FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6159, 599 aa 1>>>pF1KB6159 599 - 599 aa - 599 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0025+/-0.00198; mu= 13.7704+/- 0.118 mean_var=343.9374+/-64.064, 0's: 0 Z-trim(107.0): 926 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.069157 statistics sampled from 8283 (9321) to 8283 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 2.760 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 599) 4267 441.0 2.1e-123 CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 509) 3659 380.2 3.5e-105 CCDS74693.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 640) 3592 373.7 4.1e-103 CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 2057 220.8 6e-57 CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 591) 1961 210.9 3.8e-54 CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 667) 1958 210.7 4.9e-54 CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 635) 1956 210.4 5.5e-54 CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 654) 1956 210.5 5.6e-54 CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 657) 1956 210.5 5.6e-54 CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 653) 1951 210.0 7.9e-54 CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 1802 195.1 2.3e-49 CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 1797 194.5 3.2e-49 CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 1797 194.6 3.3e-49 CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 1797 194.6 3.4e-49 CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1691 184.1 5.5e-46 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1585 173.5 8.3e-43 CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1578 172.8 1.3e-42 CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1578 172.8 1.3e-42 CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 ( 603) 1575 172.4 1.5e-42 CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1575 172.5 1.6e-42 CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1561 171.1 4.1e-42 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1552 170.3 8.3e-42 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1494 164.3 4.1e-40 CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1489 163.8 5.8e-40 CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1489 163.9 5.9e-40 CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1485 163.4 7.6e-40 CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1485 163.5 7.8e-40 CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1483 163.4 9.7e-40 CCDS12844.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19 ( 581) 1479 162.8 1.1e-39 CCDS33089.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19 ( 617) 1479 162.8 1.2e-39 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1481 163.3 1.2e-39 CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1477 162.6 1.3e-39 CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1477 162.6 1.3e-39 CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1477 162.6 1.3e-39 CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1475 162.5 1.6e-39 CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1475 162.6 1.7e-39 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1472 162.3 2.1e-39 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1469 161.8 2.3e-39 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1469 161.9 2.4e-39 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1469 161.9 2.4e-39 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1469 161.9 2.4e-39 CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1469 162.2 2.8e-39 CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1467 161.8 3e-39 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1465 161.5 3.2e-39 CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1462 161.2 4e-39 CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1462 161.3 4.3e-39 CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1462 161.3 4.3e-39 CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1462 161.3 4.3e-39 CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1462 161.4 4.3e-39 CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1457 160.5 4.7e-39 >>CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 (599 aa) initn: 4267 init1: 4267 opt: 4267 Z-score: 2329.0 bits: 441.0 E(32554): 2.1e-123 Smith-Waterman score: 4267; 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CCDS43 NKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAK 470 480 490 500 510 520 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 INCREYEPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCS .. : ...:. ::. :: :.: :.: .:::.:. .: :. :.:::. :::::: CCDS43 VKYGECGQGFSVKSDVITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCR 530 540 550 560 570 580 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 ECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGR ::::::: .: : :::::. ::::.:::::..: .:.: :: :. :::::: :::: CCDS43 ECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGR 590 600 610 620 630 640 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 GFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQ :::..: .. ::: :.::::::: ::::.: .:.: ::: :.::::::::::::::: CCDS43 GFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSW 650 660 670 680 690 700 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 NSDLIKHQRTHLDEKPYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLL .: :. ::::: ::::::::::::: .:: :. :.:::.::::::: :::::: :: : CCDS43 QSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSHL 710 720 730 740 750 760 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 LVHQRTHSGEKHYVCRECRRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHE : :::::.::: :::::: ::: .::::. :::::..::::.:::::::: .:: :. :. CCDS43 LRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQ 770 780 790 800 810 820 550 560 570 580 590 pF1KB6 RTHSGEKPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH :::.::::::: :::::: :: :: :::::.::: ::::::::::: .:.: ::::: CCDS43 RTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSDRSSLCYHQRTHT 830 840 850 860 870 880 CCDS43 GEKPYVCREDE 890 >>CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (591 aa) initn: 4962 init1: 1755 opt: 1961 Z-score: 1085.6 bits: 210.9 E(32554): 3.8e-54 Smith-Waterman score: 1961; 56.3% identity (75.6% similar) in 504 aa overlap (101-599:9-509) 80 90 100 110 120 pF1KB6 FTEAEWKRLSPEQRNLYKEVMLENYRNLLSLAEPKPEIYTCSSCLLAFSCQQFLSQHVL- ::.:.::.: : .:: :.: :::: CCDS63 MCNGRKTVLADPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLC 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 ----QIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKPWSARTE :: ::::....::. .:: ..: :: :. : ..::: : : :. : .::. CCDS63 NHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQ-QQASEGRPWSDQAEGPE-GEGAMPLFGRTK 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 ERETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGAINCRE .: : :: : ::: .: :.: :: : : :: :: . :: ::..:.: ::..:: : CCDS63 KR-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGE 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 YEPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRG . . .:.... : :.:::.:. : ..:. ...: ::.. :: ::: :: ::::: CCDS63 CGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRG 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 FSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEK :..::.: :.:::: ::::.: :::..: .:: : :: ::: :::::: :::.:::.: CCDS63 FNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQK 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 SSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLI :. .:::::: :: :: .:: .: :.:.: .::: :::::::.:.:::: : : . :. CCDS63 SAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLV 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 KHQRTHLDEKPYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQR .::::: :::::: ::..: ..:::: :.:::.:::::::: :::::: :: : :: CCDS63 NHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQN 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 THSGEKHYVCRECRRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSG ::::: ::..: :::::.:::::::::::.:::..: :::::: .::.:..:.::::: CCDS63 IHSGEKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFSQKSNLVAHQRTHSG 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 pF1KB6 EKPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH :.:::: :::::::... :. :.: :: :: :.::.:: ::..:: :: :.:.: CCDS63 ERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSALITHKRAHSEEKPC 460 470 480 490 500 510 CCDS63 VCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRHRKTTSVHHRLPVQP 520 530 540 550 560 570 >>CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (667 aa) initn: 4962 init1: 1755 opt: 1958 Z-score: 1083.6 bits: 210.7 E(32554): 4.9e-54 Smith-Waterman score: 1958; 52.9% identity (73.2% similar) in 544 aa overlap (61-599:48-585) 40 50 60 70 80 90 pF1KB6 KLTQNHKAKGLPSNDTDCPQKKEGKAQIVVPVTFRDVTVIFTEAEWKRLSPEQRNLYKEV :. : . . :.. : . .. ..: CCDS74 RCGPGAVPRIRGSVVLAPRWRSSPAGGWSDPLFFGGAGISFSKPELITQLEQGKETWRE- 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 pF1KB6 MLENYRNLLSLAEPKPEIYTCSSCLLAFSCQQFLSQHVL-----QIFLGLCAENHFHPGN :. . . .:.::.: : .:: :.: :::: :: ::::....::. CCDS74 --EKKCSPATCPDPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGD 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 pF1KB6 SSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKPWSARTEERETSRAFPSPLQRQSASPR .:: ..: :: :. : ..::: : : :. : .::..: : :: : ::: .: : CCDS74 PGPGDQEKQ-QQASEGRPWSDQAEGPE-GEGAMPLFGRTKKR-TLGAFSRPPQRQPVSSR 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 260 pF1KB6 KGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGAINCREYEPDHNLESNFITNPRTLLG .: :: : : :: :: . :: ::..:.: ::..:: : . . .:.... : : CCDS74 NGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSG 200 210 220 230 240 250 270 280 290 300 310 320 pF1KB6 KKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPY .:::.:. : ..:. ...: ::.. :: ::: :: ::::::..::.: :.:::: :::: CCDS74 EKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPY 260 270 280 290 300 310 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 LCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLE .: :::..: .:: : :: ::: :::::: :::.:::.::. .:::::: :: :: . CCDS74 MCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSD 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 CGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQRTHLDEKPYVCRECGRG :: .: :.:.: .::: :::::::.:.:::: : : . :..::::: :::::: ::.. CCDS74 CGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHS 380 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 FCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECRRGFSQK : ..:::: :.:::.:::::::: :::::: :: : :: ::::: ::..: :::::. CCDS74 FSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQNIHSGEKPIVCKDCGRGFSQQ 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KB6 SNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSGEKPYVCSECGRGFSRKSLLL :::::::::::.:::..: :::::: .::.:..:.::::::.:::: :::::::... :. CCDS74 SNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFSQKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLI 500 510 520 530 540 550 570 580 590 pF1KB6 VHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH :.: :: :: :.::.:: ::..:: :: :.:.: CCDS74 RHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSALITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQM 560 570 580 590 600 610 CCDS74 THTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRHRKTTSVHHRLPVQPDPEPCAGQPSDSLYSL 620 630 640 650 660 >>CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (635 aa) initn: 4962 init1: 1755 opt: 1956 Z-score: 1082.7 bits: 210.4 E(32554): 5.5e-54 Smith-Waterman score: 1956; 56.3% identity (75.5% similar) in 503 aa overlap (102-599:54-553) 80 90 100 110 120 pF1KB6 TEAEWKRLSPEQRNLYKEVMLENYRNLLSLAEPKPEIYTCSSCLLAFSCQQFLSQHVL-- :.:.::.: : .:: :.: :::: CCDS74 VPRIRGSVVLAPRWRSSPAGGWSDPLFFGGADPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLCN 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 ---QIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKPWSARTEE :: ::::....::. .:: ..: :: :. : ..::: : : :. : .::.. CCDS74 HPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQ-QQASEGRPWSDQAEGPE-GEGAMPLFGRTKK 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 RETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGAINCREY : : :: : ::: .: :.: :: : : :: :: . :: ::..:.: ::..:: : CCDS74 R-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGEC 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 EPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRGF . . .:.... : :.:::.:. : ..:. ...: ::.. :: ::: :: :::::: CCDS74 GLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGF 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB6 SQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEKS ..::.: :.:::: ::::.: :::..: .:: : :: ::: :::::: :::.:::.:: CCDS74 NRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKS 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB6 SFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIK . .:::::: :: :: .:: .: :.:.: .::: :::::::.:.:::: : : . :.. CCDS74 AVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVN 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB6 HQRTHLDEKPYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRT ::::: :::::: ::..: ..:::: :.:::.:::::::: :::::: :: : :: CCDS74 HQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQNI 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB6 HSGEKHYVCRECRRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSGE ::::: ::..: :::::.:::::::::::.:::..: :::::: .::.:..:.:::::: CCDS74 HSGEKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGECGRGFSQKSNLVAHQRTHSGE 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 pF1KB6 KPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH .:::: :::::::... :. :.: :: :: :.::.:: ::..:: :: :.:.: CCDS74 RPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGFGNKSALITHKRAHSEEKPCV 510 520 530 540 550 560 CCDS74 CRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKSHLSRHRKTTSVHHRLPVQPD 570 580 590 600 610 620 >>CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (654 aa) initn: 4962 init1: 1755 opt: 1956 Z-score: 1082.5 bits: 210.5 E(32554): 5.6e-54 Smith-Waterman score: 2061; 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