Result of FASTA (omim) for
pF1KB6120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6120, 583 aa
1>>>pF1KB6120 583 - 583 aa - 583 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8879+/-0.000529; mu= -13.7322+/- 0.033
mean_var=559.0398+/-114.750, 0's: 0 Z-trim(122.2): 316 B-trim: 658 in 1/57
Lambda= 0.054244
statistics sampled from 39741 (40073) to 39741 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.47), width: 16
Scan time: 11.440
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002897 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform 2 ( 583) 3797 312.1 3.3e-84
NP_001247422 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 604) 3797 312.1 3.3e-84
NP_001247421 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 604) 3797 312.1 3.3e-84
NP_002435 (OMIM: 309845) moesin [Homo sapiens] ( 577) 3117 258.9 3.4e-68
XP_005262326 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 578) 3095 257.2 1.1e-67
XP_011529261 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 610) 3095 257.2 1.2e-67
XP_016885035 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 566) 3062 254.6 6.6e-67
XP_016885034 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 566) 3062 254.6 6.6e-67
NP_003370 (OMIM: 123900) ezrin [Homo sapiens] ( 586) 3048 253.5 1.4e-66
NP_001104547 (OMIM: 123900) ezrin [Homo sapiens] ( 586) 3048 253.5 1.4e-66
NP_001247423 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 447) 2775 232.0 3.2e-60
XP_011534412 (OMIM: 123900) PREDICTED: ezrin isofo ( 450) 2141 182.4 2.8e-45
NP_000259 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 595) 1704 148.3 6.7e-35
NP_057502 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 590) 1679 146.3 2.6e-34
NP_861970 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 590) 1679 146.3 2.6e-34
NP_861546 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 590) 1679 146.3 2.6e-34
XP_016884298 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) P ( 557) 1633 142.7 3e-33
XP_016884299 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) P ( 552) 1608 140.8 1.2e-32
NP_001247424 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 257) 1484 130.7 5.7e-30
NP_861966 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 548) 1458 129.0 3.9e-29
NP_861969 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 507) 1279 115.0 6.2e-25
NP_861968 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 507) 1279 115.0 6.2e-25
NP_861967 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 549) 1273 114.5 9e-25
NP_001247425 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 200) 689 68.4 2.5e-11
NP_861971 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 165) 548 57.3 4.7e-08
NP_060497 (OMIM: 616305,616819) FERM domain-contai (1039) 481 52.8 6.4e-06
XP_016871884 (OMIM: 616305,616819) PREDICTED: FERM (1046) 481 52.8 6.4e-06
XP_016871883 (OMIM: 616305,616819) PREDICTED: FERM (1050) 481 52.8 6.4e-06
NP_001305265 (OMIM: 616305,616819) FERM domain-con (1055) 481 52.8 6.5e-06
XP_011517845 (OMIM: 616305,616819) PREDICTED: FERM (1062) 481 52.9 6.5e-06
NP_001305266 (OMIM: 616305,616819) FERM domain-con (1072) 481 52.9 6.5e-06
XP_005252547 (OMIM: 616305,616819) PREDICTED: FERM (1078) 481 52.9 6.6e-06
XP_005252546 (OMIM: 616305,616819) PREDICTED: FERM (1083) 481 52.9 6.6e-06
XP_006717523 (OMIM: 616305,616819) PREDICTED: FERM (1095) 481 52.9 6.6e-06
XP_005245827 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 809) 450 50.3 2.9e-05
NP_976217 (OMIM: 130500,611804) protein 4.1 isofor ( 641) 447 50.0 2.9e-05
NP_001159478 (OMIM: 130500,611804) protein 4.1 iso ( 720) 448 50.1 3e-05
XP_016856093 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 523) 443 49.6 3.1e-05
XP_005245820 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 850) 448 50.2 3.3e-05
NP_001159479 (OMIM: 130500,611804) protein 4.1 iso ( 601) 443 49.6 3.4e-05
NP_001171868 (OMIM: 611730) band 4.1-like protein ( 505) 440 49.3 3.6e-05
NP_001171867 (OMIM: 611730) band 4.1-like protein ( 505) 440 49.3 3.6e-05
XP_016856081 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 732) 444 49.8 3.7e-05
XP_011539261 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot (1017) 448 50.3 3.8e-05
XP_005245826 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 810) 444 49.8 4e-05
XP_016856086 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 767) 443 49.7 4.1e-05
XP_016856092 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 524) 437 49.1 4.3e-05
NP_001171866 (OMIM: 611730) band 4.1-like protein ( 687) 440 49.5 4.4e-05
XP_016856072 (OMIM: 130500,611804) PREDICTED: prot ( 976) 444 49.9 4.6e-05
NP_001317239 (OMIM: 611730) band 4.1-like protein ( 732) 440 49.5 4.6e-05
>>NP_002897 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform 2 [Hom (583 aa)
initn: 3797 init1: 3797 opt: 3797 Z-score: 1632.9 bits: 312.1 E(85289): 3.3e-84
Smith-Waterman score: 3797; 100.0% identity (100.0% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
550 560 570 580
>>NP_001247422 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform 1 [ (604 aa)
initn: 3797 init1: 3797 opt: 3797 Z-score: 1632.7 bits: 312.1 E(85289): 3.3e-84
Smith-Waterman score: 3797; 100.0% identity (100.0% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAMWGPKLYALFQMRSCQSS
550 560 570 580 590 600
NP_001 IKQM
>>NP_001247421 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform 1 [ (604 aa)
initn: 3797 init1: 3797 opt: 3797 Z-score: 1632.7 bits: 312.1 E(85289): 3.3e-84
Smith-Waterman score: 3797; 100.0% identity (100.0% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAMWGPKLYALFQMRSCQSS
550 560 570 580 590 600
NP_001 IKQM
>>NP_002435 (OMIM: 309845) moesin [Homo sapiens] (577 aa)
initn: 3302 init1: 2675 opt: 3117 Z-score: 1345.3 bits: 258.9 E(85289): 3.4e-68
Smith-Waterman score: 3117; 81.0% identity (93.5% similar) in 583 aa overlap (1-583:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::: :.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::.:::::
NP_002 MPKTISVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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:::::: :::.::.:: :::::::.::::::::::.::::::::::::.::::.::::::
NP_002 LNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
:::::::::::.::::.:::.:: ::::.:.::::::::::::.:.::::::: ::::::
NP_002 TAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHR
130 140 150 160 170 180
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pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::...::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::..:.:::::::
NP_002 GMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
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pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
:::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::: :
NP_002 EVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKK
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pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::.:::::::.::::.::::::. :::.: :::. ::::: :. . . :: :.::::: :
NP_002 AQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALE
370 380 390 400 410 420
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pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
.::.::.:. :: :..::: ::.:::.:: .:::::::. ::::.::.: :
NP_002 MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPH------VAE
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pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
:.:::.::.:::.:::::.: ... . ::::::.::..:::::.:.:.::.::::.:::
NP_002 PAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARD
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pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:.::: ::..::::.. ::::::::::::::::::::::::.:
NP_002 ESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM
540 550 560 570
>>XP_005262326 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isoform (578 aa)
initn: 3325 init1: 2647 opt: 3095 Z-score: 1336.0 bits: 257.2 E(85289): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 3095; 81.0% identity (93.6% similar) in 579 aa overlap (5-583:6-578)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWL
:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::.::::
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pF1KB6 KLNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPP
::::::: :::.::.:: :::::::.::::::::::.::::::::::::.::::.:::::
XP_005 KLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPP
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pF1KB6 ETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEH
::::::::::::.::::.:::.:: ::::.:.::::::::::::.:.::::::: :::::
XP_005 ETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEH
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pF1KB6 RGMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIG
:::::::...::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::..:.::::::
XP_005 RGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIG
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240 250 260 270 280 290
pF1KB6 FPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDT
250 260 270 280 290 300
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pF1KB6 IEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTI
::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.:::::::::::::::::::
XP_005 IEVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTK
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pF1KB6 KAQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAA
:::.:::::::.::::.::::::. :::.: :::. ::::: :. . . :: :.:::::
XP_005 KAQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLAL
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pF1KB6 ELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVI
:.::.::.:. :: :..::: ::.:::.:: .:::::::. ::::.::.: :
XP_005 EMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPH------VA
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pF1KB6 PPTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQAR
:.:::.::.:::.:::::.: ... . ::::::.::..:::::.:.:.::.::::.::
XP_005 EPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANAR
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pF1KB6 DETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
::.::: ::..::::.. ::::::::::::::::::::::::.:
XP_005 DESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM
540 550 560 570
>>XP_011529261 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isoform (610 aa)
initn: 3325 init1: 2647 opt: 3095 Z-score: 1335.7 bits: 257.2 E(85289): 1.2e-67
Smith-Waterman score: 3095; 81.0% identity (93.6% similar) in 579 aa overlap (5-583:38-610)
10 20 30
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVV
:.::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSAQDQVPGELESITTTVRSTDPQASFSSQISVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVV
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40 50 60 70 80 90
pF1KB6 KTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLKLNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELI
::.:::::::::::: :.::.::::::::::: :::.::.:: :::::::.:::::::::
XP_011 KTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLKLNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELI
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pF1KB6 QEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPETAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLP
:.::::::::::::.::::.:::::::::::::::::.::::.:::.:: ::::.:.:::
XP_011 QDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLP
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160 170 180 190 200 210
pF1KB6 QRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHRGMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGT
:::::::::.:.::::::: ::::::::::::...::::::::::::::::: ::::::.
XP_011 QRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHRGMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGS
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pF1KB6 ELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRL
:::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 RINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::
XP_011 RINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAE
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pF1KB6 KEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIKAQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERR
::::.::::::::::::::::::: :::.:::::::.::::.::::::. :::.: :::.
XP_011 KEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKKAQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQ
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pF1KB6 AAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAELAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQE
::::: :. . . :: :.::::: :.::.::.:. :: :..::: ::.:::.:: .::
XP_011 EAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALEMAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQE
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pF1KB6 DLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIPPTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEER
:::::. ::::.::.: : :.:::.::.:::.:::::.: ... . ::::::
XP_011 DLEKTRAELKTAMSTPH------VAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEER
490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 VTETQKNERVKKQLQALSSELAQARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTK
.::..:::::.:.:.::.::::.::::.::: ::..::::.. :::::::::::::::::
XP_011 TTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTK
550 560 570 580 590 600
580
pF1KB6 QRIDEFEAM
:::::::.:
XP_011 QRIDEFESM
610
>>XP_016885035 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isoform (566 aa)
initn: 3247 init1: 2620 opt: 3062 Z-score: 1322.2 bits: 254.6 E(85289): 6.6e-67
Smith-Waterman score: 3062; 80.9% identity (93.5% similar) in 572 aa overlap (12-583:1-566)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::.:::::
XP_016 MDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLK
10 20 30 40
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pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
:::::: :::.::.:: :::::::.::::::::::.::::::::::::.::::.::::::
XP_016 LNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPE
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pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
:::::::::::.::::.:::.:: ::::.:.::::::::::::.:.::::::: ::::::
XP_016 TAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHR
110 120 130 140 150 160
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pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::...::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::..:.:::::::
XP_016 GMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGF
170 180 190 200 210 220
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pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
:::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::: :
XP_016 EVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKK
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::.:::::::.::::.::::::. :::.: :::. ::::: :. . . :: :.::::: :
XP_016 AQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALE
350 360 370 380 390 400
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pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
.::.::.:. :: :..::: ::.:::.:: .:::::::. ::::.::. : :
XP_016 MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMST------PHVAE
410 420 430 440 450 460
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pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
:.:::.::.:::.:::::.: ... . ::::::.::..:::::.:.:.::.::::.:::
XP_016 PAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARD
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580
pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:.::: ::..::::.. ::::::::::::::::::::::::.:
XP_016 ESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM
530 540 550 560
>>XP_016885034 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isoform (566 aa)
initn: 3247 init1: 2620 opt: 3062 Z-score: 1322.2 bits: 254.6 E(85289): 6.6e-67
Smith-Waterman score: 3062; 80.9% identity (93.5% similar) in 572 aa overlap (12-583:1-566)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::.:::::
XP_016 MDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLK
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
:::::: :::.::.:: :::::::.::::::::::.::::::::::::.::::.::::::
XP_016 LNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
:::::::::::.::::.:::.:: ::::.:.::::::::::::.:.::::::: ::::::
XP_016 TAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
::::::...::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::..:.:::::::
XP_016 GMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
:::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::: :
XP_016 EVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKK
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
::.:::::::.::::.::::::. :::.: :::. ::::: :. . . :: :.::::: :
XP_016 AQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALE
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
.::.::.:. :: :..::: ::.:::.:: .:::::::. ::::.::. : :
XP_016 MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMST------PHVAE
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PTENEHDEHDENNAEASAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARD
:.:::.::.:::.:::::.: ... . ::::::.::..:::::.:.:.::.::::.:::
XP_016 PAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARD
470 480 490 500 510 520
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pF1KB6 ETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
:.::: ::..::::.. ::::::::::::::::::::::::.:
XP_016 ESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM
530 540 550 560
>>NP_003370 (OMIM: 123900) ezrin [Homo sapiens] (586 aa)
initn: 3083 init1: 2643 opt: 3048 Z-score: 1316.1 bits: 253.5 E(85289): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 3048; 76.3% identity (92.8% similar) in 586 aa overlap (1-583:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:::.::. ::::
NP_003 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
:.:::. :.:.:::::::::::::.::::.:::::.:::.::::::::.::.::::::::
NP_003 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
:::::.:::::::.::::::.:: :::...::.::::..:::::..:::.::: :: :::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]