::::: .: .. .:..:.: CCDS31 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLH---PPSPVPQ-GVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACER 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 SREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQMERE : :: .: : ::..:.: .: .....:.::.. . .::.... . .... .:. CCDS31 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 KIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQLEEKQ ... :::.: . : :.: .:: :::: .: . . . .... . .::. :::.:: . CCDS31 NVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 QQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTEKMQS : :. ::::: :.: :.. ... : ..: .:. .. . :.:.:..: CCDS31 QLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPG-----LVETLRRFRG---- 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 DMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNLFPCV ::::::::: : ::::.. :.:. . :.: :::.::::. ::: CCDS31 ----------------DVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCV 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 pF1KB5 LGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRK-GGVTSAPQNGFWAVSLWYGKEYWA ::. : .:::::::::::...:..:::...: :: : :: :::: . .. :. : CCDS31 LGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAG-NGFW-ILVFLGSYY-- 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 LTSPMTAL-PLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPVRPYFS-LS .: :: ::: : .::::::::.::..:::..:. : : . : : .:: :: :: CCDS31 -NSSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLS 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 pF1KB5 YSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP .: .:. :: .: .: CCDS31 ----SSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ 450 460 >>CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 (498 aa) initn: 822 init1: 327 opt: 697 Z-score: 572.5 bits: 115.5 E(32554): 1.4e-25 Smith-Waterman score: 852; 30.9% identity (60.5% similar) in 517 aa overlap (5-493:4-497) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MASGSVAECLQQETTCPVCLQYFAEPMMLDCGHNICCACL-ARCWGT---AETNVSCPQC :: ...:.:::.::. ..::. :::::..: ::. :. . .. . ::: : CCDS41 MDFSVKVDIEKEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSFCQACITAKIKESVIISRGESSCPVC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RETFPQRHMRPNRHLANVTQLVKQLRTERPSGPGGEMGVCEKHREPLKLYCEEDQMPICV . : ..::::::::... ::... :. : . :::.: . :...:.:: :: CCDS41 QTRFQPGNLRPNRHLANIVERVKEVKMS-PQ-EGQKRDVCEHHGKKLQIFCKEDGKVICW 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VCDRSREHRGHSVLPLEEAVEGFKEQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQ ::. :.::.::... ..:.:. .:..: :..: . . .. . . .: :. . : CCDS41 VCELSQEHQGHQTFRINEVVKECQEKLQVALQRLIKEDQEAEKLEDDIRQERTAWKNYIQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 MEREKIVWEFEQLYHSLKEHEYRLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQL .::.::. :... : ..: : : .::: .. . ... .: :. . . :.::..: CCDS41 IERQKILKGFNEMRVILDNEEQRELQKLEEGEVNVLDNLAAATDQLVQQRQDASTLISDL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 EEKQQQPTRELLQDIGDTLSRAERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTE ... . . :.:::. :...:.: . . : ....:. : .: . .:. . CCDS41 QRRLRGSSVEMLQDVIDVMKRSESWTLKK----PKSVSKKL-----KSVFRVPDLSGM-- 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 KMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNL .. ..:: ..: : ::: :.: .: .. .: . :::. .:: :. CCDS41 -----LQVLKELTDVQYYWVDVMLNPGSATSNVAISVDQRQVKTVRTCTFKNSNPCDFSA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KB5 FPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCE--DSVCRKGGVTSA------------- : :.: : .:..::::.:. : : .:: .:. .. . : CCDS41 FG-VFGCQYFSSGKYYWEVDVSGKIAWILGVHSKISSLNKRKSSGFAFDPSVNYSKVYSR 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 --PQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALP------LRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVT :: :.:...: :: :. . .. : . .: :.:.::::.:: :::.::: CCDS41 YRPQYGYWVIGLQNTCEYNAFEDSSSSDPKVLTLFMAVPPCRIGVFLDYEAGIVSFFNVT 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 ER-CHTFTFSHATFCGPVRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETS .. . :: : :. :::. . .:. .:: : CCDS41 NHGALIYKFSGCRFSRPAYPYFN----PWNCLVPMTVCPPSS 470 480 490 pF1KB5 P >>CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 (526 aa) initn: 675 init1: 393 opt: 695 Z-score: 570.6 bits: 115.2 E(32554): 1.8e-25 Smith-Waterman score: 695; 50.7% identity (75.6% similar) in 209 aa overlap (289-497:278-478) 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 ERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTEKMQSDMEKIQELREAQLYSVDV : ..:. : . .:... ..: :..::: CCDS46 VAVAVILMVLGLLTIGSIFFTWRLYNERPRERRNEFSSK-ERLLEELK-WKKATLHAVDV 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 TLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVG :::::::.: :.: .. ..:: .: ::.. :::. .::::: : .:::::::::: CCDS46 TLDPDTAHPHLFLYEDSKSVRLEDSRQKLPEKTERFDSWPCVLGRETFTSGRHYWEVEVG 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 DKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTPLQRVGI :.. :.::::...: .:: .:.:::::: : ::. ::::: : ::: : .:::: CCDS46 DRTDWAIGVCRENVMKKGFDPMTPENGFWAVEL-YGNGYWALTPLRTPLPLAGPPRRVGI 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 FLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPVRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGF ::::..:..::::... .:::..:: ::.::.: : .:.::. :: :::.. :: CCDS46 FLDYESGDISFYNMNDGSDIYTFSNVTFSGPLRPFFCL-WSSGKK--PLTICPIA--DGP 430 440 450 460 470 500 510 pF1KB5 SGHVGNHGHSMETSP CCDS46 ERVTVIANAQDLSKEIPLSPMGEDSAPRDADTLHSKLIPTQPSQGAP 480 490 500 510 520 >>CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 (475 aa) initn: 656 init1: 633 opt: 688 Z-score: 565.5 bits: 114.1 E(32554): 3.5e-25 Smith-Waterman score: 688; 55.7% identity (77.6% similar) in 183 aa overlap (309-490:231-412) 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 IFAQKCLFLTESLKQFTEKMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQV :.:.:. : ::::::::.:.::::.. : : CCDS47 HAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAVTLDPDTAHPKLILSEDQRCV 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 RYSYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGV : . .: .::::.::.. .::: : .: ::::: ::::.:: .::: .:: ::: : CCDS47 RLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTKWILGVCSESVSRKGKV 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 TSAPQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHT :..: :: : . :.:: :::::.:.. :. : . :::::::.:: .::::::.. : CCDS47 TASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDYEAGVISFYNVTNKSHI 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 pF1KB5 FTFSHATFCGPVRPYFSLS-YSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP :::.: .: ::.::.: ..:::..:::.:: CCDS47 FTFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEESIVPRPEGKGHANGDVSLK 390 400 410 420 430 CCDS47 VNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF 440 450 460 470 >>CCDS43414.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 (329 aa) initn: 656 init1: 310 opt: 683 Z-score: 563.6 bits: 113.2 E(32554): 4.5e-25 Smith-Waterman score: 683; 40.6% identity (66.5% similar) in 313 aa overlap (171-480:21-322) 150 160 170 180 190 pF1KB5 EQIQNQLDHLKRVKDLKKRRRAQGEQARAELLSLTQM--EREKIVWEFEQLYHSLKEHEY ::. :: :.::. ::. : : :.: CCDS43 MTQATGQMLCLHVQVPLQLLLLGQKQMAAEQEKVGAEFQALRAFLVEQEG 10 20 30 40 50 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 RLLARLEELDLAIYNSINGAITQFSCNISHLSSLIAQLEEKQQQPTRELLQDIGDTLSRA :::.:::::. . .. : ..:.. .:..::.: .:..: :.: ..::.. .:::: CCDS43 RLLGRLEELSREVAQKQNENLAQLGVEITQLSKLSSQIQETAQKPDLDFLQEFKSTLSRC 60 70 80 90 100 110 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 ERIRIPEPWITPPDLQEKIHIFAQKCLFLTESLKQFTEKMQSDMEKIQELREAQLYSVDV . :.: . ....:. . : . : ::.: : .....:: .. :.. CCDS43 SNVPGPKPTTVSSEMKNKVWNVSLKTFVLKGMLKKFKEDLRGELEKEEK--------VEL 120 130 140 150 160 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 TLDPDTAYPSLILSDNLRQVRYSYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVG ::::::: : :::: .:. :: . ::::..: ::. ::.: : .:::.:::::: CCDS43 TLDPDTANPRLILSLDLKGVRLGERAQDLPNHPCRFDTNTRVLASCGFSSGRHHWEVEVG 170 180 190 200 210 220 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 DKAKWTIGVCEDSVCRKGGVTSAPQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTP-LQRVG .: :..:: ..:: ::: . .:..: ::..: : .:::.::: . :: :.:: CCDS43 SKDGWAFGVARESVRRKGLTPFTPEEGVWALQL-NGGQYWAVTSPERS-PLSCGHLSRVR 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 IFLDYDAGEVSFYNVTERCHTFTFSHATFCGPVRPYFSLSYSGGKSAAPLIICPMSGIDG . :: ..: :::: : . : .:: ...: : : ::. .: CCDS43 VALDLEVGAVSFYAVEDMRHLYTF-RVNFQERVFPLFSVCSTGTYLRIWP 290 300 310 320 500 510 pF1KB5 FSGHVGNHGHSMETSP 513 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 10:45:57 2016 done: Sat Nov 5 10:45:57 2016 Total Scan time: 2.920 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]