FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6007, 834 aa
1>>>pF1KB6007 834 - 834 aa - 834 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5384+/-0.000529; mu= 14.1413+/- 0.032
mean_var=130.1379+/-26.671, 0's: 0 Z-trim(110.6): 205 B-trim: 197 in 1/53
Lambda= 0.112427
statistics sampled from 18744 (19002) to 18744 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 10.810
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_031394 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating pro ( 834) 5599 921.1 0
XP_011533144 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 5391 887.4 0
XP_011533143 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 5391 887.4 0
NP_001307751 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating ( 802) 5391 887.4 0
NP_006497 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating pro ( 849) 3531 585.7 2.9e-166
NP_001290174 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating ( 850) 3522 584.3 8e-166
NP_001290175 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating ( 853) 3504 581.3 6.1e-165
XP_016862458 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 871) 3497 580.2 1.4e-164
XP_011511361 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 853) 3488 578.7 3.7e-164
XP_016862457 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 872) 3488 578.7 3.7e-164
NP_001307750 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating ( 451) 3030 504.2 5.3e-142
XP_016875928 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 3030 504.2 5.3e-142
XP_016875927 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 3030 504.2 5.3e-142
XP_016862459 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 707) 2665 445.2 4.9e-124
XP_016862460 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 573) 2243 376.6 1.7e-103
XP_016862461 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 442) 1821 308.1 5.6e-83
NP_008920 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating pro ( 803) 816 145.3 1e-33
XP_016867150 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 840) 816 145.3 1.1e-33
XP_011514025 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 682) 626 114.4 1.7e-24
NP_001073346 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating ( 757) 625 114.3 2.1e-24
XP_016867151 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 794) 625 114.3 2.2e-24
NP_001180450 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 776) 465 88.4 1.4e-16
XP_011537156 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 447) 450 85.7 5e-16
XP_011516573 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1065) 435 83.6 5.1e-15
XP_016869789 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1065) 435 83.6 5.1e-15
NP_619723 (OMIM: 609205) disabled homolog 2-intera (1065) 435 83.6 5.1e-15
XP_011516572 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1065) 435 83.6 5.1e-15
XP_005251781 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1128) 435 83.7 5.3e-15
XP_011516569 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1131) 435 83.7 5.3e-15
NP_115941 (OMIM: 609205) disabled homolog 2-intera (1132) 435 83.7 5.3e-15
XP_016869788 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1141) 435 83.7 5.3e-15
XP_011516568 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1153) 435 83.7 5.4e-15
XP_011516567 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1160) 435 83.7 5.4e-15
XP_005251778 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1161) 435 83.7 5.4e-15
XP_016869787 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1164) 435 83.7 5.4e-15
XP_011516566 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1182) 435 83.7 5.5e-15
XP_005251776 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1189) 435 83.7 5.5e-15
XP_016858344 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1138) 434 83.5 5.9e-15
NP_004832 (OMIM: 606136) ras GTPase-activating pro (1139) 434 83.5 6e-15
XP_005245679 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1142) 434 83.5 6e-15
XP_016858343 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1145) 434 83.5 6e-15
XP_016858342 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1234) 434 83.5 6.3e-15
NP_733793 (OMIM: 606136) ras GTPase-activating pro (1280) 434 83.5 6.5e-15
XP_011508469 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1287) 434 83.5 6.5e-15
XP_011508468 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1290) 434 83.5 6.5e-15
XP_016858341 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1409) 434 83.6 7e-15
XP_016858340 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1412) 434 83.6 7e-15
XP_016858339 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1416) 434 83.6 7e-15
XP_016858338 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1419) 434 83.6 7e-15
NP_006763 (OMIM: 603384,612621) ras/Rap GTPase-act (1343) 427 82.4 1.5e-14
>>NP_031394 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating protein (834 aa)
initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599 Z-score: 4918.8 bits: 921.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5599; 100.0% identity (100.0% similar) in 834 aa overlap (1-834:1-834)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 YGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDAD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 SEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 KKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 EFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 EFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 SPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 KRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 ENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 ENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 FIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMAT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 FYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 FYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 RWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 RWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQAN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 NCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 NCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 QLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 QLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB6 KQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 KQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
790 800 810 820 830
>>XP_011533144 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase-acti (802 aa)
initn: 5391 init1: 5391 opt: 5391 Z-score: 4736.7 bits: 887.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5391; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (33-834:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 VEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KB6 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
760 770 780 790 800
>>XP_011533143 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase-acti (802 aa)
initn: 5391 init1: 5391 opt: 5391 Z-score: 4736.7 bits: 887.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5391; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (33-834:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 VEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KB6 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
760 770 780 790 800
>>NP_001307751 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating prot (802 aa)
initn: 5391 init1: 5391 opt: 5391 Z-score: 4736.7 bits: 887.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5391; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (33-834:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 VEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
10 20 30
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pF1KB6 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
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pF1KB6 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
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pF1KB6 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
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pF1KB6 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
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pF1KB6 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
460 470 480 490 500 510
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pF1KB6 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KB6 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
760 770 780 790 800
>>NP_006497 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating protein (849 aa)
initn: 2977 init1: 1943 opt: 3531 Z-score: 3105.9 bits: 585.7 E(85289): 2.9e-166
Smith-Waterman score: 3531; 61.6% identity (87.0% similar) in 817 aa overlap (8-818:34-848)
10 20 30
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCY
.::.::.. :: ::::: : :: :::::.
NP_006 AAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 CTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAI
::.:::::::.::..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..:: ::::::
NP_006 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGL
.:::: .. ...:::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...: :.::
NP_006 KKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF
:..::: :::::::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.::::::: ::..::.:.
NP_006 PLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK
::::..:::::.:::: .:: : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: :
NP_006 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 PDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAV
:::::::::. ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:..
NP_006 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL
:::::.::. ..::: .:.: ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.:::
NP_006 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF
:: ..:::.: : :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..::::::::::
NP_006 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF
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460 470 480 490 500 510
pF1KB6 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
.:::. :..:: .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: :::::::
NP_006 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 KTVQTLGS---LSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE
::.::::: :::::: ::::..: :...:.:. : :::.::: :::. .. ...
NP_006 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVE
.:. :::: : :::::: :.: :::::::: ::..:.::::. : . .:.::..::::::
NP_006 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGKDAIYTIPVKNILAVE
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 KLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLS
:::: ::. :::::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::.::.
NP_006 KLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLN
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB6 GHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGS
:.::::. .... ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.::::.
NP_006 GNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACGT
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB6 KSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQE
.::.::..: .::.:::.: :.::..:. . . :.. : .:.. . ...::::.:
NP_006 IAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKE
790 800 810 820 830 840
820 830
pF1KB6 HPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
.:: :.
NP_006 NPIVGKAS
>>NP_001290174 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating prot (850 aa)
initn: 2923 init1: 1943 opt: 3522 Z-score: 3098.0 bits: 584.3 E(85289): 8e-166
Smith-Waterman score: 3522; 61.5% identity (87.0% similar) in 818 aa overlap (8-818:34-849)
10 20 30
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCY
.::.::.. :: ::::: : :: :::::.
NP_001 AAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 CTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAI
::.:::::::.::..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..:: ::::::
NP_001 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGL
.:::: .. ...:::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...: :.::
NP_001 KKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF
:..::: :::::::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.::::::: ::..::.:.
NP_001 PLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK
::::..:::::.:::: .:: : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: :
NP_001 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 PDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAV
:::::::::. ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:..
NP_001 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL
:::::.::. ..::: .:.: ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.:::
NP_001 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL
370 380 390 400 410 420
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pF1KB6 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF
:: ..:::.: : :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..::::::::::
NP_001 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF
430 440 450 460 470 480
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pF1KB6 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
.:::. :..:: .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: :::::::
NP_001 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 KTVQTLGS---LSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE
::.::::: :::::: ::::..: :...:.:. : :::.::: :::. .. ...
NP_001 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQP-LYSIPIENILAV
.:. :::: : :::::: :.: :::::::: ::..:.::::. :.. .:.::..:::::
NP_001 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAV
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 EKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYL
::::: ::. :::::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::.::
NP_001 EKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYL
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB6 SGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACG
.:.::::. .... ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.::::
NP_001 NGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACG
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB6 SKSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQ
. .::.::..: .::.:::.: :.::..:. . . :.. : .:.. . ...::::.
NP_001 TIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSK
790 800 810 820 830 840
820 830
pF1KB6 EHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
:.:: :.
NP_001 ENPIVGKAS
850
>>NP_001290175 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating prot (853 aa)
initn: 3057 init1: 1943 opt: 3504 Z-score: 3082.2 bits: 581.3 E(85289): 6.1e-165
Smith-Waterman score: 3504; 61.1% identity (86.6% similar) in 821 aa overlap (8-818:34-852)
10 20 30
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCY
.::.::.. :: ::::: : :: :::::.
NP_001 AAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 CTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAI
::.:::::::.::..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..:: ::::::
NP_001 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGL
.:::: .. ...:::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...: :.::
NP_001 KKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF
:..::: :::::::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.::::::: ::..::.:.
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220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK
::::..:::::.:::: .:: : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: :
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850
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pF1KB6 FQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDS
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830
pF1KB6 RQQSETSTHSI
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10 20 30 40
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFR
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pF1KB6 TKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRD
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XP_011 TQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDLCNHSGKE
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pF1KB6 TVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRV
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XP_011 TVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEEDIEKLEIRI
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pF1KB6 DLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVV
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pF1KB6 YTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRV
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XP_011 VPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTLKPILDEICDSSK
380 390 400 410 420 430
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pF1KB6 PCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQ
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XP_011 SCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFP
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pF1KB6 DDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGS---L
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XP_011 NDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSL
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XP_011 RAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKN
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pF1KB6 MFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSD
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XP_011 MFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGE
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pF1KB6 SAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQE-
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XP_011 NTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACGTIAVYQGPQKEP
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pF1KB6 -EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNY
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XP_011 DDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS
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830
pF1KB6 IRQQSETSTHSI
>>XP_016862457 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase-acti (872 aa)
initn: 3032 init1: 1909 opt: 3488 Z-score: 3068.1 bits: 578.7 E(85289): 3.7e-164
Smith-Waterman score: 3488; 61.7% identity (87.1% similar) in 806 aa overlap (20-818:68-871)
10 20 30 40
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFR
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XP_016 VGLSFKKKSKLCRRETSKKKERLKNKKAESEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINLDQEEVYR
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pF1KB6 TKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRD
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XP_016 TQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDLCNHSGKE
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110 120 130 140 150 160
pF1KB6 TWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQ-CDPYA
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XP_016 TWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGLPLINGQSCDPYA
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRV
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XP_016 TVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEEDIEKLEIRI
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 DLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVV
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XP_016 DLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDDLGSLRLNIC
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRV
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XP_016 YTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVLPLVRLLLHHDKL
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 VPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHK
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XP_016 VPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTLKPILDEICDSSK
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 PCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQ
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XP_016 SCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFP
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470 480 490 500 510 520
pF1KB6 DDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGS---L
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XP_016 NDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSL
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530 540 550 560 570 580
pF1KB6 SKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIK
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