Result of FASTA (omim) for
pF1KB6159
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6159, 599 aa
1>>>pF1KB6159 599 - 599 aa - 599 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1275+/-0.000642; mu= 25.3786+/- 0.040
mean_var=410.2978+/-83.660, 0's: 0 Z-trim(113.8): 1921 B-trim: 72 in 1/54
Lambda= 0.063318
statistics sampled from 21010 (23308) to 21010 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 10.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001297143 (OMIM: 609760) histone-lysine N-methy ( 894) 2058 204.2 1.5e-51
NP_064612 (OMIM: 609760) histone-lysine N-methyltr ( 894) 2057 204.1 1.6e-51
NP_001269925 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 671) 1964 195.4 5.3e-49
NP_001269932 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 591) 1961 195.0 6.2e-49
XP_016883546 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 591) 1961 195.0 6.2e-49
NP_001269933 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 591) 1961 195.0 6.2e-49
XP_016883544 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 591) 1961 195.0 6.2e-49
XP_016883545 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 591) 1961 195.0 6.2e-49
NP_001269936 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 667) 1958 194.8 7.8e-49
NP_001269934 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 635) 1956 194.6 8.7e-49
XP_011527642 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 636) 1956 194.6 8.7e-49
XP_016883536 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_005260877 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_005260876 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_016883535 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
NP_001269928 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_011527638 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_016883537 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
NP_001269929 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_011527640 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
NP_001269926 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_016883533 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
NP_001269927 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_011527639 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_016883534 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
NP_001269930 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_011527641 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 654) 1956 194.6 8.7e-49
XP_016883530 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 657) 1956 194.6 8.8e-49
NP_001269931 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 657) 1956 194.6 8.8e-49
XP_016883531 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 657) 1956 194.6 8.8e-49
NP_001269935 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 661) 1956 194.6 8.8e-49
XP_016883547 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 590) 1952 194.1 1.1e-48
XP_016883543 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
NP_001076799 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
NP_001269924 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
XP_016883541 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
XP_016883540 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
XP_016883539 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
XP_016883542 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
NP_003425 (OMIM: 604075) zinc finger protein 133 i ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
XP_016883538 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1951 194.1 1.2e-48
XP_016883532 (OMIM: 604075) PREDICTED: zinc finger ( 656) 1951 194.2 1.2e-48
NP_001269937 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 559) 1900 189.3 2.9e-47
NP_001316702 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 599) 1802 180.5 1.5e-44
NP_001316701 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 599) 1802 180.5 1.5e-44
NP_001316700 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 599) 1802 180.5 1.5e-44
NP_001316699 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 621) 1802 180.5 1.5e-44
NP_001316697 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 627) 1802 180.5 1.5e-44
NP_001316695 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 635) 1802 180.5 1.5e-44
NP_001316694 (OMIM: 165250) Krueppel-related zinc ( 635) 1802 180.5 1.5e-44
>>NP_001297143 (OMIM: 609760) histone-lysine N-methyltra (894 aa)
initn: 1898 init1: 1898 opt: 2058 Z-score: 1046.4 bits: 204.2 E(85289): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 2058; 58.3% identity (74.9% similar) in 509 aa overlap (96-599:375-882)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DVTVIFTEAEWKRLSPEQRNLYKEVMLENYRNLLSLAEPKPEIYTCSSCLLAFSCQQFLS
..:.. ::::::. : :: :::: :.:::
NP_001 RVIRPGCELLVWYGDEYGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLS
350 360 370 380 390 400
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QHVL-----QIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKPW
::: : : : :.. ..: : :: .:. ::: ....::: ::
NP_001 QHVERNHSSQNFPGPSARKLLQPENPCPGDQNQE-QQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLL
410 420 430 440 450 460
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SARTEERETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGA
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NP_001 NKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAK
470 480 490 500 510 520
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 INCREYEPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCS
.. : ...:. ::. :: :.: :.: .:::.:. .: :. :.:::. ::::::
NP_001 VKYGECGQGFSVKSDVITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCR
530 540 550 560 570 580
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGR
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NP_001 ECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGR
590 600 610 620 630 640
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pF1KB6 GFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQ
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NP_001 GFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSW
650 660 670 680 690 700
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NSDLIKHQRTHLDEKPYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLL
.: :. ::::: ::::::::::::: .:: :. :.:::.::::::: :::::: :: :
NP_001 QSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSHL
710 720 730 740 750 760
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LVHQRTHSGEKHYVCRECRRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHE
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NP_001 LRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQ
770 780 790 800 810 820
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pF1KB6 RTHSGEKPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH
:::.::::::: :::::: :: :: :::::.::: ::::::::::: .:.: :::::
NP_001 RTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSDRSSLCYHQRTHT
830 840 850 860 870 880
NP_001 GEKPYVCREDE
890
>>NP_064612 (OMIM: 609760) histone-lysine N-methyltransf (894 aa)
initn: 1897 init1: 1897 opt: 2057 Z-score: 1045.9 bits: 204.1 E(85289): 1.6e-51
Smith-Waterman score: 2057; 58.3% identity (74.7% similar) in 509 aa overlap (96-599:375-882)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DVTVIFTEAEWKRLSPEQRNLYKEVMLENYRNLLSLAEPKPEIYTCSSCLLAFSCQQFLS
..:.. ::::::. : :: :::: :.:::
NP_064 RVIRPGCELLVWYGDEYGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFLS
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130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QHVL-----QIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSHVSCWFENAEGQERGGGSKPW
::: : : : :.. ..: : :: .:. ::: ....::: ::
NP_064 QHVERNHSSQNFPGPSARKLLQPENPCPGDQNQE-QQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLL
410 420 430 440 450 460
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SARTEERETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQRPNPVQLDKGLKELETLRFGA
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NP_064 NKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAK
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 INCREYEPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKDRSTLIRHHRIHSMEKPYVCS
.. : ...:. ::. :: :.: :.: .:::.:. .: :. :.:::. ::::::
NP_064 VKYGECGQGFSVKSDVITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLIHQRIHTGEKPYVCR
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310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSILNRHQWTHSEEKPYVCSECGR
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NP_064 ECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGR
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pF1KB6 GFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQRIHSGEKPYVCRECGRGFSQ
:::..: .. ::: :.::::::: ::::.: .:.: ::: :.:::::::::::::::
NP_064 GFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSW
650 660 670 680 690 700
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pF1KB6 NSDLIKHQRTHLDEKPYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHSGEKPYVCGECGRGFSRKSLL
.: :. ::::: ::::::::::::: .:: :. :.:::.::::::: :::::: :: :
NP_064 QSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSHL
710 720 730 740 750 760
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pF1KB6 LVHQRTHSGEKHYVCRECRRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKPYICRECGRGFCDKSTLIVHE
: :::::.::: :::::: ::: .::::. :::::..::::.:::::::: .:: :. :.
NP_064 LRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQ
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pF1KB6 RTHSGEKPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECGRGFSHKSNLIRHQRTH
:::.::::::: :::::: :: :: :::::.::: ::::::::::: .:.: :::::
NP_064 RTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSDRSSLCYHQRTHT
830 840 850 860 870 880
NP_064 GEKPYVCREDE
890
>>NP_001269925 (OMIM: 604075) zinc finger protein 133 is (671 aa)
initn: 4962 init1: 1755 opt: 1964 Z-score: 1000.7 bits: 195.4 E(85289): 5.3e-49
Smith-Waterman score: 2033; 52.6% identity (70.5% similar) in 589 aa overlap (62-599:4-589)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 LTQNHKAKGLPSNDTDCPQKKEGKAQIVVPVTFRDVTVIFTEAEWKRLSPEQRNLYKEVM
..::::.: ::. ::. ::: ::.::.:::
NP_001 MAHMAFRDVAVDFTQDEWRLLSPAQRTLYREVM
10 20 30
100
pF1KB6 LENYRNLLSL----------------------------------------------AEPK
:::: ::.:: :.:.
NP_001 LENYSNLVSLGISFSKPELITQLEQGKETWREEKKCSPATCPDHQEYGNNCDLQKEADPE
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 PEIYTCSSCLLAFSCQQFLSQHVL-----QIFLGLCAENHFHPGNSSPGHWKQQGQQYSH
::.: : .:: :.: :::: :: ::::....::. .:: ..: :: :.
NP_001 PELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQ-QQASE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 VSCWFENAEGQERGGGSKPWSARTEERETSRAFPSPLQRQSASPRKGNMVVETEPSSAQR
: ..::: : : :. : .::..: : :: : ::: .: :.: :: : : ::
NP_001 GRPWSDQAEGPE-GEGAMPLFGRTKKR-TLGAFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQT
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 PNPVQLDKGLKELETLRFGAINCREYEPDHNLESNFITNPRTLLGKKPYICSDCGRSFKD
:: . :: ::..:.: ::..:: : . . .:.... : :.:::.:. : ..:.
NP_001 GNPEETDKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSL
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 RSTLIRHHRIHSMEKPYVCSECGRGFSQKSNLSRHQRTHSEEKPYLCRECGQSFRSKSIL
...: ::.. :: ::: :: ::::::..::.: :.:::: ::::.: :::..: .:: :
NP_001 KKSLARHQKAHSGEKPIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 NRHQWTHSEEKPYVCSECGRGFSEKSSFIRHQRTHSGEKPYVCLECGRSFCDKSTLRKHQ
:: ::: :::::: :::.:::.::. .:::::: :: :: .:: .: :.:.: .::
NP_001 IIHQRTHSGEKPYVCRECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQ
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 RIHSGEKPYVCRECGRGFSQNSDLIKHQRTHLDEKPYVCRECGRGFCDKSTLIIHERTHS
: :::::::.:.:::: : : . :..::::: :::::: ::..: ..:::: :.:::.
NP_001 RTHSGEKPYACKECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHT
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 GEKPYVCGECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCRECRRGFSQKSNLIRHQRTHSNEKP
:::::::: :::::: :: : :: ::::: ::..: :::::.:::::::::::.:::
NP_001 GEKPYVCGVCGRGFSLKSHLNRHQNIHSGEKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKP
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 YICRECGRGFCDKSTLIVHERTHSGEKPYVCSECGRGFSRKSLLLVHQRTHSGEKHYVCR
..: :::::: .::.:..:.::::::.:::: :::::::... :. :.: :: :: :.::
NP_001 MVCGECGRGFSQKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCR
520 530 540 550 560 570
590
pF1KB6 ECGRGFSHKSNLIRHQRTH
.:: ::..:: :: :.:.:
NP_001 QCGLGFGNKSALITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGR
580 590 600 610 620 630
>>NP_001269932 (OMIM: 604075) zinc finger protein 133 is (591 aa)
initn: 4962 init1: 1755 opt: 1961 Z-score: 999.5 bits: 195.0 E(85289): 6.2e-49
Smith-Waterman score: 1961; 56.3% identity (75.6% similar) in 504 aa overlap (101-599:9-509)
80 90 100 110 120
pF1KB6 FTEAEWKRLSPEQRNLYKEVMLENYRNLLSLAEPKPEIYTCSSCLLAFSCQQFLSQHVL-
::.:.::.: : .:: :.: ::::
NP_001 MCNGRKTVLADPEPELYLDPFCPPGFSSQKFPMQHVLC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]