Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6008
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6008, 2813 aa
1>>>pF1KB6008 2813 - 2813 aa - 2813 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0897+/-0.00137; mu= 24.8863+/- 0.083
mean_var=177.8228+/-33.795, 0's: 0 Z-trim(107.4): 129 B-trim: 22 in 1/50
Lambda= 0.096179
statistics sampled from 9404 (9533) to 9404 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 8.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8539.1 VWF gene_id:7450|Hs108|chr12 (2813) 20127 2808.1 0
CCDS44513.1 MUC6 gene_id:4588|Hs108|chr11 (2439) 1968 288.3 3.5e-76
CCDS59225.2 OTOG gene_id:340990|Hs108|chr11 (2913) 1808 266.2 1.9e-69
CCDS76390.1 OTOG gene_id:340990|Hs108|chr11 (2925) 1808 266.3 1.9e-69
CCDS76369.1 MUC5AC gene_id:4586|Hs108|chr11 (5654) 1573 234.0 1.8e-59
CCDS44515.2 MUC5B gene_id:727897|Hs108|chr11 (5762) 1516 226.1 4.4e-57
CCDS47663.2 ZAN gene_id:7455|Hs108|chr7 (2721) 642 104.4 9.2e-21
CCDS47664.2 ZAN gene_id:7455|Hs108|chr7 (2812) 642 104.4 9.4e-21
CCDS5442.1 BMPER gene_id:168667|Hs108|chr7 ( 685) 587 96.0 8.1e-19
CCDS33410.2 COL6A3 gene_id:1293|Hs108|chr2 (2570) 509 85.9 3.2e-15
CCDS8434.1 TECTA gene_id:7007|Hs108|chr11 (2155) 506 85.4 3.8e-15
CCDS54439.1 COL6A3 gene_id:1293|Hs108|chr2 (1036) 465 79.3 1.3e-13
CCDS33411.2 COL6A3 gene_id:1293|Hs108|chr2 (1237) 465 79.4 1.4e-13
CCDS33409.1 COL6A3 gene_id:1293|Hs108|chr2 (2971) 465 79.9 2.4e-13
CCDS33412.1 COL6A3 gene_id:1293|Hs108|chr2 (3177) 465 80.0 2.5e-13
CCDS7589.2 VWA2 gene_id:340706|Hs108|chr10 ( 755) 394 69.2 9.9e-11
>>CCDS8539.1 VWF gene_id:7450|Hs108|chr12 (2813 aa)
initn: 20127 init1: 20127 opt: 20127 Z-score: 15098.0 bits: 2808.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 20127; 99.9% identity (100.0% similar) in 2813 aa overlap (1-2813:1-2813)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MIPARFAGVLLALALILPGTLCAEGTRGRSSTARCSLFGSDFVNTFDGSMYSFAGYCSYL
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CCDS85 MIPARFAGVLLALALILPGTLCAEGTRGRSSTARCSLFGSDFVNTFDGSMYSFAGYCSYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LAGGCQKRSFSIIGDFQNGKRVSLSVYLGEFFDIHLFVNGTVTQGDQRVSMPYASKGLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LAGGCQKRSFSIIGDFQNGKRVSLSVYLGEFFDIHLFVNGTVTQGDQRVSMPYASKGLYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ETEAGYYKLSGEAYGFVARIDGSGNFQVLLSDRYFNKTCGLCGNFNIFAEDDFMTQEGTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ETEAGYYKLSGEAYGFVARIDGSGNFQVLLSDRYFNKTCGLCGNFNIFAEDDFMTQEGTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TSDPYDFANSWALSSGEQWCERASPPSSSCNISSGEMQKGLWEQCQLLKSTSVFARCHPL
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CCDS85 TSDPYDFANSWALSSGEQWCERASPPSSSCNISSGEMQKGLWEQCQLLKSTSVFARCHPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VDPEPFVALCEKTLCECAGGLECACPALLEYARTCAQEGMVLYGWTDHSACSPVCPAGME
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CCDS85 VDPEPFVALCEKTLCECAGGLECACPALLEYARTCAQEGMVLYGWTDHSACSPVCPAGME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 YRQCVSPCARTCQSLHINEMCQERCVDGCSCPEGQLLDEGLCVESTECPCVHSGKRYPPG
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CCDS85 YRQCVSPCARTCQSLHINEMCQERCVDGCSCPEGQLLDEGLCVESTECPCVHSGKRYPPG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TSLSRDCNTCICRNSQWICSNEECPGECLVTGQSHFKSFDNRYFTFSGICQYLLARDCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 TSLSRDCNTCICRNSQWICSNEECPGECLVTGQSHFKSFDNRYFTFSGICQYLLARDCQD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 HSFSIVIETVQCADDRDAVCTRSVTVRLPGLHNSLVKLKHGAGVAMDGQDVQLPLLKGDL
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CCDS85 HSFSIVIETVQCADDRDAVCTRSVTVRLPGLHNSLVKLKHGAGVAMDGQDVQLPLLKGDL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 RIQRTVTASVRLSYGEDLQMDWDGRGRLLVKLSPVYAGKTCGLCGNYNGNQGDDFLTPSG
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 RIQHTVTASVRLSYGEDLQMDWDGRGRLLVKLSPVYAGKTCGLCGNYNGNQGDDFLTPSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LAEPRVEDFGNAWKLHGDCQDLQKQHSDPCALNPRMTRFSEEACAVLTSPTFEACHRAVS
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CCDS85 LAEPRVEDFGNAWKLHGDCQDLQKQHSDPCALNPRMTRFSEEACAVLTSPTFEACHRAVS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PLPYLRNCRYDVCSCSDGRECLCGALASYAAACAGRGVRVAWREPGRCELNCPKGQVYLQ
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CCDS85 PLPYLRNCRYDVCSCSDGRECLCGALASYAAACAGRGVRVAWREPGRCELNCPKGQVYLQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 CGTPCNLTCRSLSYPDEECNEACLEGCFCPPGLYMDERGDCVPKAQCPCYYDGEIFQPED
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CCDS85 CGTPCNLTCRSLSYPDEECNEACLEGCFCPPGLYMDERGDCVPKAQCPCYYDGEIFQPED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 IFSDHHTMCYCEDGFMHCTMSGVPGSLLPDAVLSSPLSHRSKRSLSCRPPMVKLVCPADN
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CCDS85 IFSDHHTMCYCEDGFMHCTMSGVPGSLLPDAVLSSPLSHRSKRSLSCRPPMVKLVCPADN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB6 LRAEGLECTKTCQNYDLECMSMGCVSGCLCPPGMVRHENRCVALERCPCFHQGKEYAPGE
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CCDS85 LRAEGLECTKTCQNYDLECMSMGCVSGCLCPPGMVRHENRCVALERCPCFHQGKEYAPGE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB6 TVKIGCNTCVCRDRKWNCTDHVCDATCSTIGMAHYLTFDGLKYLFPGECQYVLVQDYCGS
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CCDS85 TVKIGCNTCVCQDRKWNCTDHVCDATCSTIGMAHYLTFDGLKYLFPGECQYVLVQDYCGS
850 860 870 880 890 900
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pF1KB6 NPGTFRILVGNKGCSHPSVKCKKRVTILVEGGEIELFDGEVNVKRPMKDETHFEVVESGR
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CCDS85 NPGTFRILVGNKGCSHPSVKCKKRVTILVEGGEIELFDGEVNVKRPMKDETHFEVVESGR
910 920 930 940 950 960
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pF1KB6 YIILLLGKALSVVWDRHLSISVVLKQTYQEKVCGLCGNFDGIQNNDLTSSNLQVEEDPVD
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CCDS85 YIILLLGKALSVVWDRHLSISVVLKQTYQEKVCGLCGNFDGIQNNDLTSSNLQVEEDPVD
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB6 FGNSWKVSSQCADTRKVPLDSSPATCHNNIMKQTMVDSSCRILTSDVFQDCNKLVDPEPY
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CCDS85 FGNSWKVSSQCADTRKVPLDSSPATCHNNIMKQTMVDSSCRILTSDVFQDCNKLVDPEPY
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pF1KB6 LDVCIYDTCSCESIGDCACFCDTIAAYAHVCAQHGKVVTWRTATLCPQSCEERNLRENGY
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CCDS85 LDVCIYDTCSCESIGDCACFCDTIAAYAHVCAQHGKVVTWRTATLCPQSCEERNLRENGY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB6 ECEWRYNSCAPACQVTCQHPEPLACPVQCVEGCHAHCPPGKILDELLQTCVDPEDCPVCE
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CCDS85 ECEWRYNSCAPACQVTCQHPEPLACPVQCVEGCHAHCPPGKILDELLQTCVDPEDCPVCE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB6 VAGRRFASGKKVTLNPSDPEHCQICHCDVVNLTCEACQEPGGLVVPPTDAPVSPTTLYVE
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CCDS85 VAGRRFASGKKVTLNPSDPEHCQICHCDVVNLTCEACQEPGGLVVPPTDAPVSPTTLYVE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB6 DISEPPLHDFYCSRLLDLVFLLDGSSRLSEAEFEVLKAFVVDMMERLRISQKWVRVAVVE
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CCDS85 DISEPPLHDFYCSRLLDLVFLLDGSSRLSEAEFEVLKAFVVDMMERLRISQKWVRVAVVE
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB6 YHDGSHAYIGLKDRKRPSELRRIASQVKYAGSQVASTSEVLKYTLFQIFSKIDRPEASRI
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CCDS85 YHDGSHAYIGLKDRKRPSELRRIASQVKYAGSQVASTSEVLKYTLFQIFSKIDRPEASRI
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KB6 ALLLMASQEPQRMSRNFVRYVQGLKKKKVIVIPVGIGPHANLKQIRLIEKQAPENKAFVL
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CCDS85 TLLLMASQEPQRMSRNFVRYVQGLKKKKVIVIPVGIGPHANLKQIRLIEKQAPENKAFVL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KB6 SSVDELEQQRDEIVSYLCDLAPEAPPPTLPPHMAQVTVGPGLLGVSTLGPKRNSMVLDVA
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CCDS85 SSVDELEQQRDEIVSYLCDLAPEAPPPTLPPDMAQVTVGPGLLGVSTLGPKRNSMVLDVA
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pF1KB6 FVLEGSDKIGEADFNRSKEFMEEVIQRMDVGQDSIHVTVLQYSYMVTVEYPFSEAQSKGD
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CCDS85 FVLEGSDKIGEADFNRSKEFMEEVIQRMDVGQDSIHVTVLQYSYMVTVEYPFSEAQSKGD
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pF1KB6 ILQRVREIRYQGGNRTNTGLALRYLSDHSFLVSQGDREQAPNLVYMVTGNPASDEIKRLP
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CCDS85 ILQRVREIRYQGGNRTNTGLALRYLSDHSFLVSQGDREQAPNLVYMVTGNPASDEIKRLP
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pF1KB6 GDIQVVPIGVGPNANVQELERIGWPNAPILIQDFETLPREAPDLVLQRCCSGEGLQIPTL
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CCDS85 SPAPDCSQPLDVILLLDGSSSFPASYFDEMKSFAKAFISKANIGPRLTQVSVLQYGSITT
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pF1KB6 IDVPWNVVPEKAHLLSLVDVMQREGGPSQIGDALGFAVRYLTSEMHGARPGASKAVVILV
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CCDS85 IDVPWNVVPEKAHLLSLVDVMQREGGPSQIGDALGFAVRYLTSEMHGARPGASKAVVILV
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pF1KB6 TDVSVDSVDAAADAARSNRVTVFPIGIGDRYDAAQLRILAGPAGDSNVVKLQRIEDLPTM
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CCDS85 TDVSVDSVDAAADAARSNRVTVFPIGIGDRYDAAQLRILAGPAGDSNVVKLQRIEDLPTM
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pF1KB6 VTLGNSFLHKLCSGFVRICMDEDGNEKRPGDVWTLPDQCHTVTCQPDGQTLLKSHRVNCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 VTLGNSFLHKLCSGFVRICMDEDGNEKRPGDVWTLPDQCHTVTCQPDGQTLLKSHRVNCD
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB6 RGLRPSCPNSQSPVKVEETCGCRWTCPCVCTGSSTRHIVTFDGQNFKLTGSCSYVLFQNK
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CCDS85 RGLRPSCPNSQSPVKVEETCGCRWTCPCVCTGSSTRHIVTFDGQNFKLTGSCSYVLFQNK
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB6 EQDLEVILHNGACSPGARQGCMKSIEVKHSALSVELHSDMEVTVNGRLVSVPYVGGNMEV
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CCDS85 EQDLEVILHNGACSPGARQGCMKSIEVKHSALSVELHSDMEVTVNGRLVSVPYVGGNMEV
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB6 NVYGAIMHEVRFNHLGHIFTFTPQNNEFQLQLSPKTFASKTYGLCGICDENGANDFMLRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 NVYGAIMHEVRFNHLGHIFTFTPQNNEFQLQLSPKTFASKTYGLCGICDENGANDFMLRD
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB6 GTVTTDWKTLVQEWTVQRPGQTCQPILEEQCLVPDSSHCQVLLLPLFAECHKVLAPATFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GTVTTDWKTLVQEWTVQRPGQTCQPILEEQCLVPDSSHCQVLLLPLFAECHKVLAPATFY
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pF1KB6 AICQQDSCHQEQVCEVIASYAHLCRTNGVCVDWRTPDFCAMSCPPSLVYNHCEHGCPRHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AICQQDSCHQEQVCEVIASYAHLCRTNGVCVDWRTPDFCAMSCPPSLVYNHCEHGCPRHC
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB6 DGNVSSCGDHPSEGCFCPPDKVMLEGSCVPEEACTQCIGEDGVQHQFLEAWVPDHQPCQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 DGNVSSCGDHPSEGCFCPPDKVMLEGSCVPEEACTQCIGEDGVQHQFLEAWVPDHQPCQI
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB6 CTCLSGRKVNCTTQPCPTAKAPTCGLCEVARLRQNADQCCPEYECVCDPVSCDLPPVPHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 CTCLSGRKVNCTTQPCPTAKAPTCGLCEVARLRQNADQCCPEYECVCDPVSCDLPPVPHC
2290 2300 2310 2320 2330 2340
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pF1KB6 ERGLQPTLTNPGECRPNFTCACRKEECKRVSPPSCPPHRLPTLRKTQCCDEYECACNCVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ERGLQPTLTNPGECRPNFTCACRKEECKRVSPPSCPPHRLPTLRKTQCCDEYECACNCVN
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2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB6 STVSCPLGYLASTATNDCGCTTTTCLPDKVCVHRSTIYPVGQFWEEGCDVCTCTDMEDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 STVSCPLGYLASTATNDCGCTTTTCLPDKVCVHRSTIYPVGQFWEEGCDVCTCTDMEDAV
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pF1KB6 MGLRVAQCSQKPCEDSCRSGFTYVLHEGECCGRCLPSACEVVTGSPRGDSQSSWKSVGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MGLRVAQCSQKPCEDSCRSGFTYVLHEGECCGRCLPSACEVVTGSPRGDSQSSWKSVGSQ
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pF1KB6 WASPENPCLINECVRVKEEVFIQQRNVSCPQLEVPVCPSGFQLSCKTSACCPSCRCERME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 WASPENPCLINECVRVKEEVFIQQRNVSCPQLEVPVCPSGFQLSCKTSACCPSCRCERME
2530 2540 2550 2560 2570 2580
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pF1KB6 ACMLNGTVIGPGKTVMIDVCTTCRCMVQVGVISGFKLECRKTTCNPCPLGYKEENNTGEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ACMLNGTVIGPGKTVMIDVCTTCRCMVQVGVISGFKLECRKTTCNPCPLGYKEENNTGEC
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pF1KB6 CGRCLPTACTIQLRGGQIMTLKRDETLQDGCDTHFCKVNERGEYFWEKRVTGCPPFDEHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 CGRCLPTACTIQLRGGQIMTLKRDETLQDGCDTHFCKVNERGEYFWEKRVTGCPPFDEHK
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2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KB6 CLAEGGKIMKIPGTCCDTCEEPECNDITARLQYVKVGSCKSEVEVDIHYCQGKCASKAMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 CLAEGGKIMKIPGTCCDTCEEPECNDITARLQYVKVGSCKSEVEVDIHYCQGKCASKAMY
2710 2720 2730 2740 2750 2760
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pF1KB6 SIDINDVQDQCSCCSPTRTEPMQVALHCTNGSVVYHEVLNAMECKCSPRKCSK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SIDINDVQDQCSCCSPTRTEPMQVALHCTNGSVVYHEVLNAMECKCSPRKCSK
2770 2780 2790 2800 2810
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CCDS59 IVLVRTEDVAPADIVSFLLTAALYKAKAHDPDVVSLEAADRPNFFLHVTANGSLELAKWQ
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pF1KB6 TCEACQEPGGLVVPPT----DAPVSPTTLYVEDISEPPLHDFYCSRLLDLVFLLDGSSRL
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.:. . . .. : .: :: . .. :... . ::. . ::
CCDS59 DEVTQRCV--YLEDCVE----PAVWVPTEAL----GNETLPPSQGLPTPSDEEPQLSQES
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CCDS59 -LPPET-PAAASLSTATDGLAATPFMSLE-STRPSQLLSGLPPDTSLP--LAKVGTSAPV
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CCDS47 EVSYIKAVHVTVFDLSISLLR---GCKVMLNGHRVALPVWLAQGRVTIRLSSNLVLLYTN
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