Result of FASTA (omim) for
pF1KB5980
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5980, 567 aa
1>>>pF1KB5980 567 - 567 aa - 567 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7012+/-0.000343; mu= 5.7627+/- 0.022
mean_var=287.9340+/-61.130, 0's: 0 Z-trim(122.6): 190 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.075584
statistics sampled from 40664 (40891) to 40664 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.479), width: 16
Scan time: 10.760
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016868054 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 618) 1425 169.0 4.1e-41
NP_872633 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 iso ( 688) 1425 169.0 4.4e-41
XP_016868055 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 688) 1425 169.0 4.4e-41
NP_001265202 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 ( 688) 1425 169.0 4.4e-41
XP_016868050 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 688) 1425 169.0 4.4e-41
NP_872634 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 iso ( 699) 1425 169.0 4.4e-41
XP_011514840 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1425 169.0 4.5e-41
XP_005250608 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1425 169.0 4.5e-41
XP_006716161 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1425 169.0 4.5e-41
XP_016868053 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 719) 1425 169.0 4.5e-41
XP_016868049 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 725) 1425 169.1 4.5e-41
XP_005250607 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 730) 1425 169.1 4.5e-41
XP_011514838 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 730) 1425 169.1 4.5e-41
XP_016868052 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 780) 1425 169.1 4.7e-41
XP_016868051 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 780) 1425 169.1 4.7e-41
XP_005250606 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protei ( 811) 1425 169.1 4.9e-41
NP_003128 (OMIM: 601939) SRSF protein kinase 1 [Ho ( 655) 1337 159.4 3.3e-38
XP_011507449 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 272 42.8 0.0016
XP_016855733 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 272 42.8 0.0016
XP_016855732 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 272 42.8 0.0016
XP_016855730 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 272 42.8 0.0016
XP_016855731 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 272 42.8 0.0016
NP_001281268 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 271) 260 41.5 0.0041
NP_000066 (OMIM: 123829,609048) cyclin-dependent k ( 303) 256 41.1 0.006
XP_005244935 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 497) 260 41.8 0.0061
XP_011507445 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 498) 260 41.8 0.0062
NP_003984 (OMIM: 602989) dual specificity protein ( 498) 260 41.8 0.0062
NP_001281267 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 499) 260 41.8 0.0062
XP_016866923 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 264 42.5 0.0066
XP_016866922 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 264 42.5 0.0066
XP_016866924 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 264 42.5 0.0066
XP_016866921 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 867) 264 42.5 0.0066
XP_011513272 (OMIM: 602338) PREDICTED: serine/thre ( 829) 263 42.4 0.0069
NP_003836 (OMIM: 609181) dual specificity tyrosine ( 520) 256 41.4 0.0086
>>XP_016868054 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (618 aa)
initn: 1757 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 859.2 bits: 169.0 E(85289): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 1671; 53.5% identity (66.6% similar) in 548 aa overlap (27-452:67-610)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQE
: : :: :. . .:::::::::
XP_016 LMSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQE
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 DPKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHY
:: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: ::
XP_016 DPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHY
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWII
::::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.::::::
XP_016 TETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWII
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KSNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATE
::::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.::::::
XP_016 KSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATE
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 WQQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE---
::.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
XP_016 WQKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREA
280 290 300 310 320 330
300
pF1KB5 -------------------------------AMEAATQAE---DSG--------------
..: :..:: :.:
XP_016 ERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKE
340 350 360 370 380 390
310 320 330
pF1KB5 -LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP------
.. : . . .. : : . :: . . : :
XP_016 NIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLD
400 410 420 430 440 450
340 350 360
pF1KB5 -----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--
.: :: :: :: :::: :..: :.:: ::
XP_016 EPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPL
460 470 480 490 500 510
370 380 390 400 410
pF1KB5 SNQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNAC
..:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..:::::::::
XP_016 TEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNAC
520 530 540 550 560 570
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 WVHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRD
::::::::::::::::..:::::: :. ::::::::::
XP_016 WVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMENCDTSPS
580 590 600 610
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 EDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQ
>>NP_872633 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isoform (688 aa)
initn: 2400 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.6 bits: 169.0 E(85289): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 1867; 55.7% identity (68.2% similar) in 576 aa overlap (27-480:30-601)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQED
: : :: :. . .::::::::::
NP_872 MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQED
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHYT
: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: :::
NP_872 PADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWIIK
:::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.:::::::
NP_872 ETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATEW
:::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.:::::::
NP_872 SNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
:.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
NP_872 QKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAE
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 ------------------------------AMEAATQAE---DSG---------------
..: :..:: :.:
NP_872 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
300 310 320 330 340 350
310 320 330
pF1KB5 LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP-------
.. : . . .. : : . :: . . : :
NP_872 IEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLDE
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB5 ----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
.: :: :: :: :::: :..: :.:: :: .
NP_872 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410
pF1KB5 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
.:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..::::::::::
NP_872 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
:::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
:::::
NP_872 DHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDA
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 447 init1: 447 opt: 447 Z-score: 282.3 bits: 62.4 E(85289): 5.5e-09
Smith-Waterman score: 447; 70.9% identity (91.9% similar) in 86 aa overlap (481-566:602-687)
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELR
:.::::.:: :::::.:::::::::::::
NP_872 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELR
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560
pF1KB5 HIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
:: .:: :.:..::.::: :: :.:.::. ::.::.:..:::::::..::.:::::
NP_872 HITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
640 650 660 670 680
>>XP_016868055 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (688 aa)
initn: 2400 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.6 bits: 169.0 E(85289): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 1867; 55.7% identity (68.2% similar) in 576 aa overlap (27-480:30-601)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQED
: : :: :. . .::::::::::
XP_016 MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQED
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHYT
: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: :::
XP_016 PADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWIIK
:::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.:::::::
XP_016 ETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATEW
:::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.:::::::
XP_016 SNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
:.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
XP_016 QKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAE
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 ------------------------------AMEAATQAE---DSG---------------
..: :..:: :.:
XP_016 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
300 310 320 330 340 350
310 320 330
pF1KB5 LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP-------
.. : . . .. : : . :: . . : :
XP_016 IEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLDE
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB5 ----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
.: :: :: :: :::: :..: :.:: :: .
XP_016 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410
pF1KB5 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
.:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..::::::::::
XP_016 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
:::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
:::::
XP_016 DHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDA
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 447 init1: 447 opt: 447 Z-score: 282.3 bits: 62.4 E(85289): 5.5e-09
Smith-Waterman score: 447; 70.9% identity (91.9% similar) in 86 aa overlap (481-566:602-687)
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELR
:.::::.:: :::::.:::::::::::::
XP_016 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELR
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560
pF1KB5 HIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
:: .:: :.:..::.::: :: :.:.::. ::.::.:..:::::::..::.:::::
XP_016 HITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
640 650 660 670 680
>>NP_001265202 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isof (688 aa)
initn: 2400 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.6 bits: 169.0 E(85289): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 1867; 55.7% identity (68.2% similar) in 576 aa overlap (27-480:30-601)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQED
: : :: :. . .::::::::::
NP_001 MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQED
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHYT
: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: :::
NP_001 PADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWIIK
:::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.:::::::
NP_001 ETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATEW
:::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.:::::::
NP_001 SNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
:.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
NP_001 QKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAE
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 ------------------------------AMEAATQAE---DSG---------------
..: :..:: :.:
NP_001 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
300 310 320 330 340 350
310 320 330
pF1KB5 LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP-------
.. : . . .. : : . :: . . : :
NP_001 IEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLDE
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB5 ----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
.: :: :: :: :::: :..: :.:: :: .
NP_001 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410
pF1KB5 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
.:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..::::::::::
NP_001 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
:::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
:::::
NP_001 DHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDA
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 447 init1: 447 opt: 447 Z-score: 282.3 bits: 62.4 E(85289): 5.5e-09
Smith-Waterman score: 447; 70.9% identity (91.9% similar) in 86 aa overlap (481-566:602-687)
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELR
:.::::.:: :::::.:::::::::::::
NP_001 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELR
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520 530 540 550 560
pF1KB5 HIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
:: .:: :.:..::.::: :: :.:.::. ::.::.:..:::::::..::.:::::
NP_001 HITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
640 650 660 670 680
>>XP_016868050 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (688 aa)
initn: 2357 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.6 bits: 169.0 E(85289): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 1857; 55.7% identity (68.2% similar) in 575 aa overlap (27-479:30-600)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQED
: : :: :. . .::::::::::
XP_016 MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQED
10 20 30 40 50
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pF1KB5 PKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHYT
: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: :::
XP_016 PADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWIIK
:::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.:::::::
XP_016 ETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATEW
:::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.:::::::
XP_016 SNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
:.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
XP_016 QKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAE
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 ------------------------------AMEAATQAE---DSG---------------
..: :..:: :.:
XP_016 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
300 310 320 330 340 350
310 320 330
pF1KB5 LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP-------
.. : . . .. : : . :: . . : :
XP_016 IEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLDE
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB5 ----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
.: :: :: :: :::: :..: :.:: :: .
XP_016 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410
pF1KB5 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
.:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..::::::::::
XP_016 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
:::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
::::
XP_016 DHIALIIELLGKVPRKYAMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDA
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 417 init1: 417 opt: 417 Z-score: 264.6 bits: 59.1 E(85289): 5.3e-08
Smith-Waterman score: 417; 62.8% identity (89.5% similar) in 86 aa overlap (481-566:602-687)
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELR
:.:::: .: .:. :.::.:::.:.::::
XP_016 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIALIIELLGKVPRKYAMLGKYSKEFFTRKGELR
580 590 600 610 620 630
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pF1KB5 HIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
:: .:: :.:..::.::: :: :.:.::. ::.::.:..:::::::..::.:::::
XP_016 HITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
640 650 660 670 680
>>NP_872634 (OMIM: 602980) SRSF protein kinase 2 isoform (699 aa)
initn: 2400 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.5 bits: 169.0 E(85289): 4.4e-41
Smith-Waterman score: 1867; 55.7% identity (68.2% similar) in 576 aa overlap (27-480:41-612)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQE
: : :: :. . .:::::::::
NP_872 ARKRRPKREKHPKKPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQE
20 30 40 50 60
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pF1KB5 DPKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHY
:: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: ::
NP_872 DPADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB5 TETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWII
::::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.::::::
NP_872 TETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWII
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KSNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATE
::::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.::::::
NP_872 KSNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 WQQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE---
::.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
NP_872 WQKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB5 -------------------------------AMEAATQAE---DSG--------------
..: :..:: :.:
NP_872 ERKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKE
310 320 330 340 350 360
310 320 330
pF1KB5 -LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP------
.. : . . .. : : . :: . . : :
NP_872 NIEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLD
370 380 390 400 410 420
340 350 360
pF1KB5 -----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--
.: :: :: :: :::: :..: :.:: ::
NP_872 EPNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPL
430 440 450 460 470 480
370 380 390 400 410
pF1KB5 SNQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNAC
..:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..:::::::::
NP_872 TEQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNAC
490 500 510 520 530 540
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 WVHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRD
::::::::::::::::..:::::: :. ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 WVHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRD
550 560 570 580 590 600
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 EDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQ
::::::
NP_872 EDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHED
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 447 init1: 447 opt: 447 Z-score: 282.2 bits: 62.4 E(85289): 5.6e-09
Smith-Waterman score: 447; 70.9% identity (91.9% similar) in 86 aa overlap (481-566:613-698)
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELR
:.::::.:: :::::.:::::::::::::
NP_872 CMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRGELR
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560
pF1KB5 HIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEKRASAADCLQHPWLNP
:: .:: :.:..::.::: :: :.:.::. ::.::.:..:::::::..::.:::::
NP_872 HITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEKRASAGECLRHPWLNS
650 660 670 680 690
>>XP_011514840 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (719 aa)
initn: 2086 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.4 bits: 169.0 E(85289): 4.5e-41
Smith-Waterman score: 1867; 55.7% identity (68.2% similar) in 576 aa overlap (27-480:30-601)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQED
: : :: :. . .::::::::::
XP_011 MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQED
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHYT
: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: :::
XP_011 PADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWIIK
:::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.:::::::
XP_011 ETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SNYQGLPVPCVKSIVRQVLHGLDYLHTKCKIIHTDIKPENILLCVGDAYIRRLAAEATEW
:::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.:::::::
XP_011 SNYQGLPVRCVKSIIRQVLQGLDYLHSKCKIIHTDIKPENILMCVDDAYVRRMAAEATEW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QQAGAPPPSRSIVSTAPQEVLQTGKLSKNKRKKMRRKRKQQKRLLEERLRDLQRLE----
:.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
XP_011 QKAGAPPPSGSAVSTAPQQK-PIGKISKNKKKKLKKKQKRQAELLEKRLQEIEELEREAE
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB5 ------------------------------AMEAATQAE---DSG---------------
..: :..:: :.:
XP_011 RKIIEENITSAAPSNDQDGEYCPEVKLKTTGLEEAAEAETAKDNGEAEDQEEKEDAEKEN
300 310 320 330 340 350
310 320 330
pF1KB5 LRLDGGSGSTSSSGCHP---------GGARAGP-----------SPASSSPAP-------
.. : . . .. : : . :: . . : :
XP_011 IEKDEDDVDQELANIDPTWIESPKTNGHIENGPFSLEQQLDDEDDDEEDCPNPEEYNLDE
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KB5 ----------------GG----GRSLSAGSQTSGFSGSLFS----PASC-SILS-GS--S
.: :: :: :: :::: :..: :.:: :: .
XP_011 PNAESDYTYSSSYEQFNGELPNGRHKIPESQFPEFSTSLFSGSLEPVACGSVLSEGSPLT
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410
pF1KB5 NQRE---------------TGGLLSPSTPFGASNLLVNPLEPQNADKIKIKIADLGNACW
.:.: :: : :.. :..::::::.:.:::::..::::::::::
XP_011 EQEESSPSHDRSRTVSASSTGDL--PKAKTRAADLLVNPLDPRNADKIRVKIADLGNACW
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VHKHFTEDIQTRQYRAVEVLIGAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
:::::::::::::::..:::::: :. :::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VHKHFTEDIQTRQYRSIEVLIGAGYSTPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRDE
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DHIAHIVELLGDIPPAFALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQA
:::::
XP_011 DHIAHIIELLGSIPRHFALSGKYSREFFNRRDHIALIIELLGKVPRKYAMLGKYSKEFFT
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 451 init1: 442 opt: 448 Z-score: 282.6 bits: 62.5 E(85289): 5.3e-09
Smith-Waterman score: 448; 60.6% identity (85.6% similar) in 104 aa overlap (467-566:616-718)
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 GAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRD----EDHIAHIVELLGDIPPAF
::. :::. .:::: :.:::: .: .
XP_011 PHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGK-YSREFFNRRDHIALIIELLGKVPRKY
590 600 610 620 630 640
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 ALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEK
:. :.::.:::.:.:::::: .:: :.:..::.::: :: :.:.::. ::.::.:..:::
XP_011 AMLGKYSKEFFTRKGELRHITKLKPWSLFDVLVEKYGWPHEDAAQFTDFLIPMLEMVPEK
650 660 670 680 690 700
560
pF1KB5 RASAADCLQHPWLNP
::::..::.:::::
XP_011 RASAGECLRHPWLNS
710
>>XP_005250608 (OMIM: 602980) PREDICTED: SRSF protein ki (719 aa)
initn: 2086 init1: 1299 opt: 1425 Z-score: 858.4 bits: 169.0 E(85289): 4.5e-41
Smith-Waterman score: 1867; 55.7% identity (68.2% similar) in 576 aa overlap (27-480:30-601)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSASTGGGGDSGGSGGSSSSSQASCGPESSGSELALATPVPQMLQGLLGSDDEEQED
: : :: :. . .::::::::::
XP_005 MSVNSEKSSSSERPEPQQKAPLVPPPPPPPPPPPPPLPDPTP-PEPEEEILGSDDEEQED
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PKDYCKGGYHPVKIGDVFNGRYHVVRKLGWGHFSTVWLCWDIQRKRFVALKVVKSAGHYT
: ::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.: :::::.:::::: :::
XP_005 PADYCKGGYHPVKIGDLFNGRYHVIRKLGWGHFSTVWLCWDMQGKRFVAMKVVKSAQHYT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ETAVDEIKLLKCVRDSDPSDPKRETIVQLIDDFRISGVNGVHVCMVLEVLGHQLLKWIIK
:::.::::::::::.::::::... .:::::::.:::.::.:::::.:::::.:::::::
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:::::::: :::::.::::.::::::.:::::::::::::::.:: :::.::.:::::::
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:.::::::: : ::::::. ::.::::.::...:.:.: .:::.::.....::
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..: :..:: :.:
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.. : . . .. : : . :: . . : :
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.: :: :: :: :::: :..: :.:: :: .
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:::::
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pF1KB5 GAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRD----EDHIAHIVELLGDIPPAF
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pF1KB5 RASAADCLQHPWLNP
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XP_006 RASAGECLRHPWLNS
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XP_016 ETALDEIKLLKCVRESDPSDPNKDMVVQLIDDFKISGMNGIHVCMVFEVLGHHLLKWIIK
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pF1KB5 GAEYGPPADIWSTACMAFELATGDYLFEPHSGEDYSRD----EDHIAHIVELLGDIPPAF
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XP_016 PHSGEDYSRDEDHIAHIIELLGSIPRHFALSGK-YSREFFNRRDHIALIIELLGKVPRKY
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pF1KB5 ALSGRYSREFFNRRGELRHIHNLKHWGLYEVLMEKYEWPLEQATQFSAFLLPMMEYIPEK
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pF1KB5 RASAADCLQHPWLNP
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XP_016 RASAGECLRHPWLNS
710
567 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:58:29 2016 done: Sat Nov 5 01:58:31 2016
Total Scan time: 10.760 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]