Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6120, 583 aa
1>>>pF1KB6120 583 - 583 aa - 583 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4424+/-0.0012; mu= -5.3840+/- 0.073
mean_var=486.1132+/-97.557, 0's: 0 Z-trim(113.8): 105 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.058171
statistics sampled from 14354 (14443) to 14354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8343.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 583) 3797 333.4 4.9e-91
CCDS58174.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 604) 3797 333.4 5e-91
CCDS14382.1 MSN gene_id:4478|Hs108|chrX ( 577) 3117 276.3 7.3e-74
CCDS5258.1 EZR gene_id:7430|Hs108|chr6 ( 586) 3048 270.5 4.1e-72
CCDS58172.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 447) 2775 247.5 2.7e-65
CCDS13861.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 595) 1704 157.7 3.7e-38
CCDS13862.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 590) 1679 155.6 1.6e-37
CCDS58171.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 257) 1484 138.9 7.7e-33
CCDS13863.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 548) 1458 137.0 5.8e-32
CCDS13865.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 507) 1279 122.0 1.8e-27
CCDS13864.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 549) 1273 121.5 2.7e-27
CCDS58173.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 200) 689 72.0 7.9e-13
>>CCDS8343.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (583 aa)
initn: 3797 init1: 3797 opt: 3797 Z-score: 1747.9 bits: 333.4 E(32554): 4.9e-91
Smith-Waterman score: 3797; 100.0% identity (100.0% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
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CCDS83 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
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CCDS83 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
550 560 570 580
>>CCDS58174.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (604 aa)
initn: 3797 init1: 3797 opt: 3797 Z-score: 1747.7 bits: 333.4 E(32554): 5e-91
Smith-Waterman score: 3797; 100.0% identity (100.0% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAMWGPKLYALFQMRSCQSS
550 560 570 580 590 600
CCDS58 IKQM
>>CCDS14382.1 MSN gene_id:4478|Hs108|chrX (577 aa)
initn: 3302 init1: 2675 opt: 3117 Z-score: 1439.5 bits: 276.3 E(32554): 7.3e-74
Smith-Waterman score: 3117; 81.0% identity (93.5% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::: :.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::.:::::
CCDS14 MPKTISVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
:::::: :::.::.:: :::::::.::::::::::.::::::::::::.::::.::::::
CCDS14 LNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
:::::::::::.::::.:::.:: ::::.:.::::::::::::.:.::::::: ::::::
CCDS14 TAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::...::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::..:.:::::::
CCDS14 GMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
:::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::: :
CCDS14 EVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::.:::::::.::::.::::::. :::.: :::. ::::: :. . . :: :.::::: :
CCDS14 AQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
.::.::.:. :: :..::: ::.:::.:: .:::::::. ::::.::.: :
CCDS14 MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPH------VAE
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
:.:::.::.:::.:::::.: ... . ::::::.::..:::::.:.:.::.::::.:::
CCDS14 PAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARD
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:.::: ::..::::.. ::::::::::::::::::::::::.:
CCDS14 ESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM
540 550 560 570
>>CCDS5258.1 EZR gene_id:7430|Hs108|chr6 (586 aa)
initn: 3083 init1: 2643 opt: 3048 Z-score: 1408.1 bits: 270.5 E(32554): 4.1e-72
Smith-Waterman score: 3048; 76.3% identity (92.8% similar) in 586 aa overlap (1-583:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:::.::. ::::
CCDS52 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
:.:::. :.:.:::::::::::::.::::.:::::.:::.::::::::.::.::::::::
CCDS52 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
:::::.:::::::.::::::.:: :::...::.::::..:::::..:::.::: :: :::
CCDS52 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
:::....:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS52 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS52 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
:::::::::::::::::::: :::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.: :
CCDS52 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
:..:: :: ..::.:..:::::.::::::: .: :: .:: . .::.::.:.:::::::
CCDS52 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
:::.::::::::::...::.:. ::::.: ::.:: ::::::. ::.:::::::: :
CCDS52 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEA---SAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQ
. . .. ....:: :::::.::. . :.::.:.::..:::::..:: .:::::.:
CCDS52 VSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQ
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KB6 ARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
::::.:.:.::..: ::.. :::::::::::::::::::::::::.
CCDS52 ARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
550 560 570 580
>>CCDS58172.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (447 aa)
initn: 2765 init1: 2765 opt: 2775 Z-score: 1285.7 bits: 247.5 E(32554): 2.7e-65
Smith-Waterman score: 2775; 98.2% identity (98.4% similar) in 440 aa overlap (144-583:10-447)
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 EIYCPPETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQ
: :::. : :::::::::::::::::
CCDS58 MLSWNLPFSPIQLANNFLTS--VLEQHKLTKEQWEERIQ
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NWHEEHRGMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NWHEEHRGMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDK
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMR
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 RRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQ
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 IEEQTIKAQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEEQTIKAQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKN
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 QEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPP
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 PPPPVIPPTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPPPVIPPTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSS
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580
pF1KB6 ELAQARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELAQARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
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10 20 30 40
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:: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.:
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::::::. : .:::..::: ..::.::.:. :.: :::.::.. :::.:::::.:::
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170 180 190 200 210 220
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CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL
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230 240 250 260 270 280
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::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :: :
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290 300 310 320 330 340
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CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR
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.. :. . .: ..... . ..:: ..: : ..: . :.: . . .::
CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKA--TAI
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410 420 430 440 450 460
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. .. .:. : ::. .. :.: : .... .:: . .. :.: ...:..:
CCDS13 RTEEEKRLMEQKVLEAEV--LALKMA---EESERRAKEADQLKQDLQEAREAERRAKQKL
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. . : :: :. : . . . : .... . .. . :.:.: .:.
CCDS13 LEIATKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMKRLSMEIEKEKVEYMEKS
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pF1KB6 ERVKKQLQALSSELAQARDETKKTQNDVLHAENV-KAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEF
.....::. :..:. . . ..: :.:: :: ..: .:..:.... ..:.:. :
CCDS13 KHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKLTLQSAKSRVAFF
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 EAM
: .
CCDS13 EEL
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10 20 30 40
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVW
:: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.:
CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 FFGLQYVDSKGYSTWLKLNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFF
::::::. : .:::..::: ..::.::.:. :.: :::.::.. :::.:::::.:::
CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPENAEEELVQEITQHLFF
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110 120 130 140 150 160
pF1KB6 LQVKEAILNDEIYCPPETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKL
::::. ::...::::::..:::::::::::::::. .:: :.::...:::.::.. ...
CCDS13 LQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 TKEQWEERIQNWHEEHRGMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDAL
: :.::::: :. :::: :... :::::::::::::::::: :.::::::: ::::::
CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL
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230 240 250 260 270 280
pF1KB6 GLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILAL
::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :: :
CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIERE
:.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:: .: ::. :: ::. ....::.
CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR
300 310 320 330 340 350
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.. :. . .: ..... . ..:: ..: : ..: . :.: . . .::
CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKA--TAI
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pF1KB6 AKQAADQMKNQEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEEL
. .. .:. : ::. .. :.: : .... .:: . .. :.: ...:..:
CCDS13 RTEEEKRLMEQKVLEAEV--LALKMA---EESERRAKEADQLKQDLQEAREAERRAKQKL
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. . : :: :. : . . . : .... . .. . :.:.: .:.
CCDS13 LEIATKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMKRLSMEIEKEKVEYMEKS
480 490 500 510 520 530
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pF1KB6 ERVKKQLQALSSELAQARDETKKTQNDVLHAENV-KAGRDKYKTLRQIR-QGNTKQRIDE
.....::. :..:. . . ..: :.:: :: ..: .:..:... . ::
CCDS13 KHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQGRRPICI
540 550 560 570 580 590
580
pF1KB6 FEAM
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MERLKQIEEQTIKAQKELEEQTRKALELDQ
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380 390 400 410 420 430
pF1KB6 ERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIPPTENEHDEHDENNAEAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARDETKKTQNDVLHAENVKA
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pF1KB6 GRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAMWGPKLYALFQMRSCQSSIKQM
220 230 240 250
>>CCDS13863.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (548 aa)
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pF1KB6 LFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLKLNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPED
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CCDS13 GAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPEN
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 VSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLA
. :::.:::::.:::::::. ::...::::::..:::::::::::::::. .:: :.::
CCDS13 AEEELVQEITQHLFFLQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLA
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...:::.::.. ...: :.::::: :. :::: :... :::::::::::::::::: :
CCDS13 QEELLPKRVINLYQMTPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAI
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pF1KB6 KNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFV
.::::::: ::::::::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: :
CCDS13 RNKKGTELLLGVDALGLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFK
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pF1KB6 FYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKK
: . .::.:: :: ::.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:: .: ::.
CCDS13 FNSSKLRVNKLILQLCIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQ
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:: ::. ....::. .. :. . .: ..... . ..:: ..: : ..: .
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:.: . . .:: . .. .:. : ::. .. :.: : .... .:: . ..
CCDS13 AEQEMQRIKA--TAIRTEEEKRLMEQKVLEAEV--LALKMA---EESERRAKEADQLKQD
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:.: ...:..: . . : :: :. : . . . : .... . .
CCDS13 LQEAREAERRAKQKLLEIATKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMKRL
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. . :.:.: .:......::. :..:. . . ..: :.:: :: ..: .:..:.
CCDS13 SMEIEKEKVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTI
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pF1KB6 RQIR-QGNTKQRIDEFEAM
.. . ::
CCDS13 KKPQAQGRRPICI
540
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CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEVKKQILDEKI
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
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CCDS13 YCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQMTPEMWEERITAW
50 60 70 80 90 100
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. :::: :... :::::::::::::::::: :.::::::: ::::::::.::. ...::
CCDS13 YAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDALGLHIYDPENRLT
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CCDS13 PKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQLCIGNHDLFMRRR
170 180 190 200 210 220
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pF1KB6 KPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIE
: :..::::::::::::: .::.:: .: ::. :: ::. ....::. .. :. . .
CCDS13 KADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERRLLQMKEEATMAN
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 EQTIKAQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQE
: ..... . ..:: ..: : ..: . :.: . . .:: . .. .:.
CCDS13 EALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIK--ATAIRTEEEKRLMEQK
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CCDS13 VLEAEV--LALKMA---EESERRAKEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLEIATKPTYPPM
350 360 370 380 390 400
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:. : . . . : .... . .. . :.:.: .:......::. :..
CCDS13 NPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMKRLSMEIEKEKVEYMEKSKHLQEQLNELKT
410 420 430 440 450 460
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:. . . ..: :.:: :: ..: .:..:... . ::
CCDS13 EIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQGRRPICI
470 480 490 500
583 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 10:57:18 2016 done: Sat Nov 5 10:57:18 2016
Total Scan time: 3.780 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]