FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6006, 2468 aa 1>>>pF1KB6006 2468 - 2468 aa - 2468 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.6865+/-0.000556; mu= -30.9198+/- 0.035 mean_var=545.0923+/-108.902, 0's: 0 Z-trim(120.2): 122 B-trim: 0 in 0/61 Lambda= 0.054934 statistics sampled from 35091 (35215) to 35091 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16 Scan time: 24.570 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005900 (OMIM: 157129) microtubule-associated pr (2468) 15986 1283.7 0 NP_001311184 (OMIM: 157129) microtubule-associated (2342) 15185 1220.2 0 XP_016877678 (OMIM: 600178) PREDICTED: microtubule (3041) 2442 210.3 3.1e-52 NP_002364 (OMIM: 600178) microtubule-associated pr (2803) 1896 167.0 3.1e-39 NP_060644 (OMIM: 607573) microtubule-associated pr (1059) 1320 121.3 6.9e-26 XP_016882419 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule (1068) 1320 121.3 7e-26 NP_001295292 (OMIM: 607573) microtubule-associated (1033) 1299 119.6 2.1e-25 XP_016882420 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule (1042) 1299 119.6 2.2e-25 XP_011528502 (OMIM: 105400,162230,616924) PREDICTE ( 924) 374 46.3 0.0023 NP_066554 (OMIM: 105400,162230,616924) neurofilame (1020) 374 46.3 0.0025 >>NP_005900 (OMIM: 157129) microtubule-associated protei (2468 aa) initn: 15986 init1: 15986 opt: 15986 Z-score: 6861.4 bits: 1283.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 15986; 100.0% identity (100.0% similar) in 2468 aa overlap (1-2468:1-2468) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 MATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 LGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 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NP_002 EEDATKAEGFYQKHMQEP--LKVTPRSREAFGGRELGLQGKAPEKETSLFLSSLTTPAGA 680 690 700 710 720 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB6 REPASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEI----------SS : .: :.:::.:: ::.: : :::: . :.::: : . :: .. .: NP_002 TEHVSYIQDETIPGYSETEQTISDEEIH-DEPEERPAPPRFHTSTYDLPGPEGAGPFEAS 730 740 750 760 770 780 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB6 EP--------------TPMDEMSTPRDVMSDETNNEETESPSQ---EFVNITKYESSLYS .: :: :.. : .... .:: : . : ..... .:. NP_002 QPADSAVPATSGKVYGTPETELTYPTNIVAAPLAEEEHVSSATSITECDKLSSFATSVAE 790 800 810 820 830 840 1180 1190 1200 1210 pF1KB6 QEY--SKPADVTPLNGFSE----------GSKTDATDGKDYNASASTISPPSSMEEDKFS .. : : : .: : .:.:.::.: :: ::.:::: ::.:::: NP_002 DQSVASLTAPQTEETGKSSLLLDTVTSIPSSRTEATQGLDYVPSAGTISPTSSLEEDK-- 850 860 870 880 890 900 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KB6 RSALRDAYCSEVKASTTLDIKDSI--SAVSSEKVSPSKSPSLSPSPPSPLEKTPLGERSV .... : . ... . . : ...:.:.. . . .. ..:. NP_002 --GFKSPPCEDFSVTGESEKRGEIIGKGLSGERAVEEEEEETA--------NVEMSEKLC 910 920 930 940 950 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KB6 NFSLTPNEIKVSAEAEVAPVSPEVTQEVVEEHCASPEDKTLEVVSPSQSVTGSAGHTPYY . :: . . . : : . . .::.: ::.:.:....:: : :: :::.. NP_002 SQYGTP--VFSAPGHALHPGEPALGE--AEERCLSPDDSTVKMASPPPSGPPSATHTPFH 960 970 980 990 1000 1010 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KB6 QSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFSDAKDENERASVSPMDEPVPDSESPIEKVLSP :::..::: : . : .. . .:.. . .:.: : . ::: : NP_002 QSPVEEKSE--PQDFQEADSWGDTKRTPGVGKEDAAEETVKP--GPEEGTLEKEEKV-PP 1020 1030 1040 1050 1060 1400 1410 1420 1430 pF1KB6 LRSP-----PLI---GSESAYESFLSADDKA-------SGR------GAES-PFEEKSGK ::: :. : . ..: :.::: .:. :::. : .. NP_002 PRSPQAQEAPVNIDEGLTGCTIQLLPAQDKAIVFEIMEAGEPTGPILGAEALPGGLRTLP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KB6 Q--GSPDQVSPVSEMTSTSLYQDKQEGKSTDFAPIKEDFGQEKKTDDVEAMSSQPALALD : :.: : . : .. . :: . :. :. .: . .:: . ... : : NP_002 QEPGKP-QKDEVLRYPDRSLSPEDAESLSVLSVPSPDTANQEPTPKSPCGLTEQ---YLH 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KB6 ERKLGDVSP--TQ-IDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEG---VAEDTYSHME . . .::: :: ...:. . :: :....: .: .: .. : .... ..:. NP_002 KDRWPEVSPEDTQSLSLSEESPSKE-TSLDVSSKQLSPESLGTLQFGELNLGKEEMGHLM 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KB6 GVASVSTASVATSSFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEV-DDSLSVSVVQTP-TTFQETE . ..: . : : ::: . .:: . . .:.. ::::. ..: ..:... 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NP_002 NEAVKQQDKALEQKGRDLEQKDTALEQKDKALE---PKDKDL-----EEKDKALEQKDKI 1400 1410 1420 1430 1440 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KB6 PKSDISPLTPRESS-PLYSPTFSDSTSAVKEKTATCHSSSSPPIDAASAEPYGFRASVLF :. . : .... . .. . . ...: . ... . : . .: : :: NP_002 PEEKDKALEQKDTALEQKDKALEPKDKDLEQKDRVLEQKEKIPEEKDKALDQKVR-SVEH 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KB6 DTMQHHLALNRDLSTPGLEKDSGGKTPGDFSYAYQKPEETTRSPDEEDYDYESYEKTTRT . . .: .: . ::. . :.: .: :. . ...: :. . NP_002 KAPEDTVAEMKDRD---LEQTD--KAP---EQKHQAQEQKDKVSEKKDQALEQKYWALGQ 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KB6 SDVGGYYYEKIERTTKSPSDSGYSYETIGKTTKTPEDGDYSYEIIEKTTRTPEEGGYSYD .: : .:.. .. .. . : . . . :: . ...:. ..::. . NP_002 KD------EALEQNIQALEENHQTQE---QESLVQEDKTRKPKMLEE--KSPEKVKAMEE 1570 1580 1590 1600 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KB6 ISEKTTSPPEVSGY--SYEKTERSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITS : .. : : . :.:. . : : .. .: .:. . :. 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NP_060 VDPGVCNLDEQLKVFVSRHSATFSSIVKGQRSLHHRGDNLETLVLLNPSDKSLYDELRNL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 ITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKAS-L . : : ::::::.: :.:.::::.::.:.:: ..:.... :.:: ..:.:: : . : NP_060 LLDPASHKLLVLAGPCLEETGELLLQTGGFSPHHFLQVLKDREIRDILATTPPPVQPPIL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 TLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFI--NIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFD :. :: ::: . .:: . ...:: . ::. ::: :: ::..::.: ::::. 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NP_060 LHPPSAGAERT------------------------------LASVCALLVWHPAGPGEKV 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 IRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRES .:::::: . .:.:: .:.:: ::..:..: .:: : : . .. .. .: .:.. NP_060 VRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHLRFLREPVVTPQDLEG--PGRAESKESVGSRDSSKRE 430 440 450 460 470 480 550 560 570 580 590 pF1KB6 LKPAAKPLPSKS----VRKE-SKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETK :..: :.. .::: .. :.:. :. .... : .... : :.. .: ... NP_060 GLLATHPRPGQERPGVARKEPARAEAPRKTE-KEAKTPRELKKDPKPSVSRTQPREVRRA 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 PSVTE--KEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPK : . :.. .. :.: :: NP_060 ASSVPNLKKTNAQAAPKPRKAPSTSHSGFPPVANGPRSPPSLRCGEASPPSAACGSPASQ 550 560 570 580 590 600 >-- initn: 823 init1: 463 opt: 565 Z-score: 262.4 bits: 61.4 E(85289): 7.1e-08 Smith-Waterman score: 724; 34.8% identity (57.2% similar) in 477 aa overlap (2009-2468:649-1059) 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KB6 RSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTS : .:... : : . .. :. :: .. NP_060 GEEKALELPLAASSIPRPRTPSPESHRSPAEGSERLSLSPLRGGEAGPDASPTVTTPTVT 620 630 640 650 660 670 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KB6 T----------YCYETAEKITRT-PQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEAR----QDVDLC : . :. :... . :. : ::. . ..: : .::::: NP_060 TPSLPAEVGSPHSTEVDESLSVSFEQVLPPSAPTSEAGLSLPLRGPRARRSASPHDVDLC 680 690 700 710 720 730 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KB6 LVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCD ::: ::..: :. : . : : .:.. . .:.. ..:: :. . NP_060 LVSPCEFEHRKA--VP--MAPAPASPGSSNDSSARSQE---RAGGL----GA-------E 740 750 760 770 780 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KB6 ETPPTSVSESAPSQTDSDVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPA :::::::::: :. .::: : : . :. : . :. .: .: :: : NP_060 ETPPTSVSESLPTLSDSD-P-----VPLAPGAADSDEDTEGFGVP-------RH-DPLPD 790 800 810 820 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KB6 PVQDRSPSPRHPDVSMVDPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDG :.. : : .. ::::: : . .. .. ..:.:: .. .: . . NP_060 PLKVPPPLPDPSSICMVDPEMLPPKTA------RQTENVSRTRKPLARPNS----RAAAP 830 840 850 860 870 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KB6 KSKPLAASPKPAGLKESSDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNA :. :.::. : :: ..:..:: : . ::.: ..: . : NP_060 KATPVAAA-KTKGLA-GGDRASR---------------PLS------ARSEPSEKGGR-A 880 890 900 910 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KB6 ANASASKSAKTATAGPGTTKTTKS--SAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVR . :.. :::: ::. . ... ::.:: :::::: :.:. :... :: :::.::: NP_060 PLSRKSSTPKTATRGPSGSASSRPGVSATPPKSPVYLDLAYLPSGSSAHLVDEEFFQRVR 920 930 940 950 960 970 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KB6 SSYYVVSGNDPAAEEPSRAVLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQ . ::.::.: :: :::::::: .: .: ..::::::: :: .:. :: ::: ..: NP_060 ALCYVISGQDQRKEEGMRAVLDALLASKQHWDRDLQVTLIPTFDSVAMHTWYAETHARHQ 980 990 1000 1010 1020 1030 2450 2460 pF1KB6 DLNIMVLASSSTVVMQDESFPACKIEL :.: ::.:.: : :::..:::::.:. NP_060 ALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF 1040 1050 >>XP_016882419 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule-ass (1068 aa) initn: 2151 init1: 602 opt: 1320 Z-score: 585.7 bits: 121.3 E(85289): 7e-26 Smith-Waterman score: 1514; 43.5% identity (70.2% similar) in 591 aa overlap (39-618:16-565) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 TEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVG-EIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWD ::.::: :. . : .. ..: :::::: XP_016 MAAVAGSGAAAAPSSLLLVVGSEFGSPGLLTYVLEELERGIRSWD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 TNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAVSTEVRLM .. ::::..::.::::::: :: : ::. ::::.: :::.::.::::... :.: . XP_016 VDPGVCNLDEQLKVFVSRHSATFSSIVKGQRSLHHRGDNLETLVLLNPSDKSLYDELRNL 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 ITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKAS-L . : : ::::::.: :.:.::::.::.:.:: ..:.... :.:: ..:.:: : . : XP_016 LLDPASHKLLVLAGPCLEETGELLLQTGGFSPHHFLQVLKDREIRDILATTPPPVQPPIL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 TLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFI--NIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFD :. :: ::: . .:: . ...:: . ::. ::: :: ::..::.: ::::. 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XP_016 LHPPSAGAERT------------------------------LASVCALLVWHPAGPGEKV 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 IRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRES .:::::: . .:.:: .:.:: ::..:..: .:: : : . .. .. .: .:.. XP_016 VRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHLRFLREPVVTPQDLEG--PGRAESKESVGSRDSSKRE 430 440 450 460 470 480 550 560 570 580 590 pF1KB6 LKPAAKPLPSKS----VRKE-SKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETK :..: :.. .::: .. :.:. :. .... : .... : :.. .: ... XP_016 GLLATHPRPGQERPGVARKEPARAEAPRKTE-KEAKTPRELKKDPKPSVSRTQPREVRRA 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 PSVTE--KEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPK : . :.. .. :.: :: XP_016 ASSVPNLKKTNAQAAPKPRKAPSTSHSGFPPVANGPRSPPSLRCGEASPPSAACGSPASQ 550 560 570 580 590 600 >-- initn: 755 init1: 266 opt: 537 Z-score: 250.3 bits: 59.2 E(85289): 3.3e-07 Smith-Waterman score: 696; 34.2% identity (56.2% similar) in 486 aa overlap (2009-2468:649-1068) 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KB6 RSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTS : .:... : : . .. :. :: .. XP_016 GEEKALELPLAASSIPRPRTPSPESHRSPAEGSERLSLSPLRGGEAGPDASPTVTTPTVT 620 630 640 650 660 670 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KB6 T----------YCYETAEKITRT-PQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEAR----QDVDLC : . :. :... . :. : ::. . ..: : .::::: XP_016 TPSLPAEVGSPHSTEVDESLSVSFEQVLPPSAPTSEAGLSLPLRGPRARRSASPHDVDLC 680 690 700 710 720 730 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KB6 LVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCD ::: ::..: :. : . : : .:.. . .:.. ..:: :. . XP_016 LVSPCEFEHRKA--VP--MAPAPASPGSSNDSSARSQE---RAGGL----GA-------E 740 750 760 770 780 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KB6 ETPPTSVSESAPSQTDSDVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPA :::::::::: :. .::: : : . :. : . :. .: .: :: : XP_016 ETPPTSVSESLPTLSDSD-P-----VPLAPGAADSDEDTEGFGVP-------RH-DPLPD 790 800 810 820 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KB6 PVQDRSPSPRHPDVSMVDPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDG :.. : : .. ::::: : . .. .. ..:.:: .. .: . . XP_016 PLKVPPPLPDPSSICMVDPEMLPPKTA------RQTENVSRTRKPLARPNS----RAAAP 830 840 850 860 870 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KB6 KSKPLAASPKPAGLKESSDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNA :. :.::. : :: ..:..:: : . ::.: ..: . : XP_016 KATPVAAA-KTKGLA-GGDRASR---------------PLS------ARSEPSEKGGR-A 880 890 900 910 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KB6 ANASASKSAKTATAGPGTTKTTKS--SAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVR . :.. :::: ::. . ... ::.:: :::::: :.:. :... :: :::.::: XP_016 PLSRKSSTPKTATRGPSGSASSRPGVSATPPKSPVYLDLAYLPSGSSAHLVDEEFFQRVR 920 930 940 950 960 970 2390 2400 2410 2420 2430 pF1KB6 SSYYVVSGNDPAAEEPSRAVLDALLEGKAQWGSNMQV---------TLIPTHDSEVMREW . ::.::.: :: :::::::: .: .: ..:: ::::: :: .:. : XP_016 ALCYVISGQDQRKEEGMRAVLDALLASKQHWDRDLQVRVTPGPLVVTLIPTFDSVAMHTW 980 990 1000 1010 1020 1030 2440 2450 2460 pF1KB6 YQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQDESFPACKIEL : ::: ..: :.: ::.:.: : :::..:::::.:. XP_016 YAETHARHQALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF 1040 1050 1060 >>NP_001295292 (OMIM: 607573) microtubule-associated pro (1033 aa) initn: 2185 init1: 602 opt: 1299 Z-score: 576.9 bits: 119.6 E(85289): 2.1e-25 Smith-Waterman score: 1493; 43.9% identity (70.5% similar) in 567 aa overlap (62-618:14-539) 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 FLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFS ::::::.. ::::..::.::::::: :: NP_001 MAGMIDRFSPANTGIRSWDVDPGVCNLDEQLKVFVSRHSATFS 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 PEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAVSTEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELI : ::. ::::.: :::.::.::::... :.: .. : : ::::::.: :.:.::::. NP_001 SIVKGQRSLHHRGDNLETLVLLNPSDKSLYDELRNLLLDPASHKLLVLAGPCLEETGELL 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 LQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKAS-LTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFI ::.:.:: ..:.... :.:: ..:.:: : . ::. :: ::: . .:: . NP_001 LQTGGFSPHHFLQVLKDREIRDILATTPPPVQPPILTITCPTFGDWAQLAPAVPGLQGAL 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 pF1KB6 --NIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGG ...:: . ::. ::: :: ::..::.: ::::..::::::::::.:..::::::::: NP_001 RLQLRLNPPAQLPNSEGLCEFLEYVAESLEPPSPFELLEPPTSGGFLRLGRPCCYIFPGG 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 RGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKI ::.:.::::::..:.::::. :: ::::.:::::::..:.:: : :.:::.::.:.::. NP_001 LGDAAFFAVNGFTVLVNGGSNPKSSFWKLVRHLDRVDAVLVTHPGADSLPGLNSLLRRKL 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 AELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYL :: . : . :. . .: .. ::::.:::::.:. : . .. :. .:: ..:. : NP_001 AE-RSEVAAGGGSWDDRLRRLISPNLGVVFFNACEAAS------RLARGEDEAELALSLL 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 NKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDK .:.. : :: :. :..::.:::::.:.::::.: ... : NP_001 AQLGITPLPLSRG-PVPAKPTVLFEKMGVGRLDMYVLHPPSAGAERT------------- 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 AEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHL :.:: .:.:::::.:.::..:::::: . .:.:: .:.:: NP_001 -----------------LASVCALLVWHPAGPGEKVVRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHL 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 DFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRESLKPAAKPLPSKS----VRKE-SKE ::..:..: .:: : : . .. .. .: .:.. :..: :.. .::: .. NP_001 RFLREPVVTPQDLEG--PGRAESKESVGSRDSSKREGLLATHPRPGQERPGVARKEPARA 430 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 620 pF1KB6 ETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKPSVTE--KEVPSKEEPSPVKAEVA :.:. :. .... : .... : :.. .: ... : . :.. .. :.: :: NP_001 EAPRKTE-KEAKTPRELKKDPKPSVSRTQPREVRRAASSVPNLKKTNAQAAPKPRKAPST 490 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 pF1KB6 EKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEVAKKEDKTPIKKEEKPKKEEVK NP_001 SHSGFPPVANGPRSPPSLRCGEASPPSAACGSPASQLVATPSLELGPIPAGEEKALELPL 550 560 570 580 590 600 >-- initn: 823 init1: 463 opt: 565 Z-score: 262.5 bits: 61.4 E(85289): 6.9e-08 Smith-Waterman score: 724; 34.8% identity (57.2% similar) in 477 aa overlap (2009-2468:623-1033) 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KB6 RSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTS : .:... : : . .. :. :: .. NP_001 GEEKALELPLAASSIPRPRTPSPESHRSPAEGSERLSLSPLRGGEAGPDASPTVTTPTVT 600 610 620 630 640 650 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KB6 T----------YCYETAEKITRT-PQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEAR----QDVDLC : . :. :... . :. : ::. . ..: : .::::: NP_001 TPSLPAEVGSPHSTEVDESLSVSFEQVLPPSAPTSEAGLSLPLRGPRARRSASPHDVDLC 660 670 680 690 700 710 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KB6 LVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCD ::: ::..: :. : . : : .:.. . .:.. ..:: :. . NP_001 LVSPCEFEHRKA--VP--MAPAPASPGSSNDSSARSQE---RAGGL----GA-------E 720 730 740 750 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KB6 ETPPTSVSESAPSQTDSDVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPA :::::::::: :. .::: : : . :. : . :. .: .: :: : NP_001 ETPPTSVSESLPTLSDSD-P-----VPLAPGAADSDEDTEGFGVP-------RH-DPLPD 760 770 780 790 800 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KB6 PVQDRSPSPRHPDVSMVDPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDG :.. : : .. ::::: : . .. .. ..:.:: .. .: . . NP_001 PLKVPPPLPDPSSICMVDPEMLPPKTA------RQTENVSRTRKPLARPNS----RAAAP 810 820 830 840 850 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KB6 KSKPLAASPKPAGLKESSDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNA :. :.::. : :: ..:..:: : . ::.: ..: . : NP_001 KATPVAAA-KTKGLA-GGDRASR---------------PLS------ARSEPSEKGGR-A 860 870 880 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KB6 ANASASKSAKTATAGPGTTKTTKS--SAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVR . :.. :::: ::. . ... ::.:: :::::: :.:. :... :: :::.::: NP_001 PLSRKSSTPKTATRGPSGSASSRPGVSATPPKSPVYLDLAYLPSGSSAHLVDEEFFQRVR 890 900 910 920 930 940 2390 2400 2410 2420 2430 2440 pF1KB6 SSYYVVSGNDPAAEEPSRAVLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQ . ::.::.: :: :::::::: .: .: ..::::::: :: .:. :: ::: ..: NP_001 ALCYVISGQDQRKEEGMRAVLDALLASKQHWDRDLQVTLIPTFDSVAMHTWYAETHARHQ 950 960 970 980 990 1000 2450 2460 pF1KB6 DLNIMVLASSSTVVMQDESFPACKIEL :.: ::.:.: : :::..:::::.:. NP_001 ALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF 1010 1020 1030 >>XP_016882420 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule-ass (1042 aa) initn: 2131 init1: 602 opt: 1299 Z-score: 576.9 bits: 119.6 E(85289): 2.2e-25 Smith-Waterman score: 1493; 43.9% identity (70.5% similar) in 567 aa overlap (62-618:14-539) 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 FLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFS ::::::.. ::::..::.::::::: :: XP_016 MAGMIDRFSPANTGIRSWDVDPGVCNLDEQLKVFVSRHSATFS 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KB6 PEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAVSTEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELI : ::. ::::.: :::.::.::::... :.: .. : : ::::::.: :.:.::::. XP_016 SIVKGQRSLHHRGDNLETLVLLNPSDKSLYDELRNLLLDPASHKLLVLAGPCLEETGELL 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KB6 LQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKAS-LTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFI ::.:.:: ..:.... :.:: ..:.:: : . ::. :: ::: . .:: . XP_016 LQTGGFSPHHFLQVLKDREIRDILATTPPPVQPPILTITCPTFGDWAQLAPAVPGLQGAL 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 pF1KB6 --NIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGG ...:: . ::. ::: :: ::..::.: ::::..::::::::::.:..::::::::: XP_016 RLQLRLNPPAQLPNSEGLCEFLEYVAESLEPPSPFELLEPPTSGGFLRLGRPCCYIFPGG 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 RGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKI ::.:.::::::..:.::::. :: ::::.:::::::..:.:: : :.:::.::.:.::. XP_016 LGDAAFFAVNGFTVLVNGGSNPKSSFWKLVRHLDRVDAVLVTHPGADSLPGLNSLLRRKL 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 AELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYL :: . : . :. . .: .. ::::.:::::.:. : . .. :. .:: ..:. : XP_016 AE-RSEVAAGGGSWDDRLRRLISPNLGVVFFNACEAAS------RLARGEDEAELALSLL 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 NKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDK .:.. : :: :. :..::.:::::.:.::::.: ... : XP_016 AQLGITPLPLSRG-PVPAKPTVLFEKMGVGRLDMYVLHPPSAGAERT------------- 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 AEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHL :.:: .:.:::::.:.::..:::::: . .:.:: .:.:: XP_016 -----------------LASVCALLVWHPAGPGEKVVRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHL 390 400 410 420 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 DFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRESLKPAAKPLPSKS----VRKE-SKE ::..:..: .:: : : . .. .. .: .:.. :..: :.. .::: .. XP_016 RFLREPVVTPQDLEG--PGRAESKESVGSRDSSKREGLLATHPRPGQERPGVARKEPARA 430 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 620 pF1KB6 ETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKPSVTE--KEVPSKEEPSPVKAEVA :.:. :. .... : .... : :.. .: ... : . :.. .. :.: :: XP_016 EAPRKTE-KEAKTPRELKKDPKPSVSRTQPREVRRAASSVPNLKKTNAQAAPKPRKAPST 490 500 510 520 530 540 630 640 650 660 670 680 pF1KB6 EKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEVAKKEDKTPIKKEEKPKKEEVK XP_016 SHSGFPPVANGPRSPPSLRCGEASPPSAACGSPASQLVATPSLELGPIPAGEEKALELPL 550 560 570 580 590 600 >-- initn: 755 init1: 266 opt: 537 Z-score: 250.5 bits: 59.2 E(85289): 3.3e-07 Smith-Waterman score: 696; 34.2% identity (56.2% similar) in 486 aa overlap (2009-2468:623-1042) 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KB6 RSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTS : .:... : : . .. :. :: .. XP_016 GEEKALELPLAASSIPRPRTPSPESHRSPAEGSERLSLSPLRGGEAGPDASPTVTTPTVT 600 610 620 630 640 650 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KB6 T----------YCYETAEKITRT-PQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEAR----QDVDLC : . :. :... . :. : ::. . ..: : .::::: XP_016 TPSLPAEVGSPHSTEVDESLSVSFEQVLPPSAPTSEAGLSLPLRGPRARRSASPHDVDLC 660 670 680 690 700 710 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KB6 LVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCD ::: ::..: :. : . : : .:.. . .:.. ..:: :. . XP_016 LVSPCEFEHRKA--VP--MAPAPASPGSSNDSSARSQE---RAGGL----GA-------E 720 730 740 750 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KB6 ETPPTSVSESAPSQTDSDVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPA :::::::::: :. .::: : : . :. : . :. .: .: :: : XP_016 ETPPTSVSESLPTLSDSD-P-----VPLAPGAADSDEDTEGFGVP-------RH-DPLPD 760 770 780 790 800 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KB6 PVQDRSPSPRHPDVSMVDPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDG :.. : : .. ::::: : . .. .. ..:.:: .. .: . . XP_016 PLKVPPPLPDPSSICMVDPEMLPPKTA------RQTENVSRTRKPLARPNS----RAAAP 810 820 830 840 850 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KB6 KSKPLAASPKPAGLKESSDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNA :. :.::. : :: ..:..:: : . ::.: ..: . : XP_016 KATPVAAA-KTKGLA-GGDRASR---------------PLS------ARSEPSEKGGR-A 860 870 880 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KB6 ANASASKSAKTATAGPGTTKTTKS--SAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVR . :.. :::: ::. . ... ::.:: :::::: :.:. :... :: :::.::: XP_016 PLSRKSSTPKTATRGPSGSASSRPGVSATPPKSPVYLDLAYLPSGSSAHLVDEEFFQRVR 890 900 910 920 930 940 2390 2400 2410 2420 2430 pF1KB6 SSYYVVSGNDPAAEEPSRAVLDALLEGKAQWGSNMQV---------TLIPTHDSEVMREW . ::.::.: :: :::::::: .: .: ..:: ::::: :: .:. : XP_016 ALCYVISGQDQRKEEGMRAVLDALLASKQHWDRDLQVRVTPGPLVVTLIPTFDSVAMHTW 950 960 970 980 990 1000 2440 2450 2460 pF1KB6 YQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQDESFPACKIEL : ::: ..: :.: ::.:.: : :::..:::::.:. XP_016 YAETHARHQALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF 1010 1020 1030 1040 >>XP_011528502 (OMIM: 105400,162230,616924) PREDICTED: n (924 aa) initn: 261 init1: 213 opt: 374 Z-score: 181.5 bits: 46.3 E(85289): 0.0023 Smith-Waterman score: 431; 30.8% identity (53.6% similar) in 504 aa overlap (566-1042:423-896) 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 KQRADSRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPE-VTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPI :: . :. : ::.:.::. : . XP_011 MALDIEIAAYRKLLEGEECRIGFGPIPFSLPEGLPKIPSVSTHIKVKSEEKIKVVE---- 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KB6 KTETKPSVTEKEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKE :.: . ..:... : . : ::.:.. ..: . .::. .: ... ..: : XP_011 KSEKETVIVEEQT----EETQVTEEVTEEEEKEAKEEEGKEEEGGEEEEAEG-GEEETKS 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 pF1KB6 KPKKEVA--KKEDKTPIKKEEK-------PKKEEVKKEVKKEIKKEEK-KEPKKEVKKET : .:.: .:: :.:.:.: : :.:::.:. . :.:. :: : :.: .. 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NP_066 AKSPVKEEA---KSPAEVKSPEKAK-SPTKEEAKSPEKAKSPEKEEAKSPEKAKSPVKAE 620 630 640 650 660 670 820 830 840 850 860 870 pF1KB6 AIGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDFEELKAEEVDVTKDIKPQLELIEDEEKLKETEPVEA : .: : .. .::: : .: : . : .: : .. :: : :: NP_066 AKSPEKAKSPVKAEAKSPE---KAKSPVKEEAKSPEKAKSPVKEEAKSPEKAKSPVKEEA 680 690 700 710 720 730 880 890 900 910 920 930 pF1KB6 YVIQKEREVTKGPAESPDEGITTTEGEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAG-FE . .: . .: :.::... . ... ..:: :..... . .:: ... . . NP_066 KTPEKAKSPVKEEAKSPEKAKSPEKAKTLDVKSPEAKTPAKEEARSPADKFPEKAKSPVK 740 750 760 770 780 790 940 950 960 970 980 990 pF1KB6 ESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEEHVCVSASKHSPTEDEESAK-AEADAYIREKRESV : .. . .. :.:. ::.. .. :. ::...::. . ... .. .: NP_066 EEVKSPEKAKSPLKEDAKAPEKEIPKKEEVK----SPVKEEEKPQEVKVKEPPKKAEEEK 800 810 820 830 840 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB6 ASGDDRAEEDMD---EAIEKGEAEQSEEEADEEDKAEDAREEEYEPEKMEAEDYVMAVVD : . ..:: : : : :: . . : .: .: .: . : .: :::: : NP_066 APATPKTEEKKDSKKEEAPKKEAPKPKVEEKKEPAVEKPKESKVEAKKEEAEDK--KKVP 850 860 870 880 890 900 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB6 KAAEAGGAEEQYGFLTTPTKQLGAQSPGREPASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQ- . . :. . . : .. .. .:: .. : . ..::. ....:.. NP_066 TPEKEAPAKVEVKEDAKPKEK--TEVAKKEPDDAKAKEPSKPAEKKEAAPEKKDTKEEKA 910 920 930 940 950 960 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB6 --PEEFTATSGYTQSTIE-ISSEPTPMDEMSTPRDVMSDETNNEETESPSQEFVNITKYE ::: : . .. . .:.::. .. .. .:. ... :. ... NP_066 KKPEEKPKTEAKAKEDDKTLSKEPSKPKAEKAEKSSSTDQKDSKPPEKATEDKAAKGK 970 980 990 1000 1010 1020 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB6 SSLYSQEYSKPADVTPLNGFSEGSKTDATDGKDYNASASTISPPSSMEEDKFSRSALRDA 2468 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 04:05:42 2016 done: Fri Nov 4 04:05:46 2016 Total Scan time: 24.570 Total Display time: 1.310 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]