Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6014
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6014, 698 aa
1>>>pF1KB6014 698 - 698 aa - 698 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2475+/-0.000702; mu= 16.1618+/- 0.043
mean_var=88.8663+/-17.846, 0's: 0 Z-trim(112.3): 26 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.136052
statistics sampled from 13085 (13109) to 13085 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16
Scan time: 4.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35178.1 QSOX2 gene_id:169714|Hs108|chr9 ( 698) 4775 947.1 0
CCDS1337.1 QSOX1 gene_id:5768|Hs108|chr1 ( 747) 1609 325.7 1.6e-88
CCDS30950.1 QSOX1 gene_id:5768|Hs108|chr1 ( 604) 1587 321.3 2.6e-87
>>CCDS35178.1 QSOX2 gene_id:169714|Hs108|chr9 (698 aa)
initn: 4775 init1: 4775 opt: 4775 Z-score: 5061.8 bits: 947.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4775; 100.0% identity (100.0% similar) in 698 aa overlap (1-698:1-698)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAAAGAAVARSPGIGAGPALRARRSPPPRAARLPRLLVLLAAAAVGPGAGGAARLYRAGE
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CCDS35 MAAAGAAVARSPGIGAGPALRARRSPPPRAARLPRLLVLLAAAAVGPGAGGAARLYRAGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DAVWVLDSGSVRGATANSSAAWLVQFYSSWCGHCIGYAPTWRALAGDVRDWASAIRVAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DAVWVLDSGSVRGATANSSAAWLVQFYSSWCGHCIGYAPTWRALAGDVRDWASAIRVAAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DCMEEKNQAVCHDYDIHFYPTFRYFKAFTKEFTTGENFKGPDRELRTVRQTMIDFLQNHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DCMEEKNQAVCHDYDIHFYPTFRYFKAFTKEFTTGENFKGPDRELRTVRQTMIDFLQNHT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 EGSRPPACPRLDPIQPSDVLSLLDNRGSHYVAIVFESNSSYLGREVILDLIPYESIVVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGSRPPACPRLDPIQPSDVLSLLDNRGSHYVAIVFESNSSYLGREVILDLIPYESIVVTR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ALDGDKAFLEKLGVSSVPSCYLIYPNGSHGLINVVKPLRAFFSSYLKSLPDVRKKSLPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ALDGDKAFLEKLGVSSVPSCYLIYPNGSHGLINVVKPLRAFFSSYLKSLPDVRKKSLPLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EKPHKEENSEIVVWREFDKSKLYTVDLESGLHYLLRVELAAHKSLAGAELKTLKDFVTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EKPHKEENSEIVVWREFDKSKLYTVDLESGLHYLLRVELAAHKSLAGAELKTLKDFVTVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AKLFPGRPPVKKLLEMLQEWLASLPLDRIPYNAVLDLVNNKMRISGIFLTNHIKWVGCQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AKLFPGRPPVKKLLEMLQEWLASLPLDRIPYNAVLDLVNNKMRISGIFLTNHIKWVGCQG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 SRSELRGYPCSLWKLFHTLTVEASTHPDALVGTGFEDDPQAVLQTMRRYVHTFFGCKECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SRSELRGYPCSLWKLFHTLTVEASTHPDALVGTGFEDDPQAVLQTMRRYVHTFFGCKECG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 EHFEEMAKESMDSVKTPDQAILWLWKKHNMVNGRLAGHLSEDPRFPKLQWPTPDLCPACH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EHFEEMAKESMDSVKTPDQAILWLWKKHNMVNGRLAGHLSEDPRFPKLQWPTPDLCPACH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 EEIKGLASWDEGHVLTFLKQHYGRDNLLDTYSADQGDSSEGGTLARGEEEEKRLTPPEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EEIKGLASWDEGHVLTFLKQHYGRDNLLDTYSADQGDSSEGGTLARGEEEEKRLTPPEVS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 HGDRDTQSVRPPGALGPRPALPESLHHSLDGKLQSLDGPGAHKEVGGAAPFLGVDFSSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HGDRDTQSVRPPGALGPRPALPESLHHSLDGKLQSLDGPGAHKEVGGAAPFLGVDFSSLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB6 MSLCVVLYVASSLFLMVMYFFFRVRSRRWKVKHHHPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSLCVVLYVASSLFLMVMYFFFRVRSRRWKVKHHHPAV
670 680 690
>>CCDS1337.1 QSOX1 gene_id:5768|Hs108|chr1 (747 aa)
initn: 1645 init1: 554 opt: 1609 Z-score: 1702.9 bits: 325.7 E(32554): 1.6e-88
Smith-Waterman score: 1617; 41.5% identity (67.6% similar) in 620 aa overlap (25-629:8-613)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAAGAAVARSPGIGAGPALRARRSPPPRAARLPRLLVLLAAAAVGPGAGGAAR--LYRA
: :: : ::.:: . :::..: : :: .
CCDS13 MRRCNSGSGPP-----PSLLLLLLWLLAVPGANAAPRSALY-S
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GEDAVWVLDSGSVRGATANSSAAWLVQFYSSWCGHCIGYAPTWRALAGDVRDWASAIRVA
: . .:.. .::::. .: .:: :.:..:::::::..::::.::: ::. : :. .:
CCDS13 PSDPLTLLQADTVRGAVLGSRSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKALAEDVKAWRPALYLA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ALDCMEEKNQAVCHDYDIHFYPTFRYFKAFTKEFTTGENFKGPDRELRTVRQTMIDFLQN
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CCDS13 ALDCAEETNSAVCRDFNIPGFPTVRFFKAFTKN-GSGAVFPVAGADVQTLRERLIDALES
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 HTEGSRPPACPRLDPIQPSDVLSLLDNRGSHYVAIVFESNSSYLGREVILDLIPYESIVV
: . . ::::: :.: . .. ... . .:.:..::...::::::: ::: .....:
CCDS13 HHD-TWPPACPPLEPAKLEEIDGFFARNNEEYLALIFEKGGSYLGREVALDLSQHKGVAV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TRALDGDKAFLEKLGVSSVPSCYLIYPNGSHGLINVVKPLRAFFSSYLKSLPDVRKKSLP
:.:. . ..:.::.. :::::.. ::: . . :. :.:...::. : . ...
CCDS13 RRVLNTEANVVRKFGVTDFPSCYLLFRNGSVSRVPVLMESRSFYTAYLQRLSGLTREAAQ
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LPEKPHKEENSEIVVWREFDKSKLYTVDLESGLHYLLRVELAAHKSLAGAELKTLKDFVT
: .. .::. :.::.: .::::.:::.::.:.. : : .: .:: ::.
CCDS13 TTVAPTTANKIAPTVWKLADRSKIYMADLESALHYILRIEVGRFPVLEGQRLVALKKFVA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VLAKLFPGRPPVKKLLEMLQEWLASLPLDRIPYNAVLDLVNNKMRISGIFLTNHIKWVGC
:::: ::::: :...:. ..::: ..:::. ... : : :.....:.::
CCDS13 VLAKYFPGRPLVQNFLHSVNEWLKRQKRNKIPYSFFKTALDD--RKEGAVLAKKVNWIGC
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 QGSRSELRGYPCSLWKLFHTLTVEASTHPDALVGTGFEDDPQAVLQTMRRYVHTFFGCKE
:::. ..::.::::: ::: :::.:. . . . . :: ..: ::: ::::..
CCDS13 QGSEPHFRGFPCSLWVLFHFLTVQAARQ--NVDHSQEAAKAKEVLPAIRGYVHYFFGCRD
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 CGEHFEEMAKESMDSVKTPDQAILWLWKKHNMVNGRLAGHLSEDPRFPKLQWPTPDLCPA
:. :::.:: :: : .:. :.::::..:: ::.:::: ::::.:::.::: .:: :
CCDS13 CASHFEQMAAASMHRVGSPNAAVLWLWSSHNRVNARLAGAPSEDPQFPKVQWPPRELCSA
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 CHEEIKGLASWDEGHVLTFLKQHYGRDNLLDTYSA-------DQGDSSEGGTLARGEEE-
::.: . :: .:.::: :.. .:.. . : : . . . :: : :
CCDS13 CHNERLDVPVWDVEATLNFLKAHFSPSNIILDFPAAGSAARRDVQNVAAAPELAMGALEL
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640
pF1KB6 EKR---LTP--PEVSHGDRDTQSVRPPGALGPRPALPESLHHSLDGKLQSLDGPGAHKEV
:.: : : ::. .. .: : : ::. . : .:: .:
CCDS13 ESRNSTLDPGKPEMMKSPTNTTPHVP--AEGPEASRPPKLHPGLRAAPGQEPPEHMAELQ
580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KB6 GGAAPFLGVDFSSLDMSLCVVLYVASSLFLMVMYFFFRVRSRRWKVKHHHPAV
CCDS13 RNEQEQPLGQWHLSKRDTGAALLAESRAEKNRLWGPLEVRRVGRSSKQLVDIPEGQLEAR
630 640 650 660 670 680
>>CCDS30950.1 QSOX1 gene_id:5768|Hs108|chr1 (604 aa)
initn: 1531 init1: 554 opt: 1587 Z-score: 1681.0 bits: 321.3 E(32554): 2.6e-87
Smith-Waterman score: 1596; 41.1% identity (68.7% similar) in 603 aa overlap (25-624:8-588)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAAGAAVARSPGIGAGPALRARRSPPPRAARLPRLLVLLAAAAVGPGAGGAAR--LYRA
: :: : ::.:: . :::..: : :: .
CCDS30 MRRCNSGSGPP-----PSLLLLLLWLLAVPGANAAPRSALY-S
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 GEDAVWVLDSGSVRGATANSSAAWLVQFYSSWCGHCIGYAPTWRALAGDVRDWASAIRVA
: . .:.. .::::. .: .:: :.:..:::::::..::::.::: ::. : :. .:
CCDS30 PSDPLTLLQADTVRGAVLGSRSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKALAEDVKAWRPALYLA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ALDCMEEKNQAVCHDYDIHFYPTFRYFKAFTKEFTTGENFKGPDRELRTVRQTMIDFLQN
:::: :: :.:::.:..: .:: :.::::::. .: : ...:.:. .:: :..
CCDS30 ALDCAEETNSAVCRDFNIPGFPTVRFFKAFTKN-GSGAVFPVAGADVQTLRERLIDALES
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 HTEGSRPPACPRLDPIQPSDVLSLLDNRGSHYVAIVFESNSSYLGREVILDLIPYESIVV
: . . ::::: :.: . .. ... . .:.:..::...::::::: ::: .....:
CCDS30 HHD-TWPPACPPLEPAKLEEIDGFFARNNEEYLALIFEKGGSYLGREVALDLSQHKGVAV
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 TRALDGDKAFLEKLGVSSVPSCYLIYPNGSHGLINVVKPLRAFFSSYLKSLPDVRKKSLP
:.:. . ..:.::.. :::::.. ::: . . :. :.:...::. : . ...
CCDS30 RRVLNTEANVVRKFGVTDFPSCYLLFRNGSVSRVPVLMESRSFYTAYLQRLSGLTREAAQ
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LPEKPHKEENSEIVVWREFDKSKLYTVDLESGLHYLLRVELAAHKSLAGAELKTLKDFVT
: .. .::. :.::.: .::::.:::.::.:.. : : .: .:: ::.
CCDS30 TTVAPTTANKIAPTVWKLADRSKIYMADLESALHYILRIEVGRFPVLEGQRLVALKKFVA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 VLAKLFPGRPPVKKLLEMLQEWLASLPLDRIPYNAVLDLVNNKMRISGIFLTNHIKWVGC
:::: ::::: :...:. ..::: ..:::. ... : : :.....:.::
CCDS30 VLAKYFPGRPLVQNFLHSVNEWLKRQKRNKIPYSFFKTALDD--RKEGAVLAKKVNWIGC
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 QGSRSELRGYPCSLWKLFHTLTVEASTHPDALVGTGFEDDPQAVLQTMRRYVHTFFGCKE
:::. ..::.::::: ::: :::.:. . . . . :: ..: ::: ::::..
CCDS30 QGSEPHFRGFPCSLWVLFHFLTVQAARQ--NVDHSQEAAKAKEVLPAIRGYVHYFFGCRD
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 CGEHFEEMAKESMDSVKTPDQAILWLWKKHNMVNGRLAGHLSEDPRFPKLQWPTPDLCPA
:. :::.:: :: : .:. :.::::..:: ::.:::: ::::.:::.::: .:: :
CCDS30 CASHFEQMAAASMHRVGSPNAAVLWLWSSHNRVNARLAGAPSEDPQFPKVQWPPRELCSA
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 CHEEIKGLASWDEGHVLTFLKQHYGRDNLLDTYSADQGDSSEGGTLARGEEEEKRLTPPE
::.: . :: .:.::: :.. .:.. . : .:. :: .. .. . ::
CCDS30 CHNERLDVPVWDVEATLNFLKAHFSPSNIILDFPA-------AGSAAR-RDVQNVAAAPE
520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 VSHGDRDTQSVRPPGALGP-RPALPESLHHSLDGKLQSLDGPGAHKEVGGAAPFLGVDFS
.. : . .: ..: : .: . .:
CCDS30 LAMGALELESRN--STLDPGKPEMMKSPTNTTPHVPAEGPELI
570 580 590 600
698 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 07:22:08 2016 done: Sat Nov 5 07:22:09 2016
Total Scan time: 4.390 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]