FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6116, 582 aa 1>>>pF1KB6116 582 - 582 aa - 582 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3956+/-0.00084; mu= 18.4533+/- 0.051 mean_var=75.1022+/-14.956, 0's: 0 Z-trim(107.7): 52 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.147995 statistics sampled from 9661 (9713) to 9661 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16 Scan time: 3.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11409.1 FKBP10 gene_id:60681|Hs108|chr17 ( 582) 3999 863.5 0 CCDS5439.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 ( 570) 2331 507.4 2e-143 CCDS64622.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 ( 623) 2119 462.1 9.1e-130 CCDS64623.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 ( 338) 1357 299.3 5.3e-81 CCDS8063.1 FKBP2 gene_id:2286|Hs108|chr11 ( 142) 335 80.8 1.3e-15 CCDS46462.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 ( 221) 320 77.7 1.7e-14 CCDS8773.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 ( 201) 312 76.0 5.1e-14 CCDS2280.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 ( 222) 312 76.0 5.5e-14 CCDS5423.1 FKBP14 gene_id:55033|Hs108|chr7 ( 211) 308 75.1 9.6e-14 CCDS44871.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 ( 146) 297 72.7 3.6e-13 CCDS4808.1 FKBP5 gene_id:2289|Hs108|chr6 ( 457) 297 73.0 9.1e-13 CCDS8512.1 FKBP4 gene_id:2288|Hs108|chr12 ( 459) 268 66.8 6.7e-11 CCDS13014.1 FKBP1A gene_id:2280|Hs108|chr20 ( 108) 260 64.7 6.8e-11 >>CCDS11409.1 FKBP10 gene_id:60681|Hs108|chr17 (582 aa) initn: 3999 init1: 3999 opt: 3999 Z-score: 4613.0 bits: 863.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3999; 100.0% identity (100.0% similar) in 582 aa overlap (1-582:1-582) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MFPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLEDVVIERYHIPRACPREVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MFPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLEDVVIERYHIPRACPREVQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 MGDFVRYHYNGTFEDGKKFDSSYDRNTLVAIVVGVGRLITGMDRGLMGMCVNERRRLIVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MGDFVRYHYNGTFEDGKKFDSSYDRNTLVAIVVGVGRLITGMDRGLMGMCVNERRRLIVP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 PHLGYGSIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVRYH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PHLGYGSIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVRYH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 YNGTLLDGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 YNGTLLDGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 GYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 GYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 TLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 TLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 SAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 SAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 DYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESGARGVPGSAVLLFEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 DYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESGARGVPGSAVLLFEV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 ELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 QDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL 550 560 570 580 >>CCDS5439.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 (570 aa) initn: 2390 init1: 1502 opt: 2331 Z-score: 2688.4 bits: 507.4 E(32554): 2e-143 Smith-Waterman score: 2331; 58.0% identity (80.0% similar) in 571 aa overlap (15-582:12-570) 10 20 30 40 50 pF1KB6 MFPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLED--VVIERYHIPRACPRE ::: ::: :. :.:.:..: : . ::: .: ::: CCDS54 MAFRGWRPPPPPLLLLLLWVT-------GQAAPVAGLGSDAELQIERRFVPDECPRT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB6 VQMGDFVRYHYNGTFEDGKKFDSSYDRNTLVAIVVGVGRLITGMDRGLMGMCVNERRRLI :. :::::::: ::: ::.::::::::.. . :: :.::::::..:.:::::::: . 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CCDS64 NIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKRTVIIPPHLGYGEAGVDGEVPGSAVLVFDIELLEL 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 EDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPGQDPEK ::: ::.:.:. . ::::..: . .::: :::: .:.:::. :::.: :: : : CCDS64 VAGLPEGYMFIWNGEVSPNLFEEIDKDGNGEVLLEEFSEYIHAQVASGKGKLAPGFDAEL 530 540 550 560 570 580 550 560 570 580 pF1KB6 TIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL . .:: ::::: :::.:..:.::: :.: :.:: CCDS64 IVKNMFTNQDRNGDGKVTAEEFKLK---DQEAKHDEL 590 600 610 620 >>CCDS64623.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 (338 aa) initn: 2120 init1: 553 opt: 1357 Z-score: 1567.7 bits: 299.3 E(32554): 5.3e-81 Smith-Waterman score: 1357; 56.3% identity (80.4% similar) in 341 aa overlap (243-582:3-338) 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 GMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLET : :: :::::: : :.:.:::::....:. CCDS64 MAGKDIPGQASLVFDVALLDLHNPKDSISIEN 10 20 30 280 290 300 310 320 330 pF1KB6 LELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQG .: .: : . .:::.::::::.:.::::::::::::.:..:::::::.:::::.:: : CCDS64 KVVPENCERISQSGDFLRYHYNGTLLDGTLFDSSYSRNRTFDTYIGQGYVIPGMDEGLLG 40 50 60 70 80 90 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 ACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETC .:.::.:::..::::.:::.: :. :::::::.:..::::::::.: . : . .: . : CCDS64 VCIGEKRRIVVPPHLGYGEEGRGN-IPGSAVLVFDIHVIDFHNPSDSISITSHYKPPD-C 100 110 120 130 140 150 400 410 420 430 440 450 pF1KB6 NETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSHDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERR . .: ::...:::: :::::: : .. . : . .::...:. :.: ::. :::::.: CCDS64 SVLSKKGDYLKYHYNASLLDGTLLDSTWNLGKTYNIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKR 160 170 180 190 200 210 460 470 480 490 500 510 pF1KB6 QLIVPPHLAHGESGARG-VPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDL .:.::::..::.:. : :::::::.:..::. ::: ::.:.:. . ::::..: CCDS64 TVIIPPHLGYGEAGVDGEVPGSAVLVFDIELLELVAGLPEGYMFIWNGEVSPNLFEEIDK 220 230 240 250 260 270 520 530 540 550 560 570 pF1KB6 NKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKS . .::: :::: .:.:::. :::.: :: : : . .:: ::::: :::.:..:.::: CCDS64 DGNGEVLLEEFSEYIHAQVASGKGKLAPGFDAELIVKNMFTNQDRNGDGKVTAEEFKLK- 280 290 300 310 320 580 pF1KB6 DEDEERVHEEL :.: :.:: CCDS64 --DQEAKHDEL 330 >>CCDS8063.1 FKBP2 gene_id:2286|Hs108|chr11 (142 aa) initn: 661 init1: 326 opt: 335 Z-score: 393.8 bits: 80.8 E(32554): 1.3e-15 Smith-Waterman score: 335; 46.2% identity (69.8% similar) in 106 aa overlap (156-261:31-136) 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 GSIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVRYHYNGTL .:... : ::: . :: ...::.: : CCDS80 MRLSWFRVLTVLSICLSAVATATGAEGKRKLQIGVKKRVDHCPIKSRKGDVLHMHYTGKL 10 20 30 40 50 60 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 LDGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEKGYGTV ::: ::.: .. . .:.: .::: :::::::: ::.::..:: :.:::.: CCDS80 EDGTEFDSSLPQNQPFVFSLGTGQVIKGWDQGLLGMCEGEKRKLVIPSELGYGERGAPPK 70 80 90 100 110 120 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 IPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDGTLFDS :: :.:::.: :. . CCDS80 IPGGATLVFEVELLKIERRTEL 130 140 >>CCDS46462.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 (221 aa) initn: 332 init1: 207 opt: 320 Z-score: 373.8 bits: 77.7 E(32554): 1.7e-14 Smith-Waterman score: 338; 31.5% identity (65.5% similar) in 200 aa overlap (380-573:35-220) 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 GENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCS :.:..: :: :.:..:.: ::.. ::. CCDS46 MHFLFRFIVFFYLWGLFTAQRQKKEESTEEVKIEVLHRP-ENCSKTSKKGDLLNAHYDGY 10 20 30 40 50 60 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 LL-DGTQLFTS--HDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESG : ::.... : .. : :. .::...::.::: .. :: ::.:....:: .:.:. : CCDS46 LAKDGSKFYCSRTQNEGHPKWFVLGVGQVIKGLDIAMTDMCPGEKRKVVIPPSFAYGKEG 70 80 90 100 110 120 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 ARG-VPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTF .: .: .:.:.::.:: . : : . . :...:...: .. :.. . CCDS46 YEGKIPPDATLIFEIELYAVTKG-PRSI----------ETFKQIDMDNDRQLSKAEINLY 130 140 150 160 170 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 IKAQVSEG-KGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKL-KSDEDEERVHEEL .. . . : : :: .. :.:...:.. :: :. : .. . :: CCDS46 LQREFEKDEKPRDKSYQDA--VLEDIFKKNDHDGDGFISPKEYNVYQHDEL 180 190 200 210 220 >>CCDS8773.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 (201 aa) initn: 321 init1: 189 opt: 312 Z-score: 365.1 bits: 76.0 E(32554): 5.1e-14 Smith-Waterman score: 312; 40.4% identity (72.8% similar) in 114 aa overlap (259-371:29-141) 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 IIIPPFLAYGEKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPP-GCVRRAGAGD .....: ..:.::: :: :.. :. :: CCDS87 MTLRPSLLPLHLLLLLLLSAAVCRAEAGLETESPVRTLQVETLVEPPEPCAEPAAFGD 10 20 30 40 50 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 FMRYHYNGSLMDGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHL .. ::.:::.:: ..:.: .:. .:: .:::..:.: :.::.:: :: :: CCDS87 TLHIHYTGSLVDGRIIDTSLTRDPLV-IELGQKQVIPGLEQSLLDMCVGEKRRAIIPSHL 60 70 80 90 100 110 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 AYGENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYN :::. : ..:..::. ..:..: CCDS87 AYGKRGFPPSVPADAVVQYDVELIALIRANYWLKLVKGILPLVGMAMVPALLGLIGYHLY 120 130 140 150 160 170 >>CCDS2280.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 (222 aa) initn: 331 init1: 173 opt: 312 Z-score: 364.5 bits: 76.0 E(32554): 5.5e-14 Smith-Waterman score: 333; 31.8% identity (65.7% similar) in 201 aa overlap (380-573:35-221) 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 GENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCS :.:..: :: :.:..:.: ::.. ::. CCDS22 MHFLFRFIVFFYLWGLFTAQRQKKEESTEEVKIEVLHRP-ENCSKTSKKGDLLNAHYDGY 10 20 30 40 50 60 410 420 430 440 450 460 pF1KB6 LL-DGTQLFTS--HDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESG : ::.... : .. : :. .::...::.::: .. :: ::.:....:: .:.:. : CCDS22 LAKDGSKFYCSRTQNEGHPKWFVLGVGQVIKGLDIAMTDMCPGEKRKVVIPPSFAYGKEG 70 80 90 100 110 120 470 480 490 500 510 520 pF1KB6 -ARG-VPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFST :.: .: .:.:.::.:: . : : . . :...:...: .. :.. CCDS22 YAEGKIPPDATLIFEIELYAVTKG-PRSI----------ETFKQIDMDNDRQLSKAEINL 130 140 150 160 170 530 540 550 560 570 580 pF1KB6 FIKAQVSEG-KGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKL-KSDEDEERVHEEL ... . . : : :: .. :.:...:.. :: :. : .. . :: CCDS22 YLQREFEKDEKPRDKSYQDA--VLEDIFKKNDHDGDGFISPKEYNVYQHDEL 180 190 200 210 220 >>CCDS5423.1 FKBP14 gene_id:55033|Hs108|chr7 (211 aa) initn: 381 init1: 171 opt: 308 Z-score: 360.2 bits: 75.1 E(32554): 9.6e-14 Smith-Waterman score: 380; 33.2% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (361-573:7-210) 340 350 360 370 380 pF1KB6 QGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPGSAVL-IFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPS .::: .: . .: : :.:..:..: CCDS54 MRLFLWNAVLTLFVTSLIGALIPEPEVKIEVLQKPF 10 20 30 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 ETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTS---HDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGM :.. :: ::.. ::. : .:: : :. : : ::: ....: : ::.:: CCDS54 -ICHRKTKGGDLMLVHYEGYLEKDGSLFHSTHKHNNGQPIWFTLGILEALKGWDQGLKGM 40 50 60 70 80 90 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 CVGERRQLIVPPHLAHGESGARGVPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLF ::::.:.::.:: :..:. : .: ..:.:...:. ..: : . :.. : CCDS54 CVGEKRKLIIPPALGYGKEGKGKIPPESTLIFNIDLLEIRNG-PRS-----HES-----F 100 110 120 130 140 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 EDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDE ..:::: : .. .: ....: . : .: .. . . . :.:...:...:: :.. : CCDS54 QEMDLNDDWKLSKDEVKAYLKKEF-EKHGAVVNESHHDALVEDIFDKEDEDKDGFISARE 150 160 170 180 190 200 570 580 pF1KB6 LKLKSDEDEERVHEEL . : :: CCDS54 FTYKHDEL 210 >>CCDS44871.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 (146 aa) initn: 424 init1: 174 opt: 297 Z-score: 349.8 bits: 72.7 E(32554): 3.6e-13 Smith-Waterman score: 297; 41.3% identity (71.2% similar) in 104 aa overlap (259-361:29-131) 230 240 250 260 270 280 pF1KB6 IIIPPFLAYGEKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPP-GCVRRAGAGD .....: ..:.::: :: :.. :. :: CCDS44 MTLRPSLLPLHLLLLLLLSAAVCRAEAGLETESPVRTLQVETLVEPPEPCAEPAAFGD 10 20 30 40 50 290 300 310 320 330 340 pF1KB6 FMRYHYNGSLMDGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHL .. ::.:::.:: ..:.: .:. .:: .:::..:.: :.::.:: :: :: CCDS44 TLHIHYTGSLVDGRIIDTSLTRDPLV-IELGQKQVIPGLEQSLLDMCVGEKRRAIIPSHL 60 70 80 90 100 110 350 360 370 380 390 400 pF1KB6 AYGENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYN :::. : ..::. CCDS44 AYGKRGFPPSVPGTKDNLMRPPGMTSSSQ 120 130 140 582 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 21:47:01 2016 done: Fri Nov 4 21:47:02 2016 Total Scan time: 3.580 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]