Result of FASTA (omim) for
pF1KB6016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6016, 941 aa
1>>>pF1KB6016 941 - 941 aa - 941 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4894+/-0.00035; mu= 11.9983+/- 0.022
mean_var=149.8984+/-30.790, 0's: 0 Z-trim(119.3): 83 B-trim: 251 in 1/55
Lambda= 0.104755
statistics sampled from 32987 (33081) to 32987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 11.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001171827 (OMIM: 300263,300560) histone lysine ( 878) 2065 324.5 1.5e-87
NP_001171826 (OMIM: 300263,300560) histone lysine ( 948) 2051 322.4 6.9e-87
XP_005262057 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist ( 984) 2051 322.4 7.1e-87
XP_016884851 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1024) 2044 321.3 1.5e-86
NP_055922 (OMIM: 300263,300560) histone lysine dem (1024) 2044 321.3 1.5e-86
XP_005262054 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 2044 321.3 1.6e-86
XP_005262056 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 2044 321.3 1.6e-86
XP_016884850 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 2044 321.3 1.6e-86
NP_001171825 (OMIM: 300263,300560) histone lysine (1060) 2044 321.3 1.6e-86
XP_011529080 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1085) 2044 321.3 1.6e-86
XP_005262053 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1085) 2044 321.3 1.6e-86
NP_005383 (OMIM: 604351) lysine-specific demethyla (1096) 1934 304.7 1.6e-81
XP_005252108 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-spec (1097) 1934 304.7 1.6e-81
XP_006717206 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-spec (1062) 1238 199.5 7.4e-50
NP_001005366 (OMIM: 609078) lysine-specific demeth (1265) 620 106.2 1.1e-21
XP_005254013 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1299) 620 106.2 1.1e-21
XP_005254012 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1305) 620 106.2 1.1e-21
NP_115979 (OMIM: 609078) lysine-specific demethyla (1336) 620 106.2 1.1e-21
XP_011537171 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1337) 620 106.2 1.2e-21
XP_011537170 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1339) 620 106.2 1.2e-21
XP_011537169 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1353) 620 106.2 1.2e-21
XP_006718543 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1067) 615 105.4 1.6e-21
XP_011543162 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1134) 615 105.4 1.7e-21
XP_016872880 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145) 615 105.4 1.7e-21
XP_016872881 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145) 615 105.4 1.7e-21
NP_036440 (OMIM: 605657) lysine-specific demethyla (1162) 615 105.4 1.7e-21
NP_071388 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator ( 562) 254 50.6 2.6e-05
NP_542986 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator ( 562) 254 50.6 2.6e-05
NP_542987 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator (1189) 254 50.9 4.7e-05
NP_001180299 (OMIM: 604140) death-inducer oblitera (1189) 254 50.9 4.7e-05
XP_011526811 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2240) 254 51.0 7.7e-05
NP_149072 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator (2240) 254 51.0 7.7e-05
NP_001180298 (OMIM: 604140) death-inducer oblitera (2240) 254 51.0 7.7e-05
XP_011526809 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276) 254 51.1 7.8e-05
XP_011526808 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276) 254 51.1 7.8e-05
XP_011526810 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276) 254 51.1 7.8e-05
XP_011526807 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276) 254 51.1 7.8e-05
XP_011526806 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276) 254 51.1 7.8e-05
XP_016881207 (OMIM: 609150) PREDICTED: CXXC-type z ( 656) 225 46.3 0.00061
NP_055408 (OMIM: 609150) CXXC-type zinc finger pro ( 656) 225 46.3 0.00061
XP_011524242 (OMIM: 609150) PREDICTED: CXXC-type z ( 660) 225 46.3 0.00062
NP_001095124 (OMIM: 609150) CXXC-type zinc finger ( 660) 225 46.3 0.00062
XP_011522826 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2188) 231 47.6 0.00084
XP_016879843 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2327) 231 47.6 0.00088
XP_005257217 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2961) 231 47.7 0.0011
XP_011522825 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2977) 231 47.7 0.0011
XP_005257216 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3015) 231 47.7 0.0011
XP_011522824 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3031) 231 47.7 0.0011
XP_005257215 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3032) 231 47.7 0.0011
XP_005257214 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3094) 231 47.7 0.0011
>>NP_001171827 (OMIM: 300263,300560) histone lysine deme (878 aa)
initn: 2089 init1: 1635 opt: 2065 Z-score: 1692.8 bits: 324.5 E(85289): 1.5e-87
Smith-Waterman score: 2080; 44.2% identity (69.3% similar) in 796 aa overlap (37-813:5-787)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
NP_001 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
NP_001 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
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NP_001 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
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NP_001 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
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NP_001 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
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NP_001 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
NP_001 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
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NP_001 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
. :. . :. .: : : :: .: .: .. . .. :. .:..:. :
NP_001 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRL---SLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAE
460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
: . :. :... .:. . . .. . . . .: ..: . : .:
NP_001 RKGKESSALGPA--GQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLD
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDIS
.: . ..: .: . .. .. : . ...:. :. .:.
NP_001 GNESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAE-QVMEDEFDLDSDDELQID
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710
pF1KB6 ESEDSGPECTALKSIFTTE--ESESSGDEKK----QEITSNFKEESNVMRNFLQKSQK-P
: . .. : . ... .: .. :. ...:. .. ..... .
NP_001 ERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGYQ
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KB6 SRSEIPIK--RECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDP
. . : . : :.: ::.: :::::: ::.:. :. ..:. .:. : .
NP_001 TATPAPAQGASEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS
690 700 710 720 730 740
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pF1KB6 SSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKC
:: : :: . : .:.. . .::. . . .. . . :.
NP_001 SSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPS
750 760 770 780 790 800
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pF1KB6 IRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSF
NP_001 LESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAA
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>>NP_001171826 (OMIM: 300263,300560) histone lysine deme (948 aa)
initn: 2243 init1: 1633 opt: 2051 Z-score: 1680.9 bits: 322.4 E(85289): 6.9e-87
Smith-Waterman score: 2165; 42.0% identity (67.4% similar) in 955 aa overlap (37-935:5-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
NP_001 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
NP_001 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
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NP_001 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
NP_001 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
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NP_001 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
NP_001 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
NP_001 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKS
.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .: . .
NP_001 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGACLN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB6 QGIPIVCPVSRSSNEATSPYH------SRRKMRKL-RDHNVRTPSNLDILELHTREVLK-
.. .. ..:: :: : .....: ... .. ...: .: ...:..
NP_001 DSDDDSPDLDLDGNE--SPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMED
460 470 480 490 500
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pF1KB6 RLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEW--RAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFA
.... .: .. .: :: . : :. ::: . .:. :.:
NP_001 EFDLDSDDELQIDERL-GKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCS-----DPNRV----REP--
510 520 530 540 550
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pF1KB6 DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGV-EHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSS
. . . . :. .. .. :. ..::. :. . .... ..: .. .: . :
NP_001 GEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPS
560 570 580 590 600 610
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pF1KB6 GYSDIS--------ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNF
:. .: .:.: ..:.. .: ...:::. .:.. ::
NP_001 TQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS-----SSGLGTVSNS----
620 630 640 650 660
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pF1KB6 LQKSQK-PSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQ---IQSTDCSGE
::. :.. :::: : .::: .. :. ..:.. : . . .
NP_001 -PASQRTPGKR--PIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQD-SLGACFKDAEYIYPSLESDDD
670 680 690 700 710 720
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pF1KB6 RNSLQD-PSSCHGSNH-----EVR---QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDT
.:.. :.. ..:. ..: : . :.::. : .: . . : ...
NP_001 DPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAA-------
730 740 750 760 770
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pF1KB6 SRFHPQDLSRSQKC--IRKEGS-SEISQ-RVQSRNY---VDSSGSSLQNGKYMQNSNLTS
... :.:...:: :.:. .:. : : :. : : . . ..: :
NP_001 AKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPP
780 790 800 810 820 830
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pF1KB6 GA--CQISNGSLSPE----RP----VGETSFSV-PLHP-----TKRPASNPPPISNQATK
. .:::. . :: ..... :. :. : .::. . :::: .
NP_001 PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQ--SNQAGQ
840 850 860 870 880 890
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pF1KB6 GKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
:::::::.::::::::.:::..:::
NP_001 GKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
900 910 920 930 940
>>XP_005262057 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone (984 aa)
initn: 2243 init1: 1633 opt: 2051 Z-score: 1680.6 bits: 322.4 E(85289): 7.1e-87
Smith-Waterman score: 2165; 42.0% identity (67.4% similar) in 955 aa overlap (37-935:41-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
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70 80 90 100 110 120
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:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
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80 90 100 110 120
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::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
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130 140 150 160 170 180
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::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
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190 200 210 220 230 240
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.::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
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250 260 270 280 290 300
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::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
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310 320 330 340 350 360
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::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
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370 380 390 400 410 420
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.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .: . .
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430 440 450 460 470 480
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.. .. ..:: :: : .....: ... .. ...: .: ...:..
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490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 RLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEW--RAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFA
.... .: .. .: :: . : :. ::: . .:. :.:
XP_005 EFDLDSDDELQIDERL-GKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCS-----DPNRV----REP--
550 560 570 580 590
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. . . . :. .. .. :. ..::. :. . .... ..: .. .: . :
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600 610 620 630 640 650
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pF1KB6 GYSDIS--------ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNF
:. .: .:.: ..:.. .: ...:::. .:.. ::
XP_005 TQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS-----SSGLGTVSNS----
660 670 680 690 700
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pF1KB6 LQKSQK-PSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQ---IQSTDCSGE
::. :.. :::: : .::: .. :. ..:.. : . . .
XP_005 -PASQRTPGKR--PIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQD-SLGACFKDAEYIYPSLESDDD
710 720 730 740 750
770 780 790 800 810
pF1KB6 RNSLQD-PSSCHGSNH-----EVR---QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDT
.:.. :.. ..:. ..: : . :.::. : .: . . : ...
XP_005 DPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAA-------
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860
pF1KB6 SRFHPQDLSRSQKC--IRKEGS-SEISQ-RVQSRNY---VDSSGSSLQNGKYMQNSNLTS
... :.:...:: :.:. .:. : : :. : : . . ..: :
XP_005 AKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPP
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900 910
pF1KB6 GA--CQISNGSLSPE----RP----VGETSFSV-PLHP-----TKRPASNPPPISNQATK
. .:::. . :: ..... :. :. : .::. . :::: .
XP_005 PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQ--SNQAGQ
880 890 900 910 920 930
920 930 940
pF1KB6 GKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
:::::::.::::::::.:::..:::
XP_005 GKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
940 950 960 970 980
>>XP_016884851 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone (1024 aa)
initn: 2245 init1: 1635 opt: 2044 Z-score: 1674.7 bits: 321.3 E(85289): 1.5e-86
Smith-Waterman score: 2107; 45.6% identity (68.5% similar) in 820 aa overlap (37-813:5-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
XP_016 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
XP_016 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
XP_016 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
XP_016 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
.::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
XP_016 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
XP_016 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
XP_016 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .:. .: ::
XP_016 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
. :. . :. .: : : :: .: .: ..: ..: :: . :
XP_016 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
: . : . : : . .:.:.: :. :. :. :.
XP_016 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
: ::..:: :. :..: .: :.. :.. :.. . ...:.: :
XP_016 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
.:.. . : .: :.. :: .. .. : .. .::.:. : :
XP_016 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
: .: . .... ..:. :.. . . : :.: ::.: :::::: ::.:. :
XP_016 GK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSS
680 690 700 710 720 730
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pF1KB6 TC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLR
. ..:. .:. : . :: : :: . : .:.. . .::. . .
XP_016 SSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEE
740 750 760 770 780 790
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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
.. . . :.
XP_016 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
800 810 820 830 840 850
>>NP_055922 (OMIM: 300263,300560) histone lysine demethy (1024 aa)
initn: 2245 init1: 1635 opt: 2044 Z-score: 1674.7 bits: 321.3 E(85289): 1.5e-86
Smith-Waterman score: 2107; 45.6% identity (68.5% similar) in 820 aa overlap (37-813:5-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
NP_055 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
NP_055 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
NP_055 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
NP_055 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
.::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
NP_055 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
NP_055 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
NP_055 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .:. .: ::
NP_055 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
. :. . :. .: : : :: .: .: ..: ..: :: . :
NP_055 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
: . : . : : . .:.:.: :. :. :. :.
NP_055 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
: ::..:: :. :..: .: :.. :.. :.. . ...:.: :
NP_055 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
570 580 590 600 610 620
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pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
.:.. . : .: :.. :: .. .. : .. .::.:. : :
NP_055 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
: .: . .... ..:. :.. . . : :.: ::.: :::::: ::.:. :
NP_055 GK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSS
680 690 700 710 720 730
750 760 770 780 790 800
pF1KB6 TC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLR
. ..:. .:. : . :: : :: . : .:.. . .::. . .
NP_055 SSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEE
740 750 760 770 780 790
810 820 830 840 850 860
pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
.. . . :.
NP_055 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
800 810 820 830 840 850
>>XP_005262054 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone (1049 aa)
initn: 2245 init1: 1635 opt: 2044 Z-score: 1674.5 bits: 321.3 E(85289): 1.6e-86
Smith-Waterman score: 2107; 45.6% identity (68.5% similar) in 820 aa overlap (37-813:5-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
XP_005 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
XP_005 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
XP_005 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
XP_005 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
.::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
XP_005 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
XP_005 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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