Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6110
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6110, 628 aa
1>>>pF1KB6110 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7687+/-0.000822; mu= 9.9026+/- 0.050
mean_var=165.2843+/-33.506, 0's: 0 Z-trim(114.5): 14 B-trim: 388 in 1/51
Lambda= 0.099760
statistics sampled from 15034 (15045) to 15034 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.781), E-opt: 0.2 (0.462), width: 16
Scan time: 4.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 ( 628) 4294 629.9 3.1e-180
CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 651) 2303 343.4 5.7e-94
CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 653) 2282 340.4 4.7e-93
CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 621) 1813 272.8 9.4e-73
CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 572) 1768 266.3 7.8e-71
CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19 ( 510) 1455 221.2 2.6e-57
CCDS7357.1 ZMIZ1 gene_id:57178|Hs108|chr10 (1067) 387 67.8 8.6e-11
>>CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 (628 aa)
initn: 4294 init1: 4294 opt: 4294 Z-score: 3349.4 bits: 629.9 E(32554): 3.1e-180
Smith-Waterman score: 4294; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
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CCDS72 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAPIPPTLLAPGTLLGPKREVDMHPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAPIPPTLLAPGTLLGPKREVDMHPPLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQILTSREVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQILTSREVLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHLQSFDAALYLQMNEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHLQSFDAALYLQMNEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PGYGLDGLQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDLPPTKKHCSVTSAAIPALPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PGYGLDGLQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDLPPTKKHCSVTSAAIPALPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 SKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 HYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPG
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 GALREGHGGPLPSGPSLTGCRSDIISLD
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GALREGHGGPLPSGPSLTGCRSDIISLD
610 620
>>CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (651 aa)
initn: 1958 init1: 1388 opt: 2303 Z-score: 1800.5 bits: 343.4 E(32554): 5.7e-94
Smith-Waterman score: 2375; 57.9% identity (78.4% similar) in 663 aa overlap (1-628:1-651)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
::. .:::.::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:.::::::::
CCDS45 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TLLAPGTLLGP
::::::.: . :.:::. .. .::. :. :.: :: : . : : .::::
CCDS45 YRRRFPQKIMTPADLSIPNV--HSSPM--PATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGP
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTP
:.:... : : .:::::. .. ::::.. :::.::.::: .::::.:. :.:::::
CCDS45 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 QQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYL
:::::: .: .. :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::::
CCDS45 QQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 PPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLL
::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .::
CCDS45 PPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 QKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHL
:.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
CCDS45 QRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
: :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.:
CCDS45 QCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL
::. :::..:: . :.:: :... .. . :...::::::::::.::::::.
CCDS45 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 PPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAF
:. :. : : . : ..::.:. :: : : :.:.. .. ..... ...: :
CCDS45 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KB6 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL
:. :.::::.: ::. ..:::. :.... :.:: : ..:: : .. . ::
CCDS45 HMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QMFL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KB6 GPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSDII
:. ::. .: . : ::.:. ...:::.:. . . :. : :::
CCDS45 DQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDII
600 610 620 630 640
pF1KB6 SLD
:::
CCDS45 SLD
650
>>CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (653 aa)
initn: 1937 init1: 1388 opt: 2282 Z-score: 1784.2 bits: 340.4 E(32554): 4.7e-93
Smith-Waterman score: 2354; 57.8% identity (78.4% similar) in 657 aa overlap (7-628:9-653)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIK
.:.::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:.::::::
CCDS81 MFTLQDSYVKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB6 ELYRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TLLAPGTLL
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CCDS81 ELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVH--SSPM--PATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 GPKREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFAL
:::.:... : : .:::::. .. ::::.. :::.::.::: .::::.:. :.:::
CCDS81 GPKHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TPQQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPG
:::::::: .: .. :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::
CCDS81 TPQQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 YLPPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGT
::::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .
CCDS81 YLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 LLQKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCA
:::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.
CCDS81 LLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 HLQSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGS
::: :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.
CCDS81 HLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB6 WCPMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEE
: ::. :::..:: . :.:: :... .. . :...::::::::::.::::::
CCDS81 WAPMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEE
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 DLPPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPP
. :. :. : : . : ..::.:. :: : : :.:.. .. ..... ...:
CCDS81 EEEPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRH
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KB6 AF---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSH
: :. :.::::.: ::. ..:::. :.... :.:: : ..:: : .. .
CCDS81 PFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QM
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 FLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSD
:: :. ::. .: . : ::.:. ...:::.:. . . :. : :
CCDS81 FLDQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPD
600 610 620 630 640
pF1KB6 IISLD
:::::
CCDS81 IISLD
650
>>CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (621 aa)
initn: 2079 init1: 1568 opt: 1813 Z-score: 1419.7 bits: 272.8 E(32554): 9.4e-73
Smith-Waterman score: 2168; 59.6% identity (77.7% similar) in 579 aa overlap (1-550:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
::.. ::..:: :::::::::::::::::::::::.:: .:::::::.:.:.::.::.::
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLS-----LLSLPPGTSPVGSPGPLAPI---PPTLLAP-------GT
::::.:: : :::: ..:: :.::: .: : : : ..: :.
CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 LL----GPKREVDM-HPPLPQPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHF
.: : :... ::.: :::::: .: ::::.: ::.::.:...: :::.: :
CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIP-PVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFF
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TFALTPQQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLC
::::::::..: ::. :::.. :::.:::::.:: :::::::: .: .: .::::::
CCDS32 IFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 PLPGYLPPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQL
::::: :: ::: : :::.::.::: :.:::..::: : ..:.::.:.:::.::::::::
CCDS32 PLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TAGTLLQKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRA
:.. :::.:. ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS32 TSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LTCAHLQSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFM
.::.::: :::::::::::::::: :::::::: :::::.::::::::..::: :::.:.
CCDS32 VTCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB6 EDGSWCPMKPKKEASEVCPPPGYGLDG--LQYSPVQGGDPSE-NKKKVEVIDLTIESSSD
::::::::.::::: .: : ... . .: . :: .::::.:::::::::::
CCDS32 EDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSD
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 EEDLPPTKKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLS------SL
::. ::.:..: . . . : .:::: .::::: : :.. .. . :.
CCDS32 EEEDPPAKRKC-IFMSETQSSP-TKGVLM--YQPSSV-RVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSV
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 PLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLG
:.: . : ...:. :::..:.. .. :. : . ::
CCDS32 PFH-HTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESST
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KB6 PLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPSGPSLTGCRSDIISLD
CCDS32 HVSSSSSRSETGVITSSGSNIPDIISLD
600 610 620
>>CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (572 aa)
initn: 2113 init1: 1568 opt: 1768 Z-score: 1385.2 bits: 266.3 E(32554): 7.8e-71
Smith-Waterman score: 2123; 60.7% identity (78.1% similar) in 557 aa overlap (1-528:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
::.. ::..:: :::::::::::::::::::::::.:: .:::::::.:.:.::.::.::
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLS-----LLSLPPGTSPVGSPGPLAPI---PPTLLAP-------GT
::::.:: : :::: ..:: :.::: .: : : : ..: :.
CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 LL----GPKREVDM-HPPLPQPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHF
.: : :... ::.: :::::: .: ::::.: ::.::.:...: :::.: :
CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIP-PVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFF
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 TFALTPQQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLC
::::::::..: ::. :::.. :::.:::::.:: :::::::: .: .: .::::::
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