Result of FASTA (omim) for
pF1KB5992
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5992, 609 aa
1>>>pF1KB5992 609 - 609 aa - 609 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1376+/-0.000427; mu= 20.8777+/- 0.027
mean_var=76.4150+/-15.415, 0's: 0 Z-trim(111.4): 16 B-trim: 825 in 1/53
Lambda= 0.146719
statistics sampled from 20008 (20022) to 20008 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 7.960
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001125 (OMIM: 104150,615969,615970) alpha-fetop ( 609) 4083 874.3 0
NP_000468 (OMIM: 103600,615999,616000) serum album ( 609) 1727 375.6 2.7e-103
NP_001124 (OMIM: 104145) afamin precursor [Homo sa ( 599) 1660 361.4 5e-99
XP_016863331 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isof ( 494) 1213 266.7 1.3e-70
XP_016863333 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isof ( 423) 1056 233.4 1.2e-60
XP_016863332 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isof ( 425) 1053 232.8 1.8e-60
XP_006714240 (OMIM: 139200) PREDICTED: vitamin D-b ( 425) 403 95.2 4.8e-19
NP_000574 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein ( 474) 217 55.9 3.7e-07
NP_001191235 (OMIM: 139200) vitamin D-binding prot ( 474) 217 55.9 3.7e-07
NP_001191236 (OMIM: 139200) vitamin D-binding prot ( 493) 217 55.9 3.8e-07
>>NP_001125 (OMIM: 104150,615969,615970) alpha-fetoprote (609 aa)
initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083 Z-score: 4670.5 bits: 874.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4083; 100.0% identity (100.0% similar) in 609 aa overlap (1-609:1-609)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEATY
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NP_001 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEATY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCHEKEILEKYGHSDCCSQSEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCHEKEILEKYGHSDCCSQSEEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTILL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 WAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSNKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSNKIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGLFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADII
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 IGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 QGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKLI
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SKTRAALGV
:::::::::
NP_001 SKTRAALGV
>>NP_000468 (OMIM: 103600,615999,616000) serum albumin p (609 aa)
initn: 2022 init1: 1666 opt: 1727 Z-score: 1975.4 bits: 375.6 E(85289): 2.7e-103
Smith-Waterman score: 1727; 40.3% identity (71.4% similar) in 611 aa overlap (1-609:1-609)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEATY
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NP_000 MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 KEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCHEKEILEKYGH-SDCCSQSEE
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NP_000 EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTIL
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NP_000 ERNECFLQHKDDNP-NLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LWAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAIT
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NP_000 FFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSNKI
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NP_000 VARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNR-FLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEY
:::. ::...:: ..:::: : : :.: :. ..: . . :..::. :..::
NP_000 KECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADL-PSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SRRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCGL
.::::. .: ..::.:: :. :::: . .: :: : .:.. ..: : : :..: :
NP_000 ARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCEL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 FQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAAD
:..:::: .:::.:: ::::.::... :. ..:... ... ::. : : . :.: .
NP_000 FEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLC
.....::. :: :::. : .::: : .:::::::.: ::::::: :. . : :: :.:
NP_000 VVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADIC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQK
. : :: :..:::.::. :.:::.::. ::....::::.....:.::::::.:
NP_000 TLSEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKK
540 550 560 570 580 590
600
pF1KB5 LISKTRAALGV
:.. ..::::.
NP_000 LVAASQAALGL
600
>>NP_001124 (OMIM: 104145) afamin precursor [Homo sapien (599 aa)
initn: 1808 init1: 1178 opt: 1660 Z-score: 1898.8 bits: 361.4 E(85289): 5e-99
Smith-Waterman score: 1660; 39.7% identity (73.7% similar) in 594 aa overlap (8-599:9-597)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEAT
:..::. .::: :: . : . ..: : : .. .. : :::.:::::
NP_001 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIEN-FNSTQKFIEDNIEYITIIAFAQYVQEAT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 YKEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLP--AFLEELCHEKEILEKYGHSDCCSQS
..:. :.::: . .. .:. : ..:: .. :..: . . .:.. : :::.
NP_001 FEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPEC--SKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHNFSHCCSKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EEGRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPT
. :. ::. .:: . .: : . .: .:.::: .::...:.:.::.:::.::..:::
NP_001 DAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTLDPEEKCQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFVFAPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ILLWAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQA
.: :...... :::. .: :.:.::.: ::. :. : ..:.:... .:::.. .
NP_001 LLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTKVVHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ITVTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSN
: .. ::::: :..: :. .:: ::. .. ::.:::..:..: :.:..:::.::..:.
NP_001 IYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQDSISS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KITECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHE
:: :::. :::::::....:..:. :: ..: ... : ... . :.:.:. :
NP_001 KIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAKFTFE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YSRRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCG
::::::.:.. .::... :..::..: .:::: : .:..... ..: .... :
NP_001 YSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMVQQECK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAA
::.::. :. .:. :: ::::.. ::... .::... .::: :::. .:: .. :
NP_001 HFQNLGKDGLKYHYLIRLTKIAPQLSTEELVSLGEKMVTAFTTCCTLSEE--FACVDNLA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDL
:...:.:: .: .::.: .:: ...: ::::: :: .:.::::: ::.: : :: :.
NP_001 DLVFGELCGVNENRTINPAVDHCCKTNFAFRRPCFESLKADKTYVPPPFSQDLFTFHADM
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 CQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQ
::.:. :: ..::.:::: : ..:.:.:......:.....:::... :::: ::.
NP_001 CQSQNEELQRKTDRFLVNLVKLKHELTDEELQSLFTNFANVVDKCCKAESPEVCFNEESP
540 550 560 570 580 590
600
pF1KB5 KLISKTRAALGV
:.
NP_001 KIGN
>>XP_016863331 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isoform (494 aa)
initn: 1387 init1: 1178 opt: 1213 Z-score: 1388.6 bits: 266.7 E(85289): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 1213; 38.1% identity (72.4% similar) in 467 aa overlap (8-472:9-470)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEAT
:..::. .::: :: . : . ..: : : .. .. : :::.:::::
XP_016 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIEN-FNSTQKFIEDNIEYITIIAFAQYVQEAT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 YKEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLP--AFLEELCHEKEILEKYGHSDCCSQS
..:. :.::: . .. .:. : ..:: .. :..: . . .:.. : :::.
XP_016 FEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPEC--SKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHNFSHCCSKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EEGRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPT
. :. ::. .:: . .: : . .: .:.::: .::...:.:.::.:::.::..:::
XP_016 DAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTLDPEEKCQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFVFAPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ILLWAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQA
.: :...... :::. .: :.:.::.: ::. :. : ..:.:... .:::.. .
XP_016 LLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTKVVHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ITVTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSN
: .. ::::: :..: :. .:: ::. .. ::.:::..:..: :.:..:::.::..:.
XP_016 IYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQDSISS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KITECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHE
:: :::. :::::::....:..:. :: ..: ... : ... . :.:.:. :
XP_016 KIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAKFTFE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YSRRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCG
::::::.:.. .::... :..::..: .:::: : .:..... ..: .... :
XP_016 YSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMVQQECK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAA
::.::. :. .:. :: ::::.. ::... .::... .::: :::. .::
XP_016 HFQNLGKDGLKYHYLIRLTKIAPQLSTEELVSLGEKMVTAFTTCCTLSEE--FACVDNLT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDL
XP_016 CVNLRMRSFRGRQTGFLST
480 490
>>XP_016863333 (OMIM: 104145) PREDICTED: afamin isoform (423 aa)
initn: 1006 init1: 1006 opt: 1056 Z-score: 1209.9 bits: 233.4 E(85289): 1.2e-60
Smith-Waterman score: 1056; 37.4% identity (72.4% similar) in 409 aa overlap (8-414:9-414)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEAT
:..::. .::: :: . : . ..: : : .. .. : :::.:::::
XP_016 MKLLKLTGFIFFLFFLTESLTLPTQPRDIEN-FNSTQKFIEDNIEYITIIAFAQYVQEAT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 YKEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLP--AFLEELCHEKEILEKYGHSDCCSQS
..:. :.::: . .. .:. : ..:: .. :..: . . .:.. : :::.
XP_016 FEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPEC--SKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHNFSHCCSKV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EEGRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPT
. :. ::. .:: . .: : . .: .:.::: .::...:.:.::.:::.::..:::
XP_016 DAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFPTLDPEEKCQAYESNRESLLNHFLYEVARRNPFVFAPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ILLWAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQA
.: :...... :::. .: :.:.::.: ::. :. : ..:.:... .:::.. .
XP_016 LLTVAVHFEEVAKSCCEEQNKVNCLQTRAIPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLKFGTKVVHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ITVTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSN
: .. ::::: :..: :. .:: ::. .. ::.:::..:..: :.:..:::.::..:.
XP_016 IYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQDSISS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KITECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHE
:: :::. :::::::....:..:. :: ..: ... : ... . :.:.:. :
XP_016 KIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAKFTFE
300 310 320 330 340 350
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pF1KB5 YSRRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCG
::::::.:.. .::... :..::..: .:::: : .:..... ..: ....
XP_016 YSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMVQQEFT
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XP_016 SSGSRR
420
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10 20 30 40 50
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEAT
:..::. .::: :: . : . ..: : : .. .. : :::.:::::
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..:. :.::: . .. .:. : ..:: .. :..: . . .:.. : :::.
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pF1KB5 ITVTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSN
: .. ::::: :..: :. .:: ::. .. ::.:::..:..: :.:..:::.::..:.
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pF1KB5 KITECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHE
:: :::. :::::::....:..:. :: ..: ... : ... . :.:.:. :
XP_016 KIKECCEKKIPERGQCIINSNKDDRPKDLSLREGKFTDSENVCQERDADPDTFFAKFTFE
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pF1KB5 YSRRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEELQKYIQESQALAKRSCG
::::::.:.. .::... :..::..: .:::: : .:..... ..:
XP_016 YSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPGCYRYAEDKFNETTEKSLKMLPHQAH
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pF1KB5 LFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAA
XP_016 EDSSPTLH
420
>>XP_006714240 (OMIM: 139200) PREDICTED: vitamin D-bindi (425 aa)
initn: 265 init1: 105 opt: 403 Z-score: 462.9 bits: 95.2 E(85289): 4.8e-19
Smith-Waterman score: 403; 21.7% identity (57.1% similar) in 434 aa overlap (9-429:5-425)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRN-EYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEAT
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pF1KB5 YKEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCHEKEILEKY-GHSDCCSQSE
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pF1KB5 EGRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTI
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XP_006 LERKLC-MAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTNYG--QAPLS
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pF1KB5 LL--WAARYDKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQ
:: .. : ... ::: . . . :: : :.: . :....:. . .: . .
XP_006 LLVSYTKSYLSMVGSCCTSASPTVCF-LKERLQLKHLSLLTTLSNRVCSQYAAYGEKKSR
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pF1KB5 AITVTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCL-QDGEKIMSYICSQQDTL
.. ::.:: ... .. :. :.... .::.. ::. .. . .:.. .:
XP_006 LSNLIKLAQKVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTK
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..:. .::. :... : . :: :... . ..: . :. .. . ..
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pF1KB5 VHEYSRR-H-PQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQD-KG---EEELQKYIQES
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pF1KB5 QAL-AKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSED
: : : : . : . . . :
XP_006 QELCADYSENTFTEYKKKLMLN
410 420
>>NP_000574 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein iso (474 aa)
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pF1KB5 DKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITVTKLSQ
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NP_000 LSMVGSCCTSASPTVCF-LKERLQLKHLSLLTTLSNRVCSQYAAYGEKKSRLSNLIKLAQ
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pF1KB5 KFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCL-QDGEKIMSYICSQQDTLSNKITECCK
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pF1KB5 L-TTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSRR-H
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pF1KB5 -PQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQD-KG---EEELQKYIQESQAL-AKRSC
:.. .: .: . . : .: ..:. : . :: ..::...:...: : : :
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pF1KB5 GLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGA
. : :: .. . : :. : .:: .. : . :..::... : .:
NP_000 NTFT---EY--KKKLAERLKAKLPDATPTELAKLVNKHSDFASNCCSINSPPLYCDSEID
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pF1KB5 ADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKD
:..
NP_000 AELKNIL
470
>>NP_001191235 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein (474 aa)
initn: 265 init1: 121 opt: 217 Z-score: 249.4 bits: 55.9 E(85289): 3.7e-07
Smith-Waterman score: 289; 23.1% identity (55.6% similar) in 333 aa overlap (158-479:155-470)
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTILL--WAARY
. :.:..: . . :: :: .. :
NP_001 ALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTN--YGQAPLSLLVSYTKSY
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pF1KB5 DKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITVTKLSQ
... ::: . . . :: : :.: . :....:. . .: . . .. ::.:
NP_001 LSMVGSCCTSASPTVCF-LKERLQLKHLSLLTTLSNRVCSQYAAYGEKKSRLSNLIKLAQ
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pF1KB5 KFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCL-QDGEKIMSYICSQQDTLSNKITECCK
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NP_001 KVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTKNSKFEDCCQ
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pF1KB5 L-TTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSRR-H
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NP_001 EKTAMDVFVCTYFMPAAQLPE--LPDVE-LPTNKDVCD--PGNTKV-MDKYTFELSRRTH
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pF1KB5 -PQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQD-KG---EEELQKYIQESQAL-AKRSC
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NP_001 LPEVFLS---KVLEPTLKSLGECCDVEDSTTCFNAKGPLLKKELSSFIDKGQELCADYSE
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pF1KB5 GLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGA
. : :: .. . : :. : .:: .. : . :..::... : .:
NP_001 NTFT---EY--KKKLAERLKAKLPDATPTELAKLVNKHSDFASNCCSINSPPLYCDSEID
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pF1KB5 ADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQCCTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKD
:..
NP_001 AELKNIL
470
>>NP_001191236 (OMIM: 139200) vitamin D-binding protein (493 aa)
initn: 265 init1: 121 opt: 217 Z-score: 249.2 bits: 55.9 E(85289): 3.8e-07
Smith-Waterman score: 289; 23.1% identity (55.6% similar) in 333 aa overlap (158-479:174-489)
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTILL--WAARY
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NP_001 ALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTN--YGQAPLSLLVSYTKSY
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DKIIPSCCKAENAVECFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITVTKLSQ
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NP_001 LSMVGSCCTSASPTVCF-LKERLQLKHLSLLTTLSNRVCSQYAAYGEKKSRLSNLIKLAQ
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pF1KB5 KFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCL-QDGEKIMSYICSQQDTLSNKITECCK
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NP_001 KVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTKNSKFEDCCQ
270 280 290 300 310 320
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pF1KB5 L-TTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSRR-H
:... : . :: :... . ..: . :. .. . ... : ::: :
NP_001 EKTAMDVFVCTYFMPAAQLPE--LPDVE-LPTNKDVCD--PGNTKV-MDKYTFELSRRTH
330 340 350 360 370
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pF1KB5 -PQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQD-KG---EEELQKYIQESQAL-AKRSC
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NP_001 LPEVFLS---KVLEPTLKSLGECCDVEDSTTCFNAKGPLLKKELSSFIDKGQELCADYSE
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGA
. : :: .. . : :. : .:: .. : . :..::... : .:
NP_001 NTFT---EY--KKKLAERLKAKLPDATPTELAKLVNKHSDFASNCCSINSPPLYCDSEID
440 450 460 470 480
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NP_001 AELKNIL
490
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