Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6164
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6164, 602 aa
1>>>pF1KB6164 602 - 602 aa - 602 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4517+/-0.000955; mu= 6.8735+/- 0.058
mean_var=196.9223+/-39.050, 0's: 0 Z-trim(113.3): 15 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.091396
statistics sampled from 13904 (13919) to 13904 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.428), width: 16
Scan time: 4.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4878.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6 ( 602) 4007 540.8 1.8e-153
CCDS55002.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6 ( 570) 3254 441.5 1.4e-123
CCDS43464.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6 ( 496) 3230 438.3 1.1e-122
CCDS9964.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 ( 524) 2737 373.3 4.2e-103
CCDS53912.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 ( 555) 2735 373.1 5.3e-103
CCDS53911.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 ( 540) 2660 363.2 4.9e-100
CCDS9965.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 ( 485) 2509 343.2 4.5e-94
CCDS45163.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 ( 449) 2500 342.0 9.6e-94
CCDS9758.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14 ( 467) 2083 287.1 3.5e-77
CCDS1503.1 PPP2R5A gene_id:5525|Hs108|chr1 ( 486) 2063 284.4 2.3e-76
CCDS61468.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14 ( 462) 2053 283.1 5.4e-76
CCDS8085.1 PPP2R5B gene_id:5526|Hs108|chr11 ( 497) 2044 281.9 1.3e-75
CCDS55686.1 PPP2R5A gene_id:5525|Hs108|chr1 ( 429) 1997 275.7 8.6e-74
CCDS61467.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14 ( 391) 1901 263.0 5.2e-70
>>CCDS4878.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6 (602 aa)
initn: 4007 init1: 4007 opt: 4007 Z-score: 2868.6 bits: 540.8 E(32554): 1.8e-153
Smith-Waterman score: 4007; 100.0% identity (100.0% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPYKLKKEKEPPKVAKCTAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPYKLKKEKEPPKVAKCTAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NSTPPPTQLSKIKYSGGPQIVKKERRQSSSRFNLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NSTPPPTQLSKIKYSGGPQIVKKERRQSSSRFNLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KLRQCCVLFDFVSDPLSDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLRQCCVLFDFVSDPLSDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LALLDLFDSEDPRERDFLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LALLDLFDSEDPRERDFLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LEILGSIINGFALPLKEEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LEILGSIINGFALPLKEEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VIVGLLKFWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VIVGLLKFWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RALYYWNNEYIMSLISDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RALYYWNNEYIMSLISDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 AEDIQLLKRTVETEAVQMLKDIKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AEDIQLLKRTVETEAVQMLKDIKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQE
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 AL
::
CCDS48 AL
>>CCDS55002.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6 (570 aa)
initn: 3233 init1: 3233 opt: 3254 Z-score: 2332.3 bits: 441.5 E(32554): 1.4e-123
Smith-Waterman score: 3730; 94.7% identity (94.7% similar) in 602 aa overlap (1-602:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPYKLKKEKEPPKVAKCTAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MPYKLKKEKEPPKVAKCTAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NSTPPPTQLSKIKYSGGPQIVKKERRQSSSRFNLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQ
:::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS55 NSTPPPTQLSKIKYSGGPQIVKKE--------------------------------LFIQ
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KLRQCCVLFDFVSDPLSDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLRQCCVLFDFVSDPLSDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLF
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LALLDLFDSEDPRERDFLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LALLDLFDSEDPRERDFLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAEL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LEILGSIINGFALPLKEEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEILGSIINGFALPLKEEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEP
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VIVGLLKFWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VIVGLLKFWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RALYYWNNEYIMSLISDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RALYYWNNEYIMSLISDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPT
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 AEDIQLLKRTVETEAVQMLKDIKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEDIQLLKRTVETEAVQMLKDIKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQE
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 AL
::
CCDS55 AL
570
>>CCDS43464.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6 (496 aa)
initn: 3230 init1: 3230 opt: 3230 Z-score: 2316.1 bits: 438.3 E(32554): 1.1e-122
Smith-Waterman score: 3230; 99.2% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (112-602:6-496)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 KKERRQSSSRFNLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKF
....::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPYKLKKEKELFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKF
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 KEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEP
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 TLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLALLDLFDSEDPRERDFLKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLALLDLFDSEDPRERDFLKTI
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKM
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 FLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEPVIVGLLKFWPKTHSPKEVMFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEPVIVGLLKFWPKTHSPKEVMFL
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 NELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAR
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 VLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKGRFRMKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKGRFRMKE
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 REEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPTAEDIQLLKRTVETEAVQMLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPTAEDIQLLKRTVETEAVQMLKD
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600
pF1KB6 IKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQEAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQEAL
460 470 480 490
>>CCDS9964.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 (524 aa)
initn: 2703 init1: 2703 opt: 2737 Z-score: 1964.4 bits: 373.3 E(32554): 4.2e-103
Smith-Waterman score: 2737; 81.6% identity (92.3% similar) in 495 aa overlap (106-600:30-522)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 GGPQIVKKERRQSSSRFNLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQKLRQCCVLFDFVSDP
..: : ..:.:::::::::::::::::::
CCDS99 MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVVLLHIRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDP
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 LSDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLFRTLPPSSNPTGAEFD
:::::.::::::.:.::::::::.:.:.:: ::::.: ::.::.::::::::::::::::
CCDS99 LSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFD
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 PEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLALLDLFDSEDPRER
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::::
CCDS99 PEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRER
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 DFLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPL
::::: ::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPL
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 KEEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEPVIVGLLKFWPKTHSP
:::::.::..::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::...:::.:::::::
CCDS99 KEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSP
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 KEVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLI
::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLI
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 SDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKG
:::::..::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :
CCDS99 SDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKE
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 RFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPTAEDIQLLKRTVETEA
...:::::: : :::.::. :::: .. . .:::. : ::.:.:..::. ::
CCDS99 KLKMKEREEAWVKIENLAKANPQYTVYSQASTMSIPVAMETDGPLFEDVQMLRKTVKDEA
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600
pF1KB6 VQMLKDIKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQEAL
: :: ::.. : ::::::::: .: :::::: ::.:. :::.
CCDS99 HQAQKDPKKDRPLARRKSELPQDPHTKKALEAHCRADEL--ASQDGR
480 490 500 510 520
>>CCDS53912.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14 (555 aa)
initn: 2800 init1: 2703 opt: 2735 Z-score: 1962.7 bits: 373.1 E(32554): 5.3e-103
Smith-Waterman score: 2753; 72.0% identity (82.5% similar) in 600 aa overlap (1-600:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPYKLKKEKEPPKVAKCTAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPS
:: : ::::: ::..: ..: :. :.: ..: .:. ::: : :
CCDS53 MPNKNKKEKESPKAGK-SGKSSKEGQD----TVESEGTSPEE----------PSSPKVP-
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NSTPPPTQLSKIKYSGGPQIVKKERRQSSSRFNLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQ
:: . :: :: .: : ..:.::::
CCDS53 ---PPLLPELLVLIFGG----------------------LQG----RDVPPADQEKLFIQ
50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KLRQCCVLFDFVSDPLSDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLF
::::::::::::::::::::.::::::.:.::::::::.:.:.:: ::::.: ::.::.:
CCDS53 KLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMF
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LALLDLFDSEDPRERDFLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAEL
: ::.::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::
CCDS53 LQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAEL
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LEILGSIINGFALPLKEEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEP
::::::::::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS53 LEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEP
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VIVGLLKFWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAE
:...:::.:::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::
CCDS53 VVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RALYYWNNEYIMSLISDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
::::::::::::::::::::..::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPT
:::::::.:::: : ...:::::: : :::.::. :::: .. . .:::. :
CCDS53 FDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQYTVYSQASTMSIPVAMETDGPL
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CCDS53 FEDVQMLRKTVKDEAHQAQKDPKKDRPLARRKSELPQDPHTKKALEAHCRADEL--ASQD
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pF1KB6 AL
CCDS53 GR
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CCDS53 RTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFV
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CCDS53 LEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEP
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CCDS53 RALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKL
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pF1KB6 FDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPT
:::::::.:::: : ...:::::: : :::.::. :::
CCDS53 FDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLAKANPQAQ--------------------
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pF1KB6 AEDIQLLKRTVETEAVQMLKDIKKEKVLLRRKSELPQDVYTIKALEAHKRAEEFLTASQE
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CCDS53 -------------------KDPKKDRPLARRKSELPQDPHTKKALEAHCRADEL--ASQD
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pF1KB6 AL
CCDS53 GR
540
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CCDS45 KEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLI
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pF1KB6 SDNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKG
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CCDS45 KLKMKEREEAWVKIENLAKANPQVLKKRIT
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CCDS97 MSSAPTTPPS-VDKVDGFSRKSVRKARQKRSQ
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CCDS97 SSSQFRSQGKPIELTPLPLLKDVPSSEQPELFLKKLQQCCVIFDFM-DTLSDLKMKEYKR
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. :::.:.::: :: .:: :::.: : : :.:::::::.. :::::::::::::.
CCDS97 STLNELVDYITISRGCLTEQTYPEVVRMVSCNIFRTLPPSDS---NEFDPEEDEPTLEAS
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CCDS97 GKFLGLRAFIRKQINNIFLRFVYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLVKV
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pF1KB6 LLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEPVIVGLLKFWPKTHSPKEVMFLNELEE
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CCDS97 LIPLHTVRSLSLFHAQLAYCIVQFLEKDPSLTEPVIRGLMKFWPKTCSQKEVMFLGELEE
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::::::::.: :..::::.:.:::::::::::::::::::::::::::: .:. .::::
CCDS97 ILDVIEPSQFVKIQEPLFKQIAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIM
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pF1KB6 FPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKGRFRMKEREEMW
: .::: :: ::: .: .:.::.:: :::::. .::. : ::...:. . . :::::.:
CCDS97 FSSLYRISKEHWNPAIVALVYNVLKAFMEMNSTMFDELTATYKSDRQREKKKEKEREELW
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pF1KB6 QKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPTAEDIQLLKRTVETEAVQMLKDIKKEK
.:.:.:
CCDS97 KKLEDLELKRGLRRDGIIPT
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pF1KB6 TAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPSNSTPPPTQLSKIKYSGG
..:.::.. : . ... . ..
CCDS15 MSSSSPPAGAA--SAAISASEKVDGFTRKSV
10 20
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pF1KB6 PQIVKKERRQSSSRF-NLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQKLRQCCVLFDFVSDPL
. ...: :.::.: . ... ::. :: :::. ..:..::: :::.:::.::::. : .
CCDS15 RKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLKDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFM-DSV
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CCDS15 SDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNP---DFDP
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pF1KB6 EEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLALLDLFDSEDPRERD
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CCDS15 EEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERD
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pF1KB6 FLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLK
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CCDS15 FLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLK
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CCDS15 AEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQK
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pF1KB6 EVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIS
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CCDS15 EVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIE
330 340 350 360 370 380
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pF1KB6 DNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKGR
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CCDS15 ENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREK
390 400 410 420 430 440
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pF1KB6 FRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPTAEDIQLLKRTVETEAV
. ::::.:.:.:::
CCDS15 KKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE
450 460 470 480
602 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 14:05:28 2016 done: Sat Nov 5 14:05:28 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]