FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6102, 614 aa 1>>>pF1KB6102 614 - 614 aa - 614 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1141+/-0.000905; mu= 4.2228+/- 0.055 mean_var=234.5815+/-49.398, 0's: 0 Z-trim(114.7): 22 B-trim: 742 in 2/52 Lambda= 0.083739 statistics sampled from 15246 (15265) to 15246 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.469), width: 16 Scan time: 3.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46590.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 ( 595) 3976 493.2 4.1e-139 CCDS13221.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 ( 604) 3976 493.2 4.1e-139 CCDS56544.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 615) 2568 323.1 6.7e-88 CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 567) 2563 322.5 9.5e-88 CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 577) 2563 322.5 9.6e-88 CCDS75767.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 584) 2563 322.5 9.7e-88 CCDS6256.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 604) 2563 322.5 1e-87 CCDS75766.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 ( 663) 2563 322.5 1.1e-87 CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 ( 567) 1204 158.3 2.5e-38 CCDS10972.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 ( 653) 1056 140.5 6.8e-33 >>CCDS46590.1 CBFA2T2 gene_id:9139|Hs108|chr20 (595 aa) initn: 3976 init1: 3976 opt: 3976 Z-score: 2611.1 bits: 493.2 E(32554): 4.1e-139 Smith-Waterman score: 3976; 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64.8% identity (84.6% similar) in 585 aa overlap (33-611:39-612) 10 20 30 40 50 pF1KB6 FHHVGQARLELLTSGDLPALASQRAGITVGPEKRVP---AMPGSPVEVKIQSRSSPPTMP :: :. .:: :::.:: ::: .::::: CCDS56 TSDKLQCVFNEYKAAVWVPPRPRPLSRAPLPEDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 PLPPINPGGPRPVSFTPTALSNGINHSPPTLNGAPSPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPA : :: . :.:: :::::.:.:: .::: .::::::::. :::::.::.::.:.::::: CCDS56 P-PPTTQGAPRTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB6 TCGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFP .:::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::: ::::::::: CCDS56 ACGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB6 LRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEV ::::::::::::::::::::::::: :::.:.:::::::.:::..: .::.::::::..: CCDS56 LRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB6 HGNGKRPSPERREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPP . :::: .:.: .::.:::. . : :.:: :::::. :.:: . ..:.: ::::: CCDS56 NENGKRRTPDRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLS-YQPNGLPHPTPP 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 PLQHYTLEDIATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWK : ::: :.:.: .: ::. . ::..:::.. .::.: :.:..:::::.::::.::: CCDS56 PPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB6 HLDHALNCIMEMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTELRKTG--TELVSRQ :::: :::::.::::::::..:::::::.:::::::: :::.. .:.: : . ::: CCDS56 HLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQ 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB6 HSPGSADSLSNDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKA .:: . : .. :..::: ::..:::: :.:::.:::::.:: :::.:.::::.:::.:: CCDS56 QSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKA 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KB6 FEVIATERARMEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYC ..:.::::.::.:.:..::::::::. :::.::.:.:.:::::::::::::::: :::: CCDS56 HDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYC 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB6 GSFCQHKDWERHHRLCGQNLHGQSPHGQG-RPLLPVGRGSSARSADCSVPSPALDKTSAT ::::::::::.::..:::.:..:. :: : . ::. . . .. :: .: :. CCDS56 GSFCQHKDWEKHHHICGQTLQAQQ---QGDTPAV-----SSSVTPNSGAGSP-MDTPPAA 550 560 570 580 590 600 610 pF1KB6 TSRSSTPASVTAIDTNGL : ::.::.. ..:.: CCDS56 TPRSTTPGTPSTIETTPR 600 610 >>CCDS6257.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (567 aa) initn: 1899 init1: 1141 opt: 2563 Z-score: 1688.8 bits: 322.5 E(32554): 9.5e-88 Smith-Waterman score: 2563; 65.4% identity (85.2% similar) in 575 aa overlap (40-611:1-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 RLELLTSGDLPALASQRAGITVGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPPLPPINPGGP :: :::.:: ::: .:::::: :: . :.: CCDS62 MPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP-PPTTQGAP 10 20 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 RPVSFTPTALSNGINHSPPTLNGAPSPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKL : :::::.:.:: .::: .::::::::. :::::.::.::.:.::::: .::::::::: CCDS62 RTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKL 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 KRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLK ::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::: ::::::::::::::::::: CCDS62 KRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLK 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 ANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPE ::::::::::::::: :::.:.:::::::.:::..: .::.::::::..:. :::: .:. CCDS62 ANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPD 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 RREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDI : .::.:::. . : :.:: :::::. :.:: . ..:.: :::::: ::: :.:. CCDS62 RTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLS-YQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDM 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 ATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIM : .: ::. . ::..:::.. .::.: :.:..:::::.::::.::::::: ::::: CCDS62 AIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIM 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 EMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTELRKTG--TELVSRQHSPGSADSLS .::::::::..:::::::.:::::::: :::.. .:.: : . :::.:: . : .. CCDS62 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVA 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 NDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERAR :..::: ::..:::: :.:::.:::::.:: :::.:.::::.:::.:: ..:.::::. CCDS62 LDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAK 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 MEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWE ::.:.:..::::::::. :::.::.:.:.:::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS62 MERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWE 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 RHHRLCGQNLHGQSPHGQG-RPLLPVGRGSSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASV .::..:::.:..:. :: : . ::. . . .. :: .: :.: ::.::.. CCDS62 KHHHICGQTLQAQQ---QGDTPAV-----SSSVTPNSGAGSP-MDTPPAATPRSTTPGTP 510 520 530 540 550 610 pF1KB6 TAIDTNGL ..:.: CCDS62 STIETTPR 560 >>CCDS47891.1 RUNX1T1 gene_id:862|Hs108|chr8 (577 aa) initn: 1899 init1: 1141 opt: 2563 Z-score: 1688.7 bits: 322.5 E(32554): 9.6e-88 Smith-Waterman score: 2563; 65.4% identity (85.2% similar) in 575 aa overlap (40-611:11-574) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 RLELLTSGDLPALASQRAGITVGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPPLPPINPGGP :: :::.:: ::: .:::::: :: . :.: CCDS47 MPDRTEKHSTMPDSPVDVKTQSRLTPPTMPP-PPTTQGAP 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 RPVSFTPTALSNGINHSPPTLNGAPSPPQRFSNGPASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKL : :::::.:.:: .::: .::::::::. :::::.::.::.:.::::: .::::::::: CCDS47 RTSSFTPTTLTNGTSHSPTALNGAPSPPNGFSNGPSSSSSSSLANQQLPPACGARQLSKL 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 KRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALVNSTVTIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLK ::::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::: ::::::::::::::::::: CCDS47 KRFLTTLQQFGNDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLK 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 ANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEHLLLNTSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPE ::::::::::::::: :::.:.:::::::.:::..: .::.::::::..:. :::: .:. CCDS47 ANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPD 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 RREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDI : .::.:::. . : :.:: :::::. :.:: . ..:.: :::::: ::: :.:. CCDS47 RTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLS-YQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDM 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 ATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIM : .: ::. . ::..:::.. .::.: :.:..:::::.::::.::::::: ::::: CCDS47 AIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIM 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 EMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTELRKTG--TELVSRQHSPGSADSLS .::::::::..:::::::.:::::::: :::.. .:.: : . :::.:: . : .. CCDS47 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVA 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 NDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERAR :..::: ::..:::: :.:::.:::::.:: :::.:.::::.:::.:: ..:.::::. CCDS47 LDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAK 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 MEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWE ::.:.:..::::::::. :::.::.:.:.:::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS47 MERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWE 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 RHHRLCGQNLHGQSPHGQG-RPLLPVGRGSSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASV .::..:::.:..:. :: : . ::. . . .. :: .: :.: ::.::.. 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CCDS75 ANLPLLQRELLHCARLAKQNPAQYLAQHEQLLLDASTTSPVDSSELLLDVNENGKRRTPD 250 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 RREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDI : .::.:::. . : :.:: :::::. :.:: . ..:.: :::::: ::: :.:. CCDS75 RTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRYSPNNGLS-YQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDM 310 320 330 340 350 360 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 ATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDELVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIM : .: ::. . ::..:::.. .::.: :.:..:::::.::::.::::::: ::::: CCDS75 AIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIM 370 380 390 400 410 420 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 EMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNENTELRKTG--TELVSRQHSPGSADSLS .::::::::..:::::::.:::::::: :::.. .:.: : . :::.:: . : .. CCDS75 DMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVA 430 440 450 460 470 480 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 NDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTEEAVNKVKIQAMSEVQKAVAEAEQKAFEVIATERAR :..::: ::..:::: :.:::.:::::.:: :::.:.::::.:::.:: ..:.::::. CCDS75 LDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAK 490 500 510 520 530 540 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 MEQTIADVKRQAAEDAFLVINEQEESTENCWNCGRKASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWE ::.:.:..::::::::. :::.::.:.:.:::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS75 MERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWE 550 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 600 pF1KB6 RHHRLCGQNLHGQSPHGQG-RPLLPVGRGSSARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASV .::..:::.:..:. :: : . ::. . . .. :: .: :.: ::.::.. CCDS75 KHHHICGQTLQAQQ---QGDTPAV-----SSSVTPNSGAGSP-MDTPPAATPRSTTPGTP 610 620 630 640 650 610 pF1KB6 TAIDTNGL ..:.: CCDS75 STIETTPR 660 >>CCDS10973.1 CBFA2T3 gene_id:863|Hs108|chr16 (567 aa) initn: 2366 init1: 1073 opt: 1204 Z-score: 801.5 bits: 158.3 E(32554): 2.5e-38 Smith-Waterman score: 2330; 60.7% identity (81.1% similar) in 578 aa overlap (40-611:1-564) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 RLELLTSGDLPALASQRAGITVGPEKRVPAMPGSPVEVKIQSRSSPPTMPPLPPI-NPGG :: ::.::: : ::.::.::: :: . :. 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