FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6007, 834 aa
1>>>pF1KB6007 834 - 834 aa - 834 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0616+/-0.00117; mu= 16.7733+/- 0.070
mean_var=86.7346+/-16.849, 0's: 0 Z-trim(103.7): 102 B-trim: 44 in 1/49
Lambda= 0.137714
statistics sampled from 7427 (7535) to 7427 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32016.1 RASA3 gene_id:22821|Hs108|chr13 ( 834) 5599 1123.3 0
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CCDS59506.1 RASA4B gene_id:100271927|Hs108|chr7 ( 757) 623 134.7 5.9e-31
CCDS55888.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 776) 465 103.3 1.7e-21
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CCDS6833.2 DAB2IP gene_id:153090|Hs108|chr9 (1132) 435 97.4 1.5e-19
CCDS1322.1 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1139) 434 97.2 1.7e-19
CCDS1321.2 RASAL2 gene_id:9462|Hs108|chr1 (1280) 434 97.2 1.8e-19
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CCDS55889.1 RASAL1 gene_id:8437|Hs108|chr12 ( 806) 421 94.6 7.5e-19
CCDS47243.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5 ( 870) 418 94.0 1.2e-18
CCDS34200.1 RASA1 gene_id:5921|Hs108|chr5 (1047) 418 94.0 1.4e-18
CCDS11264.1 NF1 gene_id:4763|Hs108|chr17 (2818) 381 86.9 5.3e-16
CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 283 67.0 7.2e-11
>>CCDS32016.1 RASA3 gene_id:22821|Hs108|chr13 (834 aa)
initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599 Z-score: 6011.6 bits: 1123.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5599; 100.0% identity (100.0% similar) in 834 aa overlap (1-834:1-834)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDAD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEA
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 FYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 RWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQAN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 NCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 QLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB6 KQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
790 800 810 820 830
>>CCDS3117.1 RASA2 gene_id:5922|Hs108|chr3 (849 aa)
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Smith-Waterman score: 3531; 61.6% identity (87.0% similar) in 817 aa overlap (8-818:34-848)
10 20 30
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCY
.::.::.. :: ::::: : :: :::::.
CCDS31 AAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 CTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAI
::.:::::::.::..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..:: ::::::
CCDS31 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGL
.:::: .. ...:::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...: :.::
CCDS31 KKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF
:..::: :::::::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.::::::: ::..::.:.
CCDS31 PLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK
::::..:::::.:::: .:: : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: :
CCDS31 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 PDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAV
:::::::::. ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:..
CCDS31 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL
:::::.::. ..::: .:.: ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.:::
CCDS31 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF
:: ..:::.: : :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..::::::::::
CCDS31 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
.:::. :..:: .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: :::::::
CCDS31 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 KTVQTLGS---LSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE
::.::::: :::::: ::::..: :...:.:. : :::.::: :::. .. ...
CCDS31 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVE
.:. :::: : :::::: :.: :::::::: ::..:.::::. : . .:.::..::::::
CCDS31 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGKDAIYTIPVKNILAVE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 KLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLS
:::: ::. :::::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::.::.
CCDS31 KLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLN
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700 710 720 730 740 750
pF1KB6 GHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGS
:.::::. .... ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.::::.
CCDS31 GNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACGT
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB6 KSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQE
.::.::..: .::.:::.: :.::..:. . . :.. : .:.. . ...::::.:
CCDS31 IAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKE
790 800 810 820 830 840
820 830
pF1KB6 HPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
.:: :.
CCDS31 NPIVGKAS
>>CCDS5725.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 (803 aa)
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Smith-Waterman score: 1186; 32.1% identity (62.8% similar) in 779 aa overlap (13-752:6-750)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
:. :.: :.::::. . : :: :..:.: ..:: : :.::::
CCDS57 MAKRSSLYIRIVEGKNLPA-KDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPF
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pF1KB6 YGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKY-HNRDTWFQLQHVDA
.::.. ..: .:. ..::..:.:.. ::..:::: . .. . .. .. . : .: .::
CCDS57 WGEEYQVHLPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDP
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 DSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGL-PI-VNGQCDPYATVTLAGPFR
: ::::..::.: :: :. .: ..: . : : :: ::.. : ..
CCDS57 DEEVQGEIHLRL---EVWP--GARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVR----YK
120 130 140 150 160
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pF1KB6 SEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLK
.....:.. .:. :...:.: ::. .: .. : ... : .:
CCDS57 GRTRETSIVKKSCYPRWNETFEFEL--------------QEGAMEALCVEAWDW---DLV
170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 FGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSS
..:::.. : .. :: .. :.:. ::: .. :. .::::.:.: .. :. :
CCDS57 SRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEV-----CREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFI
.::.:: :: . . . . . : : :: :..:. :..::: : . :.
CCDS57 SYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTSTECR--QDVATNLLKLFLGQGLAKDFL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 SAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEI
. . . :..::.. ::.::.:::::: .. .:.:::.::: .: : :... . .: :.
CCDS57 DLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVEL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450
pF1KB6 DP--VKLKD------------GENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFS
:: :..:: .: ::.. ..:: .. .. :...: .::.:. : .
CCDS57 DPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQ
390 400 410 420 430 440
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pF1KB6 LREAAAKRFQ--DDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
: . . .:: . .: . ::.::. ::::.:::.::.::.: .:.: .::::: :..
CCDS57 LFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLA
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 KTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPI
:.::..:... : . ::..: . .: :. .:.:. . . ..: .... .
CCDS57 KAVQNVGNMDTPASRA-KEAWMEPLQPTV-RQGVAQ-LKDFITKLVDIEEKDELDLQRTL
510 520 530 540 550 560
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pF1KB6 VL-----KEG-FMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENIL
: ::: ..:.:..:. . ..::: .: ::.. ... :. ... : . ::
CCDS57 SLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIR
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680
pF1KB6 AVEKLEEESFKMKNMFQVI------QPERALYIQANNCV-EAKDWIDILTKVSQCNQKRL
:.::.::.:: ....::: .:. : :.: . :: : ..:.. : ::: : :
CCDS57 AAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTA-YLQCK-CVNELNQWLSALRKVSINNTGLL
630 640 650 660 670
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pF1KB6 TVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLD-IDGDRETERIYS-LFNLYM
:::... . .: ::. .. ::. . . . : .: : :.. :: :...
CCDS57 GSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDPLDHDLEAQLIYRHLLGVEA
680 690 700 710 720 730
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pF1KB6 SKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDK
:. .: :
CCDS57 MLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLL
740 750 760 770 780 790
>>CCDS47674.1 RASA4 gene_id:10156|Hs108|chr7 (757 aa)
initn: 972 init1: 228 opt: 625 Z-score: 671.3 bits: 135.1 E(32554): 4.5e-31
Smith-Waterman score: 1043; 30.3% identity (59.6% similar) in 773 aa overlap (13-752:6-704)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
:. :.: :.::::. . : :: :..:.: ..:: : :.::::
CCDS47 MAKRSSLYIRIVEGKNLPA-KDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPF
10 20 30 40 50
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