Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6139, 593 aa
1>>>pF1KB6139 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9994+/-0.00102; mu= 15.3019+/- 0.061
mean_var=76.0604+/-15.005, 0's: 0 Z-trim(104.4): 29 B-trim: 26 in 1/49
Lambda= 0.147060
statistics sampled from 7880 (7894) to 7880 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12181.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 593) 3856 828.0 0
CCDS45948.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 590) 3823 821.0 0
CCDS62522.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 ( 604) 3329 716.2 2.9e-206
CCDS35146.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 ( 594) 2558 552.6 5e-157
CCDS6874.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 ( 603) 2546 550.1 3e-156
CCDS790.1 STXBP3 gene_id:6814|Hs108|chr1 ( 592) 1791 389.9 4.8e-108
CCDS944.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 570) 319 77.6 4.8e-14
CCDS72904.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 447) 309 75.4 1.7e-13
CCDS60244.1 VPS45 gene_id:11311|Hs108|chr1 ( 538) 282 69.7 1.1e-11
>>CCDS12181.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (593 aa)
initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856 Z-score: 4421.0 bits: 828.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3856; 99.8% identity (100.0% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVYVMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS12 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVYVMG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB6 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
550 560 570 580 590
>>CCDS45948.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (590 aa)
initn: 3312 init1: 3312 opt: 3823 Z-score: 4383.2 bits: 821.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3823; 99.3% identity (99.5% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEK---ALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKGS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSEE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPTYQLSRWTPVIK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVYVMG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS45 DVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEARAGPRLIVYVMG
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB6 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
540 550 560 570 580 590
>>CCDS62522.1 STXBP2 gene_id:6813|Hs108|chr19 (604 aa)
initn: 3329 init1: 3329 opt: 3329 Z-score: 3816.6 bits: 716.2 E(32554): 2.9e-206
Smith-Waterman score: 3824; 98.0% identity (98.2% similar) in 604 aa overlap (1-593:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEK-----------SVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDT
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKAQAQRVIHLPQSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 CPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 CPEPLFSELGRSRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 EVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EVLAQQIATLCATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LLIMDRAADPVSPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 ELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ELRHMHIADVSKKVTELLRTFCESKRLTTDKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHL
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 ADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ADDCMKHFKGSVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLL
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 YILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 YILLRNGVSEENLAKLIQHANVQAHSSLIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERMEPT
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 YQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS62 YQLSRWTPVIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGIEAR
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 AGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AGPRLIVYVMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLED
550 560 570 580 590 600
590
pF1KB6 IALP
::::
CCDS62 IALP
>>CCDS35146.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 (594 aa)
initn: 2502 init1: 1416 opt: 2558 Z-score: 2932.6 bits: 552.6 E(32554): 5e-157
Smith-Waterman score: 2558; 63.5% identity (86.0% similar) in 594 aa overlap (1-591:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
CCDS35 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
CCDS35 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
CCDS35 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
CCDS35 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
CCDS35 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
CCDS35 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
CCDS35 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
CCDS35 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 VIKDVMEDAVEDRLDRNLWPFVSDPAPTASSQAAVSARFGHWHKNKAGVEARAGPRLIVY
.:::.:::..::.:: . .:..: . .. : .:::::.:::::::: : :.:::::..
CCDS35 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 VMGGVAMSEMRAAYEVTRATEGKWEVLIGSSHILTPTRFLDDLKALDKKLEDIALP
..:::...::: :::::.:. :::::::::.::::: ..:: :: :.: :.:.
CCDS35 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS
550 560 570 580 590
>>CCDS6874.1 STXBP1 gene_id:6812|Hs108|chr9 (603 aa)
initn: 2497 init1: 1416 opt: 2546 Z-score: 2918.8 bits: 550.1 E(32554): 3e-156
Smith-Waterman score: 2546; 63.9% identity (86.2% similar) in 587 aa overlap (1-584:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPSGLKAVVGEKILSGVIRSVKKDGEWKVLIMDHPSMRILSSCCKMSDILAEGITIVED
::: ::::::::::. ::..::: ::::::..:. :::.:::::::.::..::::::::
CCDS68 MAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 INKRREPIPSLEAIYLLSPTEKSVQALIKDFQGTPTFTYKAAHIFFTDTCPEPLFSELGR
:::::::.:::::.::..:.::::..::.::. :: :.:::.::::.::. ::.:: .
CCDS68 INKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SRLAKVVKTLKEIHLAFLPYEAQVFSLDAPHSTYNLYCPFRAEERTRQLEVLAQQIATLC
:: :::.::: ::..::::::.::.:::. : ..: : .:. .. :: ::.::::::
CCDS68 SRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ATLQEYPAIRYRKGPEDTAQLAHAVLAKLNAFKADTPSLGEGPEKTRSQLLIMDRAADPV
:::.::::.::: .:.: ::. . ::.:.::: :..::::.:.::::::.::. ::
CCDS68 ATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPLLHELTFQAMAYDLLDIEQDTYRYETTGLSEAREKAVLLDEDDDLWVELRHMHIADVS
::.:::::::::.:::: ::.:.:.:::.:..::: : ::::::::::. ::: :::.::
CCDS68 SPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB6 KKVTELLRTFCESKRLTT-DKANIKDLSQILKKMPQYQKELNKYSTHLHLADDCMKHFKG
..::. :. : :::..: .:....::::.:::::::::::.:::::::::.:::::..:
CCDS68 QEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRDLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 SVEKLCSVEQDLAMGSDAEGEKIKDSMKLIVPVLLDAAVPAYDKIRVLLLYILLRNGVSE
.:.::: ::::::::.::::::::: :. :::.:::: : .:::::..::::.:.::..:
CCDS68 TVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ENLAKLIQHANVQAHSS-LIRNLEQLGGTVTNPGGSGTSSRLEPRERM-EPTYQLSRWTP
::: ::::::.. ..: .: :. .:: ... . :. : .::. : :::::::::
CCDS68 ENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTP
430 440 450 460 470 480
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CCDS68 IIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIF
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CCDS68 ILGGVSLNEMRCAYEVTQAN-GKWEVLIGSTHILTPTKFLMDLRHPDFRESSRVSFEDQA
550 560 570 580 590
CCDS68 PTME
600
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CCDS79 SINGTTEENLDRLIQNVKIENESDMIRNWSYLGVPIVPQSQQGKPLR---KDRSAEETFQ
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CCDS79 LSRWTPFIKDIMEDAIDNRLDSKEWPYCSQCPAVWNGSGAVSAR----QKPRANYLEDRK
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590
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CCDS79 VSLIKDE
590
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CCDS94 IDSQNREIMKHLKAICFLRPTKENVDYIIQELR-RPKYTI--YFIYFSNVISKSDVKSLA
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CCDS94 EADEQEVVAEVQEFYGDYIAVNPHLFSLNI------LGCCQGRNWDPAQLSRTTQGLTAL
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CCDS94 QFLKGLKGVENVYTQHQPFLHETLDHLIKGRLKENLYPYL---GPST-------------
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CCDS94 EVLASGLHSRSKESSQVTSRSASRR
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CCDS72 SRSASRR
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CCDS60 QKLESIADMKAFVENYPQFKKMSGTVSKHVTVVGELSRLVSERNLLEVSEVEQELACQND
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CCDS60 H-----SSALQNIKRLLQNPKVTEFDAARLVMLYALHYERHSSNSLPGLMMDLRNKGVSE
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CCDS60 DHLIKGRLKENLYPYLG---PST---------------------LRDRPQDIIVFVIGGA
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CCDS60 TYEEALTVYNLNRTTPGVRIVLGGTTVHNTKRDGVSLCSPAWFRTPGLKRSTRLSLPKCW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]