Result of FASTA (omim) for
pF1KB6133
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6133, 590 aa
1>>>pF1KB6133 590 - 590 aa - 590 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2704+/-0.000553; mu= -3.0623+/- 0.034
mean_var=391.7385+/-80.858, 0's: 0 Z-trim(117.9): 158 B-trim: 395 in 1/54
Lambda= 0.064800
statistics sampled from 30152 (30314) to 30152 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 11.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 3825 372.5 2.2e-102
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 2776 274.4 7.1e-73
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 2773 274.1 8.7e-73
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 2771 273.9 9.8e-73
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 2365 236.0 2.6e-61
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 2280 228.1 7e-59
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 2145 215.5 4.4e-55
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 2145 215.5 4.5e-55
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 2091 210.4 1.5e-53
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 2078 209.2 3.2e-53
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 2023 204.0 1e-51
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1920 194.3 8.5e-49
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1877 190.3 1.4e-47
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1817 184.7 6.6e-46
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1800 183.1 2e-45
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1800 183.1 2e-45
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1781 181.3 6.9e-45
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1776 180.9 1e-44
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1776 180.9 1e-44
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 1738 177.3 1e-43
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 1738 177.3 1e-43
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 1738 177.3 1.1e-43
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 1733 176.8 1.4e-43
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1722 175.7 2.8e-43
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1671 170.9 7.3e-42
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1669 170.8 8.6e-42
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1615 165.8 3.2e-40
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1613 165.6 3.3e-40
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1476 152.8 2.6e-36
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1465 151.8 5.2e-36
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1465 151.8 5.2e-36
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1452 150.5 1.1e-35
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1452 150.5 1.1e-35
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1444 149.8 2e-35
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1444 149.8 2e-35
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1444 149.9 2.2e-35
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1424 147.9 7.3e-35
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1279 134.2 6.9e-31
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1270 133.4 1.4e-30
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 1202 127.2 1.2e-28
XP_011536591 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 322) 1120 119.3 2e-26
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1098 117.2 7.7e-26
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1074 115.2 4.9e-25
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1071 114.9 5.6e-25
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 1002 108.2 3.7e-23
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508) 983 106.7 1.9e-22
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 911 100.1 2.2e-20
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 907 99.7 3e-20
NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295) 895 98.2 4e-20
XP_011536312 (OMIM: 611159) PREDICTED: keratin, ty ( 488) 862 95.4 4.7e-19
>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17 (590 aa)
initn: 3825 init1: 3825 opt: 3825 Z-score: 1959.1 bits: 372.5 E(85289): 2.2e-102
Smith-Waterman score: 3825; 100.0% identity (100.0% similar) in 590 aa overlap (1-590:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 AGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAESW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAESW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 YQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 GELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEECR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEECR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB6 GLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
550 560 570 580 590
>>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 2642 init1: 2491 opt: 2776 Z-score: 1429.3 bits: 274.4 E(85289): 7.1e-73
Smith-Waterman score: 2867; 77.2% identity (90.3% similar) in 588 aa overlap (2-589:3-563)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
: .... .:.. :.::. :: :.:::..:.::: : . :.::.: :::: .:
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
.::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
NP_005 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
NP_005 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
::::::.::::::::::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
NP_005 LDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
:::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_005 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
:::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
NP_005 WYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
:::.:::::.::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
NP_005 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
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480 490 500 510 520 530
pF1KB6 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
::.::::: :::::: :.::::::..:: :.::: :.:::: ::
NP_005 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
:.::.::: :::.::::..: :..: ::.::..:...:.::::::.:
NP_005 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
520 530 540 550 560
>>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 2636 init1: 2488 opt: 2773 Z-score: 1427.8 bits: 274.1 E(85289): 8.7e-73
Smith-Waterman score: 2864; 77.0% identity (90.1% similar) in 588 aa overlap (2-589:3-563)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
: .... .:.. :.::. :: :.:::..:.:.: : . :.::.: :::: .:
NP_005 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
.::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
NP_005 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
NP_005 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
NP_005 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
::::::::::::::.::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
NP_005 LDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
:::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_005 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
:::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
NP_005 WYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
:::.:::::.::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
NP_005 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
420 430 440 450 460 470
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pF1KB6 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
::.::::: :::::: :.::::::..:: :.::: :.:::: ::
NP_005 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
:.::.::: :::.::::. : :..: ::.::..:...:.::::::.:
NP_005 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
520 530 540 550 560
>>NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 2638 init1: 2487 opt: 2771 Z-score: 1426.8 bits: 273.9 E(85289): 9.8e-73
Smith-Waterman score: 2862; 76.5% identity (90.3% similar) in 588 aa overlap (2-589:3-563)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
: .... .:.. :.::. :: :.:::..:.:.: : . :.::.: :::: .:
NP_775 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
.::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
NP_775 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
NP_775 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_775 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
::::::::::::::.::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
NP_775 LDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
:::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_775 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
300 310 320 330 340 350
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pF1KB6 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
:::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::.:: :::::::
NP_775 WYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
:::.:::::.::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
NP_775 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
420 430 440 450 460 470
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pF1KB6 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
::.::::: ::.::: :..:::::..:: :.::: :.:::: ::
NP_775 RLNGEGVGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
:.::..:: :::.::::..: :..: ::.::..:...:.::::::.:
NP_775 ---GSGLGIGG-GFSSSSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
520 530 540 550 560
>>NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II cytos (551 aa)
initn: 2608 init1: 2197 opt: 2365 Z-score: 1221.8 bits: 236.0 E(85289): 2.6e-61
Smith-Waterman score: 2688; 74.9% identity (88.3% similar) in 590 aa overlap (1-588:1-549)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVS--RSGGGGGGGFGRVSLAGACGVG
::::::..:.::. :.:::.:::::...:. :.::: ::..:.:: .::.: :::
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10 20 30 40 50
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pF1KB6 GYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLG
..::::::::::.::.::. :.: :. :::: :.. :: ...::: :
NP_004 SFGSRSLYNLGGAKRVSINGCGSSCRS----------GFGGRASNRFG----VNSGFGYG
60 70 80 90 100
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pF1KB6 GGAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNK
::. ::::.::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::::.::::::::::::
NP_004 GGV--GGGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNK
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pF1KB6 FASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERG
::::::::::::::::::.:::.::::::..::::::::::..: ..:::::.::. :::
NP_004 FASFIDKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERG
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::..:::::::.::::: .:::::::::.:::::: ::::::::::::::::::: .: .
NP_004 RLEAELRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPE
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pF1KB6 EINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAE
::::.. :::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::
NP_004 EINFIHSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAE
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::::::::::: :::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::..::.::::::
NP_004 SWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAE
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pF1KB6 QRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEE
::::::::::: ::..:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
NP_004 QRGELALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEE
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pF1KB6 CRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSG
::::::::.:::::::::..::::::::. ::: . ::::: : : ..::
NP_004 CRLSGEGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGG-NLGLGGGSG----------YSFTTSG
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pF1KB6 GVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
: .::.:: :::::::.:.:::: ::.::::::::::::.::.
NP_004 GHSLGAGL--GGSGFSATSNRGLG-------GSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH
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Smith-Waterman score: 2423; 64.6% identity (82.1% similar) in 636 aa overlap (1-586:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGGY
::::.: . .:::..:: ::.. . :: : :..:::.:::..: : :.::.
NP_476 MSRQASKT-SGGGSQGFSGRSAVVSGSSRMS--CVAHSGGAGGGAYGFRS-----GAGGF
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pF1KB6 GSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFR------NR------------FGAGAGGGYG--FGGG
::::::::::.: ::::...:. : .: ::.: :::.: ::::
NP_476 GSRSLYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGGFGGG
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110 120 130 140
pF1KB6 AGSGFGFGGGAG----GGFG----LGGGAGFGG--GFGGPGFPVCP--------PGGIQE
: : ::::..: :::: .:: .:::: :::::: : ::::::
NP_476 RGMGGGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPGGIQE
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pF1KB6 VTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTL
::.::::: :::..:::.: .:...:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
NP_476 VTINQSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWNL
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210 220 230 240 250 260
pF1KB6 LQEQGTKTVR--QNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYED
::.:::... .:::::::..:: :: ::.:.::::::::::.::.:::::::.::::
NP_476 LQQQGTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKKKYED
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pF1KB6 EINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSD
::::::.:::::: ::::::.::::::::.::::::.:::.:.. ..::::::::.:.::
NP_476 EINKRTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQSHISD
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:::::::::::.::::::::::.::::.::.::..:::. :::: ::: ::::::::::
NP_476 TSVVLSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLR
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pF1KB6 NTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQ
::: :: :.:::::::::::..:::: ::::.:::.:::.::.::::: :: ::. :::
NP_476 NTKSEIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQAALQ
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pF1KB6 KAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSS
.::.:.:::::.::::::.::::::::::::::::::: :.::: . :.::::.::..:
NP_476 QAKDDLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSSSTTS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KB6 GYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGL-AGGSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGR
.:..::::: :::.:::::::. :::.::: .. ..:: :.:::.. :.::::..::
NP_476 --ASAGGYGGGYGGGMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRGGGG-GIGGGFGGGSSGFSGGSGF
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560 570 580 590
pF1KB6 GL--GVGFG-SGGGSSS------SVKFVSTTSSSRKSFKS
: :. .: :::: :: :.:: ....::..
NP_476 GSISGARYGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
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>>NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II cytos (639 aa)
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Smith-Waterman score: 2184; 62.7% identity (82.0% similar) in 582 aa overlap (12-573:17-585)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSR---TSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLA
:: :.::..::.. . :: .::. .:: :::::: ::
NP_000 MSCQISCKSRGRGGGGGGFRGFSSGSAVVSGGSRRSTSSFSCLSRHGGGGGG-FG-----
10 20 30 40 50
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pF1KB6 GACGVGGYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGS--------FRNRFGAGAGGGYGFGGGAG-S
: ::.::::: .:::.: ::::..::. : .: :.: ::: .::::.: :
NP_000 G----GGFGSRSLVGLGGTKSISISVAGGGGGFGAAGGFGGR-GGGFGGGSSFGGGSGFS
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pF1KB6 GFGFGGGA-GGG-FGLGGGAGFGGGFGGPG-F-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDP
: :::::. ::: :: :: : ::.:::: : : ::::.::.:::::: :::...::
NP_000 GGGFGGGGFGGGRFGGFGGPGGVGGLGGPGGFGPGGYPGGIHEVSVNQSLLQPLNVKVDP
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pF1KB6 SIQRVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLF
:: :...::::::::::::::::::::::::::.::.::: :::.... : ::::.:
NP_000 EIQNVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQMNVGTRPINLEPIF
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pF1KB6 EQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDV
. ::..:.: ::....:: .::: ::::::::.:.::::::::::.:::.:: :::::
NP_000 QGYIDSLKRYLDGLTAERTSQNSELNNMQDLVEDYKKKYEDEINKRTAAENDFVTLKKDV
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pF1KB6 DAAYMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSII
: ::: ::::..::: : .::.:.:...:::.::.. :.::.:.:::::.:::::::::
NP_000 DNAYMIKVELQSKVDLLNQEIEFLKVLYDAEISQIHQSVTDTNVILSMDNSRNLDLDSII
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pF1KB6 AEVKAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAE
:::::::::::.::. :::. :..:::::: :.:::::.:.. : ::::.::.::::..:
NP_000 AEVKAQYEEIAQRSKEEAEALYHSKYEELQVTVGRHGDSLKEIKIEISELNRVIQRLQGE
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pF1KB6 IDNVKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNT
: .::::: :.:.:::::::::: ::::::::: .::::::.::.:.:::::.::::::.
NP_000 IAHVKKQCKNVQDAIADAEQRGEHALKDARNKLNDLEEALQQAKEDLARLLRDYQELMNV
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pF1KB6 KLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGG
:::::::::::::::::::::.::. . :..::..:..::. .: ...:: .:: :..
NP_000 KLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGDLSSNVTVSVTSSTISSNVASKAAFGG--SGGRGSS
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pF1KB6 LGGGLAGGSS----GSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSV
::: ..::: :. :.: :: : ::..: :: : ...:: : : :: ::: :
NP_000 SGGGYSSGSSSYGSGGRQSGSRGGSGGGGSISGGGYGSGGGSGGRYGSGGGSKGGSISGG
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pF1KB6 KFVSTTSSSRKSFKS
NP_000 GYGSGGGKHSSGGGSRGGSSSGGGYGSGGGGSSSVKGSSGEAFGSSVTFSFR
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>>NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,600962,60 (644 aa)
initn: 2352 init1: 2032 opt: 2145 Z-score: 1109.8 bits: 215.5 E(85289): 4.5e-55
Smith-Waterman score: 2297; 63.8% identity (83.9% similar) in 602 aa overlap (1-573:1-599)
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pF1KB6 MSRQ-SSVS-FRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGAC-GV
:::: :: : .::::. ::..:: . .: . .: .: .::::: :. . .:. :.
NP_006 MSRQFSSRSGYRSGGG--FSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
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pF1KB6 GG-YGSRSLYNLGGSKRISISTS-GGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGA--GG
:: .::::: :::::: ::::.. ::. . ::.: ::: :::::. .: :::::. ::
NP_006 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGG-GFGGGGFGGGGFGGGGIGGG
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pF1KB6 GFG-LG-GGAGFGGG-FGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVR
::: .: ::.::::: ::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:.
NP_006 GFGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVK
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pF1KB6 TEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINN
..::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..:::
NP_006 SREREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINN
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:::..:.. ....::::::.::::.:::..:::::::::::.:::::: .:::::.:::.
NP_006 LRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMT
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pF1KB6 KVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQ
::.:.::.: :..::.:. ...::::::::..:.:.:.:::::::.:::::::::::::
NP_006 KVDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQ
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::.::..:..:::: ::.:::::: :::::::..::.: ::::.::.:::::.:::::::
NP_006 YEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKK
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pF1KB6 QCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDV
: .:::..:.::::::: :::::.::: .::.:::.::.:.:::::.::::::::::::.
NP_006 QISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDL
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pF1KB6 EIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTS--SVSSG---------YGSG-SGYGGGLG
:::::: :::::: :.::: . :..:: :: ..:.: :::: :.::.: :
NP_006 EIATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGG
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pF1KB6 G-GLGGGLGGGLAG-GSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGS
. : ::: ::: .. ::.:: :.:..:. : ::: . :: :.::. : : :.:::.
NP_006 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGG
540 550 560 570 580 590
580 590
pF1KB6 SSSVKFVSTTSSSRKSFKS
::
NP_006 SSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
600 610 620 630 640
>>NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskeletal (638 aa)
initn: 1899 init1: 1899 opt: 2091 Z-score: 1082.6 bits: 210.4 E(85289): 1.5e-53
Smith-Waterman score: 2282; 62.5% identity (78.7% similar) in 642 aa overlap (1-587:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGGY
:.:: . :: :..:: ::.. . :: : :.::::.:::. : : :.:..
NP_056 MNRQVCKKSFSGRSQGFSGRSAVVSGSSRMS--CVARSGGAGGGACGFRS-----GAGSF
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.::: .:: : .::::::: : ::::::: :::::: :::..::
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:.: .:...:::::::::::::::::::::::::::::.::: :::.: : . ..:::
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. ::...::: . : :. ::::.:.:..: .:::::..:
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::: ::::::::::. :::. : :. : ::: : : :.: ::: :. .
NP_778 GYGIHGRGFGSRSLYNLGGSRSISINLMG---RSTSGFCQGGGVG-GFGGGRGFGVGSTG
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