Result of FASTA (omim) for
pF1KB6132
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6132, 628 aa
1>>>pF1KB6132 628 - 628 aa - 628 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2660+/-0.000366; mu= 10.8686+/- 0.023
mean_var=198.0341+/-40.288, 0's: 0 Z-trim(119.0): 215 B-trim: 43 in 1/58
Lambda= 0.091139
statistics sampled from 32173 (32462) to 32173 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.381), width: 16
Scan time: 12.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005572 (OMIM: 111200,247420,612773) basal cell ( 628) 4242 571.0 4.4e-162
NP_001013275 (OMIM: 111200,247420,612773) basal ce ( 588) 3952 532.8 1.3e-150
XP_016873248 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surfac ( 625) 721 108.0 1e-22
XP_016873251 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surfac ( 583) 678 102.3 4.9e-21
XP_016873250 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surfac ( 604) 634 96.6 2.7e-19
XP_016873249 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surfac ( 614) 634 96.6 2.8e-19
NP_006491 (OMIM: 155735) cell surface glycoprotein ( 646) 634 96.6 2.9e-19
NP_001230209 (OMIM: 601662) CD166 antigen isoform ( 570) 286 50.8 1.6e-05
NP_001230210 (OMIM: 601662) CD166 antigen isoform ( 555) 268 48.4 8e-05
NP_001618 (OMIM: 601662) CD166 antigen isoform 1 p ( 583) 268 48.4 8.2e-05
XP_011515758 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 271 49.3 0.00011
XP_011515759 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 271 49.3 0.00011
NP_653252 (OMIM: 615904) peroxidasin-like protein (1463) 271 49.3 0.00011
NP_001069 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion pr ( 739) 236 44.3 0.0018
NP_001186763 (OMIM: 192225) vascular cell adhesion ( 677) 232 43.8 0.0024
NP_005520 (OMIM: 142461,224410,255800) basement me (4391) 240 45.7 0.004
NP_001278789 (OMIM: 142461,224410,255800) basement (4392) 240 45.7 0.004
XP_016856611 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4438) 240 45.7 0.004
XP_016856610 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4439) 240 45.7 0.004
XP_016856609 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4456) 240 45.7 0.0041
XP_011539620 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4574) 240 45.8 0.0041
>>NP_005572 (OMIM: 111200,247420,612773) basal cell adhe (628 aa)
initn: 4242 init1: 4242 opt: 4242 Z-score: 3030.9 bits: 571.0 E(85289): 4.4e-162
Smith-Waterman score: 4242; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAHPDAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCTPTGTHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAHPDAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCTPTGTHD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HYMLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPPYQLDSQGRLVLAEAQVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HYMLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPPYQLDSQGRLVLAEAQVGDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 RDYVCVVRAGAAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSAQEIATCNSRNGNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RDYVCVVRAGAAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSAQEIATCNSRNGNPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PKITWYRNGQRLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRLRKDDRDASFHCAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKITWYRNGQRLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRLRKDDRDASFHCAAH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YSLPEGRHGRLDSPTFHLTLHYPTEHVQFWVGSPSTPAGWVREGDTVQLLCRGDGSPSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YSLPEGRHGRLDSPTFHLTLHYPTEHVQFWVGSPSTPAGWVREGDTVQLLCRGDGSPSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 YTLFRLQDEQEEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDYDAADDVQLSKTLELRVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YTLFRLQDEQEEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDYDAADDVQLSKTLELRVAY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LDPLELSEGKVLSLPLNSSAVVNCSVHGLPTPALRWTKDSTPLGDGPMLSLSSITFDSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LDPLELSEGKVLSLPLNSSAVVNCSVHGLPTPALRWTKDSTPLGDGPMLSLSSITFDSNG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TYVCEASLPTVPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKADGSWREGDEVTLICSARGHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TYVCEASLPTVPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKADGSWREGDEVTLICSARGHPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PKLSWSQLGGSPAEPIPGRQGWVSSSLTLKVTSALSRDGISCEASNPHGNKRHVFHFGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKLSWSQLGGSPAEPIPGRQGWVSSSLTLKVTSALSRDGISCEASNPHGNKRHVFHFGTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SPQTSQAGVAVMAVAVSVGLLLLVVAVFYCVRRKGGPCCRQRREKGAPPPGEPGLSHSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SPQTSQAGVAVMAVAVSVGLLLLVVAVFYCVRRKGGPCCRQRREKGAPPPGEPGLSHSGS
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 EQPEQTGLLMGGASGGARGGSGGFGDEC
::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EQPEQTGLLMGGASGGARGGSGGFGDEC
610 620
>>NP_001013275 (OMIM: 111200,247420,612773) basal cell a (588 aa)
initn: 3952 init1: 3952 opt: 3952 Z-score: 2825.2 bits: 532.8 E(85289): 1.3e-150
Smith-Waterman score: 3952; 100.0% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAHPDAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCTPTGTHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAHPDAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCTPTGTHD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HYMLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPPYQLDSQGRLVLAEAQVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HYMLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPPYQLDSQGRLVLAEAQVGDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 RDYVCVVRAGAAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSAQEIATCNSRNGNPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDYVCVVRAGAAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSAQEIATCNSRNGNPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PKITWYRNGQRLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRLRKDDRDASFHCAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKITWYRNGQRLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRLRKDDRDASFHCAAH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 YSLPEGRHGRLDSPTFHLTLHYPTEHVQFWVGSPSTPAGWVREGDTVQLLCRGDGSPSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YSLPEGRHGRLDSPTFHLTLHYPTEHVQFWVGSPSTPAGWVREGDTVQLLCRGDGSPSPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 YTLFRLQDEQEEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDYDAADDVQLSKTLELRVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTLFRLQDEQEEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDYDAADDVQLSKTLELRVAY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LDPLELSEGKVLSLPLNSSAVVNCSVHGLPTPALRWTKDSTPLGDGPMLSLSSITFDSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDPLELSEGKVLSLPLNSSAVVNCSVHGLPTPALRWTKDSTPLGDGPMLSLSSITFDSNG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TYVCEASLPTVPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKADGSWREGDEVTLICSARGHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYVCEASLPTVPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKADGSWREGDEVTLICSARGHPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PKLSWSQLGGSPAEPIPGRQGWVSSSLTLKVTSALSRDGISCEASNPHGNKRHVFHFGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKLSWSQLGGSPAEPIPGRQGWVSSSLTLKVTSALSRDGISCEASNPHGNKRHVFHFGTV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SPQTSQAGVAVMAVAVSVGLLLLVVAVFYCVRRKGGPCCRQRREKGAPPPGEPGLSHSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPQTSQAGVAVMAVAVSVGLLLLVVAVFYCVRRKGGPCCRQRREKGAP
550 560 570 580
610 620
pF1KB6 EQPEQTGLLMGGASGGARGGSGGFGDEC
>>XP_016873248 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surface gl (625 aa)
initn: 548 init1: 163 opt: 721 Z-score: 528.9 bits: 108.0 E(85289): 1e-22
Smith-Waterman score: 809; 30.3% identity (57.3% similar) in 656 aa overlap (12-627:2-619)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAH---P---DAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCT
: :::. : :::: : . .:.. .: :::: :....: :
XP_016 MGLPRLVC-AFLLAACCCCPRVAGVPGEAEQPAPELVEVEVGSTALLKCG
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB6 PTGTHDHY-MLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPP--YQ--LDSQGR
. .. . ..:: :.. . : ... .:.: : :. :. : :
XP_016 LSQSQGNLSHVDWF------------SVHKEKRTLIFRVRQGQGQSEPGEYEQRLSLQDR
50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 ---LVLAEAQVGDERDYVCVVRAGAAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSA
:.:... ::: ..: .. . : .: :. :: ... : . :
XP_016 GATLALTQVTPQDERIFLC--QGKRPRSQEYRIQLRVYKAPEEPNIQVNPLGIPVNSKEP
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 QEIATCNSRNGNPAPKITWYRNGQRLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRL
.:.::: .::: : :.. ::.::. :. : : ..:.:: :.::: .: : : .:
XP_016 EEVATCVGRNGYPIPQVIWYKNGRPLK--EEKNRVHIQSSQTV-ESSGLYTLQSILKAQL
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 RKDDRDASFHCAAHYSLPEGRHGRLDSPTFHLTLHYPTEHVQFWVGSPSTPAGWVREGDT
:.:.::.:.: .: :: : : . .: . . ::::.: :. :.: ..:::
XP_016 VKEDKDAQFYCELNYRLPSGNHMK-ESREVTVPVFYPTEKV--WL--EVEPVGMLKEGDR
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 VQLLCRGDGSPSPEYTLFR----LQDEQEEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDY
:.. : .::.: :.... . .. .::. : : : :.:: . . .:: : :. :
XP_016 VEIRCLADGNPPPHFSISKQNPSTREAEEETTNDN--GVLVLEPARKEHSGRYECQGLDL
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 DAADDVQLSKTLELRVAYLDPLELSEGKVLSLPLNSSAVVNCSVHGLPTPALRWTKDSTP
:. .. ::. :: : :.. ...: . .:: ...: ... ..: .. :
XP_016 DTMISL-LSEPQELLVNYVSDVRVSPAAPERQE-GSSLTLTCEAESSQDLEFQWLREETG
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 --LGDGPMLSLSSITFDSNGTYVCEASLPTVPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKAD
: ::.:.: .. ...: : : ::.:..: :.::: .. . : : . : : :.
XP_016 QVLERGPVLQLHDLKREAGGGYRCVASVPSIPGLNRTQLVNVAIFGPPWM--AFKERKV-
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KB6 GSW-REGDEVTLICSARGHPDPKLSWSQLG-GSPAEPIPGRQGWVSSSLTLKVT------
: .:. ..: : : ::: : .::. : .: . : : : :.:.. ::
XP_016 --WVKENMVLNLSCEASGHPRPTISWNVNGTASEQDQDPQR---VLSTLNVLVTPELLET
450 460 470 480 490
520 530 540 550 560
pF1KB6 ---SALSRD-----GISCEASNPHGNKRHVFHFGTVSPQTSQAGVAVMAVAVSVGLLLLV
..:. : :.: ...:: .. . :. . ::...:: : . .: ..
XP_016 VNLTTLTPDSNTTTGLSTSTASPH-TRANSTSTERKLPEPESRGVVIVAVIVCILVLAVL
500 510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 VAVFYCVRRKGG-PCCRQRREKGAPPPGEPG---LSHSGSEQPEQTGLLMGGASGGARGG
::.: . .:: :: :. ... . ::.. . . .... ::. :::.: :.: . .
XP_016 GAVLYFLYKKGKLPCRRSGKQEITLPPSRKSELVVEVKSDKLPEEMGLLQG--SSGDKRA
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 SGGFGDEC
: :..
XP_016 PGDQGEKYIDLRH
620
>>XP_016873251 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surface gl (583 aa)
initn: 540 init1: 163 opt: 678 Z-score: 498.7 bits: 102.3 E(85289): 4.9e-21
Smith-Waterman score: 766; 30.6% identity (57.0% similar) in 611 aa overlap (12-585:2-576)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAH---P---DAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCT
: :::. : :::: : . .:.. .: :::: :....: :
XP_016 MGLPRLVC-AFLLAACCCCPRVAGVPGEAEQPAPELVEVEVGSTALLKCG
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB6 PTGTHDHY-MLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPP--YQ--LDSQGR
. .. . ..:: :.. . : ... .:.: : :. :. : :
XP_016 LSQSQGNLSHVDWF------------SVHKEKRTLIFRVRQGQGQSEPGEYEQRLSLQDR
50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 ---LVLAEAQVGDERDYVCVVRAGAAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSA
:.:... ::: ..: .. . : .: :. :: ... : . :
XP_016 GATLALTQVTPQDERIFLC--QGKRPRSQEYRIQLRVYKAPEEPNIQVNPLGIPVNSKEP
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 QEIATCNSRNGNPAPKITWYRNGQRLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRL
.:.::: .::: : :.. ::.::. :. : : ..:.:: :.::: .: : : .:
XP_016 EEVATCVGRNGYPIPQVIWYKNGRPLKE--EKNRVHIQSSQTV-ESSGLYTLQSILKAQL
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 RKDDRDASFHCAAHYSLPEGRHGRLDSPTFHLTLHYPTEHVQFWVGSPSTPAGWVREGDT
:.:.::.:.: .: :: : : . .: . . ::::.: :. :.: ..:::
XP_016 VKEDKDAQFYCELNYRLPSGNHMK-ESREVTVPVFYPTEKV--WL--EVEPVGMLKEGDR
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 VQLLCRGDGSPSPEYTLFR----LQDEQEEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDY
:.. : .::.: :.... . .. .::. : : : :.:: . . .:: : :. :
XP_016 VEIRCLADGNPPPHFSISKQNPSTREAEEETTNDN--GVLVLEPARKEHSGRYECQGLDL
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 DAADDVQLSKTLELRVAYLDPLELSEGKVLSLPLNSSAVVNCSVHGLPTPALRWTKDSTP
:. .. ::. :: : :.. ...: . .:: ...: ... ..: .. :
XP_016 DTMISL-LSEPQELLVNYVSDVRVSPAAPERQE-GSSLTLTCEAESSQDLEFQWLREETG
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 --LGDGPMLSLSSITFDSNGTYVCEASLPTVPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKAD
: ::.:.: .. ...: : : ::.:..: :.::: .. . : : . : : :.
XP_016 QVLERGPVLQLHDLKREAGGGYRCVASVPSIPGLNRTQLVNVAIFGPPWM--AFKERKV-
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KB6 GSW-REGDEVTLICSARGHPDPKLSWSQLG-GSPAEPIPGRQGWVSSSLTLKVT------
: .:. ..: : : ::: : .::. : .: . : : : :.:.. ::
XP_016 --WVKENMVLNLSCEASGHPRPTISWNVNGTASEQDQDPQR---VLSTLNVLVTPELLET
450 460 470 480 490
520 530 540 550 560
pF1KB6 ---SALSRD-----GISCEASNPHGNKRHVFHFGTVSPQTSQAGVAVMAVAVSVGLLLLV
..:. : :.: ...:: .. . :. . ::...:: : . .: ..
XP_016 VNLTTLTPDSNTTTGLSTSTASPH-TRANSTSTERKLPEPESRGVVIVAVIVCILVLAVL
500 510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 VAVFYCVRRKGG-PCCRQRREKGAPPPGEPGLSHSGSEQPEQTGLLMGGASGGARGGSGG
::.: . .:: :: :. ...
XP_016 GAVLYFLYKKGKLPCRRSGKQEMERNTSI
560 570 580
>>XP_016873250 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surface gl (604 aa)
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>>XP_016873249 (OMIM: 155735) PREDICTED: cell surface gl (614 aa)
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. .. . ..:: :.. . : ... .:.: : :. :. : :
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: .:. ..: : : ::: : .::. : .: . : : : :.:.. :: : .
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XP_016 H
>>NP_006491 (OMIM: 155735) cell surface glycoprotein MUC (646 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MEPPDAPAQARGAPRLLLLAVLLAAH---P---DAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCT
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NP_006 MGLPRLVC-AFLLAACCCCPRVAGVPGEAEQPAPELVEVEVGSTALLKCG
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pF1KB6 PTGTHDHY-MLEWFLTDRSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPP--YQ--LDSQGR
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NP_006 LSQSQGNLSHVDWF------------SVHKEKRTLIFRVRQGQGQSEPGEYEQRLSLQDR
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NP_006 GATLALTQVTPQDERIFLC--QGKRPRSQEYRIQLRVYKAPEEPNIQVNPLGIPVNSKEP
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.:.::: .::: : :.. ::.::. :. : : ..:.:: :.::: .: : : .:
NP_006 EEVATCVGRNGYPIPQVIWYKNGRPLK--EEKNRVHIQSSQTV-ESSGLYTLQSILKAQL
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NP_006 VKEDKDAQFYCELNYRLPSGNHMK-ESREVTVPVFYPTEKV--WL--EVEPVGMLKEGDR
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:. : ::: :.. .. . .:.::.:
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. ::. :::.: :.: . . : :..
NP_006 KLPEEMGLLQG--SSGDKRAPGDQGEKYIDLRH
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.. :: . ..:: .: :. . .: . .. .... : :... : .:::::::.
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NP_001 IHSEQAVFDIYYPTEQVTIQVLPPKNA---IKEGDNITLKCLGNGNPPPEEFLFYLPGQP
240 250 260 270 280
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pF1KB6 EEVLNVNLEGNLTLEGVTRGQSGTYGCRVEDYDAADDVQLSKTLELRVAYLDPLELSEGK
: . . : . :: : :. .: : : . : .. . . : ::: : :. .
NP_001 EGIRSSN---TYTLTDVRRNATGDYKCSL-----IDKKSMIASTAITVHYLD-LSLNPSG
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.. .... :.:.. . . .. : ::. : ..: :.::. ... :.::::..:
NP_001 EVTRQIGDALPVSCTISASRNATVVWMKDNIRLRSSP--SFSSLHYQDAGNYVCETALQE
350 360 370 380 390
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pF1KB6 VPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKADGSWREGDEVTLICSARGHPDPKLSWSQLG-
: :.. ...::.:.:.:..: .. :.: : : :.:: ..: : : ..:. :
NP_001 VEGLKKRESLTLIVEGKPQIKMTK---KTDPS---GLSKTIICHVEGFPKPAIQWTITGS
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:: .: : .: :.. .. .. ..: : : . .. .. . .
NP_001 GSVINQTEESPYINGRYYSKIIISPEENVT---LTCTAENQLERTVNSLNVSANENREKV
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pF1KB6 AGVAVMAVAVSVGLLL--LVVAVFYCVRRKGGPCCRQRREKGAPPPGEPGLSHSGSEQPE
: . :.. ::::: ::..: :
NP_001 NDQAKLIVGIVVGLLLAALVAGVVYWLYMKKSKTASKHVNKDLGNMEENKKLEENNHKTE
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>>NP_001230210 (OMIM: 601662) CD166 antigen isoform 3 pr (555 aa)
initn: 249 init1: 115 opt: 268 Z-score: 207.6 bits: 48.4 E(85289): 8e-05
Smith-Waterman score: 593; 26.5% identity (56.8% similar) in 548 aa overlap (41-569:31-547)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 RGAPRLLLLAVLLAAHPDAQAEVRLSVPPLVEVMRGKSVILDCTPTGTHDHYMLEWFLTD
:. : ..:. : .. .. .:
NP_001 MESKGASSCRLLFCLLISATVFRPGLGWYTVNSAYGDTIIIPCRLDVPQNLMFGKWKYEK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 RSGARPRLASAEMQGSELQVTMHDTRGRSPPYQLDSQGRLVLAEAQVGDERDYVCVVRAG
.:. : . : .... .: . :. . .:. . : ...:...::. .::.. .
NP_001 PDGS-PVFI-AFRSSTKKSVQYDDVPEYKDRLNLSENYTLSISNARISDEKRFVCML-VT
70 80 90 100 110
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pF1KB6 AAGTAEATARLNVFAKPEATEVSPNKGTLSVMEDSAQEIATCNSRNGNPAPKITWYRNGQ
.. :: . ..:: .: :. . .: . .. .... : :... : .:::::::.
NP_001 EDNVFEAPTIVKVFKQPSKPEIVSK--ALFLETEQLKKLGDCISEDSYPDGNITWYRNGK
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 RLEVPVEMNPEGYMTSRTVREASGLLSLTSTLYLRLRKDDRDASFHCAAHYSLPEGRHGR
:. :.: . . .. . .. : ..:::: . : : . : :.. : : :..
NP_001 VLH-PLE-GAVVIIFKKEMDPVTQLYTMTSTLEYKTTKADIQMPFTCSVTYYGPSGQK-T
180 190 200 210 220 230
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. : . ..::::.: . : :.. ..:::.. : : :.:.: :: :: : .
NP_001 IHSEQAVFDIYYPTEQVTIQVLPPKNA---IKEGDNITLKCLGNGNPPPEEFLFYLPGQP
240 250 260 270 280
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NP_001 EGIRSSN---TYTLTDVRRNATGDYKCSL-----IDKKSMIASTAITVHYLD-LSLNPSG
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.. .... :.:.. . . .. : ::. : ..: :.::. ... :.::::..:
NP_001 EVTRQIGDALPVSCTISASRNATVVWMKDNIRLRSSP--SFSSLHYQDAGNYVCETALQE
350 360 370 380 390
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pF1KB6 VPVLSRTQNFTLLVQGSPELKTAEIEPKADGSWREGDEVTLICSARGHPDPKLSWSQLG-
: :.. ...::.:.:.:..: .. :.: : : :.:: ..: : : ..:. :
NP_001 VEGLKKRESLTLIVEGKPQIKMTK---KTDPS---GLSKTIICHVEGFPKPAIQWTITGS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
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