Result of FASTA (ccds) for pF1KB6162
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6162, 647 aa
  1>>>pF1KB6162 647 - 647 aa - 647 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7583+/-0.000719; mu= 18.5959+/- 0.044
 mean_var=105.3777+/-21.003, 0's: 0 Z-trim(112.1): 98  B-trim: 77 in 1/50
 Lambda= 0.124940
 statistics sampled from 12754 (12886) to 12754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.396), width:  16
 Scan time:  3.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX          ( 647) 4323 790.0       0
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7           ( 630) 2797 514.9 1.3e-145
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1            ( 636) 2759 508.1 1.5e-143
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1            ( 655) 2487 459.1 8.9e-129
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20         ( 858)  933 179.1 2.3e-44
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8           ( 911)  902 173.5 1.1e-42
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1            ( 575)  846 163.2 8.9e-40
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2           ( 494)  755 146.8 6.9e-35
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1           ( 511)  676 132.5 1.4e-30
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8          ( 500)  672 131.8 2.2e-30
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19         ( 456)  653 128.3 2.2e-29
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12          ( 495)  648 127.5 4.4e-29
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2           ( 491)  564 112.3 1.6e-24
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8           ( 477)  545 108.9 1.7e-23
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1            ( 499)  533 106.7 7.7e-23
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11         ( 653)  512 103.1 1.3e-21
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12          ( 613)  510 102.7 1.6e-21
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12          ( 529)  506 101.9 2.4e-21
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20         ( 526)  495 99.9 9.3e-21
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18        ( 466)  472 95.7 1.5e-19
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2        ( 425)  470 95.3 1.8e-19
CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1          ( 356)  399 82.5 1.1e-15
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2         ( 436)  398 82.4 1.5e-15
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20         ( 513)  385 80.1 8.5e-15
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16        ( 519)  382 79.5 1.2e-14
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9         ( 545)  376 78.5 2.7e-14
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12         ( 583)  317 67.9 4.5e-11


>>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX               (647 aa)
 initn: 4323 init1: 4323 opt: 4323  Z-score: 4214.1  bits: 790.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4323; 100.0% identity (100.0% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVVNVSGRRFETWKNTLDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVVNVSGRRFETWKNTLDR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELAF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 YGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAGSSLRQRLWRAFENPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAGSSLRQRLWRAFENPH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGERFPQAFFCMDTACVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGERFPQAFFCMDTACVL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 IFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKNDDVSGAFVTLRVFRVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKNDDVSGAFVTLRVFRVF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSIP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 AAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 ADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLEDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLEDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 LLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRSTSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRSTSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 AIRLANSTASVSRGSMQELDMLAGLRRSHAPQSRSSLNAKPHDSLDLNCDSRDFVAAIIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AIRLANSTASVSRGSMQELDMLAGLRRSHAPQSRSSLNAKPHDSLDLNCDSRDFVAAIIS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       
pF1KB6 IPTPPANTPDESQPSSPGGGGRAGSTLRNSSLGTPCLFPETVKISSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IPTPPANTPDESQPSSPGGGGRAGSTLRNSSLGTPCLFPETVKISSL
              610       620       630       640       

>>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7                (630 aa)
 initn: 2012 init1: 1344 opt: 2797  Z-score: 2727.7  bits: 514.9 E(32554): 1.3e-145
Smith-Waterman score: 2797; 67.3% identity (85.9% similar) in 640 aa overlap (1-632:1-630)

               10        20        30        40         50         
pF1KB6 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVV-NVSGRRFETWKNTLD
       ::::.:.:::::::::.::.:.:. :.:  :  . .: ...:.: :::: ::.::..::.
CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB6 RYPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELA
       :::::::::::..:::  .. .::::::::.:::.:::::::.:: ::.:::.:.:::::
CCDS57 RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 FYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAGSSLRQRLWRAFENP
       :.::.::..:::: :::.::..:::::: .: ... ::.. :::. .. :::.:::::::
CCDS57 FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGES-ALPTMTA-RQRVWRAFENP
              130       140       150       160         170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 HTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGERFPQAFFCMDTACV
       :::: :::::::::::::::::::::::.:: ::.    .: :::::.  ::::.:::::
CCDS57 HTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPC-GSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACV
      180       190       200        210       220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 LIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKNDDVSGAFVTLRVFRV
       .::: :::::: ::::: ::.:::::.:::::::::::::..  :.::::::::::::::
CCDS57 MIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRV
       240       250       260       270       280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB6 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ..::::
CCDS57 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSI
       300       310       320       330       340       350       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB6 PAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ
       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ
       360       370       380       390       400       410       

     420       430       440       450         460       470       
pF1KB6 RADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLEDS--GSGEEQALCVRNRSAFEQQ
       ::::::::.:.:::::: ::::..::..: :.:: : ..  .: .:::.  .. :.:: :
CCDS57 RADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQSSEDEQAFVSKSGSSFETQ
       420       430       440       450       460       470       

       480       490       500       510        520       530      
pF1KB6 HHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGR-TSRSTSVSSQPVGPGSLLSSCCPRR
       :::::::::::: :::.:: .: :.   :.  .: .:.: :.:::     .. :.:: ::
CCDS57 HHHLLHCLEKTTNHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLSSQQ----GVTSTCCSRR
       480       490       500       510       520           530   

        540       550        560         570       580       590   
pF1KB6 AKRRAIRLANSTASVS-RGSMQELDMLA--GLRRSHAPQSRSSLNAKPHDSLDLNCDSRD
        :. ..:. :...: : .::.:::. .    ..:.   .:::::::: .. . :::..  
CCDS57 HKK-TFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKMEECVKLNCEQPY
            540       550       560       570       580       590  

           600       610        620       630       640       
pF1KB6 FVAAIISIPTPPANTPD-ESQPSSPGGGGRAGSTLRNSSLGTPCLFPETVKISSL
        ..:::::::::..::. ...: ::  .:  :. .: :.:               
CCDS57 VTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSG--GNIVRVSAL               
            600       610       620         630               

>>CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1                 (636 aa)
 initn: 2575 init1: 1347 opt: 2759  Z-score: 2690.6  bits: 508.1 E(32554): 1.5e-143
Smith-Waterman score: 2759; 65.8% identity (83.7% similar) in 658 aa overlap (1-647:1-636)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVVNVSGRRFETWKNTLDR
       ::::.:.:::::::::.::.:.:. :.: ::. : .: ::..:.:::::::.::..::.:
CCDS84 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELAF
       ::::::::.:::::.. :. ::::::::..:: ::::::::.:: :: :::.:.:.::::
CCDS84 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
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       ::..::..:::: :::.:::.:::::: .:...:.  .  ..:.  :.:: .::::::::
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       ::: :::::::::::::::::.:::::.:: :..  .:.: :::::.  ::::.:::::.
CCDS84 TSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPC-GTVP-GSKELPCGERYSVAFFCLDTACVM
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       ::: :::::::::::: ::.:::::.::::::.::::::.. .:.:::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ..:::::
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       :.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::.:.::::::.::.:..::.:. :.::    .:: .:. ::. .  .. : .:.
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       ::::::::::::: ::: ::  : .     :  .  : :: :.::.:    .: ..:: :
CCDS84 QHHHLLHCLEKTTNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHP----GLTTTCCSR
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       ....:::::::::: ::. ::.:  .:::          :...  : .  ..::.:.:
CCDS84 QITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGP---------NTNI--PSIASNVVKVSAL
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>>CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1                 (655 aa)
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CCDS84 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
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CCDS84 TSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPC-GTVP-GSKELPCGERYSVAFFCLDTACVM
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       ::: :::::::::::: ::.:::::.::::::.::::::.. .:.:::::::::::::::
CCDS84 IFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ..:::::
CCDS84 RIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIP
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CCDS84 ADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMG-KTTSLIES
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CCDS84 QHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSP
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pF1KB6 SVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSR-GSMQELDML--AGLRRSHAPQS
       :.::.:    .: ..:: ::.:. . .: ::.  ..:  :::::. .   : ..     :
CCDS84 SLSSHP----GLTTTCCSRRSKKTT-HLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTS
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pF1KB6 RSSLNAKPHDSLDLNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPD-ESQP--SSPGGGGRAGSTLRNS
       ::::: :  :.:  :: . ....:::::::::: ::. ::.:  .:::          :.
CCDS84 RSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGP---------NT
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              640       
pF1KB6 SLGTPCLFPETVKISSL
       ..  : .  ..::.:.:
CCDS84 NI--PSIASNVVKVSAL
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>>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20              (858 aa)
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pF1KB6 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT
                                 ::: :   :...  .. . .::.:   :. :. :
CCDS13            MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWR-T
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pF1KB6 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR
       ::: : : ::     ...  ..     :. :..:::::: :  :  .::::::::::  .
CCDS13 LDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMME
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pF1KB6 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAG--
       . :  .:..:: ..:.    . .::  .:...:..  :.: .. :. .  .:  .     
CCDS13 EMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCC
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pF1KB6 SSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE
       .  :..::  .:.:..:.:: ..  .. .::..:.::  ..:.:      .:  :   . 
CCDS13 AEKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLP----ELQSLDEFGQST
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pF1KB6 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND
         :: .  ....:.  :: :::::....:.. .:... .. ::..::::::. ... ...
CCDS13 DNPQ-LAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESN
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pF1KB6 -------DVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAII
              .:  .   .:..:..::.:..::: ::. ::.::.   .:::.:.. :.:.:.
CCDS13 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM
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pF1KB6 IFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVL
       ::....:.:::  . :.: ::::.::.. .::::.::::. :.:. ::: :..: ..:::
CCDS13 IFSSLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVL
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pF1KB6 VIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADK--RRAQQKVRLARI-RLAKSGTTNAFLQYKQNGGL
       :::::.:.::.:::..:....: .:  .: .   :  :   ... .  .:: .  .   .
CCDS13 VIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
           410       420       430       440       450       460   

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pF1KB6 EDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRS
           .::...   ...     : .::     : : . .. : . :... .   :.  .  
CCDS13 VVEKNGENMG--KKDKV----QDNHLSPNKWKWTKRTLS-ETSSSKSFETKEQGSPEKAR
           470             480       490        500       510      

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pF1KB6 TSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSRGSMQELDMLAGLRRSHAP---Q
       .: : : ..  .:  .   . :: ..  . :.  :..... .:   . ..    ::   .
CCDS13 SSSSPQHLNVQQL-EDMYNKMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTR
        520        530       540       550       560       570     

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pF1KB6 SRSSLNAKPHDSLD--LNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPDESQPSSPGGGGRAGSTLRNS
       ... .. .  .:.:  ..: . ::  :     :  ...:  : ::. ::           
CCDS13 TEGVIDMRSMSSIDSFISC-ATDFPEA-----TRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGA
         580       590        600            610       620         

              640                                                  
pF1KB6 SLGTPCLFPETVKISSL                                           
                                                                   
CCDS13 LGASGGRFVEANPSPDASQHSSFFIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFMEGDPSPLLPVLG
     630       640       650       660       670       680         

>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8                (911 aa)
 initn: 834 init1: 503 opt: 902  Z-score: 879.6  bits: 173.5 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 948; 35.8% identity (69.6% similar) in 438 aa overlap (27-442:20-448)

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pF1KB6 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT
                                 ::: :   ....  .. . .::.:   :. :. :
CCDS62        MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWR-T
                      10        20        30        40        50   

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pF1KB6 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR
       ::: : : ::     .... ..     :. . .:::::: :  :  .:::::::.::  .
CCDS62 LDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMME
             60        70        80        90       100       110  

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB6 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAGS-
       . :  .: .:: ..:.    . .::  .:...:..  :.: .. :. .  .:  .     
CCDS62 EMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCC
            120       130       140       150       160       170  

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pF1KB6 -SLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE
        . :..::  .:.:..:.:: ..  :. .::..:.::  ..:.:     .....    ..
CCDS62 PDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLP---ELQETDEFGQLND
            180       190       200       210          220         

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pF1KB6 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND
           :   ....:.  :: :::::....:.. .:... ...::..::::::. ... ...
CCDS62 NRQLAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESN
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pF1KB6 -------DVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAII
              .:  .   .:..:..::.:..::: ::. ::.::.   .:::.:.. :.:.:.
CCDS62 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM
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pF1KB6 IFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVL
       ::....:.:::  . :.::::::.::.. .::::.::::. :.:. ::: :..: ..:::
CCDS62 IFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVL
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pF1KB6 VIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLEDS
       :::::.:.::.:::..:....: .:     : : :  :  ..:.                
CCDS62 VIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK---AIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMEL
       410       420       430          440       450       460    

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pF1KB6 GSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRSTSV
                                                                   
CCDS62 IDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQL
          470       480       490       500       510       520    

>>CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1                 (575 aa)
 initn: 823 init1: 506 opt: 846  Z-score: 827.6  bits: 163.2 E(32554): 8.9e-40
Smith-Waterman score: 945; 38.6% identity (65.7% similar) in 492 aa overlap (25-470:87-559)

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pF1KB6       MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPP---APGVKASRGDEVLVVNVSGRRF
                                     .::::   : : .   :..: :.:.:: ::
CCDS82 PGDHLLEPEVADGGGAPPQGGCGGGGCDRYEPLPPSLPAAGEQDCCGERV-VINISGLRF
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pF1KB6 ETWKNTLDRYPDTLLGSSEKEF-FYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTG-RLHCPRQE
       ::  .:: ..:.::::. .... ..:   .::::::.   :  .: .:..: :.. : . 
CCDS82 ETQLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNV
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pF1KB6 CIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAGSSLR
        :. :.::. :: :     :.  .:..:    :.   : :.:.       : ::  .  :
CCDS82 PIDIFSEEIRFYQL-----GEEAMEKFR----EDEGFLREEER-------P-LPRRDFQR
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pF1KB6 QRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIP-CR------GSARRSSRE--
       : .:  :: :..:  :  .  :. . : .:..   .::.:  :      .:. ..: :  
CCDS82 Q-VWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQDSFEAA
       220       230       240       250       260       270       

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pF1KB6 --QPCGER-----FPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAIL
         .  : :     : . :: ..: :.. :. : :.:.:: ::.  : :..:.:::.:::.
CCDS82 GNSTSGSRAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVAII
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pF1KB6 PYYIGL---LVPK--NDDVSGAFVTLRVFR---VFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASE
       ::.: :   :. .  : . . ... :::.:   ::::::.::::.::.::: :::.   :
CCDS82 PYFITLGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRE
       340       350       360       370       380       390       

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pF1KB6 LGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAG
       ::.:.: : ...:.:......::     ..:.::: :::...:::::.::::: : ::.:
CCDS82 LGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGG
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pF1KB6 KIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKV----RLA----RIRL
       :: ::.:...:::.::::::::::::. .::.. .....   ..:    .:.    ..: 
CCDS82 KIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQYMHVGSCQHLSSSAEELRK
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pF1KB6 AKSGTTNAFLQYK--QNGGLEDSG-------SGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKT
       :.:..: .  .:   ..::.. :.       .:.  : :. :                  
CCDS82 ARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV  
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pF1KB6 TCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRSTSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANST

>>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2                (494 aa)
 initn: 742 init1: 394 opt: 755  Z-score: 739.8  bits: 146.8 E(32554): 6.9e-35
Smith-Waterman score: 803; 33.8% identity (63.6% similar) in 467 aa overlap (29-467:10-464)

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pF1KB6 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRG-DEV-LVVNVSGRRFETWKNTL
                                   : :: ..: . :.. .::::.: :   . . :
CCDS16                    MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLL
                                  10        20        30        40 

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pF1KB6 DRYPDT--------LLGSSEKEFF----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCP
       ..::.:        : :. .  :     ::  . :..:::::: :. :.. :  :..:  
CCDS16 SQYPETRLAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMK
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        110       120       130          140         150       160 
pF1KB6 RQECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCC---LEEYRDRKKENAER--LAEDEEAEQAGDGPA
       .  :   : .:. :. .  ... :::   : : :.. .: :.:  :  :. . .:..:  
CCDS16 KGICPICFKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEG--
             110       120       130       140       150           

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pF1KB6 LPAGSSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRG--SARRSSR
              .. .:. .:.:..:  : :   .. ..: :: ..  . :::     .:. .  
CCDS16 --RWRRCQKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRV
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pF1KB6 EQPCGERFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGL
       :.:  :        ..:::.  :: :::::::..:.. .:  : :...::.::::.:..:
CCDS16 EHPTLEN-------VETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSL
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pF1KB6 LVP-------KNDDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFS
        .        .  .:. :  .::..:. ::::..:::.::. : :.::   .:::.::. 
CCDS16 TLTHLGARMMELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMY
              280       290       300       310       320       330

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pF1KB6 LTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSIC
       :...:..:... .  :..  .: : ::: .::..:.::::.::::. :.:  ::. ..: 
CCDS16 LAVGIFVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAIS
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pF1KB6 SLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQN
        : ::..::::.  :..:: : :...::. .  :.....: ..  ...:  ..  . .. 
CCDS16 FLCGVIAIALPIHPIINNFVR-YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDL
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pF1KB6 GGLEDSGSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRT
        .:    .:.:   :                                             
CCDS16 DNLPPEPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK               
     450       460       470       480       490                   

>>CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1                (511 aa)
 initn: 651 init1: 507 opt: 676  Z-score: 662.7  bits: 132.5 E(32554): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 924; 36.4% identity (67.0% similar) in 451 aa overlap (28-454:73-503)

                  10        20        30         40        50      
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