Result of FASTA (omim) for
pF1KB5990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5990, 609 aa
1>>>pF1KB5990 609 - 609 aa - 609 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5373+/-0.000434; mu= 18.4035+/- 0.027
mean_var=98.3553+/-22.512, 0's: 0 Z-trim(112.2): 344 B-trim: 468 in 1/53
Lambda= 0.129323
statistics sampled from 20613 (21067) to 20613 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 8.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 1729 333.8 9.4e-91
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 1729 333.9 1.1e-90
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 1729 334.0 1.1e-90
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1729 334.0 1.2e-90
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 1729 334.0 1.2e-90
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1714 331.2 8.2e-90
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1714 331.2 8.2e-90
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 1714 331.2 8.2e-90
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1714 331.2 8.3e-90
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1714 331.2 8.3e-90
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 1714 331.2 8.3e-90
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 1681 324.9 4.7e-88
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 1681 325.0 5.7e-88
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 1673 323.4 1.4e-87
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 1673 323.4 1.4e-87
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 1670 322.8 1.9e-87
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 1623 314.2 9.7e-85
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 1610 311.7 4.7e-84
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 1610 311.7 4.7e-84
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 1606 310.9 7.8e-84
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 1602 310.1 1.2e-83
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 1598 309.4 2.1e-83
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 1592 308.4 5.3e-83
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 1592 308.4 5.5e-83
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 1574 304.9 4.5e-82
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 1575 305.2 4.5e-82
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 1570 304.3 9.4e-82
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 1567 303.7 1.2e-81
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 1567 303.7 1.2e-81
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 1425 277.1 1e-73
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 1422 276.5 1.4e-73
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 1421 276.3 1.7e-73
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 1415 275.2 3.7e-73
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 1415 275.2 3.7e-73
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 1387 270.0 1.4e-71
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 1384 269.4 1.9e-71
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1345 262.2 3.7e-69
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1345 262.2 3.7e-69
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 1345 262.2 3.7e-69
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1345 262.2 3.7e-69
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 1345 262.2 3.7e-69
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 1323 258.0 5.4e-68
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 1323 258.0 5.4e-68
NP_001278935 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 544) 1279 249.9 1.7e-65
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 1249 244.2 6.8e-64
NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 1112 218.6 3.4e-56
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1097 216.0 3e-55
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1097 216.0 3e-55
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1097 216.0 3e-55
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1097 216.0 3e-55
>>NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (568 aa)
initn: 1902 init1: 741 opt: 1729 Z-score: 1750.3 bits: 333.8 E(85289): 9.4e-91
Smith-Waterman score: 1729; 45.7% identity (78.1% similar) in 558 aa overlap (50-601:15-568)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
: .::.. .. .:..::::.::.: ..:
NP_001 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 YAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQ
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NP_001 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQE
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NP_001 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
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200 210 220 230 240 250
pF1KB5 VMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRL
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NP_001 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 PLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEV
:::.:.::. . .. :...: ::. :. :: .: :::..::..:.:::.::: : .
NP_001 PLLAPQFLAD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYL
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pF1KB5 NSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENK
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NP_001 NTVECYNPKTKTWSV-MPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQ
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pF1KB5 WTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKH
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NP_001 WNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGG
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pF1KB5 LGCAVYQDMIYAVGGRDD-----TTELSS-AERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVN
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NP_001 VGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLG
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560 570 580 590 600
pF1KB5 GQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
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NP_001 DKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
530 540 550 560
>>NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (709 aa)
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Smith-Waterman score: 1729; 45.7% identity (78.1% similar) in 558 aa overlap (50-601:156-709)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
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NP_001 SCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
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pF1KB5 YAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQ
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NP_001 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
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140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQE
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NP_001 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
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pF1KB5 VMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRL
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NP_001 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 PLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEV
:::.:.::. . .. :...: ::. :. :: .: :::..::..:.:::.::: : .
NP_001 PLLAPQFLAD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
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320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYL
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NP_001 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
430 440 450 460 470 480
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 NSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENK
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NP_001 NTVECYNPKTKTWSV-MPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQ
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pF1KB5 WTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKH
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NP_001 WNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGG
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500 510 520 530 540 550
pF1KB5 LGCAVYQDMIYAVGGRDD-----TTELSS-AERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVN
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NP_001 VGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLG
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pF1KB5 GQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
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NP_001 DKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
670 680 690 700
>>NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isoform (755 aa)
initn: 1653 init1: 741 opt: 1729 Z-score: 1748.7 bits: 334.0 E(85289): 1.1e-90
Smith-Waterman score: 1729; 45.7% identity (78.1% similar) in 558 aa overlap (50-601:202-755)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
: .::.. .. .:..::::.::.: ..:
NP_057 SCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
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pF1KB5 YAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQ
:::..::. : :: ::::... :.:: :. .. .. .. ::..:::... ..: :..
NP_057 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
240 250 260 270 280 290
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQE
:: .::::::... ::::.:: .:: ::::::::.:::...: .: ..: ..:...:.:
NP_057 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 VMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRL
:....::.::::... ...::..:. .:: ..::...::......:: .: ..: ..::
NP_057 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
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260 270 280 290 300 310
pF1KB5 PLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEV
:::.:.::. . .. :...: ::. :. :: .: :::..::..:.:::.::: : .
NP_057 PLLAPQFLAD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
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320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYL
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NP_057 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
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pF1KB5 NSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENK
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NP_057 NTVECYNPKTKTWSV-MPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQ
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pF1KB5 WTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKH
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NP_057 WNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGG
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NP_057 VGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLG
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609 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]