Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5979
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5979, 520 aa
1>>>pF1KB5979 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0818+/-0.000848; mu= 11.2603+/- 0.052
mean_var=119.7577+/-23.780, 0's: 0 Z-trim(111.1): 31 B-trim: 47 in 1/50
Lambda= 0.117199
statistics sampled from 12114 (12145) to 12114 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 3528 607.4 1.2e-173
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 1265 224.8 2.1e-58
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 1241 220.7 3e-57
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 1210 215.5 1.3e-55
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 851 154.8 2e-37
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 760 139.3 7.2e-33
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 754 138.3 1.5e-32
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 745 136.8 4.4e-32
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 737 135.5 1.4e-31
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 724 133.3 6.7e-31
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 724 133.3 6.7e-31
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 695 128.4 1.9e-29
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 688 127.3 5.8e-29
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 679 125.7 1.2e-28
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 630 117.8 1.6e-25
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 630 117.9 1.7e-25
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 600 112.4 1.7e-24
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 599 112.3 1.9e-24
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 597 111.9 2.4e-24
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 578 108.6 1.8e-23
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 537 101.7 1.8e-21
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 524 99.6 1.3e-20
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 487 93.2 6.6e-19
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 410) 479 91.8 1.6e-18
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 456 88.0 2.4e-17
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 446 86.2 7e-17
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 420 82.0 2.6e-15
>>CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 3528 init1: 3528 opt: 3528 Z-score: 3230.8 bits: 607.4 E(32554): 1.2e-173
Smith-Waterman score: 3528; 100.0% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 QPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 MFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYPW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RPSFTLDFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPSFTLDFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SKSGSSEDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNSITPEALSCSFHPSYDFYRYNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKSGSSEDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNSITPEALSCSFHPSYDFYRYNFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 MPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL
490 500 510 520
>>CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (602 aa)
initn: 914 init1: 634 opt: 1265 Z-score: 1161.9 bits: 224.8 E(32554): 2.1e-58
Smith-Waterman score: 1400; 45.5% identity (69.0% similar) in 565 aa overlap (1-520:9-566)
10 20 30
pF1KB5 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQD--------PIQAEQP-------ELRE
.::::::.:::::::.: .::::.: ..: .: :
CCDS81 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 KKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQ
.: : . . ..:... :: : .. . :: .. . :. . . :.:: ::.:::
CCDS81 AHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEE--IQVELQ
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 GSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYH
..:::::::::::::::::::::::..:::. :::: .::..:.:.::::.::::::::
CCDS81 CADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYH
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 SSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSM
::.::::::.: . :: :.:::: ::.:::::..:::..::::::.::.:::::.::
CCDS81 SSKWMVAGNADSP-VPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 HKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPT-EGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNP
:::.::::::.. : ::: . .:. .:::::.: :: :::::::::::::.:::.:::
CCDS81 HKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 FAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYP-WRPSF-TLDFKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAP
:::::::.:::: :....::: ::: :: :. : . :.::.:.::.::: :.:
CCDS81 FAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB5 SPLNS--LLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCPEAYLPNVNL---PLCYKICPTNFWQQQPLV
:: : :::: : : ::: ..... : :. : :.:: : : . . . . :
CCDS81 SPSASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLS
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 LPAPERLASSNSS--QSLAPLM-MEVP-MLSSLGVTNSKSGSS--EDSSDQYLQAPNSTN
. .:: :...: : .: ...: ..:.. . : :.: : . : . : :.
CCDS81 DSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFP--TS
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB5 QMLYGLQSPGNIFLPNSITPEAL-----------SCSFHPSYDFYRYNFSMPSRLISGSN
:. : .:. :: .: .:. . . :.: :..: ::: :: .. .
CCDS81 QFQYVMQA-GNA-ASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPE
480 490 500 510 520 530
500 510 520
pF1KB5 HLKVNDDSQV--SFGEGKCNHVHWYPA-INHYL
.:...... . : ..: .. .. :. ..: .
CCDS81 KLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGS
540 550 560 570 580 590
CCDS81 SSQMSVHMV
600
>>CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (496 aa)
initn: 789 init1: 634 opt: 1241 Z-score: 1141.3 bits: 220.7 E(32554): 3e-57
Smith-Waterman score: 1299; 48.6% identity (71.8% similar) in 465 aa overlap (86-520:3-460)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIIT
:.:: ::.::: ..:::::::::::::::
CCDS30 MSSMEE--IQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPR
::::::::..:::. :::: .::..:.:.::::.::::::::::.::::::.: . ::
CCDS30 KAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSP-VPPR
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDL
:.:::: ::.:::::..:::..::::::.::.:::::.:::::.::::::.. : ::
CCDS30 VYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDL
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SQIQSLPT-EGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGL
: . .:. .:::::.: :: :::::::::::::.:::.::::::::::.:::: :...
CCDS30 SPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAI
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340
pF1KB5 LETYP-WRPSF-TLDFKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNS--LLSPLCFSPMF
.::: ::: :: :. : . :.::.:.::.::: :.::: : :::: : : :
CCDS30 METYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTF
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 HLPTSSLGMPCPEAYLPNVNL---PLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSS--QSL
:: ..... : :. : :.:: : : . . . . : . .:: :...: :
CCDS30 HLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPS
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450
pF1KB5 APLM-MEVP-MLSSLGVTNSKSGSS--EDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNSI
.: ...: ..:.. . : :.: : . : . : :.:. : .:. :: .:
CCDS30 ETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFP--TSQFQYVMQA-GNA-ASSSS
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500
pF1KB5 TPEAL-----------SCSFHPSYDFYRYNFSMPSRLISGSNHLKVNDDSQV--SFGEGK
.:. . . :.: :..: ::: :: .. ..:...... . : ..:
CCDS30 SPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGA
390 400 410 420 430 440
510 520
pF1KB5 CNHVHWYPA-INHYL
.. .. :. ..: .
CCDS30 FGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
450 460 470 480 490
>>CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 (607 aa)
initn: 725 init1: 618 opt: 1210 Z-score: 1111.6 bits: 215.5 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1231; 43.2% identity (64.4% similar) in 553 aa overlap (6-502:16-554)
10 20 30 40
pF1KB5 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDP---IQAEQPELR------EKKGG
.:.:::::::.: ....:: . ::. . ::
CCDS34 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAAGAVDDGGCSRGGG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB5 EEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTS-------ASSGC--GSDSGY-----------G
:. . : . : . :. : :..:: : ..: :
CCDS34 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KB5 NSSESLEEKDIQM--------ELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLD
. ..:: . . .:::.:::::::.::::::::::::::::..:::..:::
CCDS34 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 PGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHPDSPCSGETWMRQI
: .::..:.:.::::.::::::::::.::::::.: . :: :.::::: ::::::::.
CCDS34 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSP-VPPRVYIHPDSPASGETWMRQV
190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 ISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPT-EGVKTFSFK
::::..::::::.::.:::::.:::::.::::::.. . ::: :. .:. ::::.:::
CCDS34 ISFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFP
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 ETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYP-WRPSF-TLDFKT
:: :::::::::::::.:::.::::::::::.:::: :..:.:.: ::::. :: :.
CCDS34 ETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFED
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360
pF1KB5 F-GADTQSGSSGSSPVTSSG-GAPSPLNSLLS-PLCFSPMFHL-PTSSLGMPCPEAYLPN
. : :...:.:. . ..: :.:. ::: : :: ::: :..: . : :
CCDS34 IPGIPKQGNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNTS--QLCSLA----
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VNLPLCYKICPTN--FWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMME--VPMLSSLGVTNSK
: :. : . .. : ........:: : . :: .:. :
CCDS34 ---PADYSACARSGLTLNRYSTSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSM
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470
pF1KB5 SGSSEDS-----SDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPG-NIFLPNSITPEALSCSF--HPSYDF
.:.. :. .. .: . . :. : . ::. : : :. : .. .: : .
CCDS34 GGTDGDTFSCPQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQ-THQGSYNTFRLHSPCAL
480 490 500 510 520
480 490 500 510 520
pF1KB5 YRYNFSMPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL
: :::: .: .. ... .:: ::
CCDS34 YGYNFSTSPKLAASPEKIV---SSQGSFLGSSPSGTMTDRQMLPPVEGVHLLSSGGQQSF
530 540 550 560 570 580
>>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 (447 aa)
initn: 799 init1: 349 opt: 851 Z-score: 785.5 bits: 154.8 E(32554): 2e-37
Smith-Waterman score: 851; 40.3% identity (65.8% similar) in 409 aa overlap (3-397:11-405)
10 20 30 40
pF1KB5 MALSSRARAFSVEALV---GRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRS
::::: :::. ::. : :. .. :. . .. ::.. . . .
CCDS43 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLE-QFVEKSSCAQPLGELT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSS--ESLEEKDIQMELQGSELWKRFHD
: ...: . . ::.: : : .. .. : : : :. .::: .::.
CCDS43 SLDAHGE-FGGGSGSSPSSS--SLC-TEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFHE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 IGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNT
.::::::::.::::::..::. .:.:: .: : .:.::::.:::::.:: :.:.:::..
CCDS43 LGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 DHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHV
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CCDS43 DP--PLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 IEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGR
:.. . . ... .: .: .:: : :: ::.::::::: ::::::. :::::::::..:
CCDS43 IKKKDHT--ASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 NRGVLDGLLETYPWRPSFTLD-FKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAPSP---LNSLLS
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CCDS43 LTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB5 PLCFSPMFHLPTS--SLGMPCPEAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSN
: :. : : .:: : . :. .. : . . ::. : .:::
CCDS43 SSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATP-IPHPIQGSLPPYSRLGM-PLT---PSAIASSM
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
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CCDS43 QGSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV
410 420 430 440
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: : : . : . . .:.:. . :
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: : . . .. ..:. . :: .:...:::::.:::::::::. .::. :
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260 270 280 290 300
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. .. :: ::. . . .:: :. :. ::.:
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CCDS31 VSRVTVQLEMK--PLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIP
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CCDS31 RITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKA
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pF1KB5 NLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTNSKSGSSE
CCDS31 RADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ
360 370 380
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CCDS13 FEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGAL---PLMSAFARS
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
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. .. :: ::. .. : .. . . .: .: ... . .::.:::
CCDS13 RNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVKAE-TSRNTPEREVELLRDAGGCVNLGLPCPAECQ
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:
CCDS13 PFNTQGLVAGRTAGDRLC
390
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CCDS13 GASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFG
90 100 110 120 130 140
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pF1KB5 LDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWM
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CCDS13 MDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADP--ATPGRVHYHPDSPAKGAQWM
150 160 170 180 190 200
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CCDS13 KQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDS---EKYAEENFKTFV
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CCDS13 FEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALP-LMSAFARSRN
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300 310 320 330 340
pF1KB5 ----PWRPSFTL-DFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLC--------FS
: .:: : : . : ..: . . . . :. : .::: .
CCDS13 PVASPTQPSGTEKDAAEARREFQRDAGGPAVLGDPAHPPQLLARVLSPSLPGAGGAGGLV
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pF1KB5 PMFHLPTSSLGMPCPEAYL--PNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSL
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CCDS13 PLPGAPGGRPSPPNPELRLEAPGASEPLHHHPYKYPAAAYDHYLGAKSRPAPYPLPGLRG
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CCDS11 APGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAAEQTIE-NIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGR
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CCDS11 HPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVK----ADENNA
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CCDS11 FGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSDLRVARLQSKE
210 220 230 240 250 260
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CCDS11 YPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVGPLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQDLPLSTFPT
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520 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]